FuNGI

A0A1Y1W7E0

Protein Details

Accession

A0A1Y1W7E0

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
51-77	DYGYSEAKSSKPKKKRQRTNNFLDIEA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
60-66	SKPKKKR
583-591	RGRGGSRGG

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005824 KOW IPR041973 KOW_Spt5_1 IPR041975 KOW_Spt5_2 IPR041978 KOW_Spt5_5 IPR036735 NGN_dom_sf IPR014722 Rib_L2_dom2 IPR039659 SPT5 IPR022581 Spt5_N
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF11942 Spt5_N
CDD	cd06081 KOW_Spt5_1 cd06082 KOW_Spt5_2 cd06085 KOW_Spt5_5

Amino Acid Sequences

MSDTVEGLFDDSDDGQYSDDNQARLGTRRKNQDYSDESDNGHGYHDDEEDDYGYSEAKSSKPKKKRQRTNNFLDIEASVETDEDEDDDDGAELGDFIEDNEAELASAEKDALRHRSSMRPAVFQDDDVMDADAMEARLRERYSGYATSSRREAPPVESDWMPQRLLLPGINDPHLWMARCIPGKERDALFAAARRIFNWRLSKGIPGVQAWKLTLVPIDDMVDVVRVKSHAPKINPSSWVRVRRGNYAGDLAQVVSVLESSDSVEVRLIPRLDYDAEARSSRSGVRPPQRLDPRGLSSRQNEILWRNDRFINGYLHKDMRLTSLQVENVQPTLEEIARFAAGEADDGDEQAAIAALASQAAAASTMDGARDLLPGEQVEVVEGDLAGVVGVVRGIEGDDTVKIVPELGGLMRNGRASVMSFPARQLRKRFRAGDHYAVVTMYADDLRISSDIGSSTGGNKQGAMVGLDVHDLVFLEGNTVGVVLKVDRDTLTILDERNDTRTVGQQSVRPARSGFERTGVDFNGNPMRRGDVGTVLQITRFVTFVLARDQASSGGVFTVRTRQLEALDPYATRNNRSSNDRGRGRGGSRGGRVGNLRGGRDPLIGKNVTANRGPYKGYMGIVKDATDMMCRVELHTNARIVNIEKEKLVVKLPSGEAIPALEFNNAPMGGGGSGGGYRGTSGSGSNGGGYRSGGASSGNDAGGWGAPPRSTYSDTRQTPVATPGSSTYGSWDTGATNSSAAGGSGGWGAASTPSGNSGWNVGSTPSGNGGWDAAASTPSGNSGWDAAPTPAASKWNTDATPSGSWGTPAPATPGGIPQTPGGPFPQTPGAGTPASRSYYDAPTPAASGSVNANQDGGFFSWATAGAVVQLLGQRGTVVDVSSERHTATIKLETGVMQSIDQTSAAHFNPRPSRPQKGDRVIVMRGAHKGSVGKMVGKDGNDGFFQQDGAESWIVEPQRNMVPYNHDY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.1
3	0.11
4	0.14
5	0.19
6	0.22
7	0.21
8	0.21
9	0.24
10	0.27
11	0.34
12	0.39
13	0.41
14	0.46
15	0.57
16	0.64
17	0.68
18	0.68
19	0.71
20	0.68
21	0.65
22	0.64
23	0.56
24	0.49
25	0.45
26	0.42
27	0.32
28	0.28
29	0.23
30	0.16
31	0.16
32	0.16
33	0.14
34	0.14
35	0.14
36	0.14
37	0.14
38	0.13
39	0.11
40	0.11
41	0.1
42	0.12
43	0.13
44	0.16
45	0.26
46	0.35
47	0.45
48	0.55
49	0.66
50	0.75
51	0.84
52	0.91
53	0.92
54	0.94
55	0.94
56	0.93
57	0.92
58	0.83
59	0.73
60	0.64
61	0.53
62	0.43
63	0.33
64	0.23
65	0.14
66	0.11
67	0.1
68	0.08
69	0.08
70	0.06
71	0.07
72	0.07
73	0.07
74	0.08
75	0.08
76	0.07
77	0.07
78	0.06
79	0.05
80	0.05
81	0.05
82	0.04
83	0.04
84	0.06
85	0.06
86	0.07
87	0.07
88	0.07
89	0.07
90	0.07
91	0.08
92	0.06
93	0.07
94	0.06
95	0.07
96	0.09
97	0.14
98	0.21
99	0.22
100	0.26
101	0.3
102	0.38
103	0.44
104	0.51
105	0.5
106	0.48
107	0.48
108	0.51
109	0.49
110	0.4
111	0.37
112	0.28
113	0.26
114	0.21
115	0.2
116	0.12
117	0.11
118	0.11
119	0.09
120	0.08
121	0.08
122	0.07
123	0.07
124	0.12
125	0.12
126	0.14
127	0.14
128	0.17
129	0.22
130	0.25
131	0.28
132	0.32
133	0.34
134	0.36
135	0.38
136	0.38
137	0.34
138	0.35
139	0.33
140	0.29
141	0.33
142	0.33
143	0.33
144	0.31
145	0.31
146	0.35
147	0.35
148	0.31
149	0.26
150	0.23
151	0.21
152	0.22
153	0.21
154	0.18
155	0.19
156	0.22
157	0.23
158	0.21
159	0.2
160	0.22
161	0.23
162	0.21
163	0.18
164	0.18
165	0.23
166	0.27
167	0.28
168	0.29
169	0.33
170	0.36
171	0.4
172	0.38
173	0.35
174	0.33
175	0.34
176	0.31
177	0.28
178	0.29
179	0.27
180	0.27
181	0.24
182	0.28
183	0.28
184	0.34
185	0.37
186	0.34
187	0.35
188	0.36
189	0.39
190	0.36
191	0.38
192	0.33
193	0.28
194	0.31
195	0.29
196	0.29
197	0.25
198	0.24
199	0.19
200	0.17
201	0.17
202	0.13
203	0.11
204	0.1
205	0.12
206	0.1
207	0.1
208	0.1
209	0.1
210	0.09
211	0.08
212	0.09
213	0.08
214	0.1
215	0.16
216	0.24
217	0.28
218	0.31
219	0.4
220	0.45
221	0.5
222	0.55
223	0.51
224	0.53
225	0.54
226	0.59
227	0.54
228	0.55
229	0.53
230	0.54
231	0.54
232	0.48
233	0.42
234	0.37
235	0.34
236	0.27
237	0.24
238	0.17
239	0.14
240	0.11
241	0.09
242	0.05
243	0.05
244	0.04
245	0.04
246	0.04
247	0.05
248	0.06
249	0.06
250	0.07
251	0.07
252	0.08
253	0.09
254	0.13
255	0.13
256	0.12
257	0.12
258	0.14
259	0.15
260	0.15
261	0.16
262	0.15
263	0.17
264	0.17
265	0.17
266	0.16
267	0.16
268	0.17
269	0.19
270	0.22
271	0.29
272	0.37
273	0.44
274	0.47
275	0.55
276	0.62
277	0.61
278	0.6
279	0.56
280	0.54
281	0.52
282	0.52
283	0.47
284	0.42
285	0.45
286	0.42
287	0.38
288	0.34
289	0.32
290	0.38
291	0.38
292	0.36
293	0.33
294	0.32
295	0.32
296	0.32
297	0.31
298	0.29
299	0.26
300	0.29
301	0.3
302	0.29
303	0.29
304	0.27
305	0.24
306	0.22
307	0.21
308	0.18
309	0.17
310	0.19
311	0.19
312	0.21
313	0.21
314	0.18
315	0.16
316	0.15
317	0.12
318	0.09
319	0.1
320	0.09
321	0.08
322	0.08
323	0.08
324	0.09
325	0.09
326	0.08
327	0.07
328	0.06
329	0.07
330	0.07
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.07
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.04
339	0.02
340	0.02
341	0.02
342	0.02
343	0.02
344	0.02
345	0.02
346	0.02
347	0.02
348	0.03
349	0.03
350	0.03
351	0.03
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.06
361	0.06
362	0.07
363	0.07
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.05
368	0.04
369	0.04
370	0.03
371	0.03
372	0.03
373	0.02
374	0.02
375	0.02
376	0.02
377	0.02
378	0.02
379	0.02
380	0.02
381	0.02
382	0.02
383	0.03
384	0.03
385	0.04
386	0.05
387	0.05
388	0.05
389	0.05
390	0.05
391	0.05
392	0.04
393	0.05
394	0.04
395	0.06
396	0.06
397	0.07
398	0.08
399	0.08
400	0.08
401	0.08
402	0.08
403	0.07
404	0.09
405	0.11
406	0.12
407	0.13
408	0.14
409	0.21
410	0.24
411	0.28
412	0.35
413	0.41
414	0.46
415	0.53
416	0.56
417	0.54
418	0.6
419	0.61
420	0.58
421	0.5
422	0.43
423	0.36
424	0.31
425	0.27
426	0.17
427	0.12
428	0.06
429	0.04
430	0.04
431	0.03
432	0.04
433	0.04
434	0.04
435	0.05
436	0.04
437	0.05
438	0.05
439	0.06
440	0.06
441	0.06
442	0.07
443	0.09
444	0.1
445	0.1
446	0.09
447	0.09
448	0.09
449	0.1
450	0.09
451	0.07
452	0.05
453	0.06
454	0.06
455	0.06
456	0.04
457	0.04
458	0.03
459	0.03
460	0.03
461	0.03
462	0.04
463	0.04
464	0.04
465	0.04
466	0.04
467	0.04
468	0.03
469	0.03
470	0.03
471	0.04
472	0.04
473	0.05
474	0.05
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.08
479	0.09
480	0.09
481	0.09
482	0.11
483	0.11
484	0.12
485	0.13
486	0.11
487	0.11
488	0.16
489	0.17
490	0.19
491	0.2
492	0.2
493	0.26
494	0.33
495	0.33
496	0.29
497	0.26
498	0.25
499	0.28
500	0.29
501	0.23
502	0.19
503	0.2
504	0.21
505	0.22
506	0.21
507	0.18
508	0.14
509	0.16
510	0.2
511	0.19
512	0.18
513	0.17
514	0.18
515	0.17
516	0.19
517	0.17
518	0.13
519	0.13
520	0.13
521	0.14
522	0.12
523	0.11
524	0.11
525	0.11
526	0.08
527	0.07
528	0.06
529	0.06
530	0.07
531	0.08
532	0.1
533	0.11
534	0.11
535	0.12
536	0.12
537	0.11
538	0.11
539	0.1
540	0.07
541	0.06
542	0.06
543	0.05
544	0.06
545	0.11
546	0.13
547	0.13
548	0.14
549	0.15
550	0.16
551	0.21
552	0.22
553	0.18
554	0.18
555	0.17
556	0.18
557	0.23
558	0.22
559	0.19
560	0.21
561	0.23
562	0.26
563	0.31
564	0.37
565	0.4
566	0.48
567	0.5
568	0.49
569	0.48
570	0.49
571	0.45
572	0.44
573	0.4
574	0.35
575	0.33
576	0.35
577	0.32
578	0.3
579	0.3
580	0.25
581	0.26
582	0.23
583	0.23
584	0.2
585	0.21
586	0.2
587	0.2
588	0.2
589	0.16
590	0.19
591	0.18
592	0.17
593	0.21
594	0.23
595	0.23
596	0.23
597	0.25
598	0.22
599	0.24
600	0.25
601	0.19
602	0.2
603	0.19
604	0.19
605	0.19
606	0.18
607	0.19
608	0.18
609	0.17
610	0.14
611	0.13
612	0.13
613	0.1
614	0.09
615	0.07
616	0.09
617	0.09
618	0.1
619	0.14
620	0.15
621	0.18
622	0.21
623	0.22
624	0.21
625	0.21
626	0.21
627	0.19
628	0.24
629	0.23
630	0.21
631	0.19
632	0.2
633	0.21
634	0.2
635	0.21
636	0.15
637	0.13
638	0.16
639	0.16
640	0.16
641	0.15
642	0.14
643	0.12
644	0.11
645	0.11
646	0.08
647	0.08
648	0.08
649	0.07
650	0.08
651	0.1
652	0.09
653	0.09
654	0.07
655	0.07
656	0.06
657	0.07
658	0.06
659	0.04
660	0.04
661	0.04
662	0.04
663	0.04
664	0.04
665	0.04
666	0.05
667	0.05
668	0.05
669	0.06
670	0.08
671	0.08
672	0.09
673	0.1
674	0.1
675	0.1
676	0.1
677	0.09
678	0.08
679	0.08
680	0.07
681	0.07
682	0.07
683	0.09
684	0.1
685	0.09
686	0.08
687	0.08
688	0.08
689	0.08
690	0.08
691	0.07
692	0.06
693	0.06
694	0.08
695	0.11
696	0.14
697	0.18
698	0.22
699	0.29
700	0.38
701	0.4
702	0.41
703	0.4
704	0.38
705	0.36
706	0.37
707	0.32
708	0.22
709	0.21
710	0.21
711	0.22
712	0.21
713	0.19
714	0.17
715	0.16
716	0.16
717	0.16
718	0.15
719	0.12
720	0.12
721	0.13
722	0.1
723	0.08
724	0.08
725	0.08
726	0.07
727	0.07
728	0.06
729	0.05
730	0.05
731	0.05
732	0.05
733	0.04
734	0.04
735	0.04
736	0.04
737	0.05
738	0.05
739	0.05
740	0.07
741	0.08
742	0.08
743	0.09
744	0.1
745	0.1
746	0.11
747	0.11
748	0.1
749	0.11
750	0.11
751	0.11
752	0.12
753	0.11
754	0.11
755	0.11
756	0.1
757	0.09
758	0.08
759	0.08
760	0.06
761	0.06
762	0.06
763	0.06
764	0.06
765	0.07
766	0.07
767	0.07
768	0.07
769	0.09
770	0.09
771	0.1
772	0.11
773	0.11
774	0.12
775	0.12
776	0.13
777	0.12
778	0.15
779	0.15
780	0.16
781	0.19
782	0.24
783	0.24
784	0.24
785	0.25
786	0.26
787	0.27
788	0.26
789	0.25
790	0.19
791	0.2
792	0.19
793	0.19
794	0.15
795	0.14
796	0.16
797	0.15
798	0.16
799	0.16
800	0.2
801	0.2
802	0.2
803	0.21
804	0.18
805	0.2
806	0.19
807	0.2
808	0.18
809	0.18
810	0.17
811	0.2
812	0.24
813	0.21
814	0.22
815	0.22
816	0.24
817	0.21
818	0.22
819	0.22
820	0.2
821	0.22
822	0.22
823	0.23
824	0.23
825	0.28
826	0.3
827	0.28
828	0.26
829	0.25
830	0.25
831	0.22
832	0.19
833	0.13
834	0.12
835	0.14
836	0.17
837	0.17
838	0.17
839	0.17
840	0.16
841	0.16
842	0.17
843	0.14
844	0.11
845	0.1
846	0.1
847	0.1
848	0.11
849	0.1
850	0.09
851	0.07
852	0.06
853	0.07
854	0.06
855	0.07
856	0.08
857	0.09
858	0.09
859	0.09
860	0.08
861	0.08
862	0.1
863	0.09
864	0.08
865	0.09
866	0.1
867	0.13
868	0.16
869	0.17
870	0.16
871	0.16
872	0.17
873	0.17
874	0.2
875	0.23
876	0.22
877	0.21
878	0.22
879	0.21
880	0.22
881	0.23
882	0.19
883	0.13
884	0.13
885	0.14
886	0.13
887	0.13
888	0.11
889	0.11
890	0.15
891	0.15
892	0.21
893	0.22
894	0.3
895	0.39
896	0.43
897	0.51
898	0.53
899	0.62
900	0.64
901	0.72
902	0.74
903	0.74
904	0.77
905	0.74
906	0.73
907	0.65
908	0.62
909	0.56
910	0.48
911	0.43
912	0.39
913	0.32
914	0.29
915	0.29
916	0.25
917	0.29
918	0.28
919	0.28
920	0.27
921	0.32
922	0.34
923	0.32
924	0.35
925	0.29
926	0.3
927	0.26
928	0.26
929	0.22
930	0.19
931	0.18
932	0.14
933	0.13
934	0.12
935	0.15
936	0.15
937	0.13
938	0.13
939	0.17
940	0.18
941	0.19
942	0.18
943	0.18
944	0.24
945	0.25
946	0.27
947	0.26

A0A1Y1W7E0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer