Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H0EVH9

Protein Details
Accession H0EVH9    Localization Confidence High Confidence Score 19.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-52VRQSKAADPLRPRKKPIRRPNLPKGALPHydrophilic
526-549SSGNESSRKKQKKHASSRPSGTSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-59ADPLRPRKKPIRRPNLPKGALPPKPKGPV
424-436KKIGKKTRKALTR
499-520SGRPKHTDALKKHKNGLKRSGS
531-540SSRKKQKKHA
614-625GKKKKLKLRLGG
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008851  TFIIF-alpha  
IPR011039  TFIIF_interaction  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF05793  TFIIF_alpha  
Amino Acid Sequences MSASPSGLSNNQTPTPNGGPPPGFVRQSKAADPLRPRKKPIRRPNLPKGALPPKPKGPVAPARGQYPVNGLAAGPIGSQPAPPPASGLHNGWTNPPEGETRYFPLYTTKKALREGLRYHVMRFSTKKDVDPANQESEQQEQFIRPVTLHRRDPKQPSRAEAGKEEEIPDVVMDSKEREKLEIAKAEKDAKRAADLAQIAPSGNNAAAQAKKNHPFRMEKTTQVYRLDKTEDEKKASDLRYEEALPWHLEDAEGKQTWVGNYEAALSDTNVMFLIEGERFLMVPIEKWYKFTAKNKFATFTIEEAEAKMGKKTRESRWVMKDKQEALLKAPPMHRLYTVKSESNTAKNANKSEMQDMDDLDFAEGDLFQDDDEQPTVEPDNDEETKETQAKIKREQQAANIFDQANEAEVEKELEKELLEMEAEKKIGKKTRKALTRRERNLIYESDSDHPYSDTSEDDTSDEEKQNEIDRRKDEEAKNKLKVESKVPSGASSKGTNTPSGRPKHTDALKKHKNGLKRSGSPNLSESSGNESSRKKQKKHASSRPSGTSTPIPGSRPMSPMPTSQAGQGRKSSMVKLNVNSTKVTDIHSAPPNPSPTGGPMSDAEATGGEMSDGGKKKKLKLRLGGTPSGSRAGSPEIRAGGTGSRAGSPQAPAPASSPRGPISVGEIAAELPPEGISIKELMAKFGGRVGDGPGKTQKNEFIRLVKECAAFGKDKLLRRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.38
3 0.39
4 0.37
5 0.38
6 0.35
7 0.35
8 0.39
9 0.38
10 0.38
11 0.34
12 0.38
13 0.4
14 0.44
15 0.45
16 0.48
17 0.47
18 0.51
19 0.6
20 0.64
21 0.67
22 0.68
23 0.73
24 0.76
25 0.81
26 0.85
27 0.86
28 0.86
29 0.87
30 0.91
31 0.94
32 0.94
33 0.87
34 0.8
35 0.78
36 0.77
37 0.74
38 0.7
39 0.66
40 0.63
41 0.66
42 0.63
43 0.57
44 0.56
45 0.58
46 0.58
47 0.59
48 0.55
49 0.51
50 0.54
51 0.5
52 0.43
53 0.38
54 0.34
55 0.25
56 0.22
57 0.19
58 0.16
59 0.16
60 0.15
61 0.1
62 0.08
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.1
67 0.16
68 0.16
69 0.16
70 0.17
71 0.18
72 0.23
73 0.26
74 0.26
75 0.24
76 0.27
77 0.28
78 0.29
79 0.29
80 0.25
81 0.22
82 0.22
83 0.21
84 0.21
85 0.24
86 0.24
87 0.27
88 0.29
89 0.29
90 0.27
91 0.34
92 0.34
93 0.35
94 0.4
95 0.42
96 0.42
97 0.46
98 0.53
99 0.51
100 0.55
101 0.54
102 0.54
103 0.57
104 0.54
105 0.52
106 0.48
107 0.44
108 0.41
109 0.41
110 0.39
111 0.4
112 0.42
113 0.43
114 0.44
115 0.48
116 0.47
117 0.52
118 0.51
119 0.47
120 0.45
121 0.44
122 0.39
123 0.38
124 0.33
125 0.27
126 0.23
127 0.17
128 0.17
129 0.19
130 0.18
131 0.13
132 0.21
133 0.29
134 0.36
135 0.44
136 0.5
137 0.54
138 0.62
139 0.72
140 0.74
141 0.74
142 0.7
143 0.66
144 0.67
145 0.64
146 0.6
147 0.54
148 0.5
149 0.44
150 0.41
151 0.38
152 0.3
153 0.25
154 0.21
155 0.17
156 0.11
157 0.09
158 0.09
159 0.08
160 0.1
161 0.13
162 0.18
163 0.18
164 0.19
165 0.2
166 0.25
167 0.31
168 0.35
169 0.35
170 0.34
171 0.37
172 0.44
173 0.44
174 0.41
175 0.38
176 0.32
177 0.32
178 0.29
179 0.27
180 0.24
181 0.24
182 0.21
183 0.2
184 0.19
185 0.17
186 0.16
187 0.15
188 0.1
189 0.08
190 0.08
191 0.07
192 0.09
193 0.12
194 0.16
195 0.21
196 0.27
197 0.35
198 0.39
199 0.43
200 0.46
201 0.5
202 0.51
203 0.56
204 0.53
205 0.5
206 0.52
207 0.54
208 0.53
209 0.52
210 0.5
211 0.41
212 0.41
213 0.39
214 0.33
215 0.32
216 0.37
217 0.35
218 0.36
219 0.35
220 0.34
221 0.38
222 0.37
223 0.36
224 0.29
225 0.27
226 0.25
227 0.25
228 0.24
229 0.19
230 0.2
231 0.17
232 0.16
233 0.15
234 0.12
235 0.11
236 0.1
237 0.11
238 0.14
239 0.14
240 0.13
241 0.13
242 0.14
243 0.14
244 0.15
245 0.13
246 0.08
247 0.08
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.07
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.07
257 0.06
258 0.05
259 0.05
260 0.07
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.07
268 0.05
269 0.06
270 0.1
271 0.16
272 0.16
273 0.18
274 0.2
275 0.24
276 0.3
277 0.37
278 0.43
279 0.45
280 0.5
281 0.5
282 0.5
283 0.45
284 0.44
285 0.38
286 0.29
287 0.23
288 0.18
289 0.17
290 0.15
291 0.15
292 0.12
293 0.11
294 0.12
295 0.14
296 0.14
297 0.21
298 0.27
299 0.31
300 0.4
301 0.46
302 0.51
303 0.58
304 0.66
305 0.63
306 0.64
307 0.63
308 0.55
309 0.55
310 0.5
311 0.41
312 0.35
313 0.35
314 0.3
315 0.28
316 0.28
317 0.28
318 0.26
319 0.26
320 0.25
321 0.24
322 0.25
323 0.29
324 0.31
325 0.27
326 0.26
327 0.29
328 0.29
329 0.3
330 0.29
331 0.25
332 0.26
333 0.27
334 0.28
335 0.27
336 0.27
337 0.26
338 0.26
339 0.24
340 0.22
341 0.2
342 0.19
343 0.17
344 0.14
345 0.13
346 0.09
347 0.08
348 0.05
349 0.05
350 0.04
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.03
355 0.04
356 0.05
357 0.05
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.1
367 0.11
368 0.11
369 0.12
370 0.12
371 0.15
372 0.16
373 0.16
374 0.17
375 0.22
376 0.25
377 0.31
378 0.38
379 0.42
380 0.46
381 0.48
382 0.49
383 0.52
384 0.5
385 0.44
386 0.39
387 0.32
388 0.27
389 0.25
390 0.19
391 0.11
392 0.09
393 0.08
394 0.06
395 0.06
396 0.07
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.05
405 0.05
406 0.06
407 0.07
408 0.08
409 0.08
410 0.08
411 0.1
412 0.15
413 0.22
414 0.27
415 0.34
416 0.41
417 0.49
418 0.58
419 0.62
420 0.69
421 0.73
422 0.78
423 0.76
424 0.74
425 0.68
426 0.62
427 0.59
428 0.5
429 0.43
430 0.34
431 0.31
432 0.27
433 0.26
434 0.23
435 0.2
436 0.18
437 0.14
438 0.13
439 0.11
440 0.09
441 0.1
442 0.1
443 0.11
444 0.11
445 0.12
446 0.13
447 0.15
448 0.16
449 0.14
450 0.14
451 0.14
452 0.2
453 0.25
454 0.27
455 0.3
456 0.31
457 0.37
458 0.41
459 0.48
460 0.48
461 0.52
462 0.58
463 0.6
464 0.63
465 0.6
466 0.59
467 0.57
468 0.54
469 0.51
470 0.46
471 0.42
472 0.4
473 0.38
474 0.37
475 0.33
476 0.32
477 0.28
478 0.25
479 0.24
480 0.25
481 0.26
482 0.28
483 0.28
484 0.33
485 0.38
486 0.42
487 0.44
488 0.43
489 0.46
490 0.5
491 0.55
492 0.57
493 0.57
494 0.63
495 0.67
496 0.67
497 0.71
498 0.66
499 0.66
500 0.65
501 0.67
502 0.65
503 0.64
504 0.66
505 0.66
506 0.65
507 0.59
508 0.54
509 0.46
510 0.38
511 0.31
512 0.25
513 0.24
514 0.26
515 0.24
516 0.26
517 0.27
518 0.33
519 0.44
520 0.52
521 0.48
522 0.54
523 0.64
524 0.71
525 0.79
526 0.82
527 0.82
528 0.82
529 0.85
530 0.82
531 0.76
532 0.65
533 0.58
534 0.51
535 0.44
536 0.39
537 0.35
538 0.3
539 0.3
540 0.32
541 0.31
542 0.31
543 0.29
544 0.3
545 0.29
546 0.29
547 0.3
548 0.3
549 0.28
550 0.29
551 0.35
552 0.33
553 0.34
554 0.35
555 0.33
556 0.33
557 0.35
558 0.35
559 0.35
560 0.39
561 0.41
562 0.41
563 0.48
564 0.48
565 0.48
566 0.44
567 0.38
568 0.34
569 0.3
570 0.31
571 0.25
572 0.23
573 0.28
574 0.34
575 0.34
576 0.33
577 0.37
578 0.37
579 0.34
580 0.33
581 0.27
582 0.24
583 0.27
584 0.25
585 0.22
586 0.2
587 0.22
588 0.22
589 0.2
590 0.17
591 0.12
592 0.12
593 0.1
594 0.09
595 0.06
596 0.05
597 0.06
598 0.12
599 0.17
600 0.18
601 0.25
602 0.29
603 0.38
604 0.45
605 0.54
606 0.57
607 0.63
608 0.68
609 0.72
610 0.75
611 0.73
612 0.69
613 0.63
614 0.56
615 0.49
616 0.41
617 0.31
618 0.26
619 0.26
620 0.25
621 0.24
622 0.25
623 0.24
624 0.24
625 0.24
626 0.23
627 0.19
628 0.17
629 0.18
630 0.15
631 0.15
632 0.15
633 0.17
634 0.18
635 0.17
636 0.19
637 0.22
638 0.22
639 0.22
640 0.24
641 0.29
642 0.31
643 0.32
644 0.32
645 0.28
646 0.29
647 0.29
648 0.27
649 0.26
650 0.25
651 0.23
652 0.19
653 0.18
654 0.17
655 0.17
656 0.17
657 0.1
658 0.07
659 0.07
660 0.07
661 0.07
662 0.06
663 0.07
664 0.08
665 0.09
666 0.14
667 0.15
668 0.16
669 0.18
670 0.18
671 0.17
672 0.2
673 0.2
674 0.15
675 0.16
676 0.2
677 0.25
678 0.25
679 0.3
680 0.35
681 0.38
682 0.4
683 0.42
684 0.45
685 0.44
686 0.5
687 0.51
688 0.49
689 0.51
690 0.54
691 0.55
692 0.53
693 0.47
694 0.41
695 0.4
696 0.37
697 0.33
698 0.29
699 0.35
700 0.35