Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2CE88

Protein Details
Accession A0A1Y2CE88    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-55DYVLRARDYNKKQKRLRALQLKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
235-259KGRRRKVGTDKNGLPIYKWKQERKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007144  SSU_processome_Utp11  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF03998  Utp11  
Amino Acid Sequences MSSLRNAVHRREHRERSQLASRERLGLLEKHKDYVLRARDYNKKQKRLRALQLKAAFKNPDEFYFKMQTTKTKNGVHIAERNEKFSAEFLKLLKTQDKNYVNYQNSINKFKIDKLKNAMHFVENNQGEIDEEDSEINETKKSNHTIFVDDEEEVKNFDAAKHFNTYPELLSRKFNRPTKEIIKSAKLNIDDNINVEKLVKARSKNIRELSSRIQREKNLTSVQNEMDIQKALMGKGRRRKVGTDKNGLPIYKWKQERKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.75
3 0.73
4 0.74
5 0.72
6 0.68
7 0.66
8 0.59
9 0.54
10 0.5
11 0.44
12 0.38
13 0.36
14 0.37
15 0.39
16 0.38
17 0.36
18 0.37
19 0.37
20 0.36
21 0.4
22 0.41
23 0.37
24 0.4
25 0.45
26 0.54
27 0.62
28 0.7
29 0.7
30 0.73
31 0.74
32 0.79
33 0.83
34 0.83
35 0.84
36 0.84
37 0.79
38 0.79
39 0.79
40 0.77
41 0.68
42 0.64
43 0.55
44 0.45
45 0.46
46 0.38
47 0.35
48 0.34
49 0.33
50 0.32
51 0.36
52 0.35
53 0.33
54 0.33
55 0.36
56 0.38
57 0.44
58 0.46
59 0.45
60 0.47
61 0.49
62 0.51
63 0.48
64 0.46
65 0.45
66 0.47
67 0.44
68 0.44
69 0.39
70 0.35
71 0.31
72 0.27
73 0.24
74 0.16
75 0.17
76 0.15
77 0.18
78 0.2
79 0.22
80 0.26
81 0.25
82 0.26
83 0.33
84 0.37
85 0.36
86 0.4
87 0.47
88 0.42
89 0.42
90 0.43
91 0.4
92 0.4
93 0.41
94 0.36
95 0.3
96 0.29
97 0.32
98 0.38
99 0.34
100 0.36
101 0.38
102 0.44
103 0.44
104 0.46
105 0.43
106 0.35
107 0.33
108 0.29
109 0.3
110 0.24
111 0.21
112 0.17
113 0.16
114 0.15
115 0.14
116 0.13
117 0.05
118 0.06
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.07
123 0.07
124 0.06
125 0.07
126 0.08
127 0.12
128 0.16
129 0.17
130 0.2
131 0.21
132 0.23
133 0.24
134 0.25
135 0.22
136 0.18
137 0.19
138 0.15
139 0.14
140 0.12
141 0.11
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.1
146 0.11
147 0.13
148 0.17
149 0.17
150 0.17
151 0.19
152 0.2
153 0.18
154 0.22
155 0.22
156 0.19
157 0.26
158 0.29
159 0.35
160 0.43
161 0.47
162 0.46
163 0.47
164 0.53
165 0.56
166 0.58
167 0.57
168 0.53
169 0.55
170 0.53
171 0.53
172 0.5
173 0.43
174 0.37
175 0.32
176 0.31
177 0.24
178 0.23
179 0.23
180 0.18
181 0.16
182 0.15
183 0.15
184 0.13
185 0.19
186 0.21
187 0.21
188 0.3
189 0.4
190 0.46
191 0.53
192 0.58
193 0.59
194 0.58
195 0.62
196 0.62
197 0.63
198 0.63
199 0.61
200 0.59
201 0.57
202 0.6
203 0.58
204 0.55
205 0.52
206 0.49
207 0.45
208 0.44
209 0.41
210 0.37
211 0.34
212 0.28
213 0.23
214 0.2
215 0.18
216 0.16
217 0.16
218 0.14
219 0.18
220 0.24
221 0.31
222 0.4
223 0.48
224 0.53
225 0.55
226 0.63
227 0.68
228 0.73
229 0.74
230 0.75
231 0.71
232 0.72
233 0.74
234 0.66
235 0.57
236 0.56
237 0.54
238 0.53
239 0.57