Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2DMF8

Protein Details
Accession A0A1Y2DMF8    Localization Confidence High Confidence Score 20.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-39NGQTVQKKKSFHHKKSNSNLNRYRKSNSHydrophilic
76-104EIEKKEVDIKKNRYHRKKSMNDMKKDDLRBasic
119-147NDKPELRKTPSKQIKKKRSKTYINKTEEGHydrophilic
298-319DEDEQEKRKKEQKQFIKQFISTHydrophilic
386-411KKFEEARAKRRAERLERQKRLQENSDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
125-137RKTPSKQIKKKRS
374-404KEKTEEEKEIDRKKFEEARAKRRAERLERQK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR014789  PolyA-riboNase_RNA-binding  
IPR039884  R3HC1/R3HCL  
IPR035979  RBD_domain_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004535  F:poly(A)-specific ribonuclease activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006402  P:mRNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF08675  RNA_bind  
Amino Acid Sequences MSEKNASNPFNNGQTVQKKKSFHHKKSNSNLNRYRKSNSNFKVKPLEQIEAEVGKQKFYSDKIPNSQNNDNHNNPEIEKKEVDIKKNRYHRKKSMNDMKKDDLRSDTVNETIFDITSNNDKPELRKTPSKQIKKKRSKTYINKTEEGQKEDDSDDIKLIDSFLSVLSLKKNEMEKEEEEIENKPQQNKYTPRRQSFSNKSNKPKKEVPIYDDVEIRKVLDCYDFPTSFKTHNLLEIFEEFKGMFRINWINDTRALFVFDTEDHARAALLSKIEETRYTIKPYENPNSDSSSSNSLNDDEDEQEKRKKEQKQFIKQFISTTNTNQATPSTRISQSSQKVQSNQESHDKPVRRQRPVTSDAVARRLIANALGVKPKEKTEEEKEIDRKKFEEARAKRRAERLERQKRLQENSDIFNE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.52
3 0.55
4 0.57
5 0.57
6 0.6
7 0.7
8 0.72
9 0.73
10 0.75
11 0.78
12 0.82
13 0.88
14 0.93
15 0.91
16 0.91
17 0.9
18 0.89
19 0.88
20 0.82
21 0.77
22 0.76
23 0.73
24 0.72
25 0.7
26 0.71
27 0.65
28 0.67
29 0.72
30 0.63
31 0.66
32 0.59
33 0.56
34 0.45
35 0.45
36 0.42
37 0.33
38 0.33
39 0.31
40 0.27
41 0.23
42 0.23
43 0.21
44 0.21
45 0.22
46 0.31
47 0.32
48 0.4
49 0.46
50 0.56
51 0.6
52 0.64
53 0.7
54 0.66
55 0.66
56 0.66
57 0.62
58 0.57
59 0.54
60 0.49
61 0.42
62 0.44
63 0.38
64 0.35
65 0.32
66 0.29
67 0.35
68 0.38
69 0.46
70 0.48
71 0.54
72 0.58
73 0.68
74 0.78
75 0.78
76 0.83
77 0.85
78 0.86
79 0.86
80 0.88
81 0.89
82 0.88
83 0.86
84 0.83
85 0.8
86 0.76
87 0.7
88 0.62
89 0.54
90 0.47
91 0.41
92 0.37
93 0.32
94 0.27
95 0.25
96 0.22
97 0.2
98 0.17
99 0.15
100 0.12
101 0.1
102 0.09
103 0.14
104 0.15
105 0.15
106 0.17
107 0.18
108 0.2
109 0.29
110 0.35
111 0.35
112 0.42
113 0.46
114 0.55
115 0.64
116 0.72
117 0.73
118 0.77
119 0.83
120 0.85
121 0.91
122 0.91
123 0.9
124 0.91
125 0.92
126 0.92
127 0.91
128 0.86
129 0.79
130 0.69
131 0.68
132 0.61
133 0.55
134 0.45
135 0.35
136 0.31
137 0.29
138 0.28
139 0.2
140 0.16
141 0.13
142 0.11
143 0.1
144 0.08
145 0.08
146 0.07
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.08
154 0.09
155 0.1
156 0.13
157 0.16
158 0.16
159 0.19
160 0.23
161 0.22
162 0.25
163 0.28
164 0.24
165 0.23
166 0.22
167 0.22
168 0.23
169 0.24
170 0.24
171 0.24
172 0.26
173 0.33
174 0.41
175 0.45
176 0.51
177 0.57
178 0.59
179 0.59
180 0.61
181 0.63
182 0.63
183 0.65
184 0.65
185 0.64
186 0.69
187 0.77
188 0.75
189 0.72
190 0.69
191 0.65
192 0.65
193 0.6
194 0.54
195 0.53
196 0.52
197 0.47
198 0.43
199 0.37
200 0.28
201 0.25
202 0.21
203 0.13
204 0.11
205 0.1
206 0.09
207 0.09
208 0.11
209 0.16
210 0.16
211 0.16
212 0.18
213 0.19
214 0.19
215 0.2
216 0.19
217 0.14
218 0.18
219 0.19
220 0.17
221 0.16
222 0.17
223 0.16
224 0.14
225 0.14
226 0.1
227 0.09
228 0.1
229 0.09
230 0.07
231 0.09
232 0.13
233 0.13
234 0.19
235 0.2
236 0.2
237 0.23
238 0.24
239 0.23
240 0.19
241 0.21
242 0.15
243 0.14
244 0.13
245 0.11
246 0.15
247 0.14
248 0.14
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.11
253 0.12
254 0.09
255 0.08
256 0.08
257 0.09
258 0.1
259 0.11
260 0.12
261 0.14
262 0.18
263 0.2
264 0.24
265 0.25
266 0.26
267 0.31
268 0.38
269 0.44
270 0.43
271 0.43
272 0.41
273 0.44
274 0.43
275 0.4
276 0.35
277 0.32
278 0.29
279 0.26
280 0.25
281 0.21
282 0.2
283 0.19
284 0.18
285 0.14
286 0.16
287 0.18
288 0.21
289 0.26
290 0.27
291 0.32
292 0.38
293 0.45
294 0.52
295 0.59
296 0.67
297 0.73
298 0.8
299 0.84
300 0.83
301 0.74
302 0.67
303 0.61
304 0.55
305 0.46
306 0.4
307 0.39
308 0.34
309 0.33
310 0.31
311 0.29
312 0.29
313 0.3
314 0.3
315 0.26
316 0.26
317 0.29
318 0.32
319 0.39
320 0.39
321 0.46
322 0.49
323 0.5
324 0.53
325 0.56
326 0.61
327 0.56
328 0.55
329 0.55
330 0.5
331 0.5
332 0.54
333 0.53
334 0.52
335 0.59
336 0.64
337 0.63
338 0.67
339 0.69
340 0.69
341 0.71
342 0.68
343 0.61
344 0.59
345 0.54
346 0.53
347 0.45
348 0.37
349 0.32
350 0.28
351 0.25
352 0.18
353 0.18
354 0.17
355 0.19
356 0.24
357 0.24
358 0.26
359 0.27
360 0.3
361 0.32
362 0.33
363 0.37
364 0.4
365 0.5
366 0.52
367 0.6
368 0.66
369 0.69
370 0.7
371 0.66
372 0.58
373 0.56
374 0.59
375 0.58
376 0.6
377 0.61
378 0.66
379 0.73
380 0.78
381 0.77
382 0.77
383 0.79
384 0.78
385 0.79
386 0.8
387 0.82
388 0.84
389 0.86
390 0.86
391 0.84
392 0.82
393 0.79
394 0.77
395 0.71