Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2DJH6

Protein Details
Accession A0A1Y2DJH6    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-40TASPKLVQKYKQLKKRIKESQDLRNINKHydrophilic
329-390SRSRSRSRSRSPYSRNRNRSRSRSRSPRYHSRSRSSYKSHNRSRSRSRSRSRSRHSRYRDEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
320-384ERSRNYMRLSRSRSRSRSRSPYSRNRNRSRSRSRSPRYHSRSRSSYKSHNRSRSRSRSRSRSRHS
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR034605  PGC-1  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MKMPGEKIYIDSTASPKLVQKYKQLKKRIKESQDLRNINKINSLTQNKITLKINLGAVKEQLTGCPSPALSYNSSNLSDNYTKVNDFDSDNSESNLSNYQSDNANPPTRGRSIERSLIFYKNQQLQSRSISNDSSSSIESDLSISTLGSLDSISQESSSSVYIRNSLLPSPNSTPLPNELNEKDLNGIEENDNEEIYINDDDLNSPQYEIVVDDKEEIEIDSEPEDLGEFPEIDDEEELILTDDETEEPKINQEIRIEQKFIKEEEKIKPNLVSESNQNNIIKVIKGETKIKDKLPTIEKKLVKEENKRFNDDDINLKRERSRNYMRLSRSRSRSRSRSPYSRNRNRSRSRSRSPRYHSRSRSSYKSHNRSRSRSRSRSRSRHSRYRDEDYHHRSGRYDRDRYYYNRKSHFYSNRKQRHFEEEADDDDDEEIISTTNTIEKTIMEDPRKKPLLDIEQTQIYRESASYLETEFYKKTIYLGDLEENTPESVIRKIFSTFGEIREIKIFPGKQYAFISYKSAISALDAIKKMNGYKLGSSVIKVGKAKIPERNKYGFGNRPWQDDDGAMAMTQDTYGFEYINNDPNQSSSMANFSAYNIYGHRNVNIINPKTYQNSSIGILDPRASNRTLLSYDDF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.25
3 0.26
4 0.34
5 0.4
6 0.42
7 0.49
8 0.56
9 0.65
10 0.72
11 0.78
12 0.79
13 0.81
14 0.87
15 0.87
16 0.85
17 0.85
18 0.84
19 0.84
20 0.85
21 0.83
22 0.77
23 0.76
24 0.7
25 0.6
26 0.59
27 0.5
28 0.45
29 0.47
30 0.48
31 0.44
32 0.45
33 0.53
34 0.48
35 0.51
36 0.49
37 0.43
38 0.4
39 0.39
40 0.4
41 0.35
42 0.36
43 0.33
44 0.31
45 0.29
46 0.28
47 0.24
48 0.21
49 0.21
50 0.19
51 0.19
52 0.19
53 0.17
54 0.16
55 0.2
56 0.23
57 0.23
58 0.25
59 0.27
60 0.28
61 0.3
62 0.3
63 0.26
64 0.29
65 0.27
66 0.25
67 0.27
68 0.26
69 0.25
70 0.24
71 0.25
72 0.2
73 0.21
74 0.23
75 0.23
76 0.25
77 0.26
78 0.26
79 0.25
80 0.23
81 0.22
82 0.24
83 0.2
84 0.17
85 0.17
86 0.18
87 0.19
88 0.2
89 0.25
90 0.27
91 0.3
92 0.29
93 0.31
94 0.34
95 0.35
96 0.37
97 0.37
98 0.38
99 0.39
100 0.46
101 0.45
102 0.46
103 0.47
104 0.47
105 0.44
106 0.41
107 0.43
108 0.43
109 0.47
110 0.47
111 0.47
112 0.46
113 0.5
114 0.51
115 0.46
116 0.41
117 0.35
118 0.31
119 0.3
120 0.27
121 0.23
122 0.19
123 0.17
124 0.15
125 0.14
126 0.12
127 0.12
128 0.1
129 0.08
130 0.08
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.09
146 0.09
147 0.1
148 0.11
149 0.13
150 0.13
151 0.16
152 0.17
153 0.18
154 0.22
155 0.21
156 0.26
157 0.28
158 0.31
159 0.29
160 0.28
161 0.28
162 0.27
163 0.29
164 0.25
165 0.27
166 0.24
167 0.26
168 0.25
169 0.24
170 0.21
171 0.18
172 0.19
173 0.14
174 0.15
175 0.12
176 0.12
177 0.14
178 0.13
179 0.12
180 0.1
181 0.1
182 0.08
183 0.09
184 0.09
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.09
190 0.11
191 0.08
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.09
198 0.08
199 0.09
200 0.09
201 0.1
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.08
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.05
214 0.05
215 0.06
216 0.05
217 0.05
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.06
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.08
237 0.11
238 0.12
239 0.14
240 0.14
241 0.19
242 0.25
243 0.27
244 0.29
245 0.27
246 0.3
247 0.3
248 0.3
249 0.27
250 0.24
251 0.27
252 0.32
253 0.38
254 0.36
255 0.35
256 0.34
257 0.32
258 0.32
259 0.28
260 0.23
261 0.22
262 0.25
263 0.25
264 0.27
265 0.26
266 0.23
267 0.22
268 0.21
269 0.16
270 0.12
271 0.13
272 0.12
273 0.15
274 0.2
275 0.22
276 0.28
277 0.31
278 0.33
279 0.35
280 0.33
281 0.37
282 0.41
283 0.44
284 0.43
285 0.49
286 0.49
287 0.46
288 0.51
289 0.52
290 0.51
291 0.54
292 0.56
293 0.58
294 0.59
295 0.61
296 0.56
297 0.51
298 0.48
299 0.39
300 0.4
301 0.33
302 0.34
303 0.3
304 0.3
305 0.32
306 0.33
307 0.35
308 0.33
309 0.37
310 0.4
311 0.46
312 0.52
313 0.53
314 0.57
315 0.61
316 0.61
317 0.62
318 0.64
319 0.65
320 0.67
321 0.7
322 0.7
323 0.72
324 0.72
325 0.74
326 0.74
327 0.77
328 0.8
329 0.82
330 0.84
331 0.82
332 0.85
333 0.84
334 0.86
335 0.86
336 0.84
337 0.84
338 0.84
339 0.83
340 0.82
341 0.81
342 0.82
343 0.79
344 0.8
345 0.77
346 0.74
347 0.75
348 0.7
349 0.7
350 0.65
351 0.67
352 0.67
353 0.71
354 0.72
355 0.74
356 0.76
357 0.77
358 0.82
359 0.83
360 0.83
361 0.83
362 0.83
363 0.83
364 0.86
365 0.89
366 0.87
367 0.87
368 0.85
369 0.85
370 0.84
371 0.84
372 0.79
373 0.78
374 0.74
375 0.7
376 0.71
377 0.68
378 0.7
379 0.61
380 0.55
381 0.48
382 0.48
383 0.51
384 0.5
385 0.48
386 0.41
387 0.43
388 0.47
389 0.52
390 0.57
391 0.56
392 0.55
393 0.56
394 0.56
395 0.56
396 0.61
397 0.66
398 0.64
399 0.65
400 0.68
401 0.72
402 0.74
403 0.75
404 0.68
405 0.67
406 0.62
407 0.56
408 0.5
409 0.43
410 0.4
411 0.37
412 0.33
413 0.25
414 0.2
415 0.17
416 0.11
417 0.08
418 0.06
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.08
427 0.08
428 0.12
429 0.17
430 0.23
431 0.27
432 0.35
433 0.37
434 0.46
435 0.49
436 0.45
437 0.41
438 0.43
439 0.46
440 0.42
441 0.44
442 0.38
443 0.41
444 0.41
445 0.41
446 0.34
447 0.24
448 0.21
449 0.17
450 0.15
451 0.09
452 0.1
453 0.1
454 0.1
455 0.11
456 0.11
457 0.14
458 0.13
459 0.13
460 0.13
461 0.12
462 0.12
463 0.14
464 0.14
465 0.14
466 0.16
467 0.19
468 0.2
469 0.2
470 0.2
471 0.19
472 0.17
473 0.15
474 0.12
475 0.1
476 0.11
477 0.12
478 0.12
479 0.12
480 0.13
481 0.15
482 0.15
483 0.21
484 0.21
485 0.22
486 0.29
487 0.28
488 0.29
489 0.3
490 0.3
491 0.24
492 0.29
493 0.28
494 0.22
495 0.31
496 0.3
497 0.31
498 0.33
499 0.37
500 0.33
501 0.33
502 0.35
503 0.27
504 0.27
505 0.23
506 0.21
507 0.15
508 0.14
509 0.17
510 0.15
511 0.2
512 0.2
513 0.2
514 0.21
515 0.23
516 0.22
517 0.22
518 0.26
519 0.22
520 0.23
521 0.25
522 0.29
523 0.28
524 0.27
525 0.29
526 0.27
527 0.29
528 0.29
529 0.29
530 0.29
531 0.34
532 0.39
533 0.42
534 0.5
535 0.53
536 0.59
537 0.61
538 0.6
539 0.6
540 0.63
541 0.62
542 0.59
543 0.61
544 0.56
545 0.57
546 0.57
547 0.52
548 0.45
549 0.36
550 0.32
551 0.23
552 0.21
553 0.15
554 0.12
555 0.1
556 0.09
557 0.08
558 0.07
559 0.06
560 0.08
561 0.08
562 0.08
563 0.09
564 0.13
565 0.16
566 0.24
567 0.24
568 0.24
569 0.23
570 0.24
571 0.26
572 0.23
573 0.21
574 0.14
575 0.17
576 0.16
577 0.17
578 0.16
579 0.16
580 0.18
581 0.18
582 0.18
583 0.16
584 0.19
585 0.23
586 0.25
587 0.24
588 0.23
589 0.23
590 0.3
591 0.38
592 0.38
593 0.37
594 0.38
595 0.41
596 0.44
597 0.46
598 0.4
599 0.34
600 0.33
601 0.31
602 0.31
603 0.3
604 0.27
605 0.26
606 0.25
607 0.25
608 0.26
609 0.27
610 0.25
611 0.24
612 0.23
613 0.26
614 0.25