Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2DME2

Protein Details
Accession A0A1Y2DME2    Localization Confidence High Confidence Score 21.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-100VVEVPKKEEKKIEKKIEKKETKKESKKNKKESKKTETEVKTETKTKTNIKKSNKKRKREEEAESKDAGBasic
139-187VHEALKTEKAKKKKKEKKEKQDKEDEEDELPKKKKRKVKDEPEKLERTLBasic
382-426AIKNKKIAKMIKGPRTKKRWTNSQKKQNAIKKHKKLLKKAAKQNKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-95PKKEEKKIEKKIEKKETKKESKKNKKESKKTETEVKTETKTKTNIKKSNKKRKREEEAE
145-178TEKAKKKKKEKKEKQDKEDEEDELPKKKKRKVKD
382-426AIKNKKIAKMIKGPRTKKRWTNSQKKQNAIKKHKKLLKKAAKQNK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR034221  RBM34_RRM2  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12394  RRM1_RBM34  
cd12395  RRM2_RBM34  
Amino Acid Sequences MEGLSFHFGTGDSKIDPKLDSLFKNSVPAPPKVVEVPKKEEKKIEKKIEKKETKKESKKNKKESKKTETEVKTETKTKTNIKKSNKKRKREEEAESKDAGKTENKVEEKKEEEEKEEVEEKKEKTEKELIEEQYRKQFVHEALKTEKAKKKKKEKKEKQDKEDEEDELPKKKKRKVKDEPEKLERTLFVGNLDKNVTEKANLKKLKQLFKKYGTIESIRFRSVAFSRNLPKKIAFITKEFHPERDCLNAYIVFENKESAEKALELNGSLFNDKHMRVDLEGKDKKLDEKKSVFVGNLAFDEQEETLWKAFSDCGEVVNVRIVRDAKTNLGKGFGYVTFKERSSVSLALELNDTTVGKRAIRVFRCKNLKKEDGNMMKEGEHAIKNKKIAKMIKGPRTKKRWTNSQKKQNAIKKHKKLLKKAAKQNK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.21
4 0.21
5 0.26
6 0.29
7 0.31
8 0.34
9 0.38
10 0.37
11 0.41
12 0.4
13 0.4
14 0.39
15 0.38
16 0.37
17 0.33
18 0.35
19 0.36
20 0.43
21 0.45
22 0.47
23 0.53
24 0.58
25 0.63
26 0.65
27 0.68
28 0.69
29 0.72
30 0.76
31 0.79
32 0.79
33 0.81
34 0.88
35 0.9
36 0.91
37 0.89
38 0.89
39 0.89
40 0.9
41 0.91
42 0.91
43 0.91
44 0.92
45 0.93
46 0.94
47 0.94
48 0.94
49 0.94
50 0.95
51 0.94
52 0.92
53 0.87
54 0.86
55 0.81
56 0.75
57 0.7
58 0.64
59 0.59
60 0.56
61 0.54
62 0.5
63 0.51
64 0.55
65 0.6
66 0.65
67 0.69
68 0.73
69 0.8
70 0.85
71 0.9
72 0.9
73 0.9
74 0.91
75 0.92
76 0.92
77 0.9
78 0.88
79 0.88
80 0.86
81 0.81
82 0.71
83 0.62
84 0.52
85 0.44
86 0.36
87 0.28
88 0.23
89 0.23
90 0.3
91 0.33
92 0.36
93 0.38
94 0.42
95 0.43
96 0.45
97 0.47
98 0.41
99 0.4
100 0.39
101 0.36
102 0.35
103 0.37
104 0.34
105 0.3
106 0.33
107 0.31
108 0.36
109 0.4
110 0.36
111 0.36
112 0.42
113 0.39
114 0.4
115 0.47
116 0.42
117 0.47
118 0.49
119 0.46
120 0.46
121 0.46
122 0.39
123 0.33
124 0.34
125 0.3
126 0.37
127 0.37
128 0.34
129 0.35
130 0.43
131 0.45
132 0.49
133 0.5
134 0.5
135 0.58
136 0.63
137 0.71
138 0.74
139 0.82
140 0.85
141 0.91
142 0.92
143 0.94
144 0.95
145 0.92
146 0.93
147 0.85
148 0.8
149 0.72
150 0.63
151 0.53
152 0.48
153 0.41
154 0.38
155 0.38
156 0.36
157 0.4
158 0.45
159 0.5
160 0.54
161 0.63
162 0.67
163 0.75
164 0.81
165 0.85
166 0.86
167 0.87
168 0.81
169 0.71
170 0.61
171 0.49
172 0.4
173 0.3
174 0.22
175 0.16
176 0.16
177 0.15
178 0.16
179 0.16
180 0.14
181 0.13
182 0.14
183 0.12
184 0.1
185 0.16
186 0.19
187 0.27
188 0.3
189 0.3
190 0.36
191 0.41
192 0.49
193 0.51
194 0.55
195 0.53
196 0.56
197 0.61
198 0.56
199 0.54
200 0.48
201 0.42
202 0.38
203 0.35
204 0.32
205 0.26
206 0.24
207 0.2
208 0.2
209 0.19
210 0.21
211 0.19
212 0.21
213 0.28
214 0.35
215 0.37
216 0.35
217 0.34
218 0.3
219 0.33
220 0.35
221 0.3
222 0.26
223 0.27
224 0.28
225 0.36
226 0.35
227 0.33
228 0.28
229 0.27
230 0.26
231 0.29
232 0.27
233 0.19
234 0.2
235 0.19
236 0.18
237 0.19
238 0.18
239 0.14
240 0.13
241 0.13
242 0.11
243 0.11
244 0.11
245 0.1
246 0.1
247 0.09
248 0.09
249 0.11
250 0.1
251 0.09
252 0.09
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.13
259 0.13
260 0.14
261 0.14
262 0.14
263 0.15
264 0.22
265 0.24
266 0.31
267 0.34
268 0.33
269 0.34
270 0.34
271 0.4
272 0.41
273 0.42
274 0.4
275 0.41
276 0.43
277 0.45
278 0.46
279 0.39
280 0.33
281 0.29
282 0.22
283 0.19
284 0.16
285 0.12
286 0.1
287 0.12
288 0.09
289 0.08
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.12
299 0.11
300 0.11
301 0.13
302 0.13
303 0.13
304 0.19
305 0.19
306 0.15
307 0.18
308 0.18
309 0.18
310 0.23
311 0.24
312 0.24
313 0.3
314 0.33
315 0.3
316 0.32
317 0.3
318 0.26
319 0.27
320 0.23
321 0.21
322 0.19
323 0.23
324 0.23
325 0.23
326 0.24
327 0.21
328 0.21
329 0.22
330 0.23
331 0.2
332 0.23
333 0.23
334 0.22
335 0.23
336 0.21
337 0.16
338 0.15
339 0.14
340 0.09
341 0.12
342 0.13
343 0.13
344 0.17
345 0.24
346 0.32
347 0.39
348 0.49
349 0.53
350 0.61
351 0.71
352 0.75
353 0.77
354 0.77
355 0.79
356 0.74
357 0.74
358 0.75
359 0.73
360 0.69
361 0.63
362 0.55
363 0.46
364 0.41
365 0.37
366 0.31
367 0.26
368 0.28
369 0.32
370 0.35
371 0.42
372 0.47
373 0.49
374 0.52
375 0.54
376 0.57
377 0.61
378 0.67
379 0.7
380 0.75
381 0.79
382 0.81
383 0.83
384 0.84
385 0.83
386 0.83
387 0.84
388 0.85
389 0.87
390 0.88
391 0.91
392 0.9
393 0.9
394 0.91
395 0.88
396 0.88
397 0.88
398 0.88
399 0.88
400 0.9
401 0.89
402 0.88
403 0.9
404 0.9
405 0.9
406 0.89