Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2D5H6

Protein Details
Accession A0A1Y2D5H6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-56HSNNYQRQKMKNSNMMNRNDSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR009604  LsmAD_domain  
IPR047575  Sm  
IPR025852  SM_dom_ATX  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
PF14438  SM-ATX  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
Amino Acid Sequences MNTRKTNSGNERMQGGRSRGNQRKDHYRESGMNSFHSNNYQRQKMKNSNMMNRNDSFSKSQERFDNKDSDFPALGDSPDRRMHDRLLFVIMNMVGTKVEVTTKNGTVYEGILHGTNTESELGVCLKMAKEKTNDNSQNNSYIPNLIIMGKDLAQISINNLELNKPERMSLRDTFKTDSAISGKSGEIFERQLQKWEPEKGNYDVSLELYPFILIYYGSTEKWDQFETNEKLFGITTDYDEEIYTTALDRTKSDFKKREQEAIKIAAEIEKASTENVHLAEERGQIIDDSDMDEEDRYGAVIRKPGKYVPPNLRKQMEANEAHHQKQSNRETKANTFVQKKEKDTKVKTEQKSNETKSAKPTTTTTKSTTTTNTTNLNNKENKNKPVTPNTTSSTISNATISNSKEPLSKIEKKTNYNDIINNKGMNQNKLQENLANHFRQFSKKEKEHLQQKKQAIMKKDKENLISGFISFSENLKLPPLKDAPSDNDLLALANKTGKELYAMNVEKENKETPKKDIPKKESISKQPNLKKSITIPSNNDNSLNNNVTLSASAATNNSKSGQSSKSIKTPISAQVHSLSGKTDKNDSEHKNKSDRDNDLTVTESVNSTASTESKSTSFKFNIEAREFKPNPSASEFVPSKNMSSKGSSQSSNDKGIFNKRNQKGNISIHNIFVKGFLKTNNQNAKNNNINVNQGSATWHYGSKPFKSQFSVTYEDTMYPPMDQQFGYYIQPIPYQGHPAMRRPYIPISMQPGTISYPYVPAPAYAAPMTHNRPVYPPNMMGAPIGAPRYIQAPVMVPAYPSEMIPQFSNSIMIPQQQILVDPGMIPPAAQGMPQAVFITEPMMEVPPEQQQS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.49
3 0.48
4 0.5
5 0.58
6 0.61
7 0.68
8 0.7
9 0.71
10 0.77
11 0.77
12 0.78
13 0.74
14 0.73
15 0.71
16 0.71
17 0.71
18 0.62
19 0.57
20 0.53
21 0.48
22 0.43
23 0.44
24 0.41
25 0.42
26 0.48
27 0.55
28 0.57
29 0.62
30 0.7
31 0.72
32 0.76
33 0.77
34 0.78
35 0.79
36 0.82
37 0.81
38 0.77
39 0.68
40 0.64
41 0.57
42 0.52
43 0.45
44 0.42
45 0.45
46 0.41
47 0.44
48 0.48
49 0.53
50 0.56
51 0.57
52 0.61
53 0.53
54 0.57
55 0.54
56 0.49
57 0.42
58 0.36
59 0.34
60 0.26
61 0.25
62 0.23
63 0.23
64 0.23
65 0.29
66 0.32
67 0.33
68 0.35
69 0.4
70 0.41
71 0.43
72 0.39
73 0.4
74 0.36
75 0.32
76 0.32
77 0.25
78 0.2
79 0.17
80 0.15
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.07
85 0.11
86 0.12
87 0.17
88 0.22
89 0.23
90 0.26
91 0.26
92 0.26
93 0.22
94 0.21
95 0.18
96 0.14
97 0.13
98 0.11
99 0.11
100 0.1
101 0.1
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.08
106 0.08
107 0.09
108 0.1
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.1
113 0.16
114 0.18
115 0.23
116 0.26
117 0.34
118 0.39
119 0.49
120 0.56
121 0.55
122 0.6
123 0.56
124 0.57
125 0.5
126 0.46
127 0.36
128 0.3
129 0.25
130 0.19
131 0.18
132 0.13
133 0.13
134 0.12
135 0.12
136 0.11
137 0.12
138 0.12
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.12
143 0.14
144 0.14
145 0.13
146 0.13
147 0.14
148 0.16
149 0.2
150 0.2
151 0.17
152 0.19
153 0.22
154 0.25
155 0.3
156 0.33
157 0.38
158 0.4
159 0.42
160 0.43
161 0.41
162 0.41
163 0.35
164 0.33
165 0.27
166 0.23
167 0.21
168 0.19
169 0.19
170 0.17
171 0.18
172 0.15
173 0.14
174 0.16
175 0.2
176 0.27
177 0.27
178 0.31
179 0.33
180 0.38
181 0.42
182 0.47
183 0.46
184 0.42
185 0.46
186 0.44
187 0.45
188 0.39
189 0.35
190 0.27
191 0.25
192 0.21
193 0.17
194 0.14
195 0.11
196 0.1
197 0.08
198 0.07
199 0.06
200 0.04
201 0.05
202 0.08
203 0.1
204 0.1
205 0.12
206 0.14
207 0.15
208 0.17
209 0.19
210 0.15
211 0.16
212 0.25
213 0.28
214 0.28
215 0.28
216 0.25
217 0.24
218 0.23
219 0.22
220 0.16
221 0.12
222 0.12
223 0.12
224 0.13
225 0.13
226 0.13
227 0.13
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.06
232 0.08
233 0.09
234 0.1
235 0.11
236 0.16
237 0.25
238 0.31
239 0.4
240 0.46
241 0.5
242 0.6
243 0.62
244 0.66
245 0.61
246 0.61
247 0.56
248 0.54
249 0.48
250 0.38
251 0.35
252 0.27
253 0.23
254 0.18
255 0.13
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.07
261 0.09
262 0.09
263 0.1
264 0.09
265 0.1
266 0.13
267 0.14
268 0.14
269 0.12
270 0.11
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.07
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.05
284 0.06
285 0.08
286 0.1
287 0.15
288 0.19
289 0.2
290 0.22
291 0.25
292 0.32
293 0.35
294 0.42
295 0.47
296 0.53
297 0.58
298 0.63
299 0.62
300 0.55
301 0.53
302 0.51
303 0.48
304 0.42
305 0.38
306 0.41
307 0.43
308 0.43
309 0.43
310 0.39
311 0.33
312 0.39
313 0.45
314 0.43
315 0.44
316 0.47
317 0.49
318 0.5
319 0.55
320 0.5
321 0.47
322 0.44
323 0.45
324 0.5
325 0.5
326 0.52
327 0.54
328 0.57
329 0.6
330 0.59
331 0.64
332 0.65
333 0.71
334 0.69
335 0.69
336 0.67
337 0.65
338 0.7
339 0.64
340 0.63
341 0.56
342 0.54
343 0.52
344 0.53
345 0.46
346 0.39
347 0.38
348 0.37
349 0.4
350 0.42
351 0.37
352 0.35
353 0.36
354 0.36
355 0.36
356 0.32
357 0.28
358 0.27
359 0.28
360 0.27
361 0.32
362 0.33
363 0.37
364 0.37
365 0.38
366 0.45
367 0.47
368 0.5
369 0.5
370 0.52
371 0.51
372 0.55
373 0.58
374 0.52
375 0.5
376 0.47
377 0.43
378 0.39
379 0.34
380 0.27
381 0.23
382 0.19
383 0.16
384 0.14
385 0.12
386 0.14
387 0.15
388 0.14
389 0.14
390 0.14
391 0.15
392 0.16
393 0.2
394 0.24
395 0.32
396 0.34
397 0.42
398 0.47
399 0.49
400 0.53
401 0.56
402 0.52
403 0.46
404 0.46
405 0.4
406 0.4
407 0.36
408 0.32
409 0.26
410 0.27
411 0.26
412 0.24
413 0.23
414 0.23
415 0.24
416 0.25
417 0.25
418 0.22
419 0.21
420 0.23
421 0.26
422 0.22
423 0.2
424 0.21
425 0.21
426 0.24
427 0.26
428 0.3
429 0.34
430 0.37
431 0.42
432 0.48
433 0.55
434 0.61
435 0.68
436 0.68
437 0.66
438 0.66
439 0.67
440 0.63
441 0.59
442 0.56
443 0.56
444 0.55
445 0.55
446 0.58
447 0.54
448 0.51
449 0.5
450 0.44
451 0.37
452 0.3
453 0.22
454 0.17
455 0.14
456 0.13
457 0.11
458 0.1
459 0.08
460 0.08
461 0.09
462 0.11
463 0.12
464 0.11
465 0.15
466 0.17
467 0.16
468 0.18
469 0.2
470 0.21
471 0.23
472 0.24
473 0.19
474 0.17
475 0.16
476 0.14
477 0.12
478 0.09
479 0.07
480 0.07
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.07
485 0.08
486 0.08
487 0.1
488 0.16
489 0.17
490 0.17
491 0.22
492 0.23
493 0.22
494 0.24
495 0.26
496 0.23
497 0.29
498 0.3
499 0.32
500 0.41
501 0.49
502 0.55
503 0.62
504 0.63
505 0.67
506 0.69
507 0.72
508 0.7
509 0.71
510 0.71
511 0.66
512 0.69
513 0.66
514 0.69
515 0.65
516 0.58
517 0.51
518 0.46
519 0.5
520 0.46
521 0.44
522 0.41
523 0.42
524 0.45
525 0.43
526 0.4
527 0.31
528 0.29
529 0.29
530 0.26
531 0.2
532 0.16
533 0.16
534 0.15
535 0.14
536 0.12
537 0.08
538 0.06
539 0.07
540 0.08
541 0.09
542 0.09
543 0.1
544 0.11
545 0.11
546 0.12
547 0.15
548 0.16
549 0.2
550 0.26
551 0.28
552 0.33
553 0.35
554 0.35
555 0.32
556 0.34
557 0.37
558 0.36
559 0.34
560 0.29
561 0.28
562 0.3
563 0.29
564 0.25
565 0.19
566 0.17
567 0.18
568 0.18
569 0.2
570 0.2
571 0.24
572 0.32
573 0.37
574 0.42
575 0.48
576 0.52
577 0.55
578 0.57
579 0.61
580 0.6
581 0.59
582 0.55
583 0.51
584 0.47
585 0.4
586 0.38
587 0.31
588 0.24
589 0.2
590 0.14
591 0.11
592 0.11
593 0.09
594 0.08
595 0.08
596 0.08
597 0.1
598 0.1
599 0.11
600 0.13
601 0.16
602 0.17
603 0.22
604 0.23
605 0.22
606 0.27
607 0.3
608 0.36
609 0.37
610 0.4
611 0.37
612 0.46
613 0.46
614 0.42
615 0.45
616 0.38
617 0.37
618 0.37
619 0.36
620 0.26
621 0.34
622 0.33
623 0.27
624 0.31
625 0.28
626 0.26
627 0.3
628 0.31
629 0.25
630 0.28
631 0.32
632 0.33
633 0.37
634 0.36
635 0.34
636 0.41
637 0.43
638 0.44
639 0.4
640 0.35
641 0.35
642 0.44
643 0.48
644 0.48
645 0.54
646 0.55
647 0.62
648 0.62
649 0.64
650 0.63
651 0.63
652 0.63
653 0.6
654 0.56
655 0.5
656 0.5
657 0.45
658 0.36
659 0.31
660 0.24
661 0.18
662 0.19
663 0.18
664 0.24
665 0.29
666 0.39
667 0.46
668 0.5
669 0.54
670 0.55
671 0.6
672 0.61
673 0.6
674 0.56
675 0.48
676 0.47
677 0.42
678 0.41
679 0.33
680 0.25
681 0.24
682 0.2
683 0.2
684 0.17
685 0.18
686 0.17
687 0.23
688 0.27
689 0.29
690 0.36
691 0.36
692 0.39
693 0.43
694 0.44
695 0.44
696 0.45
697 0.46
698 0.38
699 0.38
700 0.35
701 0.31
702 0.29
703 0.26
704 0.2
705 0.15
706 0.16
707 0.15
708 0.15
709 0.14
710 0.14
711 0.15
712 0.17
713 0.18
714 0.18
715 0.18
716 0.18
717 0.2
718 0.2
719 0.21
720 0.2
721 0.24
722 0.25
723 0.31
724 0.33
725 0.39
726 0.44
727 0.44
728 0.44
729 0.43
730 0.46
731 0.43
732 0.42
733 0.39
734 0.4
735 0.39
736 0.38
737 0.33
738 0.29
739 0.27
740 0.25
741 0.21
742 0.14
743 0.15
744 0.15
745 0.16
746 0.15
747 0.13
748 0.15
749 0.14
750 0.17
751 0.14
752 0.14
753 0.15
754 0.22
755 0.26
756 0.29
757 0.3
758 0.28
759 0.32
760 0.36
761 0.37
762 0.36
763 0.32
764 0.29
765 0.28
766 0.28
767 0.24
768 0.2
769 0.19
770 0.16
771 0.16
772 0.13
773 0.12
774 0.12
775 0.14
776 0.14
777 0.13
778 0.12
779 0.13
780 0.15
781 0.17
782 0.17
783 0.15
784 0.15
785 0.18
786 0.17
787 0.15
788 0.17
789 0.18
790 0.19
791 0.2
792 0.22
793 0.19
794 0.19
795 0.21
796 0.16
797 0.18
798 0.18
799 0.2
800 0.2
801 0.19
802 0.21
803 0.19
804 0.21
805 0.19
806 0.18
807 0.15
808 0.13
809 0.13
810 0.12
811 0.12
812 0.1
813 0.08
814 0.11
815 0.11
816 0.1
817 0.11
818 0.12
819 0.13
820 0.15
821 0.15
822 0.11
823 0.11
824 0.12
825 0.13
826 0.09
827 0.09
828 0.09
829 0.1
830 0.1
831 0.11
832 0.13