Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VZS2

Protein Details
Accession A0A1Y1VZS2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
77-128SYDYERRRDYRRSSRHDRSRDQSYRRRSRSGERHRYRSRRSRSRSRSREVVPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
84-128RDYRRSSRHDRSRDQSYRRRSRSGERHRYRSRRSRSRSRSREVVP
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12230  RRM1_U2AF65  
cd12232  RRM3_U2AF65  
Amino Acid Sequences MADSSEHAGGSKHDSIPRVGDSTEERNEISPRDRRREPGKSSETMADSFLKNMGQTLMRKGAEARDMPRRSSQRGDSYDYERRRDYRRSSRHDRSRDQSYRRRSRSGERHRYRSRRSRSRSRSREVVPLHLRPKKLSAWDQAPAGFEHVSAAEAKASGVFPPPGQAVGSRNVASFNPSVLFEHTHREENARFRPSSRGEREFPSTASRQARRIYVGNIPLAIDEDAIAGFFNGLLVQLGIAPAHELPVVNIQISHDKNYAFVELRDAEQATQAMGMDGVVLQGQKLKIRRPKDYIPPEGQAEPPRPALGLPGVLSASVPDSPNKIYVGGLAHVSHRGAGHGAAAPREALPSASTPTPASPTLPARASMAWRWVTAAWLVQRASIGARSAHAPPQPVQLDYAPPVMPPAAPDAHPTQIIQLLNMVTAAELADPDEYADIVEDPRPGRARVSARSLSSFAAVDEATTALRALAGRKFADRTVVASYMADEDFDTKNY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.32
3 0.36
4 0.37
5 0.33
6 0.28
7 0.26
8 0.28
9 0.33
10 0.35
11 0.33
12 0.31
13 0.31
14 0.34
15 0.35
16 0.37
17 0.38
18 0.43
19 0.5
20 0.54
21 0.59
22 0.67
23 0.72
24 0.72
25 0.75
26 0.73
27 0.67
28 0.66
29 0.64
30 0.57
31 0.48
32 0.42
33 0.35
34 0.29
35 0.26
36 0.24
37 0.19
38 0.15
39 0.16
40 0.16
41 0.17
42 0.19
43 0.24
44 0.3
45 0.29
46 0.3
47 0.31
48 0.33
49 0.35
50 0.37
51 0.35
52 0.38
53 0.41
54 0.43
55 0.51
56 0.52
57 0.5
58 0.54
59 0.56
60 0.56
61 0.58
62 0.62
63 0.57
64 0.59
65 0.63
66 0.61
67 0.58
68 0.53
69 0.53
70 0.53
71 0.57
72 0.6
73 0.61
74 0.67
75 0.72
76 0.77
77 0.83
78 0.87
79 0.88
80 0.86
81 0.82
82 0.82
83 0.82
84 0.81
85 0.8
86 0.8
87 0.82
88 0.79
89 0.79
90 0.73
91 0.75
92 0.76
93 0.78
94 0.79
95 0.77
96 0.82
97 0.85
98 0.9
99 0.89
100 0.89
101 0.88
102 0.88
103 0.88
104 0.89
105 0.89
106 0.91
107 0.9
108 0.87
109 0.85
110 0.77
111 0.77
112 0.68
113 0.68
114 0.63
115 0.61
116 0.63
117 0.59
118 0.56
119 0.49
120 0.51
121 0.45
122 0.45
123 0.44
124 0.43
125 0.43
126 0.44
127 0.43
128 0.4
129 0.37
130 0.3
131 0.26
132 0.18
133 0.13
134 0.11
135 0.1
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.08
146 0.09
147 0.08
148 0.1
149 0.11
150 0.1
151 0.1
152 0.11
153 0.12
154 0.15
155 0.18
156 0.16
157 0.16
158 0.17
159 0.17
160 0.18
161 0.16
162 0.13
163 0.11
164 0.11
165 0.12
166 0.12
167 0.15
168 0.13
169 0.19
170 0.2
171 0.22
172 0.22
173 0.25
174 0.27
175 0.31
176 0.37
177 0.35
178 0.34
179 0.33
180 0.39
181 0.41
182 0.47
183 0.47
184 0.46
185 0.44
186 0.47
187 0.51
188 0.45
189 0.41
190 0.36
191 0.3
192 0.31
193 0.35
194 0.34
195 0.33
196 0.34
197 0.35
198 0.33
199 0.33
200 0.3
201 0.27
202 0.28
203 0.24
204 0.22
205 0.2
206 0.17
207 0.16
208 0.13
209 0.08
210 0.05
211 0.05
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.03
216 0.03
217 0.02
218 0.02
219 0.02
220 0.02
221 0.02
222 0.02
223 0.02
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.07
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.14
240 0.14
241 0.16
242 0.15
243 0.15
244 0.16
245 0.16
246 0.17
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.13
253 0.12
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.07
258 0.06
259 0.06
260 0.05
261 0.04
262 0.04
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.06
270 0.06
271 0.1
272 0.13
273 0.2
274 0.26
275 0.32
276 0.39
277 0.43
278 0.49
279 0.56
280 0.62
281 0.62
282 0.59
283 0.57
284 0.53
285 0.48
286 0.44
287 0.37
288 0.32
289 0.27
290 0.23
291 0.21
292 0.19
293 0.17
294 0.15
295 0.12
296 0.11
297 0.09
298 0.09
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.1
308 0.11
309 0.12
310 0.13
311 0.12
312 0.1
313 0.12
314 0.13
315 0.11
316 0.12
317 0.11
318 0.11
319 0.12
320 0.12
321 0.11
322 0.09
323 0.09
324 0.08
325 0.08
326 0.09
327 0.1
328 0.11
329 0.11
330 0.11
331 0.11
332 0.1
333 0.11
334 0.09
335 0.07
336 0.07
337 0.09
338 0.11
339 0.11
340 0.12
341 0.12
342 0.13
343 0.16
344 0.15
345 0.15
346 0.17
347 0.19
348 0.22
349 0.23
350 0.22
351 0.21
352 0.22
353 0.24
354 0.22
355 0.25
356 0.23
357 0.22
358 0.22
359 0.21
360 0.2
361 0.18
362 0.19
363 0.15
364 0.17
365 0.17
366 0.16
367 0.16
368 0.16
369 0.16
370 0.14
371 0.14
372 0.1
373 0.11
374 0.13
375 0.16
376 0.2
377 0.21
378 0.22
379 0.22
380 0.3
381 0.31
382 0.29
383 0.29
384 0.25
385 0.27
386 0.26
387 0.27
388 0.19
389 0.17
390 0.18
391 0.16
392 0.14
393 0.12
394 0.15
395 0.14
396 0.14
397 0.18
398 0.2
399 0.22
400 0.23
401 0.22
402 0.19
403 0.22
404 0.21
405 0.18
406 0.17
407 0.15
408 0.14
409 0.14
410 0.12
411 0.07
412 0.07
413 0.07
414 0.04
415 0.04
416 0.05
417 0.05
418 0.05
419 0.06
420 0.06
421 0.05
422 0.05
423 0.06
424 0.06
425 0.07
426 0.09
427 0.12
428 0.13
429 0.19
430 0.22
431 0.22
432 0.24
433 0.3
434 0.35
435 0.38
436 0.46
437 0.46
438 0.46
439 0.49
440 0.48
441 0.41
442 0.37
443 0.31
444 0.22
445 0.19
446 0.16
447 0.12
448 0.11
449 0.1
450 0.08
451 0.08
452 0.08
453 0.06
454 0.07
455 0.08
456 0.11
457 0.14
458 0.19
459 0.2
460 0.24
461 0.27
462 0.26
463 0.32
464 0.3
465 0.29
466 0.3
467 0.29
468 0.26
469 0.24
470 0.24
471 0.21
472 0.2
473 0.17
474 0.12
475 0.14