Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1W068

Protein Details
Accession A0A1Y1W068    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-52GFSGQPGDKDRKKDKEKKKWQPPLPTTIGQRKKRKGPDGVAKLPQEBasic
307-329ALNSSWPYRPKDRTKRHIFGIHTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-43KDRKKDKEKKKWQPPLPTTIGQRKKRKGP
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 12.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005937  26S_Psome_P45-like  
IPR041569  AAA_lid_3  
IPR003959  ATPase_AAA_core  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR032501  Prot_ATP_ID_OB_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000502  C:proteasome complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0036402  F:proteasome-activating activity  
GO:0030163  P:protein catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00004  AAA  
PF17862  AAA_lid_3  
PF16450  Prot_ATP_ID_OB  
Amino Acid Sequences MGNAQSGFSGQPGDKDRKKDKEKKKWQPPLPTTIGQRKKRKGPDGVAKLPQEFVQNQQRLKPQEEKTQEERARVDELRGSPMTVGTLEEVIDDNHVIVSATSGPEYYVSLLSFVDKDQLEPGCSVLMHQKSMAIVGVLQDDADPMVSVMKLEKAPTESYADVGGLEQQIQEIKEAVELPLTHPELYEEMGIKPPKGVILRCLPKAVANQTSATFLRVVGSELIQKYLGDGPKLVRELFRVAEENSPSIVFIDEIDAVGTKRYDSNSGGEKEIQRTMLELLNQLDGFDSSSDVKVIMATNQIESLDPALNSSWPYRPKDRTKRHIFGIHTSRMTLSEDVDLEEFVMSKDDLSGADIKAICTEAGLLALRERRMKVCNDDFKKAREKVLYRKSEGTPEGLYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.47
3 0.57
4 0.64
5 0.75
6 0.79
7 0.84
8 0.85
9 0.91
10 0.93
11 0.95
12 0.95
13 0.93
14 0.94
15 0.89
16 0.87
17 0.83
18 0.77
19 0.74
20 0.74
21 0.75
22 0.74
23 0.77
24 0.77
25 0.8
26 0.84
27 0.85
28 0.84
29 0.84
30 0.85
31 0.84
32 0.83
33 0.81
34 0.74
35 0.65
36 0.57
37 0.48
38 0.42
39 0.34
40 0.33
41 0.36
42 0.39
43 0.4
44 0.44
45 0.5
46 0.49
47 0.54
48 0.56
49 0.51
50 0.56
51 0.61
52 0.62
53 0.61
54 0.67
55 0.65
56 0.6
57 0.56
58 0.48
59 0.47
60 0.4
61 0.37
62 0.32
63 0.3
64 0.32
65 0.3
66 0.28
67 0.22
68 0.22
69 0.2
70 0.14
71 0.13
72 0.08
73 0.08
74 0.07
75 0.08
76 0.08
77 0.07
78 0.08
79 0.07
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.05
84 0.05
85 0.06
86 0.06
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.09
99 0.09
100 0.09
101 0.12
102 0.11
103 0.11
104 0.14
105 0.15
106 0.15
107 0.15
108 0.15
109 0.11
110 0.11
111 0.12
112 0.15
113 0.16
114 0.15
115 0.15
116 0.16
117 0.15
118 0.16
119 0.15
120 0.08
121 0.06
122 0.06
123 0.07
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.04
131 0.03
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.07
137 0.07
138 0.08
139 0.09
140 0.11
141 0.12
142 0.14
143 0.17
144 0.15
145 0.15
146 0.15
147 0.13
148 0.11
149 0.1
150 0.09
151 0.06
152 0.06
153 0.05
154 0.05
155 0.06
156 0.07
157 0.07
158 0.06
159 0.06
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.08
166 0.13
167 0.14
168 0.13
169 0.12
170 0.13
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.08
175 0.08
176 0.13
177 0.13
178 0.12
179 0.12
180 0.11
181 0.13
182 0.14
183 0.14
184 0.13
185 0.22
186 0.26
187 0.26
188 0.27
189 0.25
190 0.25
191 0.27
192 0.27
193 0.22
194 0.19
195 0.2
196 0.19
197 0.22
198 0.2
199 0.18
200 0.14
201 0.11
202 0.1
203 0.09
204 0.1
205 0.07
206 0.08
207 0.1
208 0.1
209 0.11
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.14
214 0.14
215 0.11
216 0.12
217 0.12
218 0.16
219 0.17
220 0.16
221 0.13
222 0.14
223 0.16
224 0.16
225 0.16
226 0.15
227 0.15
228 0.19
229 0.19
230 0.18
231 0.16
232 0.15
233 0.13
234 0.11
235 0.1
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.07
246 0.06
247 0.07
248 0.09
249 0.11
250 0.13
251 0.16
252 0.22
253 0.24
254 0.26
255 0.27
256 0.29
257 0.29
258 0.29
259 0.26
260 0.19
261 0.18
262 0.18
263 0.17
264 0.16
265 0.15
266 0.14
267 0.15
268 0.15
269 0.14
270 0.12
271 0.1
272 0.1
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.11
284 0.11
285 0.12
286 0.12
287 0.13
288 0.12
289 0.12
290 0.13
291 0.11
292 0.1
293 0.1
294 0.1
295 0.11
296 0.12
297 0.14
298 0.18
299 0.22
300 0.28
301 0.35
302 0.44
303 0.54
304 0.64
305 0.72
306 0.77
307 0.82
308 0.82
309 0.82
310 0.81
311 0.73
312 0.72
313 0.7
314 0.65
315 0.56
316 0.5
317 0.43
318 0.37
319 0.36
320 0.27
321 0.2
322 0.16
323 0.16
324 0.16
325 0.16
326 0.15
327 0.12
328 0.11
329 0.1
330 0.07
331 0.09
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.1
338 0.13
339 0.11
340 0.16
341 0.16
342 0.16
343 0.17
344 0.17
345 0.15
346 0.12
347 0.12
348 0.07
349 0.09
350 0.1
351 0.09
352 0.13
353 0.17
354 0.2
355 0.24
356 0.27
357 0.29
358 0.33
359 0.39
360 0.44
361 0.5
362 0.58
363 0.6
364 0.67
365 0.67
366 0.69
367 0.73
368 0.67
369 0.65
370 0.63
371 0.64
372 0.66
373 0.72
374 0.74
375 0.7
376 0.73
377 0.69
378 0.68
379 0.63
380 0.57