Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H0EDQ3

Protein Details
Accession H0EDQ3    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
75-99RERGEGTGRERKKRKRAGENDTDFEBasic
256-282RALEEQERERRHRKRKRREADSEDDLEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
72-91KHPRERGEGTGRERKKRKRA
262-273ERERRHRKRKRR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR039875  LENG1-like  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
Amino Acid Sequences MPLHLLGKKSWNVYNTANIEVVKRDEAIAAAEEAASEQRMQELDSLRRMQILRGEEPTPLPIEDSPKLDSSKHPRERGEGTGRERKKRKRAGENDTDFEMRIAHDMTNTENRERQLVLRKDTDAPLVNRRGHIDLFPQPKPSSHKTVQKNEEAERELAKKKKEYEDQYTLKFFNAAGFKSSLGSDPWYKKTNSTDVGEEMPGKDVWGNEDPRRKEREAKRIVSNDPLAMMKAGARQVRQVEQERKQWREEKDREMRALEEQERERRHRKRKRREADSEDDLEGFSLDNHGGSSSKKHRSEILILNQQHNIPNFAVRSFKTNPTQTHHASILTGKIASANFPNSAHPFSLPNPLKLPTIFSYNPNATPSLRSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.41
3 0.39
4 0.37
5 0.33
6 0.33
7 0.3
8 0.3
9 0.23
10 0.2
11 0.18
12 0.16
13 0.16
14 0.16
15 0.14
16 0.12
17 0.11
18 0.1
19 0.09
20 0.09
21 0.09
22 0.08
23 0.07
24 0.07
25 0.08
26 0.09
27 0.1
28 0.14
29 0.19
30 0.23
31 0.29
32 0.32
33 0.3
34 0.35
35 0.35
36 0.32
37 0.32
38 0.33
39 0.31
40 0.32
41 0.33
42 0.29
43 0.3
44 0.3
45 0.25
46 0.2
47 0.18
48 0.16
49 0.21
50 0.22
51 0.24
52 0.24
53 0.25
54 0.27
55 0.27
56 0.33
57 0.37
58 0.46
59 0.52
60 0.55
61 0.54
62 0.58
63 0.61
64 0.62
65 0.61
66 0.57
67 0.56
68 0.6
69 0.64
70 0.68
71 0.73
72 0.75
73 0.76
74 0.79
75 0.81
76 0.82
77 0.86
78 0.86
79 0.88
80 0.84
81 0.77
82 0.7
83 0.61
84 0.49
85 0.4
86 0.3
87 0.19
88 0.14
89 0.12
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.13
94 0.2
95 0.22
96 0.23
97 0.25
98 0.25
99 0.26
100 0.27
101 0.28
102 0.31
103 0.34
104 0.37
105 0.36
106 0.38
107 0.39
108 0.39
109 0.38
110 0.33
111 0.3
112 0.33
113 0.36
114 0.35
115 0.34
116 0.35
117 0.33
118 0.29
119 0.27
120 0.24
121 0.26
122 0.3
123 0.3
124 0.33
125 0.31
126 0.33
127 0.38
128 0.39
129 0.39
130 0.4
131 0.48
132 0.52
133 0.61
134 0.64
135 0.63
136 0.62
137 0.57
138 0.55
139 0.48
140 0.41
141 0.34
142 0.32
143 0.32
144 0.32
145 0.33
146 0.32
147 0.34
148 0.4
149 0.46
150 0.48
151 0.5
152 0.55
153 0.56
154 0.55
155 0.53
156 0.46
157 0.37
158 0.32
159 0.23
160 0.18
161 0.16
162 0.14
163 0.13
164 0.13
165 0.13
166 0.13
167 0.14
168 0.1
169 0.09
170 0.11
171 0.14
172 0.17
173 0.2
174 0.23
175 0.23
176 0.25
177 0.27
178 0.3
179 0.29
180 0.28
181 0.25
182 0.24
183 0.25
184 0.23
185 0.2
186 0.15
187 0.13
188 0.11
189 0.09
190 0.09
191 0.07
192 0.1
193 0.15
194 0.18
195 0.21
196 0.29
197 0.32
198 0.36
199 0.42
200 0.41
201 0.46
202 0.51
203 0.57
204 0.58
205 0.61
206 0.63
207 0.62
208 0.62
209 0.57
210 0.5
211 0.39
212 0.31
213 0.26
214 0.19
215 0.14
216 0.12
217 0.08
218 0.09
219 0.13
220 0.14
221 0.14
222 0.17
223 0.19
224 0.23
225 0.28
226 0.34
227 0.38
228 0.42
229 0.51
230 0.55
231 0.55
232 0.58
233 0.59
234 0.57
235 0.6
236 0.6
237 0.61
238 0.64
239 0.66
240 0.62
241 0.57
242 0.51
243 0.44
244 0.45
245 0.38
246 0.34
247 0.34
248 0.39
249 0.43
250 0.48
251 0.53
252 0.57
253 0.65
254 0.7
255 0.77
256 0.81
257 0.87
258 0.91
259 0.92
260 0.93
261 0.91
262 0.88
263 0.84
264 0.76
265 0.65
266 0.55
267 0.44
268 0.33
269 0.24
270 0.16
271 0.09
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.07
278 0.08
279 0.16
280 0.24
281 0.33
282 0.35
283 0.37
284 0.41
285 0.46
286 0.53
287 0.54
288 0.55
289 0.55
290 0.55
291 0.56
292 0.53
293 0.49
294 0.45
295 0.37
296 0.31
297 0.22
298 0.24
299 0.22
300 0.22
301 0.24
302 0.21
303 0.27
304 0.28
305 0.34
306 0.38
307 0.44
308 0.48
309 0.51
310 0.58
311 0.55
312 0.56
313 0.5
314 0.43
315 0.38
316 0.35
317 0.3
318 0.24
319 0.2
320 0.15
321 0.16
322 0.15
323 0.16
324 0.18
325 0.18
326 0.18
327 0.19
328 0.24
329 0.25
330 0.28
331 0.27
332 0.25
333 0.26
334 0.26
335 0.36
336 0.35
337 0.34
338 0.35
339 0.36
340 0.37
341 0.34
342 0.38
343 0.29
344 0.34
345 0.32
346 0.33
347 0.39
348 0.4
349 0.42
350 0.38
351 0.38
352 0.32