Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1YW63

Protein Details
Accession A0A1Y1YW63    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-27MSEIIFKKSSKKKSLRKKNINLTIEDEHydrophilic
30-62DDSPVISTTKLKKDKKKKIPKKKIDLSFNQPDEHydrophilic
65-84ENVFKIKKSSASRRLAKAKLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-18KKSSKKKSLRKK
39-52KLKKDKKKKIPKKK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012890  GCFC2-like  
IPR022783  GCFC_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF07842  GCFC  
PF15458  NTR2  
Amino Acid Sequences MSEIIFKKSSKKKSLRKKNINLTIEDEENDDSPVISTTKLKKDKKKKIPKKKIDLSFNQPDEDEENVFKIKKSSASRRLAKAKLNKNIYHDDIIDTKDDSSPYSEKNLNALKNSSLNRPPPSNIIKKSQEIYNKTINTSSNIEEIKIPDAAKIHEAKKLREARRNAKHSSINPNFIPLDSNDTEMEDKKENEDEDEDEEVFEDYENNRILFGSSAVKEQEAKRKKEMKVDIINAQENESEEEDKDELNKWESELIKQGRAAPEIMKVAKKKNEMAKNQIPDICDIPSLDEVMRDFSASLYQIKLKHSEDINEEAYLTEEIDKSKKNTENLQSDLKLSSDKYTYFQELRNYIIDLAEFLDEKFKDFNKINDEYLDLKKEKELFISNRIQSDLNDCFYDFVTGWNGLVFDSEGNNTYKYDLDQKENRQMLRKLRTKIQIDKNKSKKSNNEMKPNLDDIEGYISNDDFDEKDQEVYDAKKAEILQRYNEFFSDTNKDFKSLSIIKKNFEDWKEKYSKEYNQSFGGLSMPGVFELFVKYELFLWEPLENYREFEDMIWHQEASTYGTTNMMEMDNYDPEDDDNKLLIRLVEKFAIPKVKELINLWNVFSVNQTKNLLKILMLLQDYIKTKDSFFKGVVEEIENKLKITIERIISHNPIQRVTPQKNISQHLYEQINYWFWKIFKIYNNMFLFEKYISKNSLKEMSIDKLLNQLLVPCLDILRMVYLESLLKNHEQEELLKFEMLCEPIPEKWYNEEYSVPSYLKPLELSLKEFSNMCQKNKSSRATFETIVKLLVKLRSYDEASKLGKIYKIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.9
2 0.92
3 0.93
4 0.94
5 0.94
6 0.94
7 0.89
8 0.81
9 0.76
10 0.7
11 0.6
12 0.5
13 0.41
14 0.32
15 0.28
16 0.25
17 0.18
18 0.13
19 0.12
20 0.13
21 0.11
22 0.11
23 0.18
24 0.24
25 0.35
26 0.45
27 0.53
28 0.62
29 0.73
30 0.83
31 0.87
32 0.91
33 0.92
34 0.94
35 0.96
36 0.97
37 0.96
38 0.95
39 0.94
40 0.93
41 0.9
42 0.88
43 0.87
44 0.78
45 0.68
46 0.58
47 0.5
48 0.42
49 0.37
50 0.3
51 0.2
52 0.2
53 0.22
54 0.23
55 0.22
56 0.21
57 0.22
58 0.27
59 0.35
60 0.44
61 0.51
62 0.6
63 0.67
64 0.74
65 0.8
66 0.78
67 0.78
68 0.77
69 0.77
70 0.76
71 0.77
72 0.72
73 0.69
74 0.7
75 0.66
76 0.59
77 0.5
78 0.44
79 0.38
80 0.36
81 0.31
82 0.24
83 0.21
84 0.19
85 0.19
86 0.17
87 0.19
88 0.2
89 0.21
90 0.26
91 0.29
92 0.27
93 0.34
94 0.4
95 0.38
96 0.39
97 0.39
98 0.36
99 0.39
100 0.41
101 0.41
102 0.42
103 0.45
104 0.47
105 0.49
106 0.48
107 0.49
108 0.55
109 0.57
110 0.54
111 0.57
112 0.57
113 0.57
114 0.58
115 0.56
116 0.56
117 0.53
118 0.54
119 0.54
120 0.5
121 0.47
122 0.47
123 0.42
124 0.38
125 0.35
126 0.32
127 0.28
128 0.27
129 0.26
130 0.24
131 0.25
132 0.22
133 0.22
134 0.2
135 0.16
136 0.17
137 0.18
138 0.21
139 0.25
140 0.25
141 0.28
142 0.31
143 0.32
144 0.4
145 0.49
146 0.51
147 0.54
148 0.62
149 0.67
150 0.74
151 0.79
152 0.73
153 0.71
154 0.71
155 0.68
156 0.7
157 0.66
158 0.61
159 0.54
160 0.54
161 0.47
162 0.39
163 0.35
164 0.24
165 0.26
166 0.21
167 0.23
168 0.19
169 0.2
170 0.22
171 0.21
172 0.24
173 0.2
174 0.2
175 0.2
176 0.23
177 0.22
178 0.22
179 0.23
180 0.21
181 0.21
182 0.22
183 0.2
184 0.16
185 0.16
186 0.14
187 0.12
188 0.1
189 0.09
190 0.07
191 0.11
192 0.12
193 0.12
194 0.11
195 0.11
196 0.12
197 0.11
198 0.12
199 0.13
200 0.13
201 0.15
202 0.15
203 0.16
204 0.19
205 0.23
206 0.31
207 0.35
208 0.39
209 0.46
210 0.55
211 0.57
212 0.63
213 0.66
214 0.65
215 0.65
216 0.65
217 0.61
218 0.56
219 0.56
220 0.47
221 0.41
222 0.32
223 0.24
224 0.22
225 0.18
226 0.15
227 0.12
228 0.14
229 0.13
230 0.13
231 0.13
232 0.14
233 0.14
234 0.15
235 0.15
236 0.14
237 0.18
238 0.19
239 0.19
240 0.24
241 0.25
242 0.25
243 0.26
244 0.29
245 0.27
246 0.27
247 0.27
248 0.19
249 0.2
250 0.22
251 0.23
252 0.24
253 0.24
254 0.3
255 0.34
256 0.37
257 0.4
258 0.45
259 0.52
260 0.53
261 0.59
262 0.6
263 0.58
264 0.59
265 0.55
266 0.46
267 0.39
268 0.35
269 0.26
270 0.19
271 0.15
272 0.13
273 0.11
274 0.12
275 0.1
276 0.09
277 0.09
278 0.1
279 0.1
280 0.09
281 0.09
282 0.08
283 0.09
284 0.09
285 0.1
286 0.09
287 0.12
288 0.14
289 0.16
290 0.2
291 0.2
292 0.24
293 0.24
294 0.26
295 0.26
296 0.28
297 0.27
298 0.23
299 0.22
300 0.17
301 0.17
302 0.14
303 0.11
304 0.08
305 0.07
306 0.08
307 0.1
308 0.12
309 0.13
310 0.2
311 0.24
312 0.25
313 0.32
314 0.39
315 0.42
316 0.44
317 0.47
318 0.4
319 0.37
320 0.35
321 0.28
322 0.22
323 0.17
324 0.15
325 0.12
326 0.12
327 0.13
328 0.15
329 0.19
330 0.19
331 0.22
332 0.24
333 0.23
334 0.25
335 0.23
336 0.21
337 0.18
338 0.16
339 0.13
340 0.09
341 0.09
342 0.07
343 0.06
344 0.05
345 0.09
346 0.09
347 0.1
348 0.12
349 0.11
350 0.15
351 0.16
352 0.2
353 0.22
354 0.25
355 0.25
356 0.23
357 0.25
358 0.24
359 0.25
360 0.26
361 0.2
362 0.18
363 0.19
364 0.21
365 0.19
366 0.17
367 0.21
368 0.19
369 0.25
370 0.31
371 0.3
372 0.29
373 0.3
374 0.28
375 0.23
376 0.26
377 0.21
378 0.16
379 0.15
380 0.14
381 0.13
382 0.13
383 0.14
384 0.09
385 0.08
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.07
390 0.07
391 0.06
392 0.06
393 0.05
394 0.04
395 0.04
396 0.05
397 0.06
398 0.07
399 0.08
400 0.08
401 0.09
402 0.09
403 0.09
404 0.17
405 0.17
406 0.23
407 0.28
408 0.32
409 0.39
410 0.42
411 0.43
412 0.41
413 0.43
414 0.45
415 0.49
416 0.53
417 0.47
418 0.51
419 0.58
420 0.57
421 0.61
422 0.64
423 0.64
424 0.65
425 0.72
426 0.75
427 0.76
428 0.76
429 0.72
430 0.7
431 0.7
432 0.72
433 0.7
434 0.71
435 0.66
436 0.64
437 0.61
438 0.55
439 0.46
440 0.35
441 0.27
442 0.17
443 0.18
444 0.15
445 0.12
446 0.1
447 0.09
448 0.09
449 0.09
450 0.09
451 0.05
452 0.05
453 0.08
454 0.08
455 0.09
456 0.09
457 0.1
458 0.11
459 0.12
460 0.14
461 0.12
462 0.11
463 0.13
464 0.14
465 0.19
466 0.24
467 0.25
468 0.27
469 0.3
470 0.32
471 0.3
472 0.29
473 0.26
474 0.2
475 0.21
476 0.23
477 0.21
478 0.24
479 0.23
480 0.24
481 0.23
482 0.22
483 0.26
484 0.26
485 0.31
486 0.36
487 0.38
488 0.39
489 0.4
490 0.43
491 0.42
492 0.39
493 0.4
494 0.33
495 0.4
496 0.44
497 0.43
498 0.45
499 0.45
500 0.48
501 0.49
502 0.51
503 0.45
504 0.42
505 0.42
506 0.37
507 0.31
508 0.25
509 0.16
510 0.11
511 0.09
512 0.07
513 0.06
514 0.06
515 0.06
516 0.05
517 0.06
518 0.06
519 0.07
520 0.07
521 0.07
522 0.08
523 0.09
524 0.1
525 0.09
526 0.1
527 0.1
528 0.11
529 0.12
530 0.13
531 0.12
532 0.12
533 0.13
534 0.12
535 0.12
536 0.11
537 0.14
538 0.13
539 0.17
540 0.17
541 0.15
542 0.15
543 0.16
544 0.16
545 0.15
546 0.15
547 0.12
548 0.11
549 0.12
550 0.12
551 0.11
552 0.12
553 0.08
554 0.07
555 0.07
556 0.09
557 0.09
558 0.1
559 0.1
560 0.09
561 0.09
562 0.11
563 0.11
564 0.1
565 0.1
566 0.1
567 0.1
568 0.1
569 0.1
570 0.11
571 0.12
572 0.14
573 0.14
574 0.14
575 0.16
576 0.19
577 0.26
578 0.24
579 0.24
580 0.25
581 0.26
582 0.28
583 0.28
584 0.32
585 0.31
586 0.32
587 0.29
588 0.28
589 0.27
590 0.24
591 0.25
592 0.25
593 0.2
594 0.22
595 0.25
596 0.24
597 0.25
598 0.27
599 0.24
600 0.17
601 0.18
602 0.16
603 0.18
604 0.18
605 0.17
606 0.15
607 0.19
608 0.21
609 0.21
610 0.22
611 0.18
612 0.19
613 0.26
614 0.29
615 0.28
616 0.27
617 0.28
618 0.26
619 0.27
620 0.28
621 0.23
622 0.23
623 0.23
624 0.28
625 0.24
626 0.23
627 0.22
628 0.22
629 0.19
630 0.2
631 0.23
632 0.21
633 0.24
634 0.27
635 0.32
636 0.34
637 0.39
638 0.4
639 0.36
640 0.34
641 0.32
642 0.36
643 0.41
644 0.41
645 0.45
646 0.44
647 0.48
648 0.54
649 0.57
650 0.55
651 0.49
652 0.46
653 0.44
654 0.43
655 0.37
656 0.33
657 0.31
658 0.3
659 0.26
660 0.26
661 0.22
662 0.19
663 0.23
664 0.23
665 0.26
666 0.3
667 0.37
668 0.39
669 0.45
670 0.46
671 0.45
672 0.43
673 0.38
674 0.33
675 0.26
676 0.28
677 0.22
678 0.24
679 0.26
680 0.28
681 0.3
682 0.32
683 0.37
684 0.33
685 0.33
686 0.34
687 0.34
688 0.37
689 0.35
690 0.31
691 0.3
692 0.3
693 0.27
694 0.23
695 0.2
696 0.16
697 0.16
698 0.16
699 0.11
700 0.11
701 0.1
702 0.1
703 0.09
704 0.09
705 0.09
706 0.08
707 0.08
708 0.09
709 0.11
710 0.12
711 0.13
712 0.14
713 0.16
714 0.17
715 0.18
716 0.2
717 0.19
718 0.22
719 0.25
720 0.26
721 0.25
722 0.25
723 0.24
724 0.22
725 0.25
726 0.23
727 0.19
728 0.18
729 0.19
730 0.2
731 0.25
732 0.26
733 0.24
734 0.28
735 0.32
736 0.32
737 0.32
738 0.33
739 0.32
740 0.34
741 0.35
742 0.3
743 0.26
744 0.27
745 0.26
746 0.24
747 0.21
748 0.2
749 0.25
750 0.26
751 0.3
752 0.3
753 0.31
754 0.3
755 0.3
756 0.29
757 0.32
758 0.36
759 0.36
760 0.41
761 0.44
762 0.52
763 0.6
764 0.66
765 0.62
766 0.63
767 0.66
768 0.63
769 0.62
770 0.58
771 0.55
772 0.48
773 0.44
774 0.38
775 0.32
776 0.31
777 0.33
778 0.29
779 0.25
780 0.29
781 0.32
782 0.36
783 0.4
784 0.4
785 0.42
786 0.42
787 0.43
788 0.42
789 0.4