Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2CME1

Protein Details
Accession A0A1Y2CME1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
167-188ASTSNTPPRKIQKKNRGGNVIGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
175-195RKIQKKNRGGNVIGKRRPNHP
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR001356  Homeobox_dom  
IPR008422  Homeobox_KN_domain  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF05920  Homeobox_KN  
CDD cd00086  homeodomain  
Amino Acid Sequences MDNETYNISSLLSKFEIYKEFFDFITSKYPLLKYQFFNYYYRNKFNNEEFHNNLWNNRNNSFSFNNYLCGESGPVSNMDVSKEYRPPAPSMTSDTYGYDPLLFSNNNNATQYLCHSPCLSNVKHESGFISGNNIISNPNIFNPTEINKSSFNMNSTCSDGMKAQATASTSNTPPRKIQKKNRGGNVIGKRRPNHPPEVIKILKGWFKSKEAYPYPTSQEKYKLCQSTGLTLVNNWFINARKRYLKFK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.2
3 0.24
4 0.25
5 0.28
6 0.27
7 0.27
8 0.26
9 0.28
10 0.26
11 0.22
12 0.27
13 0.25
14 0.22
15 0.25
16 0.26
17 0.29
18 0.34
19 0.38
20 0.34
21 0.39
22 0.45
23 0.43
24 0.45
25 0.46
26 0.49
27 0.5
28 0.53
29 0.5
30 0.47
31 0.5
32 0.53
33 0.57
34 0.54
35 0.55
36 0.53
37 0.53
38 0.57
39 0.52
40 0.51
41 0.48
42 0.48
43 0.44
44 0.41
45 0.42
46 0.36
47 0.4
48 0.38
49 0.34
50 0.33
51 0.29
52 0.31
53 0.28
54 0.28
55 0.23
56 0.2
57 0.18
58 0.13
59 0.13
60 0.1
61 0.1
62 0.09
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.11
67 0.12
68 0.14
69 0.17
70 0.18
71 0.21
72 0.22
73 0.23
74 0.24
75 0.25
76 0.23
77 0.27
78 0.28
79 0.27
80 0.26
81 0.25
82 0.23
83 0.2
84 0.19
85 0.13
86 0.1
87 0.08
88 0.1
89 0.09
90 0.08
91 0.15
92 0.17
93 0.18
94 0.18
95 0.18
96 0.16
97 0.17
98 0.19
99 0.17
100 0.15
101 0.15
102 0.16
103 0.16
104 0.2
105 0.25
106 0.22
107 0.21
108 0.23
109 0.26
110 0.25
111 0.25
112 0.21
113 0.17
114 0.18
115 0.13
116 0.13
117 0.11
118 0.11
119 0.11
120 0.1
121 0.09
122 0.08
123 0.09
124 0.07
125 0.07
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.11
130 0.13
131 0.16
132 0.17
133 0.18
134 0.18
135 0.18
136 0.21
137 0.2
138 0.19
139 0.16
140 0.17
141 0.16
142 0.18
143 0.18
144 0.16
145 0.16
146 0.14
147 0.15
148 0.14
149 0.13
150 0.1
151 0.11
152 0.12
153 0.12
154 0.14
155 0.15
156 0.15
157 0.23
158 0.25
159 0.26
160 0.31
161 0.39
162 0.47
163 0.54
164 0.64
165 0.67
166 0.75
167 0.82
168 0.85
169 0.81
170 0.75
171 0.74
172 0.73
173 0.73
174 0.68
175 0.66
176 0.6
177 0.59
178 0.65
179 0.61
180 0.59
181 0.57
182 0.58
183 0.56
184 0.63
185 0.59
186 0.51
187 0.48
188 0.44
189 0.39
190 0.35
191 0.35
192 0.29
193 0.31
194 0.35
195 0.36
196 0.42
197 0.43
198 0.46
199 0.46
200 0.47
201 0.49
202 0.53
203 0.51
204 0.46
205 0.5
206 0.48
207 0.5
208 0.55
209 0.54
210 0.47
211 0.51
212 0.49
213 0.46
214 0.47
215 0.43
216 0.35
217 0.31
218 0.32
219 0.31
220 0.28
221 0.22
222 0.2
223 0.22
224 0.3
225 0.33
226 0.37
227 0.42