FuNGI

A0A1Y1W1S8

Protein Details

Accession

A0A1Y1W1S8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
26-58	VWRWIWFIARCGRRRKRKAKPVADRREERRALR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
38-56	RRRKRKAKPVADRREERRA

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 10.5, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR033871 LSm5 IPR038765 Papain-like_cys_pep_sf IPR001394 Peptidase_C19_UCH IPR018200 USP_CS IPR028889 USP_dom
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0004843 F:cysteine-type deubiquitinase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0006397 P:mRNA processing GO:0016579 P:protein deubiquitination GO:0008380 P:RNA splicing GO:0006511 P:ubiquitin-dependent protein catabolic process
Pfam	View protein in Pfam PF00443 UCH
PROSITE	View protein in PROSITE PS00972 USP_1 PS00973 USP_2 PS50235 USP_3
CDD	cd01732 LSm5

Amino Acid Sequences

MQHIQRPPAMAYRRRADGKYSRWVQVWRWIWFIARCGRRRKRKAKPVADRREERRALRQQLREEAEEWLSQCIDRIVELGDDLVGSDIDDYEDDDFEGEEGSGEDSQDDADSRQVVYGLVNTGNSCFFNSVLQALASAEYLQNYLAAILERMDEVNDRCERPLVSMPLTEALWETLTDLNTVVNRDSAFQPYAVMAALGTRGLNDREQQDAQEAFQLISTAMSEEQRVFASLRVPSLFNLDLVHMLAQTDRAKSHVLAVPRGLESVGTKGLARVRAIPETGQPGGLPAEGGQSLTLGRRDVLQNPFTGLMASRLTCAQCGYTEAVRHFAFDNVSLTLPLLASCTLDQALRDYISIEELSGVQCRKCTLHRTLQELITEVRAASAWLANNPVYNTASANGESVESIGAESEMCAKAQRQAARAEAVWRRVVLNDSDNERFSDSDSEDSEFNTNNQESGTSVPNARLGFSLGSGLSRDEYPINPASQRVDRTHNLPPPYMLNVPGIIQRLRSEATDVAKALRTDVQMELPGVKLRRAYSPLSTKQIAFAKLPPCLCLHPVAYLDFAPYTTNGHLKVDPMASIIDESLTTSELSAQGVFASQQQRRSKDVADAISQGISPQTGYRLQAVVVHIGSHSYGHFITYRRKPRPPTRSGINTPRHASNPVALPMSAHVPIDKRAALSSSPPASDMSPAHDGLRKRRIVGGSSSMATASMSSISSVNDFALPAPMQQEWYLISDEDVQAVTLAERIEPTQVVGYAGTPSILPSLTNLRNLAKRSNHTQHNGGGDKMHPPGDHDGDGGLAFVRDAELTASAASSIHQVPQLIDKCIGSRIWVMMKSEKEFNVTEYEQVGDVKEVNHLDQILLNGNNICMLVPGGE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.61
3	0.61
4	0.62
5	0.61
6	0.64
7	0.64
8	0.6
9	0.59
10	0.62
11	0.57
12	0.57
13	0.57
14	0.5
15	0.48
16	0.44
17	0.44
18	0.42
19	0.45
20	0.45
21	0.46
22	0.5
23	0.58
24	0.68
25	0.74
26	0.83
27	0.87
28	0.89
29	0.91
30	0.94
31	0.95
32	0.95
33	0.95
34	0.95
35	0.95
36	0.93
37	0.88
38	0.88
39	0.83
40	0.77
41	0.76
42	0.75
43	0.75
44	0.75
45	0.76
46	0.72
47	0.75
48	0.75
49	0.67
50	0.58
51	0.52
52	0.45
53	0.39
54	0.33
55	0.26
56	0.21
57	0.18
58	0.18
59	0.15
60	0.13
61	0.11
62	0.11
63	0.1
64	0.1
65	0.1
66	0.09
67	0.08
68	0.07
69	0.07
70	0.07
71	0.05
72	0.05
73	0.05
74	0.05
75	0.05
76	0.06
77	0.07
78	0.07
79	0.08
80	0.08
81	0.08
82	0.08
83	0.07
84	0.08
85	0.06
86	0.05
87	0.06
88	0.08
89	0.08
90	0.07
91	0.07
92	0.07
93	0.07
94	0.08
95	0.08
96	0.07
97	0.09
98	0.1
99	0.1
100	0.11
101	0.11
102	0.1
103	0.1
104	0.11
105	0.11
106	0.11
107	0.12
108	0.12
109	0.13
110	0.14
111	0.14
112	0.13
113	0.12
114	0.11
115	0.12
116	0.12
117	0.12
118	0.11
119	0.11
120	0.1
121	0.09
122	0.09
123	0.08
124	0.08
125	0.08
126	0.08
127	0.08
128	0.08
129	0.07
130	0.07
131	0.06
132	0.06
133	0.06
134	0.06
135	0.06
136	0.07
137	0.07
138	0.07
139	0.08
140	0.1
141	0.11
142	0.18
143	0.21
144	0.22
145	0.22
146	0.25
147	0.24
148	0.26
149	0.31
150	0.29
151	0.28
152	0.27
153	0.27
154	0.27
155	0.26
156	0.22
157	0.16
158	0.12
159	0.1
160	0.09
161	0.1
162	0.1
163	0.11
164	0.11
165	0.1
166	0.11
167	0.12
168	0.13
169	0.12
170	0.11
171	0.11
172	0.13
173	0.15
174	0.18
175	0.17
176	0.16
177	0.16
178	0.14
179	0.15
180	0.12
181	0.1
182	0.06
183	0.05
184	0.06
185	0.05
186	0.05
187	0.05
188	0.07
189	0.09
190	0.11
191	0.14
192	0.15
193	0.2
194	0.21
195	0.21
196	0.24
197	0.23
198	0.21
199	0.22
200	0.2
201	0.15
202	0.15
203	0.15
204	0.1
205	0.1
206	0.09
207	0.06
208	0.07
209	0.07
210	0.08
211	0.08
212	0.09
213	0.09
214	0.11
215	0.1
216	0.1
217	0.14
218	0.14
219	0.16
220	0.16
221	0.16
222	0.15
223	0.19
224	0.18
225	0.15
226	0.15
227	0.13
228	0.12
229	0.12
230	0.12
231	0.07
232	0.07
233	0.07
234	0.1
235	0.11
236	0.12
237	0.12
238	0.13
239	0.15
240	0.15
241	0.2
242	0.19
243	0.2
244	0.21
245	0.22
246	0.22
247	0.21
248	0.21
249	0.15
250	0.13
251	0.11
252	0.11
253	0.11
254	0.09
255	0.09
256	0.11
257	0.14
258	0.16
259	0.16
260	0.18
261	0.2
262	0.22
263	0.23
264	0.22
265	0.21
266	0.23
267	0.22
268	0.18
269	0.15
270	0.14
271	0.13
272	0.12
273	0.1
274	0.06
275	0.07
276	0.07
277	0.07
278	0.06
279	0.06
280	0.06
281	0.08
282	0.09
283	0.07
284	0.07
285	0.1
286	0.12
287	0.18
288	0.22
289	0.22
290	0.22
291	0.23
292	0.23
293	0.21
294	0.19
295	0.14
296	0.1
297	0.1
298	0.1
299	0.09
300	0.11
301	0.11
302	0.11
303	0.11
304	0.09
305	0.08
306	0.11
307	0.12
308	0.13
309	0.15
310	0.15
311	0.2
312	0.19
313	0.19
314	0.18
315	0.16
316	0.15
317	0.13
318	0.14
319	0.11
320	0.11
321	0.1
322	0.09
323	0.08
324	0.08
325	0.07
326	0.06
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.06
331	0.06
332	0.07
333	0.07
334	0.08
335	0.09
336	0.09
337	0.09
338	0.08
339	0.08
340	0.09
341	0.09
342	0.07
343	0.06
344	0.06
345	0.07
346	0.09
347	0.1
348	0.09
349	0.09
350	0.1
351	0.12
352	0.15
353	0.21
354	0.25
355	0.33
356	0.37
357	0.43
358	0.45
359	0.45
360	0.42
361	0.37
362	0.31
363	0.23
364	0.18
365	0.12
366	0.09
367	0.07
368	0.06
369	0.05
370	0.07
371	0.06
372	0.06
373	0.08
374	0.08
375	0.09
376	0.1
377	0.11
378	0.1
379	0.1
380	0.1
381	0.09
382	0.1
383	0.09
384	0.09
385	0.07
386	0.07
387	0.06
388	0.06
389	0.05
390	0.04
391	0.04
392	0.03
393	0.03
394	0.03
395	0.03
396	0.06
397	0.06
398	0.06
399	0.07
400	0.07
401	0.12
402	0.16
403	0.19
404	0.19
405	0.2
406	0.22
407	0.23
408	0.23
409	0.24
410	0.23
411	0.22
412	0.21
413	0.19
414	0.18
415	0.17
416	0.18
417	0.14
418	0.13
419	0.13
420	0.16
421	0.17
422	0.18
423	0.17
424	0.17
425	0.15
426	0.14
427	0.14
428	0.11
429	0.11
430	0.12
431	0.12
432	0.12
433	0.12
434	0.12
435	0.1
436	0.1
437	0.11
438	0.1
439	0.09
440	0.09
441	0.08
442	0.08
443	0.1
444	0.11
445	0.09
446	0.1
447	0.1
448	0.13
449	0.13
450	0.13
451	0.11
452	0.1
453	0.09
454	0.09
455	0.09
456	0.06
457	0.07
458	0.06
459	0.06
460	0.06
461	0.06
462	0.07
463	0.07
464	0.07
465	0.11
466	0.12
467	0.13
468	0.12
469	0.13
470	0.15
471	0.17
472	0.21
473	0.2
474	0.24
475	0.25
476	0.29
477	0.35
478	0.37
479	0.35
480	0.32
481	0.31
482	0.27
483	0.29
484	0.25
485	0.19
486	0.15
487	0.13
488	0.14
489	0.15
490	0.15
491	0.12
492	0.12
493	0.11
494	0.12
495	0.13
496	0.12
497	0.12
498	0.13
499	0.15
500	0.16
501	0.15
502	0.15
503	0.16
504	0.16
505	0.15
506	0.15
507	0.13
508	0.14
509	0.14
510	0.14
511	0.12
512	0.13
513	0.12
514	0.1
515	0.12
516	0.11
517	0.12
518	0.13
519	0.13
520	0.17
521	0.2
522	0.21
523	0.25
524	0.33
525	0.36
526	0.39
527	0.39
528	0.35
529	0.37
530	0.39
531	0.34
532	0.27
533	0.28
534	0.26
535	0.29
536	0.29
537	0.25
538	0.23
539	0.22
540	0.22
541	0.19
542	0.17
543	0.16
544	0.17
545	0.16
546	0.15
547	0.14
548	0.14
549	0.11
550	0.1
551	0.08
552	0.08
553	0.09
554	0.09
555	0.11
556	0.11
557	0.13
558	0.14
559	0.14
560	0.16
561	0.14
562	0.13
563	0.12
564	0.11
565	0.09
566	0.09
567	0.08
568	0.06
569	0.05
570	0.05
571	0.05
572	0.06
573	0.05
574	0.05
575	0.06
576	0.06
577	0.07
578	0.07
579	0.06
580	0.05
581	0.06
582	0.06
583	0.09
584	0.16
585	0.17
586	0.26
587	0.32
588	0.35
589	0.38
590	0.41
591	0.38
592	0.37
593	0.41
594	0.35
595	0.32
596	0.3
597	0.27
598	0.24
599	0.22
600	0.17
601	0.12
602	0.09
603	0.07
604	0.06
605	0.08
606	0.09
607	0.11
608	0.13
609	0.13
610	0.13
611	0.16
612	0.16
613	0.16
614	0.14
615	0.14
616	0.12
617	0.12
618	0.11
619	0.09
620	0.08
621	0.07
622	0.07
623	0.08
624	0.11
625	0.13
626	0.22
627	0.31
628	0.42
629	0.47
630	0.54
631	0.63
632	0.71
633	0.78
634	0.77
635	0.74
636	0.73
637	0.76
638	0.77
639	0.77
640	0.75
641	0.7
642	0.66
643	0.63
644	0.56
645	0.49
646	0.42
647	0.36
648	0.32
649	0.28
650	0.26
651	0.22
652	0.21
653	0.19
654	0.2
655	0.17
656	0.13
657	0.12
658	0.12
659	0.15
660	0.17
661	0.17
662	0.15
663	0.15
664	0.17
665	0.16
666	0.18
667	0.22
668	0.22
669	0.21
670	0.21
671	0.21
672	0.2
673	0.22
674	0.2
675	0.19
676	0.19
677	0.2
678	0.21
679	0.24
680	0.26
681	0.32
682	0.4
683	0.37
684	0.35
685	0.4
686	0.41
687	0.4
688	0.42
689	0.4
690	0.34
691	0.33
692	0.31
693	0.26
694	0.23
695	0.19
696	0.14
697	0.09
698	0.07
699	0.06
700	0.07
701	0.07
702	0.08
703	0.09
704	0.09
705	0.09
706	0.09
707	0.09
708	0.08
709	0.11
710	0.11
711	0.11
712	0.12
713	0.12
714	0.13
715	0.13
716	0.14
717	0.12
718	0.13
719	0.14
720	0.12
721	0.13
722	0.14
723	0.14
724	0.14
725	0.12
726	0.1
727	0.09
728	0.09
729	0.08
730	0.07
731	0.07
732	0.07
733	0.08
734	0.08
735	0.1
736	0.1
737	0.11
738	0.11
739	0.11
740	0.11
741	0.11
742	0.11
743	0.1
744	0.1
745	0.09
746	0.08
747	0.08
748	0.08
749	0.08
750	0.07
751	0.09
752	0.17
753	0.2
754	0.23
755	0.25
756	0.29
757	0.34
758	0.37
759	0.43
760	0.42
761	0.45
762	0.52
763	0.59
764	0.62
765	0.62
766	0.64
767	0.6
768	0.61
769	0.58
770	0.49
771	0.42
772	0.35
773	0.34
774	0.32
775	0.3
776	0.22
777	0.23
778	0.29
779	0.31
780	0.3
781	0.27
782	0.24
783	0.21
784	0.21
785	0.18
786	0.11
787	0.07
788	0.06
789	0.05
790	0.06
791	0.05
792	0.05
793	0.06
794	0.06
795	0.07
796	0.07
797	0.07
798	0.07
799	0.07
800	0.07
801	0.1
802	0.1
803	0.11
804	0.13
805	0.14
806	0.15
807	0.24
808	0.27
809	0.27
810	0.28
811	0.26
812	0.26
813	0.28
814	0.27
815	0.21
816	0.2
817	0.22
818	0.26
819	0.28
820	0.3
821	0.34
822	0.39
823	0.4
824	0.43
825	0.4
826	0.38
827	0.36
828	0.34
829	0.35
830	0.31
831	0.29
832	0.25
833	0.25
834	0.21
835	0.21
836	0.2
837	0.14
838	0.14
839	0.13
840	0.17
841	0.17
842	0.17
843	0.19
844	0.18
845	0.17
846	0.18
847	0.19
848	0.2
849	0.19
850	0.2
851	0.18
852	0.17
853	0.17
854	0.16
855	0.14
856	0.09

A0A1Y1W1S8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer