Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2C1I1

Protein Details
Accession A0A1Y2C1I1    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-51QDERRRKIENEKIKKKEEAFBasic
188-210NRQISKKKFSKKEIQREMNRKAYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
35-49RRRKIENEKIKKKEE
405-416RLERAKRRKRRD
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MNSFKALMQKAEENQNHYEKKHLNNINRQLEQDERRRKIENEKIKKKEEAFSNFKKIAKSLPNDLQKSRDRRERSNSVSRSSRDESSISKKNSIYNLKIKKADSNNHSNDIHKNNHERQKKLSSSSLSQSKKHFSFKDLMEIAKHNDVSKPVINNSSADFREAKKALKNLSGRKKYKDDFDDDSDDGNRQISKKKFSKKEIQREMNRKAYDGSKDRVAQERMKLLKSRGIHTPVTSKISQDVTEMVKRMEKINNNNNNNNNNNNNNNSKSQSKESIRRSSLELNESRSKSNSKYNNYDKYDDESDDYDSEYEYKRRSKLSNGNSKRVKKVKGMYEDYEVYDEAYVNNNVSSIIGNIFGYNRNRYRDEDDIDDMEVGYSDVKREEARSLRIAKKEDEEEEELERQRLERAKRRKRRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.55
3 0.55
4 0.5
5 0.54
6 0.5
7 0.53
8 0.58
9 0.61
10 0.61
11 0.67
12 0.77
13 0.77
14 0.73
15 0.68
16 0.62
17 0.62
18 0.61
19 0.61
20 0.61
21 0.56
22 0.59
23 0.62
24 0.62
25 0.64
26 0.66
27 0.67
28 0.68
29 0.73
30 0.77
31 0.78
32 0.81
33 0.75
34 0.72
35 0.7
36 0.68
37 0.67
38 0.67
39 0.7
40 0.67
41 0.65
42 0.59
43 0.51
44 0.5
45 0.5
46 0.47
47 0.46
48 0.51
49 0.57
50 0.6
51 0.61
52 0.6
53 0.6
54 0.64
55 0.64
56 0.64
57 0.61
58 0.65
59 0.72
60 0.75
61 0.75
62 0.77
63 0.72
64 0.7
65 0.71
66 0.64
67 0.63
68 0.57
69 0.5
70 0.42
71 0.4
72 0.39
73 0.4
74 0.47
75 0.42
76 0.43
77 0.43
78 0.45
79 0.51
80 0.53
81 0.51
82 0.53
83 0.58
84 0.59
85 0.63
86 0.59
87 0.59
88 0.59
89 0.61
90 0.58
91 0.59
92 0.58
93 0.58
94 0.58
95 0.52
96 0.51
97 0.49
98 0.48
99 0.43
100 0.48
101 0.51
102 0.59
103 0.64
104 0.6
105 0.61
106 0.65
107 0.63
108 0.59
109 0.57
110 0.52
111 0.49
112 0.53
113 0.55
114 0.49
115 0.48
116 0.48
117 0.49
118 0.49
119 0.52
120 0.46
121 0.41
122 0.44
123 0.41
124 0.46
125 0.4
126 0.36
127 0.31
128 0.31
129 0.31
130 0.27
131 0.27
132 0.18
133 0.18
134 0.19
135 0.21
136 0.22
137 0.22
138 0.2
139 0.22
140 0.22
141 0.21
142 0.22
143 0.23
144 0.2
145 0.2
146 0.2
147 0.18
148 0.24
149 0.25
150 0.26
151 0.25
152 0.29
153 0.29
154 0.35
155 0.4
156 0.43
157 0.52
158 0.59
159 0.59
160 0.61
161 0.65
162 0.6
163 0.62
164 0.57
165 0.52
166 0.47
167 0.48
168 0.47
169 0.4
170 0.38
171 0.31
172 0.27
173 0.21
174 0.17
175 0.13
176 0.1
177 0.17
178 0.19
179 0.27
180 0.35
181 0.44
182 0.51
183 0.57
184 0.66
185 0.69
186 0.77
187 0.78
188 0.8
189 0.8
190 0.8
191 0.8
192 0.77
193 0.67
194 0.57
195 0.48
196 0.42
197 0.39
198 0.35
199 0.3
200 0.27
201 0.29
202 0.3
203 0.34
204 0.35
205 0.32
206 0.3
207 0.35
208 0.33
209 0.33
210 0.34
211 0.29
212 0.31
213 0.29
214 0.29
215 0.28
216 0.3
217 0.28
218 0.27
219 0.31
220 0.28
221 0.31
222 0.29
223 0.23
224 0.22
225 0.22
226 0.21
227 0.17
228 0.17
229 0.16
230 0.18
231 0.18
232 0.16
233 0.16
234 0.17
235 0.19
236 0.22
237 0.25
238 0.32
239 0.42
240 0.51
241 0.54
242 0.6
243 0.62
244 0.63
245 0.6
246 0.56
247 0.51
248 0.46
249 0.44
250 0.43
251 0.41
252 0.38
253 0.38
254 0.36
255 0.35
256 0.34
257 0.34
258 0.38
259 0.4
260 0.46
261 0.51
262 0.57
263 0.56
264 0.54
265 0.54
266 0.52
267 0.49
268 0.47
269 0.42
270 0.39
271 0.45
272 0.44
273 0.42
274 0.38
275 0.37
276 0.33
277 0.4
278 0.42
279 0.42
280 0.5
281 0.57
282 0.64
283 0.65
284 0.65
285 0.58
286 0.56
287 0.52
288 0.43
289 0.37
290 0.28
291 0.25
292 0.23
293 0.22
294 0.15
295 0.13
296 0.14
297 0.14
298 0.16
299 0.19
300 0.24
301 0.26
302 0.32
303 0.34
304 0.42
305 0.49
306 0.56
307 0.63
308 0.65
309 0.72
310 0.76
311 0.78
312 0.78
313 0.76
314 0.71
315 0.68
316 0.69
317 0.68
318 0.69
319 0.7
320 0.63
321 0.61
322 0.58
323 0.5
324 0.44
325 0.35
326 0.25
327 0.19
328 0.16
329 0.11
330 0.13
331 0.12
332 0.11
333 0.11
334 0.11
335 0.1
336 0.1
337 0.1
338 0.07
339 0.07
340 0.08
341 0.08
342 0.09
343 0.1
344 0.16
345 0.19
346 0.26
347 0.31
348 0.35
349 0.39
350 0.43
351 0.48
352 0.49
353 0.5
354 0.47
355 0.46
356 0.42
357 0.4
358 0.35
359 0.28
360 0.21
361 0.17
362 0.12
363 0.09
364 0.08
365 0.08
366 0.09
367 0.11
368 0.13
369 0.15
370 0.23
371 0.27
372 0.32
373 0.39
374 0.47
375 0.52
376 0.57
377 0.59
378 0.55
379 0.56
380 0.56
381 0.52
382 0.5
383 0.47
384 0.43
385 0.43
386 0.44
387 0.4
388 0.36
389 0.33
390 0.26
391 0.29
392 0.34
393 0.39
394 0.44
395 0.53
396 0.63