Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1YVR8

Protein Details
Accession A0A1Y1YVR8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
195-218VGKGNGKTHKVKKQKEKTYVYEIEHydrophilic
222-249NDGRRGGRGGRQNRNNKRQTNNKVNVDDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
56-107PKRGGFAGKSTRPARSGDGGNRGRRGGRGEYKGRGREFDRHSGSARRDSQKK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences MTDVRSKNPFELLGDEEETAQTTTKLTRNEKKILKNEVIDNSRATPRENRLRNDYPKRGGFAGKSTRPARSGDGGNRGRRGGRGEYKGRGREFDRHSGSARRDSQKKDVAGKGSWGKPTENLEEVVEVEQENTNEEEVKEVKPEEKLMTLEDYLASQAKKTIVNETNIRSANEGVDESKWGETVELEKDDEAYFVGKGNGKTHKVKKQKEKTYVYEIEQRFNDGRRGGRGGRQNRNNKRQTNNKVNVDDTNDFPSLK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.25
3 0.22
4 0.21
5 0.2
6 0.17
7 0.14
8 0.1
9 0.1
10 0.14
11 0.18
12 0.26
13 0.33
14 0.42
15 0.49
16 0.58
17 0.65
18 0.7
19 0.74
20 0.74
21 0.71
22 0.67
23 0.66
24 0.65
25 0.61
26 0.53
27 0.46
28 0.42
29 0.4
30 0.37
31 0.34
32 0.31
33 0.37
34 0.45
35 0.5
36 0.52
37 0.56
38 0.65
39 0.72
40 0.75
41 0.74
42 0.72
43 0.68
44 0.65
45 0.59
46 0.53
47 0.44
48 0.43
49 0.44
50 0.4
51 0.45
52 0.44
53 0.45
54 0.43
55 0.43
56 0.38
57 0.34
58 0.36
59 0.33
60 0.41
61 0.45
62 0.47
63 0.47
64 0.45
65 0.41
66 0.37
67 0.36
68 0.34
69 0.35
70 0.39
71 0.42
72 0.47
73 0.53
74 0.57
75 0.54
76 0.49
77 0.45
78 0.46
79 0.46
80 0.48
81 0.46
82 0.42
83 0.44
84 0.46
85 0.46
86 0.45
87 0.47
88 0.45
89 0.46
90 0.48
91 0.53
92 0.53
93 0.54
94 0.52
95 0.48
96 0.45
97 0.39
98 0.39
99 0.37
100 0.34
101 0.33
102 0.29
103 0.26
104 0.25
105 0.28
106 0.26
107 0.22
108 0.2
109 0.17
110 0.16
111 0.16
112 0.13
113 0.1
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.07
119 0.06
120 0.06
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.11
129 0.11
130 0.13
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.14
136 0.13
137 0.12
138 0.1
139 0.09
140 0.08
141 0.1
142 0.09
143 0.07
144 0.08
145 0.1
146 0.12
147 0.13
148 0.2
149 0.22
150 0.26
151 0.3
152 0.31
153 0.36
154 0.35
155 0.35
156 0.28
157 0.25
158 0.21
159 0.18
160 0.16
161 0.11
162 0.1
163 0.11
164 0.11
165 0.1
166 0.1
167 0.09
168 0.08
169 0.08
170 0.1
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.13
176 0.13
177 0.13
178 0.11
179 0.09
180 0.07
181 0.08
182 0.1
183 0.13
184 0.14
185 0.19
186 0.25
187 0.3
188 0.39
189 0.47
190 0.54
191 0.61
192 0.69
193 0.76
194 0.8
195 0.85
196 0.86
197 0.86
198 0.82
199 0.81
200 0.77
201 0.7
202 0.68
203 0.59
204 0.55
205 0.47
206 0.46
207 0.39
208 0.36
209 0.37
210 0.31
211 0.33
212 0.32
213 0.38
214 0.36
215 0.41
216 0.48
217 0.53
218 0.6
219 0.66
220 0.72
221 0.77
222 0.85
223 0.88
224 0.86
225 0.86
226 0.86
227 0.87
228 0.87
229 0.86
230 0.84
231 0.79
232 0.74
233 0.69
234 0.66
235 0.58
236 0.5
237 0.45