Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1W5K1

Protein Details
Accession A0A1Y1W5K1    Localization Confidence High Confidence Score 25.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
229-252TDIFAPELKKKKRHREGYEDGDYTHydrophilic
357-383ATEEMKKLRKERKRQNAKRQRNLVKMQHydrophilic
547-568MMREAKEKKITKRSRGKKDIVNBasic
739-763SIDRMIKRATKAKPKQKVQLVVAKNHydrophilic
778-808KYKMVDRRMKKELRAQKSRERKSKKNGGRKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
237-242KKKKRH
362-376KKLRKERKRQNAKRQ
551-564AKEKKITKRSRGKK
743-808MIKRATKAKPKQKVQLVVAKNSNRGIQGRPKGITGKYKMVDRRMKKELRAQKSRERKSKKNGGRKK
Subcellular Location(s) nucl 22, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002877  RNA_MeTrfase_FtsJ_dom  
IPR015507  rRNA-MeTfrase_E  
IPR012920  rRNA_MeTfrase_SPB1-like_C  
IPR024576  rRNA_MeTfrase_Spb1_DUF3381  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR028589  SPB1-like  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0070039  F:rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase activity  
GO:0008650  F:rRNA (uridine-2'-O-)-methyltransferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF11861  DUF3381  
PF01728  FtsJ  
PF07780  Spb1_C  
Amino Acid Sequences MGFQKKSGKGRLDKYYHLAKEQGYRARSAFKLIQLNKKYNFLGSARALIDLCAAPGGWLQVAQKYMPVQSLILGVDLVPIKPIPNVITFAEDILTDKCRNRLRQEMKTWKADVVLHDGAPNVGSNWSHDAYSQAELVLMSLKLATEFLRKGGTFVTKVFRSKDYNSLIWVFNQLFRKVEATKPPSSRNVSAEIFVVCQDFIAPKKIDPRFLDAKYVFEDLEINKTMTSTDIFAPELKKKKRHREGYEDGDYTLHKKIDAMDFVKSRDPAGILGSANEMEFVSDESKEVVKLPETTEDILLACRDLRVLGKKDFRTLMKWRAGLRERFQLEKAEEKPKIEEKEGDEGSDVEGELDALATEEMKKLRKERKRQNAKRQRNLVKMQLNMTTPTDIGLEQDADAMFTASSTVGDKRKIRDLHSGHVDDIDVEAALAGETLVSLGSRPAGSDSEMSEDEERAEDVDSDSERIAMLEDEIEGLYSEYVDRKREMDTKYDIKKKRAAEEEFRGFSDDDDEEGAEKSGSSDEESGSEASAKSEMSADEDEDIRSMMREAKEKKITKRSRGKKDIVNATPAQLSKNSAIWFDQPMFKGVGGVNLDDLSDEEVGSKRKRPVTETADDVGASDSDDFEVVSAEEFDSDPENVELEDEQREADYDLATPEAMTMVRELANRKSSKHDLIDKHFNRYTFNDSQNLPEWFLDDENRHNKPTLPVTKERIAGMQKKAEGVIQNEDMTEAEKARSIDRMIKRATKAKPKQKVQLVVAKNSNRGIQGRPKGITGKYKMVDRRMKKELRAQKSRERKSKKNGGRKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.71
3 0.64
4 0.59
5 0.55
6 0.48
7 0.51
8 0.53
9 0.54
10 0.46
11 0.47
12 0.45
13 0.48
14 0.45
15 0.43
16 0.4
17 0.39
18 0.47
19 0.51
20 0.59
21 0.6
22 0.68
23 0.64
24 0.65
25 0.59
26 0.51
27 0.49
28 0.4
29 0.4
30 0.34
31 0.36
32 0.31
33 0.31
34 0.29
35 0.24
36 0.25
37 0.18
38 0.15
39 0.1
40 0.1
41 0.08
42 0.09
43 0.1
44 0.07
45 0.09
46 0.1
47 0.13
48 0.15
49 0.14
50 0.16
51 0.17
52 0.19
53 0.19
54 0.19
55 0.16
56 0.15
57 0.17
58 0.15
59 0.13
60 0.11
61 0.09
62 0.12
63 0.12
64 0.11
65 0.1
66 0.1
67 0.11
68 0.11
69 0.13
70 0.12
71 0.14
72 0.17
73 0.17
74 0.2
75 0.2
76 0.2
77 0.18
78 0.16
79 0.15
80 0.14
81 0.17
82 0.17
83 0.19
84 0.26
85 0.34
86 0.4
87 0.46
88 0.55
89 0.6
90 0.67
91 0.76
92 0.79
93 0.78
94 0.78
95 0.73
96 0.63
97 0.57
98 0.49
99 0.41
100 0.38
101 0.33
102 0.27
103 0.26
104 0.24
105 0.21
106 0.19
107 0.17
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.11
112 0.15
113 0.16
114 0.16
115 0.16
116 0.17
117 0.18
118 0.19
119 0.17
120 0.12
121 0.12
122 0.11
123 0.11
124 0.11
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.06
130 0.07
131 0.08
132 0.11
133 0.12
134 0.14
135 0.18
136 0.18
137 0.19
138 0.22
139 0.25
140 0.22
141 0.24
142 0.3
143 0.29
144 0.33
145 0.35
146 0.36
147 0.38
148 0.39
149 0.45
150 0.44
151 0.41
152 0.41
153 0.41
154 0.37
155 0.32
156 0.33
157 0.25
158 0.25
159 0.28
160 0.26
161 0.24
162 0.24
163 0.27
164 0.26
165 0.3
166 0.35
167 0.36
168 0.43
169 0.47
170 0.5
171 0.54
172 0.58
173 0.56
174 0.49
175 0.49
176 0.42
177 0.38
178 0.34
179 0.27
180 0.22
181 0.18
182 0.16
183 0.1
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.09
188 0.15
189 0.15
190 0.17
191 0.26
192 0.29
193 0.35
194 0.36
195 0.42
196 0.43
197 0.43
198 0.5
199 0.41
200 0.41
201 0.37
202 0.35
203 0.28
204 0.21
205 0.22
206 0.14
207 0.18
208 0.18
209 0.15
210 0.14
211 0.14
212 0.14
213 0.12
214 0.12
215 0.1
216 0.09
217 0.11
218 0.12
219 0.14
220 0.17
221 0.23
222 0.32
223 0.36
224 0.44
225 0.53
226 0.63
227 0.72
228 0.79
229 0.8
230 0.81
231 0.83
232 0.83
233 0.8
234 0.7
235 0.6
236 0.5
237 0.42
238 0.34
239 0.29
240 0.2
241 0.13
242 0.12
243 0.15
244 0.18
245 0.23
246 0.22
247 0.24
248 0.25
249 0.27
250 0.3
251 0.27
252 0.23
253 0.19
254 0.18
255 0.14
256 0.14
257 0.14
258 0.11
259 0.11
260 0.11
261 0.1
262 0.1
263 0.09
264 0.07
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.08
274 0.09
275 0.09
276 0.1
277 0.11
278 0.12
279 0.15
280 0.16
281 0.17
282 0.16
283 0.15
284 0.14
285 0.13
286 0.11
287 0.08
288 0.06
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.08
293 0.14
294 0.19
295 0.25
296 0.32
297 0.33
298 0.37
299 0.4
300 0.38
301 0.38
302 0.4
303 0.42
304 0.41
305 0.43
306 0.42
307 0.46
308 0.51
309 0.5
310 0.47
311 0.47
312 0.44
313 0.42
314 0.42
315 0.37
316 0.33
317 0.34
318 0.35
319 0.35
320 0.34
321 0.33
322 0.35
323 0.37
324 0.38
325 0.33
326 0.32
327 0.27
328 0.34
329 0.33
330 0.29
331 0.24
332 0.21
333 0.19
334 0.16
335 0.13
336 0.05
337 0.05
338 0.04
339 0.04
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.05
347 0.07
348 0.1
349 0.12
350 0.19
351 0.29
352 0.38
353 0.48
354 0.58
355 0.67
356 0.76
357 0.84
358 0.89
359 0.91
360 0.93
361 0.92
362 0.91
363 0.88
364 0.85
365 0.78
366 0.75
367 0.69
368 0.6
369 0.53
370 0.45
371 0.38
372 0.31
373 0.28
374 0.2
375 0.14
376 0.13
377 0.11
378 0.08
379 0.08
380 0.07
381 0.06
382 0.05
383 0.06
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.04
389 0.03
390 0.04
391 0.03
392 0.03
393 0.04
394 0.07
395 0.09
396 0.14
397 0.16
398 0.18
399 0.26
400 0.28
401 0.31
402 0.38
403 0.39
404 0.4
405 0.44
406 0.43
407 0.35
408 0.33
409 0.3
410 0.2
411 0.17
412 0.12
413 0.05
414 0.04
415 0.03
416 0.03
417 0.03
418 0.02
419 0.02
420 0.02
421 0.02
422 0.02
423 0.02
424 0.02
425 0.02
426 0.02
427 0.03
428 0.03
429 0.04
430 0.05
431 0.06
432 0.07
433 0.08
434 0.08
435 0.11
436 0.11
437 0.12
438 0.12
439 0.11
440 0.11
441 0.1
442 0.09
443 0.07
444 0.07
445 0.06
446 0.06
447 0.07
448 0.07
449 0.08
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.06
454 0.06
455 0.05
456 0.05
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.04
461 0.04
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.07
468 0.09
469 0.1
470 0.11
471 0.12
472 0.16
473 0.22
474 0.24
475 0.26
476 0.31
477 0.37
478 0.45
479 0.53
480 0.55
481 0.53
482 0.57
483 0.56
484 0.57
485 0.57
486 0.55
487 0.53
488 0.57
489 0.59
490 0.53
491 0.5
492 0.45
493 0.36
494 0.3
495 0.25
496 0.17
497 0.11
498 0.1
499 0.1
500 0.09
501 0.09
502 0.09
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.06
508 0.07
509 0.07
510 0.07
511 0.08
512 0.1
513 0.09
514 0.09
515 0.09
516 0.08
517 0.08
518 0.08
519 0.07
520 0.06
521 0.07
522 0.07
523 0.09
524 0.1
525 0.1
526 0.1
527 0.11
528 0.11
529 0.1
530 0.1
531 0.07
532 0.07
533 0.07
534 0.11
535 0.12
536 0.19
537 0.23
538 0.32
539 0.41
540 0.47
541 0.54
542 0.61
543 0.67
544 0.7
545 0.78
546 0.8
547 0.81
548 0.85
549 0.83
550 0.78
551 0.79
552 0.78
553 0.7
554 0.66
555 0.55
556 0.48
557 0.44
558 0.38
559 0.3
560 0.21
561 0.21
562 0.17
563 0.2
564 0.19
565 0.17
566 0.18
567 0.18
568 0.2
569 0.2
570 0.22
571 0.19
572 0.2
573 0.2
574 0.19
575 0.19
576 0.16
577 0.18
578 0.15
579 0.14
580 0.13
581 0.12
582 0.12
583 0.1
584 0.1
585 0.07
586 0.07
587 0.06
588 0.07
589 0.09
590 0.14
591 0.16
592 0.22
593 0.26
594 0.32
595 0.34
596 0.38
597 0.45
598 0.49
599 0.51
600 0.5
601 0.46
602 0.41
603 0.38
604 0.34
605 0.25
606 0.17
607 0.13
608 0.08
609 0.06
610 0.06
611 0.06
612 0.05
613 0.05
614 0.05
615 0.05
616 0.05
617 0.05
618 0.05
619 0.06
620 0.06
621 0.07
622 0.08
623 0.09
624 0.09
625 0.09
626 0.09
627 0.08
628 0.09
629 0.09
630 0.09
631 0.1
632 0.09
633 0.09
634 0.09
635 0.1
636 0.1
637 0.1
638 0.09
639 0.08
640 0.08
641 0.08
642 0.08
643 0.07
644 0.07
645 0.07
646 0.06
647 0.06
648 0.06
649 0.07
650 0.1
651 0.12
652 0.15
653 0.2
654 0.28
655 0.3
656 0.31
657 0.38
658 0.42
659 0.47
660 0.51
661 0.54
662 0.54
663 0.61
664 0.7
665 0.64
666 0.66
667 0.62
668 0.55
669 0.5
670 0.47
671 0.47
672 0.43
673 0.44
674 0.41
675 0.39
676 0.43
677 0.45
678 0.42
679 0.36
680 0.29
681 0.26
682 0.22
683 0.23
684 0.22
685 0.19
686 0.26
687 0.33
688 0.36
689 0.37
690 0.36
691 0.38
692 0.4
693 0.48
694 0.48
695 0.48
696 0.52
697 0.57
698 0.61
699 0.6
700 0.55
701 0.51
702 0.5
703 0.5
704 0.49
705 0.49
706 0.44
707 0.43
708 0.43
709 0.4
710 0.36
711 0.32
712 0.32
713 0.28
714 0.27
715 0.26
716 0.26
717 0.22
718 0.19
719 0.17
720 0.13
721 0.11
722 0.13
723 0.14
724 0.15
725 0.19
726 0.2
727 0.28
728 0.34
729 0.41
730 0.44
731 0.5
732 0.55
733 0.6
734 0.66
735 0.68
736 0.72
737 0.75
738 0.8
739 0.81
740 0.85
741 0.85
742 0.85
743 0.81
744 0.81
745 0.76
746 0.73
747 0.73
748 0.68
749 0.63
750 0.56
751 0.52
752 0.46
753 0.43
754 0.42
755 0.43
756 0.48
757 0.51
758 0.5
759 0.51
760 0.52
761 0.55
762 0.58
763 0.54
764 0.54
765 0.51
766 0.58
767 0.61
768 0.65
769 0.7
770 0.68
771 0.71
772 0.72
773 0.75
774 0.74
775 0.77
776 0.78
777 0.78
778 0.8
779 0.79
780 0.8
781 0.84
782 0.87
783 0.88
784 0.87
785 0.87
786 0.87
787 0.91
788 0.91