Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2CXH6

Protein Details
Accession A0A1Y2CXH6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
193-215STSTKKTSTKKTSTKKTTTKTKTHydrophilic
393-451SYTTKKSSTKTTKTTKKSTKKTTKTTKTTKTTKTTKTKTTKTKTTKTTKKNSSLPTNSTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 10.333, mito_nucl 10.333, mito 4.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001002  Chitin-bd_1  
IPR018371  Chitin-binding_1_CS  
IPR036861  Endochitinase-like_sf  
IPR032675  LRR_dom_sf  
Gene Ontology GO:0008061  F:chitin binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00187  Chitin_bind_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00026  CHIT_BIND_I_1  
PS50941  CHIT_BIND_I_2  
CDD cd00035  ChtBD1  
Amino Acid Sequences MKFIRTLVYSFLTLGALASQCDDAKKYSKSLDTGSINYKCDSNGKVTEFKLTHVVINKDDVKVISKFTKAQKIEFDGCEYVDTLDSSYFKDFSKLTYLSVRSELPAFKYAKNLKTLEIQGNTSVDQEDIKIISKFTELEKLKIDVRNVSAKDLSSLKNLKHLKEFKLVDNNSKDNLCSYVPKEIKSICYPKDSTSTKKTSTKKTSTKKTTTKTKTTKTTKSKVTATSVTVNSNDDLVSIKGSTKVKKIELHRISLKQNGVDALATLTGLETIEFVDCDYYSPDLKASSLKNLKNLRKLIANSRHDIILFKNNDSLKSLTVSGNTSLNKDDIKIIAGFTKLEKLEIDVRVIDTTDLSSLKSLKHLKELKIEDSSSEVNFCQKLPKELRSLCKTSYTTKKSSTKTTKTTKKSTKKTTKTTKTTKTTKTTKTKTTKTKTTKTTKKNSSLPTNSTDKCGKGVAICKKGYCCSKYGYCGKSDDYCKSSRGCQSEFGSCK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.13
3 0.1
4 0.09
5 0.1
6 0.11
7 0.12
8 0.14
9 0.15
10 0.17
11 0.23
12 0.26
13 0.29
14 0.34
15 0.38
16 0.4
17 0.42
18 0.46
19 0.44
20 0.46
21 0.5
22 0.49
23 0.46
24 0.43
25 0.4
26 0.33
27 0.33
28 0.31
29 0.29
30 0.31
31 0.33
32 0.38
33 0.38
34 0.46
35 0.41
36 0.41
37 0.4
38 0.35
39 0.34
40 0.35
41 0.37
42 0.3
43 0.36
44 0.37
45 0.32
46 0.33
47 0.29
48 0.27
49 0.25
50 0.28
51 0.26
52 0.26
53 0.31
54 0.37
55 0.46
56 0.44
57 0.47
58 0.49
59 0.52
60 0.55
61 0.5
62 0.47
63 0.39
64 0.37
65 0.33
66 0.27
67 0.2
68 0.16
69 0.14
70 0.1
71 0.11
72 0.11
73 0.12
74 0.14
75 0.14
76 0.13
77 0.16
78 0.15
79 0.16
80 0.23
81 0.21
82 0.22
83 0.28
84 0.3
85 0.29
86 0.32
87 0.3
88 0.24
89 0.26
90 0.25
91 0.22
92 0.27
93 0.27
94 0.26
95 0.34
96 0.4
97 0.41
98 0.46
99 0.43
100 0.39
101 0.42
102 0.46
103 0.43
104 0.39
105 0.36
106 0.31
107 0.31
108 0.3
109 0.24
110 0.19
111 0.13
112 0.11
113 0.1
114 0.09
115 0.09
116 0.11
117 0.1
118 0.1
119 0.11
120 0.11
121 0.12
122 0.12
123 0.21
124 0.2
125 0.22
126 0.24
127 0.26
128 0.3
129 0.32
130 0.32
131 0.26
132 0.28
133 0.33
134 0.31
135 0.32
136 0.29
137 0.25
138 0.26
139 0.26
140 0.24
141 0.23
142 0.26
143 0.24
144 0.31
145 0.35
146 0.34
147 0.4
148 0.44
149 0.42
150 0.47
151 0.5
152 0.46
153 0.53
154 0.52
155 0.5
156 0.5
157 0.48
158 0.41
159 0.39
160 0.34
161 0.24
162 0.25
163 0.19
164 0.17
165 0.16
166 0.24
167 0.25
168 0.26
169 0.28
170 0.27
171 0.3
172 0.33
173 0.38
174 0.3
175 0.35
176 0.35
177 0.34
178 0.41
179 0.41
180 0.4
181 0.42
182 0.45
183 0.44
184 0.52
185 0.56
186 0.57
187 0.63
188 0.67
189 0.69
190 0.73
191 0.78
192 0.79
193 0.83
194 0.81
195 0.79
196 0.81
197 0.78
198 0.79
199 0.77
200 0.75
201 0.76
202 0.75
203 0.78
204 0.76
205 0.76
206 0.72
207 0.69
208 0.66
209 0.59
210 0.56
211 0.48
212 0.42
213 0.39
214 0.34
215 0.3
216 0.26
217 0.23
218 0.18
219 0.16
220 0.13
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.06
227 0.11
228 0.13
229 0.15
230 0.18
231 0.21
232 0.24
233 0.3
234 0.34
235 0.4
236 0.4
237 0.44
238 0.45
239 0.46
240 0.45
241 0.44
242 0.41
243 0.3
244 0.28
245 0.23
246 0.18
247 0.14
248 0.11
249 0.07
250 0.06
251 0.05
252 0.04
253 0.04
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.05
265 0.06
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.12
273 0.12
274 0.19
275 0.26
276 0.27
277 0.35
278 0.43
279 0.48
280 0.52
281 0.53
282 0.47
283 0.45
284 0.46
285 0.49
286 0.5
287 0.49
288 0.43
289 0.42
290 0.41
291 0.35
292 0.34
293 0.26
294 0.25
295 0.22
296 0.21
297 0.24
298 0.25
299 0.25
300 0.27
301 0.25
302 0.18
303 0.18
304 0.19
305 0.15
306 0.16
307 0.16
308 0.15
309 0.18
310 0.17
311 0.17
312 0.16
313 0.17
314 0.15
315 0.15
316 0.15
317 0.11
318 0.13
319 0.12
320 0.11
321 0.12
322 0.12
323 0.12
324 0.11
325 0.15
326 0.13
327 0.13
328 0.13
329 0.14
330 0.19
331 0.2
332 0.21
333 0.17
334 0.17
335 0.17
336 0.17
337 0.14
338 0.09
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.09
344 0.1
345 0.1
346 0.17
347 0.23
348 0.22
349 0.32
350 0.38
351 0.4
352 0.48
353 0.51
354 0.48
355 0.47
356 0.46
357 0.37
358 0.34
359 0.32
360 0.24
361 0.21
362 0.17
363 0.16
364 0.17
365 0.16
366 0.2
367 0.2
368 0.29
369 0.33
370 0.38
371 0.44
372 0.49
373 0.58
374 0.58
375 0.61
376 0.54
377 0.55
378 0.53
379 0.52
380 0.57
381 0.54
382 0.52
383 0.57
384 0.64
385 0.6
386 0.68
387 0.71
388 0.69
389 0.72
390 0.77
391 0.78
392 0.78
393 0.84
394 0.85
395 0.85
396 0.86
397 0.88
398 0.89
399 0.89
400 0.91
401 0.92
402 0.91
403 0.91
404 0.91
405 0.9
406 0.88
407 0.88
408 0.86
409 0.85
410 0.84
411 0.83
412 0.84
413 0.82
414 0.82
415 0.83
416 0.84
417 0.85
418 0.85
419 0.86
420 0.84
421 0.86
422 0.86
423 0.87
424 0.88
425 0.87
426 0.88
427 0.88
428 0.87
429 0.86
430 0.85
431 0.85
432 0.82
433 0.76
434 0.71
435 0.7
436 0.62
437 0.58
438 0.54
439 0.44
440 0.39
441 0.36
442 0.31
443 0.28
444 0.36
445 0.41
446 0.45
447 0.46
448 0.47
449 0.5
450 0.55
451 0.58
452 0.52
453 0.46
454 0.45
455 0.49
456 0.54
457 0.59
458 0.56
459 0.51
460 0.51
461 0.53
462 0.54
463 0.53
464 0.52
465 0.48
466 0.47
467 0.46
468 0.46
469 0.49
470 0.49
471 0.5
472 0.45
473 0.47
474 0.49