Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1WCY8

Protein Details
Accession A0A1Y1WCY8    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
276-304LIVTRGKGFTKEKNKKKRGSYSGGKITMEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
67-71KKSKK
85-118SRARPLARPRARQALRAKMRRRSQVLAALRRRRR
202-223KKKDEPPAKKRKVESAPAPKPK
282-294KGFTKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10, cyto 5.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MANDKVNELIKLHALLTELGLEKTVTTLMAEAAQLGTDNKQVQKFLESILIKEGQMEVDKPEDQKAKKSKKESSSSSSSSSSSSSRARPLARPRARQALRAKMRRRSQVLAALRRRRRQSVSSSSSSSESGSDSSSSLQLLALILVALAAIRAQDSSSSDSDSSSSDSDSDSSSSDSDSSSSSSSSSSDSDSSSSSDSEDEKKKDEPPAKKRKVESAPAPKPKQEAVIAQKAAPANTSSGFQKRGTVAQRAQGTDNRYMSKGGVDGDFGYKAHRDLIVTRGKGFTKEKNKKKRGSYSGGKITMESHSIKFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.14
4 0.16
5 0.14
6 0.13
7 0.14
8 0.12
9 0.11
10 0.11
11 0.11
12 0.07
13 0.06
14 0.07
15 0.07
16 0.08
17 0.08
18 0.08
19 0.07
20 0.07
21 0.07
22 0.08
23 0.09
24 0.11
25 0.15
26 0.19
27 0.21
28 0.22
29 0.23
30 0.25
31 0.25
32 0.22
33 0.27
34 0.24
35 0.22
36 0.25
37 0.26
38 0.22
39 0.22
40 0.21
41 0.14
42 0.15
43 0.15
44 0.13
45 0.14
46 0.17
47 0.17
48 0.23
49 0.28
50 0.28
51 0.37
52 0.46
53 0.53
54 0.59
55 0.66
56 0.69
57 0.71
58 0.78
59 0.76
60 0.73
61 0.7
62 0.65
63 0.61
64 0.53
65 0.45
66 0.37
67 0.32
68 0.26
69 0.23
70 0.24
71 0.23
72 0.26
73 0.3
74 0.32
75 0.38
76 0.46
77 0.54
78 0.58
79 0.62
80 0.62
81 0.68
82 0.67
83 0.67
84 0.65
85 0.64
86 0.65
87 0.68
88 0.7
89 0.68
90 0.74
91 0.74
92 0.72
93 0.64
94 0.59
95 0.58
96 0.6
97 0.6
98 0.62
99 0.64
100 0.66
101 0.69
102 0.68
103 0.65
104 0.62
105 0.57
106 0.57
107 0.58
108 0.58
109 0.54
110 0.52
111 0.48
112 0.44
113 0.39
114 0.3
115 0.21
116 0.15
117 0.11
118 0.1
119 0.09
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.05
128 0.04
129 0.04
130 0.03
131 0.03
132 0.02
133 0.02
134 0.02
135 0.02
136 0.02
137 0.02
138 0.02
139 0.02
140 0.02
141 0.03
142 0.05
143 0.08
144 0.08
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.09
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.08
167 0.07
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.09
173 0.09
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.11
178 0.11
179 0.12
180 0.11
181 0.11
182 0.1
183 0.1
184 0.11
185 0.16
186 0.22
187 0.22
188 0.24
189 0.26
190 0.29
191 0.36
192 0.43
193 0.47
194 0.51
195 0.61
196 0.67
197 0.72
198 0.71
199 0.73
200 0.72
201 0.7
202 0.69
203 0.69
204 0.7
205 0.74
206 0.74
207 0.66
208 0.62
209 0.55
210 0.49
211 0.4
212 0.38
213 0.35
214 0.4
215 0.39
216 0.36
217 0.38
218 0.35
219 0.32
220 0.26
221 0.2
222 0.13
223 0.13
224 0.15
225 0.15
226 0.18
227 0.21
228 0.21
229 0.23
230 0.24
231 0.3
232 0.33
233 0.37
234 0.35
235 0.39
236 0.43
237 0.41
238 0.43
239 0.4
240 0.4
241 0.39
242 0.41
243 0.36
244 0.33
245 0.31
246 0.28
247 0.26
248 0.23
249 0.18
250 0.15
251 0.13
252 0.14
253 0.15
254 0.15
255 0.14
256 0.15
257 0.14
258 0.14
259 0.15
260 0.15
261 0.14
262 0.16
263 0.24
264 0.3
265 0.31
266 0.32
267 0.34
268 0.34
269 0.39
270 0.42
271 0.44
272 0.47
273 0.56
274 0.65
275 0.72
276 0.81
277 0.84
278 0.89
279 0.9
280 0.88
281 0.87
282 0.86
283 0.85
284 0.85
285 0.81
286 0.71
287 0.61
288 0.54
289 0.47
290 0.41
291 0.34