FuNGI

A0A1Y1W9V1

Protein Details

Accession

A0A1Y1W9V1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
135-154	AGEKSQRKRRWDQTPAHVEA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

plas 17, nucl 3, cyto 3, cyto_nucl 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MQGAQKLTAEIKYDTDLYETGDKLSDYDQTMEINSTGDAVQVKPGRFGYTAPQAFIDELRGAEPAESADPFKELQRSRGISRIIADNESEYEKRRHGRSVGGAETESYAETLKRAQLENEKAELISKIQKAEQEAGEKSQRKRRWDQTPAHVEATPGGSTKRRNRWDETPKVAGGFDETPRVSGGFGETPRRSRWDETPKVSGFGETPKVSGGFGETPRRSRWDETPAATQIGESKAGGAAAAALVEDPRNAYMSDDELDALLPSEGYTIMEAPSSYVPIRTPARKLMATPGPMQGTGGFHIPEAGSSVQVEAELTREVPGIGALPFFKQDDMQHFGKLLDGQSEEEMDAEEKKEREILRLLLKIKNGTPAMRKVAMRQMAERARGYGAAAIFNQILPLFLAASLEEQERHLLVKVVDRVMMRLGPLVRPFVRRLLTVIEPMLVSADSYARAEGSEIISNLSKAAGLAAMVATMRPDIDHADEYVRNATSRAFAVVASALGIPAVLPFVRAVCGSKKSWQARHTGMRIVQQTAEVVGAGVLPHLRGLVGCVAAGLGDEQQRVRSASALALAALAEASAPYGIEAFDEVVKPLWQGIRQHRGRGLAAFLKAIGFVIPLMDAEYAGYYTREVLPVLVREFQAPDDAMKTVVLRVVRQCVGAGGVDAALVRAEVVPPFFAAFWVRRLALDRRSARHVIETTVELAAKVGGRDVVARLVGDLKDEAEALRRMAMQAVTQIAAAHGVLDVDGRLEEQLVDGVLYAFQEQGEADHVMLDGFGAVVGGLGERAKPYLQQITSALLWRLNNQSPATRQQAADAVARIAAVMRVCGEDELLGRIGTMLYEYLGEEYPEVLGSILGALRAVVDVIGVTDMRPPIGDLLPRLTPILKNRHEKVQENCIDLVGRIADRGAEFVPAREWMRSCFSLLDLLHAHKKAIRRAAVSTFGYIAKAIGPQDVLATLLNNLKVQDRQNRVCTTVAIAIVAETCAPFTVLPVLLNEYRVPELNVQNGVLKSVAFLFEYIGSMGRDYVNAVAPLLEDALVDRDLVHRQQAAAAISHMALGVAGTANEEPVLHLLNLLWPNVFETSPHSILAVLQGIESSRLCLGAGRIMMYTLQGLFHPARKVREVYWRIYNMMYIGAQPAMVAFYPAIDEPASSYARSELDYIL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.22
3	0.19
4	0.2
5	0.23
6	0.21
7	0.19
8	0.2
9	0.19
10	0.18
11	0.19
12	0.2
13	0.18
14	0.2
15	0.19
16	0.19
17	0.2
18	0.2
19	0.19
20	0.16
21	0.13
22	0.12
23	0.11
24	0.11
25	0.12
26	0.11
27	0.18
28	0.23
29	0.24
30	0.26
31	0.28
32	0.29
33	0.29
34	0.3
35	0.29
36	0.35
37	0.36
38	0.33
39	0.33
40	0.31
41	0.31
42	0.3
43	0.26
44	0.16
45	0.15
46	0.15
47	0.14
48	0.13
49	0.12
50	0.12
51	0.1
52	0.11
53	0.12
54	0.13
55	0.13
56	0.14
57	0.15
58	0.18
59	0.24
60	0.24
61	0.28
62	0.36
63	0.41
64	0.42
65	0.49
66	0.48
67	0.42
68	0.43
69	0.45
70	0.39
71	0.36
72	0.33
73	0.28
74	0.28
75	0.3
76	0.28
77	0.25
78	0.26
79	0.31
80	0.37
81	0.39
82	0.44
83	0.42
84	0.48
85	0.53
86	0.57
87	0.55
88	0.5
89	0.47
90	0.41
91	0.39
92	0.31
93	0.23
94	0.15
95	0.12
96	0.09
97	0.1
98	0.12
99	0.14
100	0.17
101	0.18
102	0.23
103	0.32
104	0.39
105	0.43
106	0.43
107	0.4
108	0.36
109	0.37
110	0.32
111	0.26
112	0.26
113	0.24
114	0.24
115	0.25
116	0.28
117	0.3
118	0.35
119	0.35
120	0.33
121	0.33
122	0.36
123	0.43
124	0.47
125	0.5
126	0.55
127	0.57
128	0.59
129	0.67
130	0.72
131	0.73
132	0.77
133	0.79
134	0.8
135	0.83
136	0.8
137	0.73
138	0.63
139	0.53
140	0.45
141	0.39
142	0.29
143	0.2
144	0.18
145	0.19
146	0.27
147	0.37
148	0.45
149	0.51
150	0.56
151	0.62
152	0.71
153	0.77
154	0.78
155	0.76
156	0.72
157	0.64
158	0.59
159	0.51
160	0.41
161	0.34
162	0.28
163	0.22
164	0.21
165	0.2
166	0.2
167	0.2
168	0.2
169	0.16
170	0.13
171	0.16
172	0.16
173	0.18
174	0.26
175	0.28
176	0.32
177	0.35
178	0.39
179	0.4
180	0.39
181	0.47
182	0.49
183	0.56
184	0.58
185	0.63
186	0.59
187	0.58
188	0.53
189	0.44
190	0.35
191	0.31
192	0.31
193	0.23
194	0.22
195	0.21
196	0.21
197	0.2
198	0.19
199	0.17
200	0.16
201	0.2
202	0.29
203	0.31
204	0.35
205	0.38
206	0.42
207	0.43
208	0.42
209	0.44
210	0.44
211	0.47
212	0.47
213	0.5
214	0.47
215	0.44
216	0.39
217	0.33
218	0.28
219	0.23
220	0.2
221	0.14
222	0.12
223	0.11
224	0.11
225	0.11
226	0.07
227	0.05
228	0.04
229	0.04
230	0.03
231	0.03
232	0.04
233	0.04
234	0.04
235	0.05
236	0.06
237	0.07
238	0.07
239	0.08
240	0.09
241	0.11
242	0.12
243	0.11
244	0.11
245	0.1
246	0.1
247	0.09
248	0.08
249	0.06
250	0.05
251	0.04
252	0.05
253	0.05
254	0.05
255	0.05
256	0.05
257	0.06
258	0.06
259	0.06
260	0.08
261	0.08
262	0.1
263	0.1
264	0.1
265	0.1
266	0.16
267	0.22
268	0.24
269	0.27
270	0.31
271	0.36
272	0.36
273	0.37
274	0.39
275	0.4
276	0.39
277	0.38
278	0.36
279	0.32
280	0.31
281	0.3
282	0.23
283	0.18
284	0.16
285	0.15
286	0.11
287	0.1
288	0.11
289	0.1
290	0.09
291	0.1
292	0.09
293	0.08
294	0.08
295	0.08
296	0.07
297	0.08
298	0.08
299	0.05
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.07
304	0.07
305	0.07
306	0.07
307	0.07
308	0.06
309	0.06
310	0.07
311	0.07
312	0.07
313	0.08
314	0.09
315	0.09
316	0.1
317	0.12
318	0.17
319	0.22
320	0.23
321	0.22
322	0.22
323	0.22
324	0.22
325	0.21
326	0.16
327	0.12
328	0.12
329	0.12
330	0.12
331	0.13
332	0.11
333	0.1
334	0.1
335	0.08
336	0.08
337	0.08
338	0.11
339	0.11
340	0.11
341	0.16
342	0.16
343	0.19
344	0.21
345	0.24
346	0.27
347	0.32
348	0.35
349	0.33
350	0.35
351	0.34
352	0.32
353	0.34
354	0.29
355	0.27
356	0.29
357	0.31
358	0.34
359	0.36
360	0.35
361	0.32
362	0.38
363	0.4
364	0.37
365	0.34
366	0.37
367	0.37
368	0.4
369	0.37
370	0.31
371	0.26
372	0.24
373	0.23
374	0.17
375	0.13
376	0.11
377	0.11
378	0.11
379	0.1
380	0.1
381	0.1
382	0.07
383	0.07
384	0.05
385	0.05
386	0.04
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.05
391	0.06
392	0.06
393	0.07
394	0.07
395	0.08
396	0.08
397	0.08
398	0.08
399	0.09
400	0.09
401	0.14
402	0.16
403	0.16
404	0.19
405	0.18
406	0.18
407	0.17
408	0.17
409	0.12
410	0.12
411	0.13
412	0.12
413	0.13
414	0.17
415	0.18
416	0.2
417	0.22
418	0.24
419	0.24
420	0.22
421	0.23
422	0.23
423	0.22
424	0.21
425	0.2
426	0.15
427	0.14
428	0.13
429	0.12
430	0.08
431	0.06
432	0.05
433	0.05
434	0.05
435	0.05
436	0.05
437	0.05
438	0.05
439	0.06
440	0.06
441	0.08
442	0.08
443	0.08
444	0.1
445	0.1
446	0.1
447	0.1
448	0.08
449	0.06
450	0.05
451	0.05
452	0.04
453	0.03
454	0.03
455	0.03
456	0.03
457	0.03
458	0.03
459	0.03
460	0.03
461	0.03
462	0.03
463	0.04
464	0.05
465	0.07
466	0.08
467	0.08
468	0.11
469	0.12
470	0.13
471	0.14
472	0.13
473	0.11
474	0.11
475	0.11
476	0.09
477	0.09
478	0.09
479	0.08
480	0.07
481	0.08
482	0.07
483	0.07
484	0.06
485	0.05
486	0.04
487	0.04
488	0.04
489	0.03
490	0.03
491	0.03
492	0.03
493	0.03
494	0.03
495	0.04
496	0.05
497	0.05
498	0.07
499	0.09
500	0.13
501	0.14
502	0.19
503	0.28
504	0.33
505	0.39
506	0.4
507	0.43
508	0.46
509	0.51
510	0.49
511	0.44
512	0.41
513	0.4
514	0.38
515	0.34
516	0.28
517	0.21
518	0.19
519	0.15
520	0.13
521	0.07
522	0.05
523	0.04
524	0.04
525	0.03
526	0.03
527	0.03
528	0.03
529	0.03
530	0.03
531	0.03
532	0.03
533	0.04
534	0.05
535	0.05
536	0.05
537	0.05
538	0.05
539	0.04
540	0.05
541	0.04
542	0.04
543	0.05
544	0.06
545	0.06
546	0.07
547	0.08
548	0.09
549	0.08
550	0.08
551	0.08
552	0.08
553	0.09
554	0.08
555	0.07
556	0.06
557	0.06
558	0.05
559	0.04
560	0.03
561	0.02
562	0.02
563	0.02
564	0.02
565	0.02
566	0.02
567	0.02
568	0.02
569	0.02
570	0.03
571	0.03
572	0.04
573	0.04
574	0.05
575	0.05
576	0.05
577	0.05
578	0.06
579	0.07
580	0.09
581	0.14
582	0.21
583	0.31
584	0.32
585	0.35
586	0.36
587	0.37
588	0.35
589	0.3
590	0.26
591	0.19
592	0.18
593	0.16
594	0.14
595	0.11
596	0.1
597	0.1
598	0.07
599	0.04
600	0.03
601	0.03
602	0.03
603	0.03
604	0.04
605	0.04
606	0.04
607	0.04
608	0.04
609	0.04
610	0.04
611	0.04
612	0.04
613	0.05
614	0.05
615	0.06
616	0.06
617	0.06
618	0.07
619	0.09
620	0.1
621	0.11
622	0.11
623	0.11
624	0.12
625	0.11
626	0.11
627	0.1
628	0.09
629	0.08
630	0.08
631	0.08
632	0.08
633	0.07
634	0.06
635	0.08
636	0.08
637	0.08
638	0.1
639	0.13
640	0.14
641	0.14
642	0.13
643	0.12
644	0.12
645	0.1
646	0.09
647	0.05
648	0.04
649	0.04
650	0.04
651	0.04
652	0.03
653	0.03
654	0.03
655	0.03
656	0.03
657	0.04
658	0.04
659	0.04
660	0.04
661	0.05
662	0.05
663	0.05
664	0.07
665	0.08
666	0.1
667	0.11
668	0.11
669	0.11
670	0.16
671	0.19
672	0.23
673	0.3
674	0.33
675	0.34
676	0.39
677	0.4
678	0.37
679	0.38
680	0.33
681	0.26
682	0.23
683	0.21
684	0.17
685	0.16
686	0.15
687	0.1
688	0.09
689	0.09
690	0.07
691	0.06
692	0.05
693	0.05
694	0.05
695	0.06
696	0.06
697	0.07
698	0.06
699	0.06
700	0.06
701	0.08
702	0.08
703	0.08
704	0.08
705	0.07
706	0.07
707	0.07
708	0.07
709	0.09
710	0.09
711	0.09
712	0.1
713	0.1
714	0.1
715	0.11
716	0.11
717	0.08
718	0.09
719	0.09
720	0.09
721	0.09
722	0.08
723	0.07
724	0.07
725	0.06
726	0.05
727	0.04
728	0.03
729	0.03
730	0.03
731	0.03
732	0.03
733	0.03
734	0.03
735	0.03
736	0.04
737	0.04
738	0.04
739	0.04
740	0.04
741	0.04
742	0.04
743	0.04
744	0.04
745	0.04
746	0.04
747	0.04
748	0.04
749	0.04
750	0.04
751	0.04
752	0.07
753	0.07
754	0.07
755	0.07
756	0.07
757	0.07
758	0.06
759	0.06
760	0.03
761	0.03
762	0.03
763	0.02
764	0.02
765	0.02
766	0.02
767	0.02
768	0.03
769	0.03
770	0.03
771	0.04
772	0.05
773	0.05
774	0.06
775	0.1
776	0.16
777	0.16
778	0.18
779	0.19
780	0.21
781	0.22
782	0.23
783	0.21
784	0.16
785	0.17
786	0.18
787	0.22
788	0.21
789	0.24
790	0.23
791	0.26
792	0.27
793	0.33
794	0.35
795	0.33
796	0.3
797	0.28
798	0.3
799	0.29
800	0.28
801	0.22
802	0.17
803	0.14
804	0.14
805	0.12
806	0.09
807	0.08
808	0.06
809	0.05
810	0.06
811	0.06
812	0.07
813	0.07
814	0.07
815	0.06
816	0.07
817	0.08
818	0.08
819	0.08
820	0.07
821	0.07
822	0.07
823	0.06
824	0.06
825	0.04
826	0.04
827	0.04
828	0.05
829	0.06
830	0.06
831	0.07
832	0.06
833	0.07
834	0.07
835	0.06
836	0.06
837	0.05
838	0.04
839	0.04
840	0.04
841	0.04
842	0.04
843	0.04
844	0.03
845	0.03
846	0.04
847	0.04
848	0.03
849	0.03
850	0.03
851	0.03
852	0.04
853	0.04
854	0.04
855	0.07
856	0.07
857	0.07
858	0.07
859	0.08
860	0.1
861	0.12
862	0.13
863	0.12
864	0.16
865	0.17
866	0.17
867	0.18
868	0.17
869	0.18
870	0.24
871	0.33
872	0.37
873	0.44
874	0.46
875	0.55
876	0.59
877	0.62
878	0.6
879	0.61
880	0.58
881	0.54
882	0.51
883	0.42
884	0.37
885	0.3
886	0.26
887	0.17
888	0.12
889	0.08
890	0.08
891	0.08
892	0.08
893	0.1
894	0.09
895	0.11
896	0.11
897	0.12
898	0.13
899	0.15
900	0.16
901	0.17
902	0.18
903	0.18
904	0.23
905	0.24
906	0.24
907	0.21
908	0.21
909	0.24
910	0.23
911	0.24
912	0.2
913	0.22
914	0.27
915	0.26
916	0.26
917	0.24
918	0.29
919	0.32
920	0.38
921	0.39
922	0.36
923	0.4
924	0.44
925	0.47
926	0.43
927	0.37
928	0.31
929	0.27
930	0.25
931	0.2
932	0.16
933	0.11
934	0.11
935	0.11
936	0.1
937	0.1
938	0.09
939	0.1
940	0.1
941	0.1
942	0.08
943	0.08
944	0.08
945	0.11
946	0.12
947	0.12
948	0.13
949	0.14
950	0.18
951	0.24
952	0.32
953	0.38
954	0.43
955	0.5
956	0.52
957	0.52
958	0.49
959	0.44
960	0.38
961	0.33
962	0.27
963	0.19
964	0.16
965	0.14
966	0.13
967	0.12
968	0.09
969	0.05
970	0.05
971	0.05
972	0.06
973	0.05
974	0.06
975	0.09
976	0.1
977	0.1
978	0.11
979	0.16
980	0.16
981	0.18
982	0.17
983	0.17
984	0.17
985	0.18
986	0.19
987	0.2
988	0.23
989	0.25
990	0.26
991	0.24
992	0.27
993	0.26
994	0.25
995	0.2
996	0.16
997	0.13
998	0.13
999	0.13
1000	0.09
1001	0.09
1002	0.09
1003	0.1
1004	0.1
1005	0.1
1006	0.11
1007	0.1
1008	0.1
1009	0.11
1010	0.1
1011	0.09
1012	0.1
1013	0.11
1014	0.12
1015	0.12
1016	0.12
1017	0.11
1018	0.11
1019	0.11
1020	0.11
1021	0.09
1022	0.06
1023	0.06
1024	0.08
1025	0.08
1026	0.08
1027	0.08
1028	0.1
1029	0.14
1030	0.15
1031	0.18
1032	0.17
1033	0.17
1034	0.19
1035	0.22
1036	0.22
1037	0.19
1038	0.18
1039	0.16
1040	0.15
1041	0.14
1042	0.12
1043	0.08
1044	0.06
1045	0.05
1046	0.05
1047	0.04
1048	0.04
1049	0.06
1050	0.06
1051	0.06
1052	0.06
1053	0.07
1054	0.07
1055	0.08
1056	0.1
1057	0.09
1058	0.09
1059	0.09
1060	0.15
1061	0.17
1062	0.17
1063	0.16
1064	0.14
1065	0.16
1066	0.17
1067	0.17
1068	0.11
1069	0.16
1070	0.22
1071	0.23
1072	0.23
1073	0.21
1074	0.2
1075	0.2
1076	0.23
1077	0.2
1078	0.13
1079	0.11
1080	0.12
1081	0.12
1082	0.14
1083	0.14
1084	0.12
1085	0.1
1086	0.1
1087	0.1
1088	0.11
1089	0.12
1090	0.15
1091	0.16
1092	0.15
1093	0.15
1094	0.15
1095	0.16
1096	0.14
1097	0.14
1098	0.1
1099	0.1
1100	0.09
1101	0.13
1102	0.15
1103	0.2
1104	0.27
1105	0.3
1106	0.35
1107	0.39
1108	0.43
1109	0.43
1110	0.51
1111	0.52
1112	0.5
1113	0.55
1114	0.53
1115	0.51
1116	0.48
1117	0.44
1118	0.34
1119	0.31
1120	0.26
1121	0.17
1122	0.15
1123	0.13
1124	0.12
1125	0.11
1126	0.1
1127	0.09
1128	0.09
1129	0.09
1130	0.07
1131	0.07
1132	0.09
1133	0.09
1134	0.11
1135	0.09
1136	0.09
1137	0.11
1138	0.15
1139	0.17
1140	0.15
1141	0.16
1142	0.17
1143	0.18
1144	0.19

A0A1Y1W9V1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer