Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2C4F1

Protein Details
Accession A0A1Y2C4F1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
54-78YETNNKTQNKHKMKKPLYTYTKREIHydrophilic
418-437NIPIKLEKVRRTPKIQKYFGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 6.5, mito 5, cyto_pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010736  SHIPPO-rpt  
Pfam View protein in Pfam  
PF07004  SHIPPO-rpt  
Amino Acid Sequences MSTKQQYNERNNNEDNKLSNQMSNQSVKDIKLDESEMINTNSDEVNDKNSSYEYETNNKTQNKHKMKKPLYTYTKREISGYRTGMGEYVPTNHTLPLTNLAIPTPGPSDYYHDLDKSGNEYTILGRPREKVNDTSPGPAIVNTRLKEKYPYWTIGKKLHYPKNPYDNGVPGPYYSLPDIQFDGQKATLKSRHYLKGEIYPSPSDYNCRKEKPDGPMYSFGRKYDKTIQDNPGTGKYNVLYNYLSTMKQYPIYSFHSKPGIGLFDKKAVDNGTPGANKYDIKIQPSNIYASIKGKYKDYKGNGVPAPNNFEIPSTIISQKNFSFTGKPLNEFESKANDPGPVNYSPNYDEVLKKSPTYSFGKAVRSNELTISRKPGPIHNVTYENISCNTEPKITIKGKPKVKIPKTPGPSDYFKDIMNIPIKLEKVRRTPKIQKYFGSGRKESKKVPPTPGPASYDISKILKYNSSPNYTMGKKLNEKNNTCHTEFNYTISEKPKDGIKFKGRMSNYVLTYPSNRVNTIKSKI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.58
3 0.53
4 0.53
5 0.47
6 0.43
7 0.38
8 0.4
9 0.41
10 0.43
11 0.38
12 0.37
13 0.38
14 0.36
15 0.37
16 0.34
17 0.3
18 0.28
19 0.29
20 0.25
21 0.24
22 0.26
23 0.25
24 0.25
25 0.23
26 0.2
27 0.19
28 0.18
29 0.16
30 0.16
31 0.14
32 0.19
33 0.19
34 0.2
35 0.19
36 0.2
37 0.22
38 0.24
39 0.29
40 0.28
41 0.35
42 0.39
43 0.43
44 0.51
45 0.53
46 0.52
47 0.55
48 0.61
49 0.64
50 0.69
51 0.72
52 0.75
53 0.78
54 0.83
55 0.82
56 0.82
57 0.81
58 0.82
59 0.81
60 0.79
61 0.77
62 0.69
63 0.64
64 0.56
65 0.52
66 0.51
67 0.46
68 0.39
69 0.33
70 0.32
71 0.29
72 0.25
73 0.21
74 0.13
75 0.14
76 0.13
77 0.15
78 0.16
79 0.16
80 0.17
81 0.16
82 0.17
83 0.18
84 0.19
85 0.18
86 0.18
87 0.17
88 0.17
89 0.16
90 0.16
91 0.12
92 0.11
93 0.11
94 0.12
95 0.18
96 0.21
97 0.24
98 0.24
99 0.23
100 0.24
101 0.23
102 0.24
103 0.21
104 0.18
105 0.15
106 0.14
107 0.14
108 0.15
109 0.2
110 0.22
111 0.2
112 0.22
113 0.24
114 0.29
115 0.34
116 0.36
117 0.35
118 0.36
119 0.43
120 0.42
121 0.43
122 0.38
123 0.34
124 0.31
125 0.27
126 0.25
127 0.22
128 0.27
129 0.24
130 0.29
131 0.29
132 0.3
133 0.34
134 0.34
135 0.35
136 0.34
137 0.39
138 0.4
139 0.43
140 0.47
141 0.48
142 0.51
143 0.52
144 0.56
145 0.6
146 0.61
147 0.63
148 0.67
149 0.69
150 0.67
151 0.61
152 0.55
153 0.5
154 0.44
155 0.39
156 0.31
157 0.21
158 0.21
159 0.19
160 0.17
161 0.15
162 0.15
163 0.14
164 0.15
165 0.16
166 0.15
167 0.16
168 0.16
169 0.17
170 0.15
171 0.18
172 0.17
173 0.21
174 0.24
175 0.24
176 0.28
177 0.33
178 0.38
179 0.37
180 0.39
181 0.37
182 0.4
183 0.41
184 0.39
185 0.35
186 0.29
187 0.29
188 0.28
189 0.26
190 0.23
191 0.25
192 0.3
193 0.33
194 0.35
195 0.36
196 0.4
197 0.46
198 0.49
199 0.54
200 0.51
201 0.49
202 0.53
203 0.53
204 0.53
205 0.48
206 0.41
207 0.38
208 0.34
209 0.35
210 0.37
211 0.42
212 0.42
213 0.47
214 0.51
215 0.49
216 0.51
217 0.48
218 0.42
219 0.38
220 0.31
221 0.26
222 0.2
223 0.2
224 0.19
225 0.19
226 0.15
227 0.11
228 0.14
229 0.15
230 0.14
231 0.12
232 0.13
233 0.12
234 0.15
235 0.15
236 0.14
237 0.16
238 0.23
239 0.27
240 0.26
241 0.28
242 0.28
243 0.27
244 0.26
245 0.24
246 0.2
247 0.16
248 0.18
249 0.16
250 0.18
251 0.19
252 0.18
253 0.18
254 0.16
255 0.16
256 0.13
257 0.13
258 0.12
259 0.12
260 0.13
261 0.13
262 0.13
263 0.13
264 0.13
265 0.2
266 0.18
267 0.22
268 0.24
269 0.24
270 0.26
271 0.27
272 0.27
273 0.21
274 0.2
275 0.17
276 0.17
277 0.19
278 0.2
279 0.19
280 0.21
281 0.24
282 0.27
283 0.34
284 0.35
285 0.4
286 0.38
287 0.44
288 0.42
289 0.42
290 0.4
291 0.34
292 0.36
293 0.29
294 0.27
295 0.21
296 0.19
297 0.16
298 0.15
299 0.15
300 0.12
301 0.15
302 0.17
303 0.17
304 0.19
305 0.19
306 0.21
307 0.2
308 0.19
309 0.18
310 0.17
311 0.26
312 0.25
313 0.26
314 0.25
315 0.28
316 0.29
317 0.28
318 0.29
319 0.25
320 0.25
321 0.24
322 0.23
323 0.21
324 0.2
325 0.2
326 0.22
327 0.17
328 0.18
329 0.18
330 0.19
331 0.19
332 0.19
333 0.19
334 0.17
335 0.17
336 0.19
337 0.24
338 0.23
339 0.22
340 0.22
341 0.22
342 0.26
343 0.29
344 0.29
345 0.3
346 0.33
347 0.4
348 0.42
349 0.43
350 0.44
351 0.4
352 0.38
353 0.35
354 0.37
355 0.34
356 0.32
357 0.36
358 0.33
359 0.34
360 0.34
361 0.36
362 0.36
363 0.38
364 0.41
365 0.39
366 0.4
367 0.37
368 0.4
369 0.35
370 0.31
371 0.26
372 0.24
373 0.2
374 0.19
375 0.2
376 0.17
377 0.18
378 0.18
379 0.25
380 0.26
381 0.33
382 0.41
383 0.48
384 0.54
385 0.57
386 0.64
387 0.67
388 0.7
389 0.73
390 0.72
391 0.73
392 0.72
393 0.73
394 0.69
395 0.64
396 0.61
397 0.55
398 0.51
399 0.43
400 0.36
401 0.32
402 0.29
403 0.29
404 0.29
405 0.25
406 0.22
407 0.25
408 0.26
409 0.28
410 0.34
411 0.34
412 0.4
413 0.49
414 0.55
415 0.61
416 0.71
417 0.76
418 0.81
419 0.8
420 0.72
421 0.71
422 0.74
423 0.73
424 0.71
425 0.65
426 0.64
427 0.67
428 0.69
429 0.66
430 0.66
431 0.68
432 0.67
433 0.71
434 0.7
435 0.69
436 0.7
437 0.7
438 0.64
439 0.58
440 0.55
441 0.48
442 0.41
443 0.37
444 0.33
445 0.28
446 0.25
447 0.25
448 0.25
449 0.26
450 0.33
451 0.36
452 0.41
453 0.41
454 0.43
455 0.47
456 0.45
457 0.49
458 0.46
459 0.47
460 0.49
461 0.56
462 0.62
463 0.65
464 0.68
465 0.69
466 0.73
467 0.72
468 0.65
469 0.62
470 0.56
471 0.55
472 0.51
473 0.47
474 0.42
475 0.37
476 0.4
477 0.41
478 0.4
479 0.33
480 0.34
481 0.37
482 0.39
483 0.41
484 0.47
485 0.49
486 0.54
487 0.57
488 0.65
489 0.6
490 0.58
491 0.61
492 0.59
493 0.52
494 0.49
495 0.46
496 0.4
497 0.42
498 0.42
499 0.42
500 0.37
501 0.37
502 0.36
503 0.41