Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1Y2D5H6

Protein Details
Accession A0A1Y2D5H6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-56HSNNYQRQKMKNSNMMNRNDSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR009604  LsmAD_domain  
IPR047575  Sm  
IPR025852  SM_dom_ATX  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
PF14438  SM-ATX  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
Amino Acid Sequences MNTRKTNSGNERMQGGRSRGNQRKDHYRESGMNSFHSNNYQRQKMKNSNMMNRNDSFSKSQERFDNKDSDFPALGDSPDRRMHDRLLFVIMNMVGTKVEVTTKNGTVYEGILHGTNTESELGVCLKMAKEKTNDNSQNNSYIPNLIIMGKDLAQISINNLELNKPERMSLRDTFKTDSAISGKSGEIFERQLQKWEPEKGNYDVSLELYPFILIYYGSTEKWDQFETNEKLFGITTDYDEEIYTTALDRTKSDFKKREQEAIKIAAEIEKASTENVHLAEERGQIIDDSDMDEEDRYGAVIRKPGKYVPPNLRKQMEANEAHHQKQSNRETKANTFVQKKEKDTKVKTEQKSNETKSAKPTTTTTKSTTTTNTTNLNNKENKNKPVTPNTTSSTISNATISNSKEPLSKIEKKTNYNDIINNKGMNQNKLQENLANHFRQFSKKEKEHLQQKKQAIMKKDKENLISGFISFSENLKLPPLKDAPSDNDLLALANKTGKELYAMNVEKENKETPKKDIPKKESISKQPNLKKSITIPSNNDNSLNNNVTLSASAATNNSKSGQSSKSIKTPISAQVHSLSGKTDKNDSEHKNKSDRDNDLTVTESVNSTASTESKSTSFKFNIEAREFKPNPSASEFVPSKNMSSKGSSQSSNDKGIFNKRNQKGNISIHNIFVKGFLKTNNQNAKNNNINVNQGSATWHYGSKPFKSQFSVTYEDTMYPPMDQQFGYYIQPIPYQGHPAMRRPYIPISMQPGTISYPYVPAPAYAAPMTHNRPVYPPNMMGAPIGAPRYIQAPVMVPAYPSEMIPQFSNSIMIPQQQILVDPGMIPPAAQGMPQAVFITEPMMEVPPEQQQS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.49
3 0.48
4 0.5
5 0.58
6 0.61
7 0.68
8 0.7
9 0.71
10 0.77
11 0.77
12 0.78
13 0.74
14 0.73
15 0.71
16 0.71
17 0.71
18 0.62
19 0.57
20 0.53
21 0.48
22 0.43
23 0.44
24 0.41
25 0.42
26 0.48
27 0.55
28 0.57
29 0.62
30 0.7
31 0.72
32 0.76
33 0.77
34 0.78
35 0.79
36 0.82
37 0.81
38 0.77
39 0.68
40 0.64
41 0.57
42 0.52
43 0.45
44 0.42
45 0.45
46 0.41
47 0.44
48 0.48
49 0.53
50 0.56
51 0.57
52 0.61
53 0.53
54 0.57
55 0.54
56 0.49
57 0.42
58 0.36
59 0.34
60 0.26
61 0.25
62 0.23
63 0.23
64 0.23
65 0.29
66 0.32
67 0.33
68 0.35
69 0.4
70 0.41
71 0.43
72 0.39
73 0.4
74 0.36
75 0.32
76 0.32
77 0.25
78 0.2
79 0.17
80 0.15
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.07
85 0.11
86 0.12
87 0.17
88 0.22
89 0.23
90 0.26
91 0.26
92 0.26
93 0.22
94 0.21
95 0.18
96 0.14
97 0.13
98 0.11
99 0.11
100 0.1
101 0.1
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.08
106 0.08
107 0.09
108 0.1
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.1
113 0.16
114 0.18
115 0.23
116 0.26
117 0.34
118 0.39
119 0.49
120 0.56
121 0.55
122 0.6
123 0.56
124 0.57
125 0.5
126 0.46
127 0.36
128 0.3
129 0.25
130 0.19
131 0.18
132 0.13
133 0.13
134 0.12
135 0.12
136 0.11
137 0.12
138 0.12
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.12
143 0.14
144 0.14
145 0.13
146 0.13
147 0.14
148 0.16
149 0.2
150 0.2
151 0.17
152 0.19
153 0.22
154 0.25
155 0.3
156 0.33
157 0.38
158 0.4
159 0.42
160 0.43
161 0.41
162 0.41
163 0.35
164 0.33
165 0.27
166 0.23
167 0.21
168 0.19
169 0.19
170 0.17
171 0.18
172 0.15
173 0.14
174 0.16
175 0.2
176 0.27
177 0.27
178 0.31
179 0.33
180 0.38
181 0.42
182 0.47
183 0.46
184 0.42
185 0.46
186 0.44
187 0.45
188 0.39
189 0.35
190 0.27
191 0.25
192 0.21
193 0.17
194 0.14
195 0.11
196 0.1
197 0.08
198 0.07
199 0.06
200 0.04
201 0.05
202 0.08
203 0.1
204 0.1
205 0.12
206 0.14
207 0.15
208 0.17
209 0.19
210 0.15
211 0.16
212 0.25
213 0.28
214 0.28
215 0.28
216 0.25
217 0.24
218 0.23
219 0.22
220 0.16
221 0.12
222 0.12
223 0.12
224 0.13
225 0.13
226 0.13
227 0.13
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.06
232 0.08
233 0.09
234 0.1
235 0.11
236 0.16
237 0.25
238 0.31
239 0.4
240 0.46
241 0.5
242 0.6
243 0.62
244 0.66
245 0.61
246 0.61
247 0.56
248 0.54
249 0.48
250 0.38
251 0.35
252 0.27
253 0.23
254 0.18
255 0.13
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.07
261 0.09
262 0.09
263 0.1
264 0.09
265 0.1
266 0.13
267 0.14
268 0.14
269 0.12
270 0.11
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.07
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.05
284 0.06
285 0.08
286 0.1
287 0.15
288 0.19
289 0.2
290 0.22
291 0.25
292 0.32
293 0.35
294 0.42
295 0.47
296 0.53
297 0.58
298 0.63
299 0.62
300 0.55
301 0.53
302 0.51
303 0.48
304 0.42
305 0.38
306 0.41
307 0.43
308 0.43
309 0.43
310 0.39
311 0.33
312 0.39
313 0.45
314 0.43
315 0.44
316 0.47
317 0.49
318 0.5
319 0.55
320 0.5
321 0.47
322 0.44
323 0.45
324 0.5
325 0.5
326 0.52
327 0.54
328 0.57
329 0.6
330 0.59
331 0.64
332 0.65
333 0.71
334 0.69
335 0.69
336 0.67
337 0.65
338 0.7
339 0.64
340 0.63
341 0.56
342 0.54
343 0.52
344 0.53
345 0.46
346 0.39
347 0.38
348 0.37
349 0.4
350 0.42
351 0.37
352 0.35
353 0.36
354 0.36
355 0.36
356 0.32
357 0.28
358 0.27
359 0.28
360 0.27
361 0.32
362 0.33
363 0.37
364 0.37
365 0.38
366 0.45
367 0.47
368 0.5
369 0.5
370 0.52
371 0.51
372 0.55
373 0.58
374 0.52
375 0.5
376 0.47
377 0.43
378 0.39
379 0.34
380 0.27
381 0.23
382 0.19
383 0.16
384 0.14
385 0.12
386 0.14
387 0.15
388 0.14
389 0.14
390 0.14
391 0.15
392 0.16
393 0.2
394 0.24
395 0.32
396 0.34
397 0.42
398 0.47
399 0.49
400 0.53
401 0.56
402 0.52
403 0.46
404 0.46
405 0.4
406 0.4
407 0.36
408 0.32
409 0.26
410 0.27
411 0.26
412 0.24
413 0.23
414 0.23
415 0.24
416 0.25
417 0.25
418 0.22
419 0.21
420 0.23
421 0.26
422 0.22
423 0.2
424 0.21
425 0.21
426 0.24
427 0.26
428 0.3
429 0.34
430 0.37
431 0.42
432 0.48
433 0.55
434 0.61
435 0.68
436 0.68
437 0.66
438 0.66
439 0.67
440 0.63
441 0.59
442 0.56
443 0.56
444 0.55
445 0.55
446 0.58
447 0.54
448 0.51
449 0.5
450 0.44
451 0.37
452 0.3
453 0.22
454 0.17
455 0.14
456 0.13
457 0.11
458 0.1
459 0.08
460 0.08
461 0.09
462 0.11
463 0.12
464 0.11
465 0.15
466 0.17
467 0.16
468 0.18
469 0.2
470 0.21
471 0.23
472 0.24
473 0.19
474 0.17
475 0.16
476 0.14
477 0.12
478 0.09
479 0.07
480 0.07
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.07
485 0.08
486 0.08
487 0.1
488 0.16
489 0.17
490 0.17
491 0.22
492 0.23
493 0.22
494 0.24
495 0.26
496 0.23
497 0.29
498 0.3
499 0.32
500 0.41
501 0.49
502 0.55
503 0.62
504 0.63
505 0.67
506 0.69
507 0.72
508 0.7
509 0.71
510 0.71
511 0.66
512 0.69
513 0.66
514 0.69
515 0.65
516 0.58
517 0.51
518 0.46
519 0.5
520 0.46
521 0.44
522 0.41
523 0.42
524 0.45
525 0.43
526 0.4
527 0.31
528 0.29
529 0.29
530 0.26
531 0.2
532 0.16
533 0.16
534 0.15
535 0.14
536 0.12
537 0.08
538 0.06
539 0.07
540 0.08
541 0.09
542 0.09
543 0.1
544 0.11
545 0.11
546 0.12
547 0.15
548 0.16
549 0.2
550 0.26
551 0.28
552 0.33
553 0.35
554 0.35
555 0.32
556 0.34
557 0.37
558 0.36
559 0.34
560 0.29
561 0.28
562 0.3
563 0.29
564 0.25
565 0.19
566 0.17
567 0.18
568 0.18
569 0.2
570 0.2
571 0.24
572 0.32
573 0.37
574 0.42
575 0.48
576 0.52
577 0.55
578 0.57
579 0.61
580 0.6
581 0.59
582 0.55
583 0.51
584 0.47
585 0.4
586 0.38
587 0.31
588 0.24
589 0.2
590 0.14
591 0.11
592 0.11
593 0.09
594 0.08
595 0.08
596 0.08
597 0.1
598 0.1
599 0.11
600 0.13
601 0.16
602 0.17
603 0.22
604 0.23
605 0.22
606 0.27
607 0.3
608 0.36
609 0.37
610 0.4
611 0.37
612 0.46
613 0.46
614 0.42
615 0.45
616 0.38
617 0.37
618 0.37
619 0.36
620 0.26
621 0.34
622 0.33
623 0.27
624 0.31
625 0.28
626 0.26
627 0.3
628 0.31
629 0.25
630 0.28
631 0.32
632 0.33
633 0.37
634 0.36
635 0.34
636 0.41
637 0.43
638 0.44
639 0.4
640 0.35
641 0.35
642 0.44
643 0.48
644 0.48
645 0.54
646 0.55
647 0.62
648 0.62
649 0.64
650 0.63
651 0.63
652 0.63
653 0.6
654 0.56
655 0.5
656 0.5
657 0.45
658 0.36
659 0.31
660 0.24
661 0.18
662 0.19
663 0.18
664 0.24
665 0.29
666 0.39
667 0.46
668 0.5
669 0.54
670 0.55
671 0.6
672 0.61
673 0.6
674 0.56
675 0.48
676 0.47
677 0.42
678 0.41
679 0.33
680 0.25
681 0.24
682 0.2
683 0.2
684 0.17
685 0.18
686 0.17
687 0.23
688 0.27
689 0.29
690 0.36
691 0.36
692 0.39
693 0.43
694 0.44
695 0.44
696 0.45
697 0.46
698 0.38
699 0.38
700 0.35
701 0.31
702 0.29
703 0.26
704 0.2
705 0.15
706 0.16
707 0.15
708 0.15
709 0.14
710 0.14
711 0.15
712 0.17
713 0.18
714 0.18
715 0.18
716 0.18
717 0.2
718 0.2
719 0.21
720 0.2
721 0.24
722 0.25
723 0.31
724 0.33
725 0.39
726 0.44
727 0.44
728 0.44
729 0.43
730 0.46
731 0.43
732 0.42
733 0.39
734 0.4
735 0.39
736 0.38
737 0.33
738 0.29
739 0.27
740 0.25
741 0.21
742 0.14
743 0.15
744 0.15
745 0.16
746 0.15
747 0.13
748 0.15
749 0.14
750 0.17
751 0.14
752 0.14
753 0.15
754 0.22
755 0.26
756 0.29
757 0.3
758 0.28
759 0.32
760 0.36
761 0.37
762 0.36
763 0.32
764 0.29
765 0.28
766 0.28
767 0.24
768 0.2
769 0.19
770 0.16
771 0.16
772 0.13
773 0.12
774 0.12
775 0.14
776 0.14
777 0.13
778 0.12
779 0.13
780 0.15
781 0.17
782 0.17
783 0.15
784 0.15
785 0.18
786 0.17
787 0.15
788 0.17
789 0.18
790 0.19
791 0.2
792 0.22
793 0.19
794 0.19
795 0.21
796 0.16
797 0.18
798 0.18
799 0.2
800 0.2
801 0.19
802 0.21
803 0.19
804 0.21
805 0.19
806 0.18
807 0.15
808 0.13
809 0.13
810 0.12
811 0.12
812 0.1
813 0.08
814 0.11
815 0.11
816 0.1
817 0.11
818 0.12
819 0.13
820 0.15
821 0.15
822 0.11
823 0.11
824 0.12
825 0.13
826 0.09
827 0.09
828 0.09
829 0.1
830 0.1
831 0.11
832 0.13