Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2C5G4

Protein Details
Accession A0A1Y2C5G4    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
111-131EEYERRKKRSVRPQVSWLRRTHydrophilic
331-356FYNVIQSKLSLRKKRAKSKYAAQVEFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
343-347KKRAK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007133  RNA_pol_II-assoc_Paf1  
Gene Ontology GO:0016593  C:Cdc73/Paf1 complex  
GO:0016570  P:histone modification  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF03985  Paf1  
Amino Acid Sequences MSSTKHHHRTIKKPGSGFMCRQRFQNTLPELPFNPKLVEFPFPRDRLYSYKTSQLIENTPYKVLPPDNELGTSLNLIDMKVFEEGPDNKNINPTEPAEIDEEDKILLISNEEYERRKKRSVRPQVSWLRRTEYISNEASNKFKNNEFSEVKMGLSIAKDTAIQSADLSVNGQIKSISRTFKIINETDLFNIKHPTKAYLKAVEIFPVFPDFVRWPNTYSHVQYNSSPLNNNSKETVEKLDEVTSTQLSNAILKPMQNPLDPSETFLSYFQPSVETAKKIILKRKHEDSDDEEFDDEAQEYNFVRDFEYVTNTESKSKKIFFTFNPEQGGAFYNVIQSKLSLRKKRAKSKYAAQVEFDKPNRIELTKREFTNSEERERNEKLKQILTKDRID
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.72
3 0.7
4 0.68
5 0.67
6 0.66
7 0.6
8 0.62
9 0.62
10 0.57
11 0.53
12 0.55
13 0.5
14 0.48
15 0.49
16 0.49
17 0.45
18 0.48
19 0.48
20 0.41
21 0.37
22 0.3
23 0.3
24 0.28
25 0.34
26 0.29
27 0.34
28 0.41
29 0.4
30 0.42
31 0.41
32 0.42
33 0.42
34 0.45
35 0.45
36 0.39
37 0.45
38 0.46
39 0.45
40 0.44
41 0.42
42 0.4
43 0.38
44 0.41
45 0.35
46 0.33
47 0.32
48 0.29
49 0.29
50 0.27
51 0.24
52 0.24
53 0.25
54 0.26
55 0.26
56 0.26
57 0.24
58 0.21
59 0.19
60 0.14
61 0.12
62 0.1
63 0.1
64 0.09
65 0.08
66 0.08
67 0.09
68 0.09
69 0.08
70 0.14
71 0.17
72 0.2
73 0.26
74 0.26
75 0.26
76 0.32
77 0.32
78 0.28
79 0.28
80 0.28
81 0.25
82 0.24
83 0.26
84 0.22
85 0.22
86 0.21
87 0.18
88 0.16
89 0.12
90 0.11
91 0.09
92 0.07
93 0.07
94 0.06
95 0.06
96 0.08
97 0.1
98 0.13
99 0.16
100 0.24
101 0.31
102 0.36
103 0.43
104 0.5
105 0.58
106 0.67
107 0.75
108 0.76
109 0.75
110 0.8
111 0.82
112 0.83
113 0.78
114 0.69
115 0.63
116 0.55
117 0.53
118 0.47
119 0.4
120 0.36
121 0.33
122 0.32
123 0.31
124 0.3
125 0.29
126 0.27
127 0.26
128 0.23
129 0.24
130 0.28
131 0.28
132 0.34
133 0.33
134 0.33
135 0.35
136 0.33
137 0.3
138 0.24
139 0.21
140 0.14
141 0.13
142 0.11
143 0.07
144 0.06
145 0.07
146 0.07
147 0.09
148 0.08
149 0.08
150 0.07
151 0.09
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.1
160 0.1
161 0.13
162 0.16
163 0.16
164 0.14
165 0.17
166 0.18
167 0.21
168 0.25
169 0.23
170 0.23
171 0.22
172 0.22
173 0.2
174 0.23
175 0.2
176 0.16
177 0.19
178 0.17
179 0.18
180 0.17
181 0.2
182 0.2
183 0.23
184 0.26
185 0.25
186 0.25
187 0.25
188 0.25
189 0.23
190 0.2
191 0.16
192 0.14
193 0.12
194 0.11
195 0.08
196 0.1
197 0.09
198 0.11
199 0.16
200 0.16
201 0.17
202 0.19
203 0.23
204 0.24
205 0.25
206 0.28
207 0.26
208 0.27
209 0.26
210 0.29
211 0.28
212 0.26
213 0.25
214 0.22
215 0.28
216 0.28
217 0.28
218 0.25
219 0.24
220 0.24
221 0.24
222 0.26
223 0.18
224 0.18
225 0.18
226 0.17
227 0.16
228 0.15
229 0.15
230 0.12
231 0.1
232 0.09
233 0.1
234 0.09
235 0.11
236 0.11
237 0.11
238 0.11
239 0.12
240 0.14
241 0.18
242 0.2
243 0.18
244 0.2
245 0.21
246 0.25
247 0.25
248 0.26
249 0.23
250 0.22
251 0.22
252 0.2
253 0.2
254 0.15
255 0.15
256 0.12
257 0.11
258 0.11
259 0.15
260 0.18
261 0.17
262 0.17
263 0.22
264 0.27
265 0.31
266 0.39
267 0.43
268 0.48
269 0.53
270 0.61
271 0.62
272 0.59
273 0.6
274 0.57
275 0.57
276 0.51
277 0.46
278 0.37
279 0.31
280 0.28
281 0.24
282 0.18
283 0.1
284 0.08
285 0.08
286 0.07
287 0.09
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.12
293 0.13
294 0.17
295 0.17
296 0.17
297 0.21
298 0.21
299 0.28
300 0.27
301 0.29
302 0.31
303 0.33
304 0.36
305 0.37
306 0.42
307 0.39
308 0.47
309 0.51
310 0.5
311 0.52
312 0.47
313 0.42
314 0.37
315 0.36
316 0.29
317 0.22
318 0.17
319 0.17
320 0.18
321 0.19
322 0.18
323 0.15
324 0.2
325 0.29
326 0.38
327 0.42
328 0.5
329 0.6
330 0.7
331 0.8
332 0.84
333 0.84
334 0.83
335 0.84
336 0.86
337 0.86
338 0.79
339 0.72
340 0.69
341 0.65
342 0.66
343 0.58
344 0.55
345 0.45
346 0.48
347 0.48
348 0.42
349 0.42
350 0.42
351 0.49
352 0.48
353 0.5
354 0.49
355 0.47
356 0.5
357 0.55
358 0.52
359 0.52
360 0.51
361 0.54
362 0.56
363 0.61
364 0.62
365 0.57
366 0.58
367 0.55
368 0.57
369 0.59
370 0.61
371 0.65