FuNGI

A0A1Y2D6H1

Protein Details

Accession

A0A1Y2D6H1

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
84-119	NVDKNIKEIEKKKDKKKNKKDKDGEKKDEQKEEKKE	Basic
384-411	NGEDNKKSKKKHGKKNKRNNEKNHAESQ	Basic
658-681	WAYLYYRKDKKTRPLDDKIRDELK	Hydrophilic
687-714	YKTIDDFRKANKEKKEKEEKEKNEKAQK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
90-114	KEIEKKKDKKKNKKDKDGEKKDEQK
389-423	KKSKKKHGKKNKRNNEKNHAESQPKNIKKGPRTKR
694-714	RKANKEKKEKEEKEKNEKAQK

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006607 DM15 IPR006630 La_HTH IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF05383 La
PROSITE	View protein in PROSITE PS50961 HTH_LA
CDD	cd07323 LAM

Amino Acid Sequences

MDGFSQIVPEGIFITSNPENLCVDYLNLDSVRTYLKLQIKYYFSIQNLCKDIFLRKQMNEEGWIDLEIIKGFKRVEGLLKLGQNVDKNIKEIEKKKDKKKNKKDKDGEKKDEQKEEKKEENQDEMEYDDAWNNQLILSSLKDEESVEVKAEEEAIYLRKKDDWKFWINPLESIITTMKELSTNEDDDEDDNEKKNNQPEIKIEDTDAPKDREVETKEDDEGWTTYNGHRRRQKKTDGATSENKPKTDGDDLFQFDDEEEWGSSPRFQDEPEDKPADDEKEEKKDEKAEDENYEIDDDMLQGLMIVTQRRKQPANPPNSLSQNESLPPRKHNTTAYDRYKNNESLNEMINEGLYYYEHNMKESNRLSMMTSKIEVVDEEEFEKLNGEDNKKSKKKHGKKNKRNNEKNHAESQPKNIKKGPRTKRFFPSETPVSNSKFLGTTPGPIGFLIVNDQVSHLKGGKRGGSNNMPSPSTSIPINGSYKSGSLSGAGLDIPRRSSYRYGSYTSSYASSYGQSFKGGHSYGSSYGTSFKEFPMFQHPSYELLKDNGFIQHKYYKYHAKALKERKNQGIGQSQEMNTLFRFWSHFLREQFNRRMYEEFKKLAIEDAEGGYRYGLECLFRFYSYGLEIHFNKDIFEDFQEMTVEDYCKKGELYGLEKFWAYLYYRKDKKTRPLDDKIRDELKEALKIYKTIDDFRKANKEKKEKEEKEKNEKAQK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.15
3	0.18
4	0.18
5	0.19
6	0.2
7	0.2
8	0.22
9	0.16
10	0.15
11	0.15
12	0.15
13	0.17
14	0.16
15	0.15
16	0.14
17	0.14
18	0.16
19	0.15
20	0.16
21	0.21
22	0.28
23	0.33
24	0.37
25	0.43
26	0.44
27	0.46
28	0.49
29	0.47
30	0.41
31	0.44
32	0.43
33	0.44
34	0.44
35	0.41
36	0.38
37	0.34
38	0.39
39	0.39
40	0.45
41	0.45
42	0.42
43	0.49
44	0.52
45	0.52
46	0.5
47	0.43
48	0.37
49	0.3
50	0.29
51	0.23
52	0.19
53	0.17
54	0.14
55	0.13
56	0.11
57	0.13
58	0.13
59	0.13
60	0.16
61	0.16
62	0.22
63	0.24
64	0.28
65	0.31
66	0.33
67	0.33
68	0.34
69	0.35
70	0.31
71	0.32
72	0.35
73	0.3
74	0.3
75	0.32
76	0.35
77	0.4
78	0.45
79	0.51
80	0.55
81	0.63
82	0.72
83	0.8
84	0.85
85	0.88
86	0.92
87	0.93
88	0.93
89	0.95
90	0.95
91	0.96
92	0.96
93	0.96
94	0.93
95	0.92
96	0.91
97	0.86
98	0.86
99	0.82
100	0.8
101	0.78
102	0.78
103	0.76
104	0.73
105	0.75
106	0.7
107	0.68
108	0.61
109	0.53
110	0.45
111	0.38
112	0.32
113	0.23
114	0.19
115	0.14
116	0.12
117	0.12
118	0.11
119	0.1
120	0.09
121	0.09
122	0.09
123	0.09
124	0.1
125	0.11
126	0.12
127	0.12
128	0.12
129	0.12
130	0.13
131	0.14
132	0.13
133	0.12
134	0.12
135	0.12
136	0.11
137	0.12
138	0.1
139	0.08
140	0.08
141	0.11
142	0.13
143	0.14
144	0.15
145	0.19
146	0.25
147	0.29
148	0.36
149	0.4
150	0.45
151	0.49
152	0.54
153	0.58
154	0.53
155	0.5
156	0.43
157	0.38
158	0.3
159	0.29
160	0.23
161	0.15
162	0.15
163	0.14
164	0.12
165	0.12
166	0.12
167	0.15
168	0.17
169	0.17
170	0.18
171	0.18
172	0.18
173	0.17
174	0.2
175	0.18
176	0.16
177	0.16
178	0.17
179	0.18
180	0.21
181	0.26
182	0.31
183	0.31
184	0.33
185	0.36
186	0.42
187	0.44
188	0.41
189	0.37
190	0.35
191	0.34
192	0.35
193	0.35
194	0.3
195	0.27
196	0.28
197	0.28
198	0.28
199	0.29
200	0.3
201	0.29
202	0.29
203	0.29
204	0.28
205	0.27
206	0.22
207	0.2
208	0.16
209	0.13
210	0.12
211	0.15
212	0.22
213	0.26
214	0.33
215	0.4
216	0.46
217	0.55
218	0.62
219	0.68
220	0.7
221	0.73
222	0.75
223	0.73
224	0.72
225	0.69
226	0.66
227	0.67
228	0.6
229	0.53
230	0.44
231	0.38
232	0.36
233	0.36
234	0.31
235	0.24
236	0.26
237	0.28
238	0.27
239	0.27
240	0.23
241	0.16
242	0.15
243	0.13
244	0.09
245	0.07
246	0.07
247	0.07
248	0.08
249	0.09
250	0.09
251	0.11
252	0.1
253	0.1
254	0.17
255	0.21
256	0.25
257	0.3
258	0.32
259	0.29
260	0.31
261	0.33
262	0.28
263	0.25
264	0.25
265	0.23
266	0.28
267	0.3
268	0.3
269	0.29
270	0.32
271	0.32
272	0.32
273	0.32
274	0.28
275	0.28
276	0.28
277	0.27
278	0.22
279	0.21
280	0.16
281	0.12
282	0.09
283	0.07
284	0.05
285	0.04
286	0.03
287	0.03
288	0.03
289	0.04
290	0.05
291	0.07
292	0.08
293	0.12
294	0.16
295	0.2
296	0.22
297	0.24
298	0.34
299	0.4
300	0.47
301	0.47
302	0.47
303	0.48
304	0.51
305	0.49
306	0.4
307	0.33
308	0.27
309	0.25
310	0.26
311	0.28
312	0.26
313	0.28
314	0.3
315	0.31
316	0.32
317	0.34
318	0.36
319	0.38
320	0.46
321	0.51
322	0.53
323	0.52
324	0.53
325	0.53
326	0.5
327	0.42
328	0.35
329	0.29
330	0.24
331	0.25
332	0.22
333	0.18
334	0.14
335	0.13
336	0.1
337	0.08
338	0.05
339	0.04
340	0.04
341	0.05
342	0.11
343	0.11
344	0.12
345	0.14
346	0.14
347	0.21
348	0.21
349	0.21
350	0.17
351	0.17
352	0.18
353	0.2
354	0.21
355	0.15
356	0.15
357	0.13
358	0.13
359	0.12
360	0.11
361	0.1
362	0.08
363	0.08
364	0.08
365	0.08
366	0.08
367	0.08
368	0.08
369	0.06
370	0.1
371	0.13
372	0.15
373	0.2
374	0.25
375	0.35
376	0.4
377	0.42
378	0.48
379	0.55
380	0.63
381	0.69
382	0.76
383	0.78
384	0.84
385	0.93
386	0.94
387	0.94
388	0.93
389	0.92
390	0.9
391	0.87
392	0.81
393	0.77
394	0.71
395	0.65
396	0.58
397	0.58
398	0.58
399	0.51
400	0.49
401	0.47
402	0.49
403	0.52
404	0.6
405	0.61
406	0.62
407	0.67
408	0.7
409	0.75
410	0.75
411	0.7
412	0.64
413	0.61
414	0.57
415	0.52
416	0.49
417	0.44
418	0.39
419	0.37
420	0.33
421	0.26
422	0.2
423	0.18
424	0.19
425	0.16
426	0.15
427	0.15
428	0.16
429	0.15
430	0.14
431	0.15
432	0.1
433	0.09
434	0.09
435	0.08
436	0.08
437	0.07
438	0.09
439	0.09
440	0.09
441	0.1
442	0.11
443	0.12
444	0.15
445	0.18
446	0.22
447	0.24
448	0.26
449	0.31
450	0.35
451	0.38
452	0.41
453	0.4
454	0.35
455	0.32
456	0.33
457	0.28
458	0.23
459	0.19
460	0.14
461	0.14
462	0.17
463	0.19
464	0.16
465	0.16
466	0.16
467	0.16
468	0.15
469	0.14
470	0.1
471	0.09
472	0.09
473	0.08
474	0.08
475	0.07
476	0.07
477	0.08
478	0.09
479	0.1
480	0.11
481	0.12
482	0.15
483	0.18
484	0.22
485	0.29
486	0.32
487	0.33
488	0.34
489	0.36
490	0.34
491	0.31
492	0.28
493	0.21
494	0.18
495	0.15
496	0.14
497	0.13
498	0.15
499	0.14
500	0.15
501	0.15
502	0.15
503	0.19
504	0.18
505	0.17
506	0.16
507	0.17
508	0.17
509	0.19
510	0.19
511	0.14
512	0.18
513	0.19
514	0.2
515	0.18
516	0.17
517	0.19
518	0.19
519	0.21
520	0.26
521	0.3
522	0.27
523	0.31
524	0.31
525	0.3
526	0.32
527	0.32
528	0.24
529	0.22
530	0.22
531	0.18
532	0.18
533	0.21
534	0.21
535	0.2
536	0.23
537	0.28
538	0.29
539	0.32
540	0.36
541	0.39
542	0.4
543	0.49
544	0.5
545	0.52
546	0.6
547	0.68
548	0.73
549	0.73
550	0.76
551	0.74
552	0.76
553	0.69
554	0.66
555	0.64
556	0.56
557	0.52
558	0.5
559	0.43
560	0.41
561	0.39
562	0.34
563	0.25
564	0.24
565	0.19
566	0.15
567	0.17
568	0.16
569	0.22
570	0.26
571	0.33
572	0.34
573	0.43
574	0.49
575	0.55
576	0.61
577	0.6
578	0.57
579	0.53
580	0.54
581	0.52
582	0.54
583	0.52
584	0.46
585	0.41
586	0.39
587	0.37
588	0.36
589	0.31
590	0.24
591	0.19
592	0.18
593	0.18
594	0.17
595	0.17
596	0.12
597	0.12
598	0.1
599	0.1
600	0.09
601	0.1
602	0.1
603	0.15
604	0.17
605	0.17
606	0.18
607	0.17
608	0.18
609	0.18
610	0.19
611	0.15
612	0.19
613	0.2
614	0.23
615	0.26
616	0.24
617	0.22
618	0.22
619	0.23
620	0.19
621	0.2
622	0.2
623	0.16
624	0.18
625	0.18
626	0.17
627	0.17
628	0.18
629	0.17
630	0.15
631	0.16
632	0.15
633	0.15
634	0.15
635	0.14
636	0.15
637	0.19
638	0.23
639	0.28
640	0.3
641	0.3
642	0.3
643	0.29
644	0.26
645	0.24
646	0.21
647	0.21
648	0.27
649	0.36
650	0.43
651	0.51
652	0.59
653	0.64
654	0.72
655	0.77
656	0.8
657	0.79
658	0.83
659	0.86
660	0.87
661	0.86
662	0.83
663	0.79
664	0.69
665	0.62
666	0.59
667	0.54
668	0.5
669	0.45
670	0.43
671	0.38
672	0.39
673	0.39
674	0.39
675	0.36
676	0.38
677	0.44
678	0.45
679	0.46
680	0.53
681	0.61
682	0.62
683	0.67
684	0.69
685	0.73
686	0.74
687	0.82
688	0.85
689	0.83
690	0.88
691	0.91
692	0.9
693	0.9
694	0.91

A0A1Y2D6H1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer