Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1W2M6

Protein Details
Accession A0A1Y1W2M6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-50AAAAASKKERRQKRQVVFKRAEQYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
20-40KTAAEKAAAAAASKKERRQKR
Subcellular Location(s) cyto 10, mito 9, nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036919  L30_ferredoxin-like_sf  
IPR016082  Ribosomal_L30_ferredoxin-like  
IPR012988  Ribosomal_L30_N  
IPR039699  Ribosomal_L7/L30  
IPR005998  Ribosomal_L7_euk  
IPR035808  Ribosomal_L7_euk_arc  
IPR003618  TFIIS_cen_dom  
Gene Ontology GO:0022625  C:cytosolic large ribosomal subunit  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF00327  Ribosomal_L30  
PF08079  Ribosomal_L30_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51321  TFIIS_CENTRAL  
CDD cd01657  Ribosomal_L7_archeal_euk  
Amino Acid Sequences MSSKVLAPETLLKQRKNAEKTAAEKAAAAAASKKERRQKRQVVFKRAEQYVKEYQQRERAEIRLRRQAKQNGNFYVPAQAKLAFVVRTKGINKIPPKARKILQLLRLLQINNGVFVRLTFATTQMLQVITPYAAWGTPNLKSVKELIYKRGYAKVNKQRVPITDNSVIEQNLGKYGIICVEDLVHEIFTVGPNFKVANNFLWPFKLSNPTGGWSGRKVRHFIEGGDAGNREDAINALIRRMN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.6
3 0.59
4 0.58
5 0.57
6 0.57
7 0.61
8 0.64
9 0.59
10 0.5
11 0.44
12 0.39
13 0.34
14 0.26
15 0.22
16 0.16
17 0.18
18 0.27
19 0.31
20 0.37
21 0.44
22 0.54
23 0.63
24 0.71
25 0.76
26 0.78
27 0.85
28 0.88
29 0.89
30 0.85
31 0.83
32 0.8
33 0.74
34 0.68
35 0.59
36 0.55
37 0.53
38 0.55
39 0.54
40 0.49
41 0.5
42 0.54
43 0.54
44 0.52
45 0.47
46 0.45
47 0.48
48 0.52
49 0.53
50 0.55
51 0.57
52 0.56
53 0.62
54 0.65
55 0.65
56 0.67
57 0.68
58 0.62
59 0.61
60 0.57
61 0.48
62 0.47
63 0.38
64 0.31
65 0.24
66 0.21
67 0.18
68 0.18
69 0.19
70 0.13
71 0.13
72 0.13
73 0.13
74 0.16
75 0.17
76 0.22
77 0.23
78 0.28
79 0.31
80 0.38
81 0.45
82 0.49
83 0.52
84 0.52
85 0.52
86 0.52
87 0.56
88 0.55
89 0.53
90 0.52
91 0.5
92 0.46
93 0.46
94 0.38
95 0.31
96 0.28
97 0.2
98 0.14
99 0.13
100 0.11
101 0.09
102 0.08
103 0.1
104 0.07
105 0.08
106 0.07
107 0.07
108 0.08
109 0.09
110 0.09
111 0.07
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.05
117 0.05
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.06
123 0.07
124 0.08
125 0.13
126 0.14
127 0.14
128 0.15
129 0.17
130 0.21
131 0.26
132 0.26
133 0.28
134 0.31
135 0.33
136 0.34
137 0.4
138 0.39
139 0.36
140 0.46
141 0.5
142 0.55
143 0.57
144 0.59
145 0.56
146 0.54
147 0.54
148 0.47
149 0.44
150 0.4
151 0.36
152 0.33
153 0.32
154 0.29
155 0.24
156 0.22
157 0.15
158 0.11
159 0.11
160 0.1
161 0.08
162 0.08
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.09
170 0.09
171 0.07
172 0.06
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.1
180 0.11
181 0.12
182 0.15
183 0.15
184 0.17
185 0.22
186 0.24
187 0.24
188 0.25
189 0.26
190 0.24
191 0.25
192 0.3
193 0.25
194 0.28
195 0.29
196 0.29
197 0.31
198 0.32
199 0.32
200 0.3
201 0.38
202 0.39
203 0.42
204 0.43
205 0.41
206 0.47
207 0.46
208 0.41
209 0.4
210 0.37
211 0.34
212 0.33
213 0.32
214 0.25
215 0.24
216 0.23
217 0.15
218 0.12
219 0.11
220 0.09
221 0.15
222 0.14