FuNGI

A0A1Y1WI00

Protein Details

Accession

A0A1Y1WI00

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
470-526	GEARSKGETKEEKRLRKQQLKDAKRDRREQKKETRSVFAEKRDRRMQSKKDRAQYVI	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
472-519	ARSKGETKEEKRLRKQQLKDAKRDRREQKKETRSVFAEKRDRRMQSKK

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto 5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPKKFIDKKKATTYKLVYRSQDDPLAFEEGASDRVFVEVGKSGQPKNKGKMIDPDQTVEQSLRDLALDDIPEEDLDGPRDAGKAALYGVYLDDREYDYTKHLRVVGSGGGVMLEASGAKKERAAGIQFTEEEEEEEEEAAGPSKFAMPAELLPSQHHMDIRAEAFPTGPQPHMNSDLREALEALEDDGVEEFDDDFLGQLNADQAPEGAEMSDEYDEFQDDEDFDPEDVFAHVRRMKAQRKYDSDSECGFSDDMPEAASDFSMSSSAMFRNDKLTLLDDQFDAVEAMYEREETDSEDERYDEDGHGIVEYDSDGNAKSISTRPDFQHVMDEFLSEFELTGKRLQVKLEGGDGAGKLSTVRNAMLKEGQDADASRKELLEKGLKMIDEANERAANDDYADLDDQFQEKQRVPWDCQTILTTYSTLDNHPSTIYEKRAPRIKVSRKTGFPMVENPDEEKEEAVEEEDRKNMGEARSKGETKEEKRLRKQQLKDAKRDRREQKKETRSVFAEKRDRRMQSKKDRAQYVIHMD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.78
2	0.78
3	0.76
4	0.7
5	0.65
6	0.64
7	0.59
8	0.57
9	0.47
10	0.4
11	0.35
12	0.35
13	0.29
14	0.25
15	0.22
16	0.17
17	0.19
18	0.17
19	0.15
20	0.1
21	0.11
22	0.11
23	0.09
24	0.1
25	0.12
26	0.13
27	0.19
28	0.23
29	0.27
30	0.34
31	0.43
32	0.49
33	0.52
34	0.56
35	0.54
36	0.55
37	0.6
38	0.62
39	0.61
40	0.55
41	0.52
42	0.48
43	0.46
44	0.43
45	0.33
46	0.26
47	0.18
48	0.16
49	0.13
50	0.11
51	0.11
52	0.1
53	0.12
54	0.12
55	0.11
56	0.11
57	0.11
58	0.11
59	0.11
60	0.1
61	0.09
62	0.11
63	0.12
64	0.11
65	0.12
66	0.12
67	0.12
68	0.11
69	0.1
70	0.09
71	0.08
72	0.09
73	0.08
74	0.08
75	0.08
76	0.09
77	0.09
78	0.08
79	0.09
80	0.1
81	0.12
82	0.14
83	0.14
84	0.18
85	0.23
86	0.24
87	0.25
88	0.26
89	0.25
90	0.24
91	0.25
92	0.21
93	0.17
94	0.16
95	0.13
96	0.1
97	0.09
98	0.08
99	0.05
100	0.04
101	0.03
102	0.04
103	0.06
104	0.07
105	0.08
106	0.09
107	0.1
108	0.13
109	0.18
110	0.2
111	0.21
112	0.22
113	0.25
114	0.24
115	0.24
116	0.22
117	0.18
118	0.16
119	0.14
120	0.13
121	0.1
122	0.1
123	0.09
124	0.08
125	0.08
126	0.08
127	0.07
128	0.06
129	0.06
130	0.07
131	0.07
132	0.07
133	0.08
134	0.08
135	0.09
136	0.13
137	0.15
138	0.15
139	0.15
140	0.19
141	0.19
142	0.19
143	0.19
144	0.17
145	0.16
146	0.18
147	0.19
148	0.16
149	0.15
150	0.14
151	0.14
152	0.12
153	0.15
154	0.14
155	0.13
156	0.14
157	0.15
158	0.18
159	0.24
160	0.26
161	0.23
162	0.24
163	0.27
164	0.25
165	0.23
166	0.21
167	0.15
168	0.14
169	0.12
170	0.1
171	0.06
172	0.06
173	0.06
174	0.06
175	0.05
176	0.04
177	0.05
178	0.04
179	0.04
180	0.04
181	0.04
182	0.04
183	0.04
184	0.04
185	0.04
186	0.04
187	0.05
188	0.05
189	0.05
190	0.05
191	0.05
192	0.06
193	0.06
194	0.06
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.06
199	0.06
200	0.05
201	0.05
202	0.06
203	0.06
204	0.06
205	0.06
206	0.05
207	0.06
208	0.07
209	0.07
210	0.08
211	0.07
212	0.07
213	0.07
214	0.07
215	0.07
216	0.06
217	0.06
218	0.1
219	0.13
220	0.13
221	0.19
222	0.27
223	0.34
224	0.42
225	0.51
226	0.54
227	0.58
228	0.63
229	0.64
230	0.59
231	0.55
232	0.47
233	0.41
234	0.33
235	0.28
236	0.22
237	0.15
238	0.13
239	0.1
240	0.08
241	0.07
242	0.06
243	0.05
244	0.05
245	0.05
246	0.04
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.04
251	0.04
252	0.05
253	0.06
254	0.08
255	0.09
256	0.09
257	0.12
258	0.12
259	0.13
260	0.12
261	0.14
262	0.14
263	0.14
264	0.14
265	0.12
266	0.11
267	0.1
268	0.1
269	0.08
270	0.05
271	0.05
272	0.04
273	0.05
274	0.05
275	0.05
276	0.05
277	0.05
278	0.06
279	0.06
280	0.09
281	0.11
282	0.12
283	0.13
284	0.13
285	0.13
286	0.15
287	0.15
288	0.11
289	0.09
290	0.09
291	0.08
292	0.08
293	0.08
294	0.06
295	0.05
296	0.05
297	0.04
298	0.04
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.05
304	0.06
305	0.09
306	0.13
307	0.16
308	0.19
309	0.2
310	0.26
311	0.27
312	0.26
313	0.31
314	0.28
315	0.28
316	0.24
317	0.23
318	0.18
319	0.17
320	0.17
321	0.08
322	0.08
323	0.06
324	0.07
325	0.08
326	0.1
327	0.11
328	0.14
329	0.16
330	0.16
331	0.18
332	0.19
333	0.19
334	0.19
335	0.17
336	0.15
337	0.15
338	0.14
339	0.11
340	0.08
341	0.07
342	0.06
343	0.06
344	0.08
345	0.08
346	0.09
347	0.11
348	0.12
349	0.14
350	0.17
351	0.17
352	0.17
353	0.18
354	0.18
355	0.16
356	0.16
357	0.19
358	0.19
359	0.2
360	0.18
361	0.16
362	0.17
363	0.18
364	0.22
365	0.24
366	0.21
367	0.23
368	0.25
369	0.24
370	0.24
371	0.24
372	0.22
373	0.2
374	0.2
375	0.2
376	0.19
377	0.19
378	0.21
379	0.2
380	0.16
381	0.13
382	0.13
383	0.1
384	0.1
385	0.11
386	0.09
387	0.09
388	0.1
389	0.1
390	0.11
391	0.15
392	0.17
393	0.17
394	0.21
395	0.27
396	0.31
397	0.36
398	0.42
399	0.44
400	0.41
401	0.41
402	0.4
403	0.34
404	0.31
405	0.27
406	0.2
407	0.15
408	0.17
409	0.16
410	0.15
411	0.18
412	0.17
413	0.16
414	0.17
415	0.17
416	0.18
417	0.22
418	0.26
419	0.29
420	0.33
421	0.39
422	0.47
423	0.48
424	0.53
425	0.6
426	0.65
427	0.68
428	0.72
429	0.74
430	0.71
431	0.74
432	0.71
433	0.64
434	0.56
435	0.54
436	0.51
437	0.47
438	0.44
439	0.42
440	0.37
441	0.36
442	0.33
443	0.26
444	0.2
445	0.16
446	0.15
447	0.14
448	0.15
449	0.16
450	0.17
451	0.19
452	0.19
453	0.18
454	0.19
455	0.22
456	0.23
457	0.3
458	0.3
459	0.35
460	0.42
461	0.43
462	0.42
463	0.47
464	0.52
465	0.49
466	0.57
467	0.6
468	0.63
469	0.72
470	0.82
471	0.83
472	0.83
473	0.85
474	0.85
475	0.87
476	0.86
477	0.87
478	0.88
479	0.87
480	0.86
481	0.89
482	0.89
483	0.89
484	0.9
485	0.89
486	0.89
487	0.89
488	0.9
489	0.85
490	0.84
491	0.77
492	0.77
493	0.74
494	0.73
495	0.73
496	0.7
497	0.73
498	0.74
499	0.76
500	0.75
501	0.78
502	0.79
503	0.79
504	0.84
505	0.85
506	0.85
507	0.85
508	0.79
509	0.75

A0A1Y1WI00

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer