Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2AET9

Protein Details
Accession A0A1Y2AET9    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
169-189NTSNALSKVRRKRKPGPDVATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
178-182RRKRK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013915  Pre-mRNA_splic_Prp19  
IPR038959  Prp19  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR004181  Znf_MIZ  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0070534  P:protein K63-linked ubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF08606  Prp19  
PF00400  WD40  
PF11789  zf-Nse  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd16656  RING-Ubox_PRP19  
cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MFCSITKEPVQEPVISKKTGHLYEKRIIKKYLEENHKCPITGEDMTEDDLIELKTGTSTLSGKPRPPTATSIPSLLTLFQNEWDSVMLETYQLKQQYQKVRQELSHALYQHDAACRVIARLTKERNEAREALINLQQTLNAQGPAEDTEMTDVSNGIGMTAEIIENMSNTSNALSKVRRKRKPGPDVATHDEVKSFTNKIEIPSLHSTNPSGILSVDLLDNTLNGKKVTWALTGGKDGQINIVDYNNDGKIINNEKAHSKKINQVQWYTKQDKMPGAFFTASADKTVKFWNCDVDSEDYAISNKYAFKGHSAEITSMSIHATGDYFASASADSTWSLVDLATNQLIVKVSKDDIESGFSCSQFHPDGLIYATGTDNDQIRIWDVKSANNVASFSARNENVGKITSISFAENGYHLASCADNESIIRIWDLRKLKNIYNIEFEDPSVEGLQSVSFDPSAQYLAGACGGDIRIYLIKQWTELCHLSGHSDNITSLCWGTNSKSIASVGMDRSLRFYGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.42
3 0.41
4 0.4
5 0.45
6 0.48
7 0.52
8 0.5
9 0.52
10 0.58
11 0.67
12 0.7
13 0.68
14 0.64
15 0.6
16 0.6
17 0.63
18 0.65
19 0.67
20 0.66
21 0.64
22 0.7
23 0.68
24 0.6
25 0.51
26 0.44
27 0.39
28 0.33
29 0.31
30 0.25
31 0.24
32 0.26
33 0.25
34 0.21
35 0.15
36 0.15
37 0.13
38 0.1
39 0.09
40 0.07
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.08
45 0.1
46 0.15
47 0.25
48 0.29
49 0.34
50 0.39
51 0.45
52 0.46
53 0.48
54 0.5
55 0.47
56 0.5
57 0.47
58 0.45
59 0.39
60 0.36
61 0.34
62 0.28
63 0.22
64 0.17
65 0.16
66 0.16
67 0.17
68 0.15
69 0.16
70 0.15
71 0.14
72 0.12
73 0.12
74 0.1
75 0.09
76 0.1
77 0.11
78 0.15
79 0.16
80 0.17
81 0.22
82 0.29
83 0.39
84 0.46
85 0.53
86 0.56
87 0.58
88 0.58
89 0.6
90 0.58
91 0.52
92 0.48
93 0.4
94 0.34
95 0.3
96 0.3
97 0.27
98 0.23
99 0.2
100 0.15
101 0.16
102 0.15
103 0.15
104 0.16
105 0.16
106 0.2
107 0.27
108 0.33
109 0.37
110 0.44
111 0.49
112 0.5
113 0.52
114 0.48
115 0.42
116 0.42
117 0.39
118 0.34
119 0.33
120 0.3
121 0.25
122 0.24
123 0.21
124 0.15
125 0.16
126 0.14
127 0.11
128 0.1
129 0.09
130 0.1
131 0.12
132 0.12
133 0.1
134 0.08
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.09
139 0.07
140 0.06
141 0.07
142 0.07
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.06
158 0.08
159 0.09
160 0.12
161 0.17
162 0.25
163 0.36
164 0.47
165 0.53
166 0.6
167 0.69
168 0.76
169 0.82
170 0.84
171 0.8
172 0.78
173 0.78
174 0.76
175 0.7
176 0.6
177 0.49
178 0.4
179 0.33
180 0.25
181 0.21
182 0.15
183 0.11
184 0.14
185 0.15
186 0.16
187 0.2
188 0.19
189 0.23
190 0.27
191 0.29
192 0.26
193 0.26
194 0.25
195 0.2
196 0.22
197 0.16
198 0.11
199 0.09
200 0.09
201 0.08
202 0.08
203 0.07
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.11
215 0.13
216 0.12
217 0.14
218 0.15
219 0.16
220 0.18
221 0.17
222 0.17
223 0.15
224 0.14
225 0.13
226 0.11
227 0.11
228 0.09
229 0.09
230 0.07
231 0.08
232 0.09
233 0.08
234 0.08
235 0.07
236 0.07
237 0.1
238 0.14
239 0.18
240 0.17
241 0.18
242 0.23
243 0.25
244 0.29
245 0.28
246 0.26
247 0.3
248 0.36
249 0.41
250 0.39
251 0.41
252 0.43
253 0.48
254 0.53
255 0.5
256 0.46
257 0.43
258 0.42
259 0.41
260 0.37
261 0.31
262 0.24
263 0.23
264 0.2
265 0.18
266 0.17
267 0.15
268 0.14
269 0.13
270 0.13
271 0.1
272 0.12
273 0.17
274 0.16
275 0.17
276 0.17
277 0.21
278 0.22
279 0.23
280 0.24
281 0.23
282 0.22
283 0.2
284 0.2
285 0.14
286 0.14
287 0.13
288 0.1
289 0.07
290 0.07
291 0.08
292 0.1
293 0.1
294 0.12
295 0.15
296 0.15
297 0.18
298 0.19
299 0.18
300 0.18
301 0.18
302 0.15
303 0.12
304 0.12
305 0.09
306 0.07
307 0.06
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.04
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.06
321 0.06
322 0.05
323 0.06
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.06
328 0.06
329 0.07
330 0.06
331 0.07
332 0.08
333 0.08
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.11
338 0.12
339 0.13
340 0.12
341 0.16
342 0.16
343 0.19
344 0.2
345 0.19
346 0.19
347 0.18
348 0.21
349 0.18
350 0.17
351 0.13
352 0.12
353 0.13
354 0.13
355 0.13
356 0.09
357 0.09
358 0.09
359 0.08
360 0.08
361 0.09
362 0.09
363 0.09
364 0.1
365 0.09
366 0.12
367 0.14
368 0.14
369 0.18
370 0.18
371 0.2
372 0.24
373 0.26
374 0.25
375 0.24
376 0.24
377 0.19
378 0.21
379 0.19
380 0.17
381 0.21
382 0.2
383 0.21
384 0.22
385 0.23
386 0.21
387 0.22
388 0.2
389 0.15
390 0.16
391 0.15
392 0.14
393 0.14
394 0.13
395 0.12
396 0.12
397 0.11
398 0.12
399 0.11
400 0.1
401 0.09
402 0.09
403 0.09
404 0.08
405 0.1
406 0.09
407 0.08
408 0.08
409 0.11
410 0.1
411 0.11
412 0.11
413 0.11
414 0.12
415 0.19
416 0.25
417 0.27
418 0.34
419 0.39
420 0.43
421 0.5
422 0.55
423 0.51
424 0.52
425 0.52
426 0.47
427 0.43
428 0.39
429 0.31
430 0.25
431 0.23
432 0.17
433 0.13
434 0.1
435 0.09
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.09
440 0.08
441 0.09
442 0.09
443 0.1
444 0.11
445 0.1
446 0.09
447 0.08
448 0.09
449 0.11
450 0.1
451 0.08
452 0.09
453 0.09
454 0.09
455 0.09
456 0.1
457 0.11
458 0.12
459 0.15
460 0.18
461 0.19
462 0.21
463 0.24
464 0.24
465 0.28
466 0.29
467 0.27
468 0.25
469 0.25
470 0.27
471 0.27
472 0.27
473 0.22
474 0.21
475 0.21
476 0.19
477 0.2
478 0.16
479 0.14
480 0.12
481 0.13
482 0.14
483 0.17
484 0.22
485 0.23
486 0.23
487 0.25
488 0.24
489 0.25
490 0.25
491 0.27
492 0.24
493 0.28
494 0.29
495 0.26
496 0.3