Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1W8T6

Protein Details
Accession A0A1Y1W8T6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
231-253FDPSARTSSKRNLRKRGNDTLGLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
303-312GKKGHKGHKR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013907  Sds3  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
Pfam View protein in Pfam  
PF08598  Sds3  
Amino Acid Sequences MDDYQELNPHMGMSHSSALSSAALPRYTQHHQMAPAYTQPHSQYQMAIGNGHHQHISNSTSSGGQPLAQAGYEWSRGYSATTGQAHIQDISGMQATATKSGAQSLRSKVTERLQQIDREVFESEARAYEQKSEEIQSELAQILRGAHPVFIEGVARLSAERDRMLTAAEQNHRYLVDLYERTFQHDREVTEKAYRAEKQAIYDKIATDIEDRRRRLKEEKDSLDISMDFVFDPSARTSSKRNLRKRGNDTLGLGEPTGRHPGKRKNNQVFGVQGIPEDDIISDLVAIRRATGVTGPLGNGNSGKKGHKGHKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.16
3 0.16
4 0.16
5 0.16
6 0.16
7 0.15
8 0.15
9 0.15
10 0.16
11 0.16
12 0.18
13 0.23
14 0.27
15 0.34
16 0.34
17 0.35
18 0.38
19 0.42
20 0.43
21 0.39
22 0.39
23 0.35
24 0.31
25 0.31
26 0.3
27 0.31
28 0.31
29 0.3
30 0.26
31 0.26
32 0.3
33 0.27
34 0.25
35 0.21
36 0.25
37 0.25
38 0.26
39 0.23
40 0.19
41 0.19
42 0.21
43 0.23
44 0.16
45 0.16
46 0.16
47 0.16
48 0.16
49 0.16
50 0.14
51 0.12
52 0.11
53 0.11
54 0.11
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.11
59 0.12
60 0.12
61 0.11
62 0.11
63 0.11
64 0.13
65 0.12
66 0.11
67 0.16
68 0.17
69 0.17
70 0.18
71 0.2
72 0.19
73 0.18
74 0.17
75 0.11
76 0.09
77 0.1
78 0.08
79 0.07
80 0.06
81 0.08
82 0.09
83 0.1
84 0.1
85 0.1
86 0.09
87 0.13
88 0.15
89 0.15
90 0.2
91 0.22
92 0.27
93 0.28
94 0.3
95 0.31
96 0.35
97 0.38
98 0.36
99 0.38
100 0.35
101 0.36
102 0.37
103 0.35
104 0.3
105 0.25
106 0.24
107 0.18
108 0.16
109 0.15
110 0.12
111 0.1
112 0.1
113 0.1
114 0.09
115 0.12
116 0.13
117 0.13
118 0.14
119 0.15
120 0.14
121 0.15
122 0.15
123 0.12
124 0.11
125 0.1
126 0.09
127 0.08
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.08
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.06
138 0.06
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.04
144 0.05
145 0.06
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.08
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.11
154 0.15
155 0.18
156 0.19
157 0.19
158 0.2
159 0.19
160 0.19
161 0.17
162 0.12
163 0.14
164 0.14
165 0.15
166 0.2
167 0.2
168 0.25
169 0.25
170 0.24
171 0.24
172 0.26
173 0.26
174 0.25
175 0.27
176 0.24
177 0.25
178 0.27
179 0.24
180 0.26
181 0.26
182 0.25
183 0.28
184 0.28
185 0.28
186 0.34
187 0.33
188 0.32
189 0.32
190 0.28
191 0.25
192 0.24
193 0.21
194 0.17
195 0.21
196 0.28
197 0.34
198 0.36
199 0.4
200 0.43
201 0.47
202 0.52
203 0.56
204 0.57
205 0.6
206 0.63
207 0.61
208 0.6
209 0.55
210 0.49
211 0.39
212 0.3
213 0.2
214 0.15
215 0.1
216 0.09
217 0.09
218 0.06
219 0.08
220 0.08
221 0.11
222 0.11
223 0.14
224 0.18
225 0.28
226 0.38
227 0.46
228 0.54
229 0.62
230 0.72
231 0.8
232 0.83
233 0.85
234 0.81
235 0.75
236 0.67
237 0.62
238 0.54
239 0.44
240 0.36
241 0.26
242 0.21
243 0.19
244 0.26
245 0.22
246 0.23
247 0.3
248 0.41
249 0.51
250 0.61
251 0.69
252 0.71
253 0.79
254 0.79
255 0.76
256 0.68
257 0.6
258 0.53
259 0.42
260 0.32
261 0.24
262 0.21
263 0.16
264 0.14
265 0.1
266 0.08
267 0.08
268 0.07
269 0.06
270 0.07
271 0.08
272 0.12
273 0.11
274 0.11
275 0.12
276 0.12
277 0.13
278 0.13
279 0.14
280 0.13
281 0.14
282 0.15
283 0.17
284 0.17
285 0.18
286 0.19
287 0.19
288 0.21
289 0.24
290 0.26
291 0.3
292 0.38