FuNGI

A0A1Y1WB78

Protein Details

Accession

A0A1Y1WB78

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
8-35	LRAAPGTRQLQKKKNTETQQVQQRRRDA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 9, mito 9, mito_nucl 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039693 Rtr1/RPAP2 IPR007308 Rtr1/RPAP2_dom IPR038534 Rtr1/RPAP2_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0046872 F:metal ion binding GO:0017018 F:myosin phosphatase activity GO:0043175 F:RNA polymerase core enzyme binding GO:0008420 F:RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat phosphatase activity
PROSITE	View protein in PROSITE PS51479 ZF_RTR1

Amino Acid Sequences

MSTSPRPLRAAPGTRQLQKKKNTETQQVQQRRRDAVKQSMRTKQQYDRLTLSWQEKLLSPVSIVQLQQAAQYMTADDYLSVQYHISLSRRKLFDVTEQKEYCSNRCMVGSRFFRQQLSNEPLYMRAPGKLEVSVMPVEDEAVEAIELDRQLEQRVLAGTGERELVDWYMSSLFAKMKIPEAVAHANNPLTIVEREGGAAAAMEVSDGMARLQFADVEGFEPAVGCSSDQDGRGACQARERQKVQIPGGAQCAAQGAAQPARSALERVARFDTGSEPHTESEAASDVVAPWDSESDDGVGYIASDDESSQSGSSSDDDMFGGMIGAAGSRSGPSLSLFGRLWTLVDRMVTPQTRAFLRDLQTAQSALPLISSAAEYNSAPGDKSMATRHSLLAGSVERELLDVQQELGVELGLGREMHLLVSSLALGQNTVVFARGELRLFVLALVFALARVLQGLAGALSGDVVVGRLEYVLHQAKTERSELEMVARRFHEAY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.65
2	0.73
3	0.74
4	0.74
5	0.75
6	0.79
7	0.79
8	0.81
9	0.82
10	0.83
11	0.82
12	0.83
13	0.84
14	0.85
15	0.84
16	0.82
17	0.79
18	0.77
19	0.74
20	0.72
21	0.7
22	0.7
23	0.72
24	0.74
25	0.75
26	0.77
27	0.79
28	0.78
29	0.77
30	0.74
31	0.73
32	0.69
33	0.67
34	0.63
35	0.56
36	0.54
37	0.54
38	0.5
39	0.45
40	0.39
41	0.35
42	0.31
43	0.32
44	0.29
45	0.23
46	0.2
47	0.19
48	0.21
49	0.22
50	0.2
51	0.19
52	0.19
53	0.19
54	0.19
55	0.17
56	0.15
57	0.12
58	0.13
59	0.12
60	0.1
61	0.1
62	0.09
63	0.07
64	0.08
65	0.09
66	0.1
67	0.09
68	0.09
69	0.09
70	0.1
71	0.13
72	0.16
73	0.21
74	0.25
75	0.33
76	0.35
77	0.36
78	0.37
79	0.37
80	0.43
81	0.47
82	0.47
83	0.48
84	0.48
85	0.47
86	0.5
87	0.5
88	0.43
89	0.37
90	0.34
91	0.25
92	0.27
93	0.3
94	0.28
95	0.35
96	0.39
97	0.37
98	0.43
99	0.44
100	0.44
101	0.42
102	0.41
103	0.41
104	0.42
105	0.4
106	0.34
107	0.32
108	0.32
109	0.3
110	0.3
111	0.22
112	0.17
113	0.17
114	0.18
115	0.19
116	0.17
117	0.18
118	0.15
119	0.17
120	0.15
121	0.13
122	0.12
123	0.1
124	0.1
125	0.09
126	0.08
127	0.05
128	0.04
129	0.04
130	0.04
131	0.04
132	0.05
133	0.05
134	0.06
135	0.07
136	0.07
137	0.09
138	0.09
139	0.09
140	0.09
141	0.1
142	0.1
143	0.09
144	0.09
145	0.09
146	0.09
147	0.09
148	0.08
149	0.07
150	0.08
151	0.08
152	0.07
153	0.07
154	0.07
155	0.06
156	0.07
157	0.06
158	0.07
159	0.08
160	0.09
161	0.11
162	0.11
163	0.13
164	0.14
165	0.15
166	0.15
167	0.18
168	0.21
169	0.2
170	0.2
171	0.19
172	0.18
173	0.17
174	0.16
175	0.12
176	0.1
177	0.09
178	0.09
179	0.08
180	0.08
181	0.08
182	0.08
183	0.08
184	0.05
185	0.05
186	0.03
187	0.03
188	0.03
189	0.02
190	0.02
191	0.02
192	0.02
193	0.02
194	0.03
195	0.03
196	0.03
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.04
201	0.05
202	0.05
203	0.05
204	0.05
205	0.05
206	0.05
207	0.05
208	0.04
209	0.05
210	0.04
211	0.04
212	0.04
213	0.06
214	0.08
215	0.08
216	0.09
217	0.09
218	0.09
219	0.13
220	0.15
221	0.13
222	0.17
223	0.23
224	0.29
225	0.36
226	0.36
227	0.38
228	0.41
229	0.46
230	0.42
231	0.39
232	0.32
233	0.28
234	0.28
235	0.24
236	0.19
237	0.13
238	0.13
239	0.1
240	0.09
241	0.08
242	0.07
243	0.08
244	0.08
245	0.08
246	0.08
247	0.09
248	0.09
249	0.09
250	0.09
251	0.14
252	0.14
253	0.17
254	0.19
255	0.18
256	0.18
257	0.18
258	0.19
259	0.14
260	0.15
261	0.14
262	0.14
263	0.14
264	0.14
265	0.14
266	0.12
267	0.11
268	0.1
269	0.08
270	0.07
271	0.06
272	0.06
273	0.06
274	0.06
275	0.05
276	0.04
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.05
281	0.05
282	0.05
283	0.05
284	0.05
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.03
290	0.03
291	0.03
292	0.04
293	0.05
294	0.06
295	0.06
296	0.06
297	0.06
298	0.07
299	0.08
300	0.08
301	0.08
302	0.08
303	0.08
304	0.08
305	0.08
306	0.07
307	0.06
308	0.04
309	0.04
310	0.03
311	0.03
312	0.03
313	0.03
314	0.03
315	0.03
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.05
320	0.08
321	0.08
322	0.12
323	0.12
324	0.12
325	0.13
326	0.13
327	0.13
328	0.12
329	0.12
330	0.09
331	0.1
332	0.1
333	0.12
334	0.17
335	0.18
336	0.18
337	0.19
338	0.21
339	0.21
340	0.23
341	0.23
342	0.23
343	0.25
344	0.29
345	0.28
346	0.28
347	0.28
348	0.26
349	0.24
350	0.2
351	0.17
352	0.11
353	0.1
354	0.08
355	0.06
356	0.06
357	0.07
358	0.06
359	0.06
360	0.07
361	0.07
362	0.08
363	0.09
364	0.09
365	0.09
366	0.09
367	0.1
368	0.1
369	0.12
370	0.16
371	0.17
372	0.19
373	0.21
374	0.21
375	0.22
376	0.22
377	0.19
378	0.19
379	0.17
380	0.16
381	0.15
382	0.15
383	0.12
384	0.12
385	0.13
386	0.1
387	0.1
388	0.08
389	0.08
390	0.09
391	0.09
392	0.09
393	0.08
394	0.07
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.05
400	0.05
401	0.06
402	0.06
403	0.07
404	0.07
405	0.07
406	0.07
407	0.07
408	0.07
409	0.07
410	0.08
411	0.07
412	0.07
413	0.06
414	0.07
415	0.07
416	0.07
417	0.08
418	0.07
419	0.07
420	0.11
421	0.13
422	0.13
423	0.12
424	0.14
425	0.13
426	0.13
427	0.13
428	0.1
429	0.08
430	0.07
431	0.07
432	0.06
433	0.05
434	0.05
435	0.05
436	0.04
437	0.05
438	0.05
439	0.04
440	0.04
441	0.05
442	0.04
443	0.05
444	0.05
445	0.04
446	0.04
447	0.04
448	0.04
449	0.03
450	0.04
451	0.04
452	0.04
453	0.04
454	0.04
455	0.05
456	0.06
457	0.13
458	0.19
459	0.2
460	0.21
461	0.24
462	0.29
463	0.32
464	0.35
465	0.28
466	0.26
467	0.28
468	0.27
469	0.34
470	0.38
471	0.35
472	0.38
473	0.37

A0A1Y1WB78

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer