Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VY56

Protein Details
Accession A0A1Y1VY56    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
417-441MVARNRKNPNAVKRTGNRKHKRQNFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
421-438NRKNPNAVKRTGNRKHKR
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 13, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039907  NOB1  
IPR017117  Nob1_euk  
IPR036283  NOB1_Zf-like_sf  
IPR014881  NOB1_Zn-bd  
IPR033411  Ribonuclease_PIN  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004521  F:RNA endonuclease activity  
GO:0000469  P:cleavage involved in rRNA processing  
GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF08772  NOB1_Zn_bind  
PF17146  PIN_6  
CDD cd09876  PIN_Nob1-like  
Amino Acid Sequences MSSAADTVETTTPTQAPSAIADQQPAVLTYEEKLQLNNNKPVVTLVVDTNPFIKGLPLDHIANKFVTIPEVLGELRSRASKDRYQSLDMKYGIDVIEPDAESMNAVVAFARKTGDYASLAMADLKIIALGFMLEKKANGMRRLRLEPVGNQPNIADRKLMKNAIEQLEQTIEDLSVEPKDEETVGIAEEGIVLTSAAKDEFEKAPRKDDFFNGEWITPNNVKLHQAASAMGMKNAMSDRPKAILKVACVTSDFAMQNVILKMGINLVTPDGIAVRRLRTWVLRCHACFELTGDMNKQFCPACGHPTLKRCSVTTSTNGQLQVHLKKDYRYNLRGTVYSMPKPHGGKHTIRDIITREDDKAYQSAVRYKNIKESKANSGLGGVNSLLDPDFIPDLLVGNSLADSKGYGVATDARGMPMVARNRKNPNAVKRTGNRKHKRQNF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.16
3 0.15
4 0.17
5 0.2
6 0.23
7 0.23
8 0.23
9 0.23
10 0.23
11 0.22
12 0.2
13 0.18
14 0.13
15 0.13
16 0.12
17 0.19
18 0.21
19 0.2
20 0.21
21 0.26
22 0.35
23 0.42
24 0.49
25 0.45
26 0.42
27 0.42
28 0.42
29 0.37
30 0.3
31 0.24
32 0.18
33 0.2
34 0.21
35 0.21
36 0.21
37 0.19
38 0.17
39 0.15
40 0.14
41 0.1
42 0.11
43 0.15
44 0.17
45 0.2
46 0.24
47 0.26
48 0.26
49 0.25
50 0.24
51 0.21
52 0.18
53 0.17
54 0.13
55 0.11
56 0.1
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.12
63 0.14
64 0.16
65 0.19
66 0.26
67 0.3
68 0.35
69 0.43
70 0.46
71 0.5
72 0.54
73 0.53
74 0.54
75 0.49
76 0.45
77 0.36
78 0.32
79 0.27
80 0.2
81 0.16
82 0.1
83 0.12
84 0.11
85 0.11
86 0.1
87 0.1
88 0.09
89 0.09
90 0.08
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.06
95 0.06
96 0.07
97 0.08
98 0.07
99 0.08
100 0.09
101 0.11
102 0.11
103 0.12
104 0.12
105 0.12
106 0.12
107 0.12
108 0.11
109 0.08
110 0.07
111 0.05
112 0.04
113 0.04
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.04
118 0.05
119 0.06
120 0.07
121 0.07
122 0.09
123 0.14
124 0.18
125 0.24
126 0.29
127 0.33
128 0.39
129 0.43
130 0.44
131 0.43
132 0.41
133 0.39
134 0.44
135 0.46
136 0.39
137 0.36
138 0.33
139 0.36
140 0.35
141 0.31
142 0.24
143 0.18
144 0.24
145 0.28
146 0.3
147 0.24
148 0.26
149 0.32
150 0.33
151 0.32
152 0.27
153 0.24
154 0.22
155 0.21
156 0.17
157 0.12
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.06
163 0.07
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.03
178 0.03
179 0.02
180 0.02
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.04
186 0.07
187 0.1
188 0.15
189 0.22
190 0.23
191 0.29
192 0.31
193 0.33
194 0.32
195 0.33
196 0.33
197 0.27
198 0.31
199 0.26
200 0.25
201 0.23
202 0.22
203 0.22
204 0.17
205 0.17
206 0.14
207 0.14
208 0.14
209 0.15
210 0.15
211 0.12
212 0.12
213 0.11
214 0.11
215 0.15
216 0.13
217 0.13
218 0.12
219 0.1
220 0.11
221 0.11
222 0.12
223 0.09
224 0.1
225 0.12
226 0.14
227 0.15
228 0.15
229 0.18
230 0.18
231 0.18
232 0.21
233 0.2
234 0.18
235 0.18
236 0.18
237 0.15
238 0.17
239 0.15
240 0.11
241 0.11
242 0.1
243 0.12
244 0.11
245 0.1
246 0.06
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.08
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.05
258 0.05
259 0.07
260 0.08
261 0.1
262 0.11
263 0.12
264 0.14
265 0.19
266 0.23
267 0.29
268 0.34
269 0.39
270 0.38
271 0.41
272 0.41
273 0.35
274 0.31
275 0.26
276 0.23
277 0.18
278 0.19
279 0.17
280 0.19
281 0.19
282 0.18
283 0.18
284 0.14
285 0.14
286 0.2
287 0.19
288 0.22
289 0.27
290 0.31
291 0.35
292 0.42
293 0.45
294 0.44
295 0.44
296 0.39
297 0.4
298 0.4
299 0.38
300 0.36
301 0.36
302 0.33
303 0.35
304 0.36
305 0.3
306 0.29
307 0.31
308 0.32
309 0.3
310 0.32
311 0.31
312 0.33
313 0.39
314 0.44
315 0.47
316 0.47
317 0.48
318 0.49
319 0.5
320 0.48
321 0.45
322 0.44
323 0.41
324 0.41
325 0.39
326 0.35
327 0.38
328 0.39
329 0.4
330 0.39
331 0.4
332 0.42
333 0.45
334 0.51
335 0.51
336 0.5
337 0.49
338 0.44
339 0.44
340 0.44
341 0.4
342 0.33
343 0.31
344 0.31
345 0.3
346 0.28
347 0.23
348 0.2
349 0.21
350 0.27
351 0.29
352 0.34
353 0.37
354 0.37
355 0.46
356 0.5
357 0.53
358 0.52
359 0.53
360 0.56
361 0.59
362 0.58
363 0.48
364 0.44
365 0.41
366 0.33
367 0.3
368 0.2
369 0.13
370 0.12
371 0.13
372 0.09
373 0.07
374 0.07
375 0.08
376 0.09
377 0.08
378 0.09
379 0.08
380 0.09
381 0.09
382 0.1
383 0.08
384 0.07
385 0.08
386 0.08
387 0.08
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.11
392 0.1
393 0.1
394 0.11
395 0.15
396 0.16
397 0.19
398 0.19
399 0.16
400 0.16
401 0.16
402 0.17
403 0.2
404 0.28
405 0.35
406 0.4
407 0.48
408 0.57
409 0.64
410 0.71
411 0.74
412 0.75
413 0.75
414 0.75
415 0.77
416 0.77
417 0.82
418 0.82
419 0.84
420 0.84
421 0.85