Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2EP76

Protein Details
Accession A0A1Y2EP76    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
375-403SESERKAKERDNLRRERQKQREREMRLSHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
199-211KFKHKKMPRGPPS
302-307KEKKEK
367-397RSSRHRNESESERKAKERDNLRRERQKQRER
555-557RRR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MSLASFLPKPRNQTLKNDSIFDRTPLISDDIVGPPPYRHRKGFIPRTVEDFGNGGAFPEIHVVQYPLDMGRKKSIKTSSTKTLPLQVDGDGKIRYDAILKQGHSNNRIIHSQLKDIVPMEKRDFNARPTEDEIKKTTEKTQAALQAILEGRSKSVQGGTSKDKKAGPSFVKYTPASKSTVGSRIIRMVEAPVDPMEPPKFKHKKMPRGPPSPPAPVLHSPPRKVSAEEQSNWVIPPCISNWKNAKGYTIPLDKRLAADGRGIQDIQINPKFASFSEALSIADRHAREEVRLRANMQAKLAAKEKKEKEERLRMLAQRAREERAGLINNASSEYNERKERNESESESESGSDTRSESSRSEHSHREHRSSRHRNESESERKAKERDNLRRERQKQREREMRLSHMGQETKSKVMRKLGDRDISEKIALGLAQPTASRESMYDQRLFNRSEGLSSGFGSEDSYNIYDKPLFAERSSNTIYRPKKTVSDENYDTEAIEKIVSNKIGGEGSRGFKGADVNSDRSGPVQFEKEEDPYELEKFLKNKRNHEGDDERSSEKRRRH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.69
3 0.69
4 0.66
5 0.6
6 0.56
7 0.54
8 0.46
9 0.41
10 0.31
11 0.29
12 0.27
13 0.28
14 0.21
15 0.2
16 0.21
17 0.2
18 0.22
19 0.22
20 0.2
21 0.19
22 0.3
23 0.38
24 0.41
25 0.42
26 0.45
27 0.53
28 0.63
29 0.71
30 0.7
31 0.68
32 0.64
33 0.67
34 0.66
35 0.56
36 0.46
37 0.36
38 0.28
39 0.22
40 0.2
41 0.13
42 0.11
43 0.1
44 0.09
45 0.11
46 0.11
47 0.1
48 0.11
49 0.11
50 0.11
51 0.11
52 0.12
53 0.11
54 0.17
55 0.19
56 0.21
57 0.3
58 0.34
59 0.35
60 0.41
61 0.47
62 0.48
63 0.54
64 0.58
65 0.59
66 0.6
67 0.64
68 0.59
69 0.59
70 0.54
71 0.49
72 0.43
73 0.36
74 0.34
75 0.3
76 0.31
77 0.23
78 0.21
79 0.19
80 0.18
81 0.16
82 0.14
83 0.15
84 0.19
85 0.24
86 0.24
87 0.31
88 0.37
89 0.43
90 0.44
91 0.47
92 0.44
93 0.42
94 0.43
95 0.38
96 0.39
97 0.35
98 0.35
99 0.35
100 0.32
101 0.3
102 0.3
103 0.34
104 0.3
105 0.32
106 0.33
107 0.32
108 0.33
109 0.39
110 0.41
111 0.38
112 0.43
113 0.4
114 0.4
115 0.41
116 0.49
117 0.44
118 0.45
119 0.44
120 0.41
121 0.42
122 0.4
123 0.4
124 0.4
125 0.38
126 0.36
127 0.39
128 0.39
129 0.37
130 0.36
131 0.29
132 0.25
133 0.24
134 0.24
135 0.2
136 0.14
137 0.14
138 0.14
139 0.14
140 0.11
141 0.12
142 0.15
143 0.16
144 0.22
145 0.29
146 0.37
147 0.38
148 0.42
149 0.41
150 0.41
151 0.43
152 0.46
153 0.43
154 0.4
155 0.43
156 0.42
157 0.46
158 0.42
159 0.41
160 0.36
161 0.33
162 0.3
163 0.26
164 0.26
165 0.24
166 0.28
167 0.29
168 0.27
169 0.27
170 0.28
171 0.28
172 0.26
173 0.22
174 0.17
175 0.15
176 0.13
177 0.13
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.12
182 0.15
183 0.14
184 0.16
185 0.26
186 0.32
187 0.34
188 0.45
189 0.51
190 0.59
191 0.67
192 0.77
193 0.76
194 0.78
195 0.79
196 0.77
197 0.72
198 0.66
199 0.59
200 0.49
201 0.44
202 0.39
203 0.4
204 0.42
205 0.42
206 0.39
207 0.39
208 0.42
209 0.38
210 0.37
211 0.37
212 0.37
213 0.38
214 0.37
215 0.37
216 0.34
217 0.34
218 0.32
219 0.27
220 0.18
221 0.11
222 0.11
223 0.1
224 0.18
225 0.18
226 0.24
227 0.29
228 0.34
229 0.38
230 0.37
231 0.37
232 0.29
233 0.31
234 0.31
235 0.34
236 0.28
237 0.28
238 0.3
239 0.27
240 0.27
241 0.27
242 0.22
243 0.15
244 0.16
245 0.15
246 0.15
247 0.15
248 0.15
249 0.12
250 0.14
251 0.14
252 0.18
253 0.18
254 0.17
255 0.16
256 0.17
257 0.17
258 0.14
259 0.17
260 0.11
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.1
265 0.11
266 0.11
267 0.07
268 0.1
269 0.1
270 0.1
271 0.11
272 0.11
273 0.12
274 0.18
275 0.23
276 0.24
277 0.25
278 0.25
279 0.29
280 0.34
281 0.34
282 0.28
283 0.27
284 0.24
285 0.26
286 0.3
287 0.28
288 0.25
289 0.33
290 0.36
291 0.4
292 0.46
293 0.51
294 0.54
295 0.6
296 0.61
297 0.58
298 0.61
299 0.54
300 0.55
301 0.51
302 0.45
303 0.41
304 0.41
305 0.38
306 0.32
307 0.3
308 0.24
309 0.26
310 0.25
311 0.18
312 0.17
313 0.15
314 0.14
315 0.15
316 0.13
317 0.09
318 0.11
319 0.14
320 0.17
321 0.22
322 0.23
323 0.24
324 0.3
325 0.33
326 0.35
327 0.37
328 0.35
329 0.35
330 0.36
331 0.35
332 0.29
333 0.26
334 0.22
335 0.17
336 0.15
337 0.1
338 0.08
339 0.09
340 0.09
341 0.11
342 0.11
343 0.15
344 0.2
345 0.24
346 0.28
347 0.34
348 0.38
349 0.45
350 0.49
351 0.53
352 0.55
353 0.58
354 0.65
355 0.69
356 0.72
357 0.73
358 0.71
359 0.66
360 0.65
361 0.66
362 0.65
363 0.62
364 0.61
365 0.53
366 0.54
367 0.54
368 0.54
369 0.52
370 0.53
371 0.56
372 0.6
373 0.67
374 0.73
375 0.8
376 0.83
377 0.86
378 0.87
379 0.86
380 0.85
381 0.86
382 0.86
383 0.83
384 0.84
385 0.79
386 0.74
387 0.7
388 0.62
389 0.56
390 0.52
391 0.46
392 0.37
393 0.38
394 0.34
395 0.33
396 0.36
397 0.35
398 0.33
399 0.39
400 0.45
401 0.45
402 0.51
403 0.54
404 0.57
405 0.55
406 0.55
407 0.51
408 0.46
409 0.4
410 0.32
411 0.24
412 0.17
413 0.15
414 0.12
415 0.09
416 0.08
417 0.08
418 0.08
419 0.09
420 0.11
421 0.12
422 0.11
423 0.11
424 0.16
425 0.22
426 0.26
427 0.29
428 0.28
429 0.33
430 0.37
431 0.38
432 0.34
433 0.32
434 0.28
435 0.25
436 0.25
437 0.23
438 0.19
439 0.18
440 0.18
441 0.13
442 0.13
443 0.14
444 0.12
445 0.1
446 0.11
447 0.12
448 0.12
449 0.12
450 0.14
451 0.13
452 0.13
453 0.17
454 0.2
455 0.21
456 0.21
457 0.28
458 0.27
459 0.32
460 0.36
461 0.33
462 0.31
463 0.38
464 0.43
465 0.41
466 0.45
467 0.43
468 0.46
469 0.52
470 0.58
471 0.56
472 0.59
473 0.58
474 0.57
475 0.57
476 0.49
477 0.42
478 0.33
479 0.27
480 0.18
481 0.15
482 0.12
483 0.12
484 0.17
485 0.17
486 0.16
487 0.16
488 0.17
489 0.19
490 0.18
491 0.2
492 0.2
493 0.23
494 0.24
495 0.24
496 0.22
497 0.21
498 0.26
499 0.23
500 0.27
501 0.29
502 0.32
503 0.33
504 0.34
505 0.33
506 0.3
507 0.3
508 0.24
509 0.22
510 0.23
511 0.22
512 0.24
513 0.28
514 0.3
515 0.31
516 0.3
517 0.3
518 0.28
519 0.29
520 0.27
521 0.25
522 0.27
523 0.3
524 0.38
525 0.43
526 0.48
527 0.55
528 0.63
529 0.7
530 0.69
531 0.73
532 0.72
533 0.71
534 0.72
535 0.67
536 0.61
537 0.57
538 0.6