Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2D4D0

Protein Details
Accession A0A1Y2D4D0    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MENFDSKKPHIRKYPDANGYFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 16.5, cyto_nucl 10, pero 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006653  Trp_synth_b_CS  
IPR006654  Trp_synth_beta  
IPR023026  Trp_synth_beta/beta-like  
IPR001926  TrpB-like_PALP  
IPR036052  TrpB-like_PALP_sf  
Gene Ontology GO:0004834  F:tryptophan synthase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00291  PALP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00168  TRP_SYNTHASE_BETA  
CDD cd06446  Trp-synth_B  
Amino Acid Sequences MENFDSKKPHIRKYPDANGYFGKYGGSFVSEELQKEMKNIENAYNTICRSQDFIHELRHIRKHFQGRPTPVYYCKNLSDLIGGARIYLKREDLNHSGAHKLNHCMGEALLAKFMGKKKLIAETGAGQHGVALATAGAYFNIKTEIHMGEVDIAKEKPNVTRMKILGADVISVDRGTKTLKDAVDSAFEAYLADPVNTIYCIGSVVGPHPFPMMVREFQRVVGIEAKDQYREMTGELPDHVVACCGGGSNAMGILSAFIEDPVRLHIVEPLGRGEKIGDNAASVRFGSEGVLHGFNSLVIKDEKGGPAPVYSCASGLDYPSVGPEHAFLVEQKRFEGHGINDIECIEAFFILSRLEGIIPALESAHAVAYAIKLAKENKSESILVNLSGRGDKDIDYVMDTWGEYADKFPNYSLLEGVDTSGINIL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.81
3 0.76
4 0.71
5 0.66
6 0.62
7 0.52
8 0.42
9 0.33
10 0.23
11 0.22
12 0.18
13 0.16
14 0.12
15 0.12
16 0.18
17 0.19
18 0.2
19 0.22
20 0.24
21 0.22
22 0.23
23 0.26
24 0.25
25 0.28
26 0.29
27 0.31
28 0.32
29 0.33
30 0.35
31 0.37
32 0.33
33 0.3
34 0.29
35 0.24
36 0.24
37 0.24
38 0.28
39 0.29
40 0.3
41 0.34
42 0.39
43 0.44
44 0.48
45 0.55
46 0.5
47 0.5
48 0.56
49 0.6
50 0.61
51 0.65
52 0.67
53 0.67
54 0.72
55 0.72
56 0.67
57 0.64
58 0.62
59 0.57
60 0.52
61 0.45
62 0.4
63 0.36
64 0.32
65 0.27
66 0.22
67 0.19
68 0.17
69 0.15
70 0.13
71 0.16
72 0.16
73 0.17
74 0.17
75 0.18
76 0.18
77 0.22
78 0.28
79 0.29
80 0.31
81 0.32
82 0.32
83 0.34
84 0.34
85 0.34
86 0.3
87 0.29
88 0.31
89 0.28
90 0.27
91 0.24
92 0.21
93 0.23
94 0.23
95 0.2
96 0.16
97 0.15
98 0.15
99 0.18
100 0.21
101 0.21
102 0.19
103 0.21
104 0.23
105 0.3
106 0.31
107 0.28
108 0.28
109 0.25
110 0.27
111 0.26
112 0.24
113 0.16
114 0.15
115 0.14
116 0.12
117 0.08
118 0.05
119 0.03
120 0.03
121 0.04
122 0.04
123 0.03
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.1
131 0.11
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.12
136 0.13
137 0.13
138 0.12
139 0.12
140 0.12
141 0.13
142 0.14
143 0.13
144 0.2
145 0.23
146 0.24
147 0.3
148 0.29
149 0.31
150 0.31
151 0.29
152 0.24
153 0.2
154 0.18
155 0.12
156 0.11
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.07
164 0.09
165 0.13
166 0.14
167 0.15
168 0.16
169 0.16
170 0.17
171 0.17
172 0.15
173 0.1
174 0.1
175 0.09
176 0.08
177 0.08
178 0.06
179 0.06
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.09
199 0.1
200 0.11
201 0.13
202 0.15
203 0.16
204 0.16
205 0.17
206 0.15
207 0.14
208 0.17
209 0.15
210 0.14
211 0.16
212 0.16
213 0.15
214 0.15
215 0.14
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.1
221 0.1
222 0.11
223 0.11
224 0.1
225 0.1
226 0.09
227 0.07
228 0.06
229 0.05
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.03
234 0.04
235 0.03
236 0.04
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.04
243 0.03
244 0.03
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.09
253 0.11
254 0.12
255 0.13
256 0.14
257 0.15
258 0.15
259 0.14
260 0.14
261 0.14
262 0.14
263 0.15
264 0.12
265 0.11
266 0.12
267 0.12
268 0.11
269 0.09
270 0.08
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.06
275 0.07
276 0.09
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.1
288 0.12
289 0.13
290 0.14
291 0.16
292 0.13
293 0.14
294 0.15
295 0.16
296 0.16
297 0.15
298 0.13
299 0.13
300 0.14
301 0.13
302 0.13
303 0.12
304 0.1
305 0.09
306 0.11
307 0.11
308 0.09
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.09
314 0.1
315 0.16
316 0.19
317 0.2
318 0.19
319 0.2
320 0.2
321 0.21
322 0.24
323 0.18
324 0.23
325 0.26
326 0.25
327 0.25
328 0.24
329 0.23
330 0.18
331 0.17
332 0.09
333 0.06
334 0.06
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.05
353 0.05
354 0.06
355 0.06
356 0.09
357 0.1
358 0.1
359 0.14
360 0.17
361 0.23
362 0.28
363 0.3
364 0.31
365 0.34
366 0.35
367 0.33
368 0.36
369 0.31
370 0.28
371 0.26
372 0.23
373 0.21
374 0.21
375 0.21
376 0.17
377 0.17
378 0.16
379 0.16
380 0.18
381 0.17
382 0.17
383 0.17
384 0.16
385 0.15
386 0.14
387 0.13
388 0.12
389 0.12
390 0.09
391 0.11
392 0.16
393 0.16
394 0.17
395 0.18
396 0.23
397 0.24
398 0.25
399 0.23
400 0.2
401 0.2
402 0.19
403 0.19
404 0.15
405 0.12