FuNGI

A0A1Y1W5N4

Protein Details

Accession

A0A1Y1W5N4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
64-90	LQWAKPGKTKSFKSKIHRLRKLRILVE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
70-84	GKTKSFKSKIHRLRK

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 8, nucl 7.5, cyto 7.5, pero 5, mito 3, extr 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR040662 Tfb2_C IPR004598 TFIIH_p52/Tfb2
Gene Ontology	GO:0000439 C:transcription factor TFIIH core complex GO:0001671 F:ATPase activator activity GO:0006289 P:nucleotide-excision repair
Pfam	View protein in Pfam PF03849 Tfb2 PF18307 Tfb2_C

Amino Acid Sequences

MGSEGAFKSTIAEYLEDLPAQFCQQLFTKPAACLAIFRLLSTLGKHIIMSMLYLDAPIELTDVLQWAKPGKTKSFKSKIHRLRKLRILVENSGKVSLDPMFRQELRNALTGGGDFGSFGIPATTRDLRITEAWLEKYANEKWEAILHFMVGQNAEMPQPSDSVLHILKMSRLMERREGDMRITNSGFQFLLQDVSSQVWTVLLQYLRLAEDQNMDVVEVLNFLFQLVGLQLGIAYRTDRFSQSQRKMLSELKDFGLMYQQGDVFYPTQLVTSLTSAMNAEHTSNNGQVSTTEMSADGYVILETNCRVYAYTSSPLQIAILNLFVHLVSRFPNFVTGVITRDSIRRALSNGITADQIVTYMTVYAHPHMRNQMPVLPITVTDQIRLWENERNRLKPTASYFYKDFHQRQDFERVYKYAEDLGAILWCNIEKRQIVVTPAAHVVIMQYVRGHRKPEQRG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.2
3	0.18
4	0.17
5	0.16
6	0.15
7	0.16
8	0.15
9	0.12
10	0.13
11	0.16
12	0.2
13	0.22
14	0.26
15	0.28
16	0.26
17	0.3
18	0.29
19	0.27
20	0.24
21	0.24
22	0.28
23	0.24
24	0.24
25	0.22
26	0.2
27	0.22
28	0.22
29	0.22
30	0.16
31	0.17
32	0.16
33	0.16
34	0.16
35	0.14
36	0.13
37	0.11
38	0.09
39	0.09
40	0.09
41	0.08
42	0.06
43	0.07
44	0.06
45	0.06
46	0.05
47	0.05
48	0.06
49	0.07
50	0.08
51	0.08
52	0.1
53	0.12
54	0.15
55	0.2
56	0.25
57	0.32
58	0.41
59	0.48
60	0.57
61	0.64
62	0.7
63	0.75
64	0.81
65	0.83
66	0.85
67	0.87
68	0.85
69	0.84
70	0.85
71	0.84
72	0.79
73	0.77
74	0.71
75	0.68
76	0.67
77	0.61
78	0.53
79	0.45
80	0.39
81	0.31
82	0.27
83	0.23
84	0.19
85	0.16
86	0.18
87	0.22
88	0.24
89	0.26
90	0.26
91	0.28
92	0.27
93	0.29
94	0.26
95	0.21
96	0.2
97	0.18
98	0.17
99	0.12
100	0.09
101	0.06
102	0.06
103	0.06
104	0.05
105	0.05
106	0.05
107	0.05
108	0.06
109	0.12
110	0.14
111	0.14
112	0.16
113	0.16
114	0.18
115	0.19
116	0.2
117	0.19
118	0.21
119	0.21
120	0.22
121	0.21
122	0.2
123	0.23
124	0.23
125	0.21
126	0.19
127	0.18
128	0.17
129	0.22
130	0.22
131	0.2
132	0.17
133	0.15
134	0.15
135	0.15
136	0.15
137	0.1
138	0.09
139	0.08
140	0.08
141	0.08
142	0.07
143	0.07
144	0.07
145	0.07
146	0.08
147	0.08
148	0.08
149	0.11
150	0.11
151	0.11
152	0.11
153	0.11
154	0.11
155	0.14
156	0.15
157	0.16
158	0.2
159	0.21
160	0.27
161	0.28
162	0.31
163	0.31
164	0.31
165	0.28
166	0.3
167	0.29
168	0.26
169	0.25
170	0.23
171	0.2
172	0.2
173	0.18
174	0.12
175	0.12
176	0.09
177	0.09
178	0.07
179	0.08
180	0.07
181	0.08
182	0.08
183	0.07
184	0.06
185	0.05
186	0.05
187	0.05
188	0.08
189	0.07
190	0.07
191	0.07
192	0.08
193	0.08
194	0.09
195	0.09
196	0.07
197	0.08
198	0.08
199	0.08
200	0.08
201	0.07
202	0.07
203	0.06
204	0.05
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.03
209	0.03
210	0.03
211	0.03
212	0.03
213	0.03
214	0.03
215	0.02
216	0.02
217	0.03
218	0.03
219	0.03
220	0.03
221	0.04
222	0.04
223	0.06
224	0.07
225	0.09
226	0.12
227	0.18
228	0.28
229	0.32
230	0.38
231	0.38
232	0.38
233	0.4
234	0.42
235	0.4
236	0.33
237	0.31
238	0.25
239	0.26
240	0.24
241	0.21
242	0.2
243	0.16
244	0.13
245	0.12
246	0.11
247	0.1
248	0.1
249	0.11
250	0.08
251	0.08
252	0.08
253	0.07
254	0.07
255	0.07
256	0.08
257	0.07
258	0.07
259	0.09
260	0.08
261	0.09
262	0.09
263	0.08
264	0.09
265	0.08
266	0.09
267	0.08
268	0.09
269	0.1
270	0.11
271	0.12
272	0.11
273	0.1
274	0.09
275	0.12
276	0.12
277	0.11
278	0.1
279	0.09
280	0.1
281	0.1
282	0.1
283	0.06
284	0.05
285	0.04
286	0.05
287	0.04
288	0.05
289	0.05
290	0.06
291	0.06
292	0.06
293	0.06
294	0.08
295	0.11
296	0.15
297	0.18
298	0.18
299	0.18
300	0.18
301	0.18
302	0.17
303	0.14
304	0.11
305	0.08
306	0.09
307	0.08
308	0.08
309	0.08
310	0.07
311	0.07
312	0.06
313	0.07
314	0.07
315	0.09
316	0.09
317	0.09
318	0.12
319	0.12
320	0.12
321	0.15
322	0.14
323	0.15
324	0.15
325	0.16
326	0.15
327	0.16
328	0.18
329	0.16
330	0.17
331	0.16
332	0.17
333	0.21
334	0.21
335	0.23
336	0.22
337	0.21
338	0.2
339	0.19
340	0.17
341	0.12
342	0.11
343	0.06
344	0.06
345	0.05
346	0.05
347	0.06
348	0.07
349	0.09
350	0.11
351	0.18
352	0.19
353	0.22
354	0.28
355	0.3
356	0.31
357	0.32
358	0.34
359	0.3
360	0.29
361	0.28
362	0.22
363	0.2
364	0.2
365	0.24
366	0.19
367	0.19
368	0.19
369	0.18
370	0.22
371	0.24
372	0.23
373	0.25
374	0.28
375	0.38
376	0.44
377	0.46
378	0.47
379	0.49
380	0.49
381	0.47
382	0.5
383	0.5
384	0.47
385	0.49
386	0.46
387	0.44
388	0.49
389	0.52
390	0.49
391	0.49
392	0.53
393	0.51
394	0.53
395	0.61
396	0.59
397	0.54
398	0.55
399	0.47
400	0.42
401	0.4
402	0.38
403	0.31
404	0.27
405	0.23
406	0.18
407	0.17
408	0.15
409	0.14
410	0.13
411	0.1
412	0.1
413	0.11
414	0.12
415	0.17
416	0.16
417	0.18
418	0.23
419	0.26
420	0.28
421	0.32
422	0.32
423	0.3
424	0.31
425	0.28
426	0.23
427	0.2
428	0.17
429	0.16
430	0.15
431	0.13
432	0.15
433	0.21
434	0.3
435	0.33
436	0.38
437	0.42

A0A1Y1W5N4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer