Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2F2L5

Protein Details
Accession A0A1Y2F2L5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
465-492IVRAYIKKRIGSKQNNQHRQQQQQQQMMHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.833, cyto 4, cyto_mito 2.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040662  Tfb2_C  
IPR004598  TFIIH_p52/Tfb2  
Gene Ontology GO:0000439  C:transcription factor TFIIH core complex  
GO:0001671  F:ATPase activator activity  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF03849  Tfb2  
PF18307  Tfb2_C  
Amino Acid Sequences MSNSNSIINNTSSESIQGDVSVFLEKLSDEEFQKLYTQPATCLAIFRLLPDLAKQFIMRLLYIKNEVPLEHIIGWCYEQYTDKVNESLRRLYKLHICTKNKNNEIRMSEVFQENLNNALIGGGNHTSFGSTSTSVDKHKVDIDFLDRYGTEQWEAVLHYMVGVNISKKPSPAVLKLLERSGLMAAKRDEVKDEYAVFNKVDINELEITNKGFQFLLQDVNTQVWAFLIQYLNMVDDLKMDLVEVLNFLFQLGSLQLGADYSVESLTPTQQQMLNDLKHLGIIYQRKRSSKRFYPTRLATSLTSGSMLTSKPSTEDSGFIILETNSRLYAYTDSELQINVLKLFVVIKPPRFANMVVGMITRDSIRRALNFGITADQIITYLRTHAHPEMKKKMPILPLTVVDQIRLWEMERNRLKVEKGCLYHDFPRDRAEVFQEVLNYAKQYNVVIWSNVEKRMLIVTTEGHHIVRAYIKKRIGSKQNNQHRQQQQQQQMMHQHH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.17
3 0.15
4 0.14
5 0.12
6 0.11
7 0.11
8 0.12
9 0.1
10 0.09
11 0.09
12 0.09
13 0.09
14 0.11
15 0.14
16 0.14
17 0.17
18 0.18
19 0.19
20 0.22
21 0.22
22 0.23
23 0.25
24 0.24
25 0.22
26 0.26
27 0.29
28 0.26
29 0.27
30 0.25
31 0.25
32 0.24
33 0.23
34 0.23
35 0.19
36 0.2
37 0.21
38 0.23
39 0.19
40 0.2
41 0.19
42 0.16
43 0.19
44 0.2
45 0.17
46 0.17
47 0.18
48 0.2
49 0.23
50 0.23
51 0.23
52 0.22
53 0.22
54 0.23
55 0.23
56 0.22
57 0.2
58 0.2
59 0.18
60 0.17
61 0.18
62 0.14
63 0.13
64 0.11
65 0.12
66 0.13
67 0.18
68 0.2
69 0.21
70 0.24
71 0.28
72 0.32
73 0.35
74 0.42
75 0.4
76 0.42
77 0.41
78 0.43
79 0.47
80 0.49
81 0.55
82 0.57
83 0.6
84 0.65
85 0.73
86 0.79
87 0.78
88 0.77
89 0.73
90 0.7
91 0.67
92 0.63
93 0.56
94 0.49
95 0.44
96 0.38
97 0.34
98 0.27
99 0.24
100 0.18
101 0.17
102 0.14
103 0.11
104 0.09
105 0.09
106 0.08
107 0.07
108 0.08
109 0.08
110 0.07
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.11
119 0.14
120 0.16
121 0.18
122 0.22
123 0.21
124 0.2
125 0.24
126 0.23
127 0.21
128 0.21
129 0.24
130 0.22
131 0.21
132 0.21
133 0.16
134 0.17
135 0.18
136 0.16
137 0.12
138 0.11
139 0.11
140 0.1
141 0.11
142 0.1
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.1
152 0.13
153 0.13
154 0.13
155 0.14
156 0.18
157 0.22
158 0.23
159 0.26
160 0.28
161 0.32
162 0.33
163 0.33
164 0.29
165 0.24
166 0.22
167 0.18
168 0.16
169 0.12
170 0.14
171 0.14
172 0.17
173 0.18
174 0.18
175 0.19
176 0.19
177 0.2
178 0.19
179 0.2
180 0.18
181 0.18
182 0.2
183 0.17
184 0.16
185 0.15
186 0.13
187 0.13
188 0.11
189 0.12
190 0.12
191 0.13
192 0.13
193 0.12
194 0.13
195 0.12
196 0.12
197 0.1
198 0.08
199 0.08
200 0.1
201 0.1
202 0.13
203 0.11
204 0.12
205 0.12
206 0.12
207 0.13
208 0.1
209 0.09
210 0.05
211 0.05
212 0.04
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.05
222 0.05
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.07
254 0.07
255 0.08
256 0.11
257 0.11
258 0.15
259 0.2
260 0.19
261 0.18
262 0.18
263 0.17
264 0.15
265 0.15
266 0.11
267 0.11
268 0.19
269 0.23
270 0.3
271 0.34
272 0.4
273 0.45
274 0.52
275 0.57
276 0.58
277 0.63
278 0.65
279 0.68
280 0.72
281 0.71
282 0.69
283 0.61
284 0.54
285 0.45
286 0.38
287 0.32
288 0.23
289 0.19
290 0.13
291 0.12
292 0.11
293 0.1
294 0.09
295 0.08
296 0.08
297 0.09
298 0.1
299 0.13
300 0.12
301 0.13
302 0.13
303 0.15
304 0.15
305 0.14
306 0.13
307 0.1
308 0.11
309 0.1
310 0.09
311 0.07
312 0.07
313 0.08
314 0.08
315 0.1
316 0.11
317 0.12
318 0.13
319 0.13
320 0.14
321 0.13
322 0.12
323 0.13
324 0.11
325 0.1
326 0.08
327 0.08
328 0.07
329 0.09
330 0.09
331 0.15
332 0.18
333 0.21
334 0.24
335 0.24
336 0.26
337 0.27
338 0.27
339 0.22
340 0.22
341 0.2
342 0.18
343 0.18
344 0.16
345 0.14
346 0.14
347 0.11
348 0.08
349 0.09
350 0.11
351 0.13
352 0.14
353 0.18
354 0.19
355 0.2
356 0.2
357 0.19
358 0.18
359 0.16
360 0.15
361 0.12
362 0.1
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.07
367 0.08
368 0.09
369 0.1
370 0.15
371 0.2
372 0.29
373 0.33
374 0.41
375 0.49
376 0.54
377 0.57
378 0.55
379 0.56
380 0.54
381 0.52
382 0.49
383 0.43
384 0.39
385 0.38
386 0.42
387 0.35
388 0.29
389 0.26
390 0.21
391 0.19
392 0.17
393 0.15
394 0.16
395 0.18
396 0.28
397 0.33
398 0.36
399 0.38
400 0.41
401 0.43
402 0.42
403 0.48
404 0.46
405 0.43
406 0.45
407 0.46
408 0.48
409 0.52
410 0.54
411 0.51
412 0.44
413 0.46
414 0.43
415 0.4
416 0.37
417 0.35
418 0.3
419 0.27
420 0.27
421 0.23
422 0.22
423 0.22
424 0.21
425 0.17
426 0.14
427 0.14
428 0.13
429 0.13
430 0.14
431 0.18
432 0.18
433 0.18
434 0.2
435 0.26
436 0.29
437 0.31
438 0.3
439 0.24
440 0.23
441 0.26
442 0.25
443 0.19
444 0.17
445 0.17
446 0.18
447 0.22
448 0.22
449 0.18
450 0.19
451 0.18
452 0.18
453 0.23
454 0.29
455 0.3
456 0.36
457 0.41
458 0.46
459 0.53
460 0.6
461 0.64
462 0.67
463 0.73
464 0.76
465 0.83
466 0.88
467 0.85
468 0.86
469 0.84
470 0.83
471 0.83
472 0.82
473 0.8
474 0.78
475 0.77
476 0.74