Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H0EGG6

Protein Details
Accession H0EGG6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
134-155DESERWDKRMKKKDNHRDDQAFBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 12.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPPAKKRKTRATAEPAEEIPALNATANETAAPKDNNSNEEPPLAEASSSSASDAATKAKERAERFKALQARAKTGAQKNLKEATLESQRLATDPNLLTSLNRKSAIASHNLMKADAEVAGEDFERKRAWDWTIDESERWDKRMKKKDNHRDDQAFQDYRQDSRKVYKRQIRDLKVDMDGYEKEKMKAVEKAAASGGLEIVETDDGELVAVDKHGTFYSTADSTGFVEHKPPKDAVDRLVKDLQQAEEARLKKRRERMGGNGDDGDVTYINEKNKNFNQKLNRFYNKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.64
3 0.57
4 0.49
5 0.38
6 0.29
7 0.2
8 0.15
9 0.11
10 0.11
11 0.1
12 0.11
13 0.11
14 0.11
15 0.11
16 0.12
17 0.16
18 0.17
19 0.17
20 0.23
21 0.26
22 0.3
23 0.34
24 0.36
25 0.33
26 0.33
27 0.32
28 0.26
29 0.25
30 0.21
31 0.16
32 0.13
33 0.14
34 0.15
35 0.14
36 0.12
37 0.1
38 0.1
39 0.12
40 0.12
41 0.13
42 0.13
43 0.15
44 0.17
45 0.21
46 0.28
47 0.31
48 0.4
49 0.43
50 0.47
51 0.48
52 0.53
53 0.56
54 0.55
55 0.57
56 0.5
57 0.5
58 0.47
59 0.47
60 0.47
61 0.45
62 0.5
63 0.49
64 0.49
65 0.48
66 0.49
67 0.46
68 0.39
69 0.34
70 0.32
71 0.33
72 0.31
73 0.27
74 0.24
75 0.24
76 0.23
77 0.24
78 0.18
79 0.15
80 0.14
81 0.15
82 0.15
83 0.15
84 0.15
85 0.18
86 0.21
87 0.19
88 0.2
89 0.19
90 0.18
91 0.23
92 0.25
93 0.25
94 0.23
95 0.22
96 0.25
97 0.25
98 0.25
99 0.2
100 0.17
101 0.13
102 0.11
103 0.08
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.06
109 0.06
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.09
114 0.11
115 0.13
116 0.16
117 0.19
118 0.23
119 0.27
120 0.27
121 0.25
122 0.25
123 0.31
124 0.27
125 0.26
126 0.27
127 0.29
128 0.38
129 0.49
130 0.55
131 0.57
132 0.68
133 0.77
134 0.82
135 0.82
136 0.8
137 0.75
138 0.67
139 0.65
140 0.6
141 0.51
142 0.4
143 0.4
144 0.33
145 0.31
146 0.33
147 0.28
148 0.23
149 0.31
150 0.4
151 0.4
152 0.49
153 0.53
154 0.56
155 0.65
156 0.73
157 0.69
158 0.66
159 0.62
160 0.56
161 0.5
162 0.44
163 0.34
164 0.27
165 0.23
166 0.19
167 0.21
168 0.19
169 0.18
170 0.2
171 0.21
172 0.22
173 0.25
174 0.24
175 0.25
176 0.24
177 0.25
178 0.22
179 0.21
180 0.18
181 0.14
182 0.12
183 0.06
184 0.06
185 0.04
186 0.05
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.03
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.11
205 0.11
206 0.12
207 0.11
208 0.12
209 0.12
210 0.14
211 0.14
212 0.11
213 0.17
214 0.23
215 0.26
216 0.28
217 0.28
218 0.29
219 0.35
220 0.37
221 0.37
222 0.42
223 0.41
224 0.43
225 0.47
226 0.43
227 0.4
228 0.41
229 0.35
230 0.31
231 0.3
232 0.28
233 0.3
234 0.33
235 0.37
236 0.42
237 0.46
238 0.48
239 0.56
240 0.62
241 0.64
242 0.69
243 0.72
244 0.75
245 0.75
246 0.71
247 0.63
248 0.54
249 0.45
250 0.37
251 0.28
252 0.18
253 0.13
254 0.11
255 0.14
256 0.17
257 0.23
258 0.24
259 0.31
260 0.39
261 0.5
262 0.51
263 0.57
264 0.64
265 0.67
266 0.76
267 0.78