Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2AHK6

Protein Details
Accession A0A1Y2AHK6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-59FYYTFSSKDRHRKLTKMKRHVLIDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007645  RNA_pol_Rpb2_3  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003899  F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF04565  RNA_pol_Rpb2_3  
Amino Acid Sequences MFMDYKYIEYVGKVLSKGKAEKSIKYFSNEHTNFDFYYTFSSKDRHRKLTKMKRHVLIDIRIYYSLFFQLLRVKGIKRMKSKVSQNVIGKNIPEDIEIMIPDSSPETTLKSIFSHRKESKEEIISIINGMIDSYLTPDSLHCDRSSYDDRNTKFYIYLCMARMFLDFNSTVQTLSKRSYYDKLSHIQRVQIPINTESENLELRLSYEYGYFCPFETPEFKDIGRAKYFGLSVLIVPAFTMDLSYLSSVLYDSPHYNDFKESKHE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.24
3 0.29
4 0.33
5 0.36
6 0.43
7 0.44
8 0.5
9 0.52
10 0.56
11 0.54
12 0.55
13 0.54
14 0.48
15 0.56
16 0.49
17 0.47
18 0.43
19 0.42
20 0.36
21 0.35
22 0.3
23 0.2
24 0.26
25 0.23
26 0.21
27 0.21
28 0.25
29 0.31
30 0.41
31 0.49
32 0.52
33 0.57
34 0.64
35 0.74
36 0.81
37 0.83
38 0.83
39 0.84
40 0.81
41 0.78
42 0.76
43 0.71
44 0.66
45 0.61
46 0.53
47 0.47
48 0.4
49 0.36
50 0.29
51 0.23
52 0.18
53 0.12
54 0.1
55 0.09
56 0.15
57 0.16
58 0.18
59 0.2
60 0.19
61 0.27
62 0.35
63 0.41
64 0.43
65 0.48
66 0.52
67 0.58
68 0.65
69 0.67
70 0.65
71 0.65
72 0.62
73 0.62
74 0.59
75 0.52
76 0.43
77 0.35
78 0.3
79 0.22
80 0.18
81 0.12
82 0.1
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.06
91 0.06
92 0.07
93 0.08
94 0.09
95 0.1
96 0.11
97 0.11
98 0.18
99 0.24
100 0.27
101 0.35
102 0.37
103 0.41
104 0.44
105 0.47
106 0.47
107 0.43
108 0.4
109 0.32
110 0.29
111 0.24
112 0.2
113 0.16
114 0.1
115 0.07
116 0.06
117 0.04
118 0.03
119 0.03
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.05
124 0.05
125 0.09
126 0.1
127 0.12
128 0.1
129 0.11
130 0.12
131 0.18
132 0.24
133 0.23
134 0.28
135 0.33
136 0.34
137 0.38
138 0.39
139 0.33
140 0.29
141 0.26
142 0.24
143 0.2
144 0.22
145 0.18
146 0.18
147 0.18
148 0.17
149 0.17
150 0.14
151 0.11
152 0.11
153 0.1
154 0.09
155 0.11
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.13
160 0.12
161 0.14
162 0.16
163 0.15
164 0.18
165 0.23
166 0.26
167 0.3
168 0.32
169 0.37
170 0.4
171 0.46
172 0.44
173 0.44
174 0.43
175 0.44
176 0.42
177 0.38
178 0.35
179 0.3
180 0.31
181 0.27
182 0.24
183 0.2
184 0.19
185 0.17
186 0.15
187 0.13
188 0.1
189 0.1
190 0.12
191 0.11
192 0.09
193 0.1
194 0.11
195 0.12
196 0.15
197 0.14
198 0.12
199 0.14
200 0.14
201 0.15
202 0.18
203 0.22
204 0.22
205 0.23
206 0.23
207 0.29
208 0.33
209 0.37
210 0.36
211 0.32
212 0.31
213 0.32
214 0.32
215 0.25
216 0.22
217 0.17
218 0.14
219 0.16
220 0.15
221 0.11
222 0.11
223 0.1
224 0.08
225 0.07
226 0.08
227 0.05
228 0.05
229 0.07
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.1
238 0.12
239 0.15
240 0.2
241 0.22
242 0.23
243 0.29
244 0.31