Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2CGP9

Protein Details
Accession A0A1Y2CGP9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
489-546VRENKGVARNKKETKEEKKARKAMVKNAKKERREAKKATKKAFKKEHMKQEKIQKTKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
494-541GVARNKKETKEEKKARKAMVKNAKKERREAKKATKKAFKKEHMKQEKI
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MGKKPFIDKKTARHYEVVHRSQRDPLLADENASKFVLKQVAPSLNLLKKGKYELRPEDDEVGYVEEFSENEVNYDYESIDGDLSETDIFNVDSEEEKEPLKDAKGNLIEREAGVAALYGIDFDDTKYDYMQHLKVIGEDPTAVFIPSKEEAKKEAKKGGIQFLDESIDLNEKSNQKKKVTFQLPEEALPSKYEEEVGLMNREDSDILTANPYVREVLYSLDDPNAIDENMEDDFVLQLNAEPGSDEEEFDMEAAMYGYEDEDEDDDDDEWAAVRKFKKAQKSEKQDLYDFEDDEDERRTGLTGFSMSSSAMFRNKHLTLLDDRFERVINQYDDDNIGELDPEAPNVRGNIDDNDLPEHYDKLFDEFLDSKDVLGKKVIEKFAGGVPSEQIAELREELKTKEFDILKYEEEQSNKKEKVQMIERELSKNEKRERNNWDCETIITTYTNIYNHPKMIKDDSIKKIHVTRKGLPIVEKEVSEEEEEEEEYEVRENKGVARNKKETKEEKKARKAMVKNAKKERREAKKATKKAFKKEHMKQEKIQKTKEMQERTMKIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.67
3 0.71
4 0.71
5 0.68
6 0.65
7 0.63
8 0.64
9 0.63
10 0.55
11 0.47
12 0.41
13 0.39
14 0.35
15 0.35
16 0.34
17 0.31
18 0.3
19 0.28
20 0.24
21 0.17
22 0.22
23 0.26
24 0.21
25 0.23
26 0.29
27 0.34
28 0.35
29 0.38
30 0.41
31 0.39
32 0.47
33 0.45
34 0.39
35 0.37
36 0.43
37 0.48
38 0.48
39 0.54
40 0.55
41 0.61
42 0.64
43 0.64
44 0.62
45 0.53
46 0.46
47 0.38
48 0.31
49 0.24
50 0.18
51 0.15
52 0.1
53 0.1
54 0.12
55 0.13
56 0.1
57 0.11
58 0.12
59 0.12
60 0.12
61 0.13
62 0.1
63 0.08
64 0.09
65 0.09
66 0.08
67 0.08
68 0.07
69 0.07
70 0.08
71 0.07
72 0.07
73 0.06
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.08
78 0.07
79 0.09
80 0.12
81 0.14
82 0.14
83 0.15
84 0.15
85 0.16
86 0.18
87 0.19
88 0.2
89 0.19
90 0.27
91 0.33
92 0.35
93 0.35
94 0.34
95 0.33
96 0.28
97 0.29
98 0.2
99 0.13
100 0.1
101 0.09
102 0.06
103 0.06
104 0.05
105 0.03
106 0.03
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.06
111 0.07
112 0.08
113 0.09
114 0.1
115 0.12
116 0.17
117 0.18
118 0.17
119 0.18
120 0.18
121 0.19
122 0.19
123 0.18
124 0.14
125 0.13
126 0.12
127 0.12
128 0.12
129 0.1
130 0.09
131 0.08
132 0.11
133 0.13
134 0.17
135 0.17
136 0.18
137 0.23
138 0.33
139 0.39
140 0.4
141 0.45
142 0.44
143 0.48
144 0.51
145 0.54
146 0.47
147 0.41
148 0.37
149 0.32
150 0.3
151 0.24
152 0.2
153 0.13
154 0.13
155 0.12
156 0.12
157 0.16
158 0.19
159 0.27
160 0.33
161 0.39
162 0.41
163 0.47
164 0.51
165 0.57
166 0.6
167 0.57
168 0.55
169 0.57
170 0.53
171 0.48
172 0.45
173 0.36
174 0.28
175 0.25
176 0.22
177 0.14
178 0.13
179 0.12
180 0.1
181 0.1
182 0.11
183 0.12
184 0.12
185 0.11
186 0.11
187 0.1
188 0.1
189 0.09
190 0.08
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.07
201 0.08
202 0.07
203 0.08
204 0.09
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.09
210 0.1
211 0.1
212 0.08
213 0.07
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.07
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.04
250 0.04
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.04
257 0.05
258 0.05
259 0.08
260 0.09
261 0.12
262 0.19
263 0.23
264 0.32
265 0.4
266 0.5
267 0.57
268 0.65
269 0.7
270 0.7
271 0.69
272 0.61
273 0.55
274 0.51
275 0.42
276 0.33
277 0.25
278 0.2
279 0.17
280 0.17
281 0.17
282 0.1
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.07
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.07
293 0.06
294 0.07
295 0.07
296 0.08
297 0.11
298 0.12
299 0.12
300 0.18
301 0.18
302 0.19
303 0.19
304 0.2
305 0.22
306 0.25
307 0.27
308 0.22
309 0.22
310 0.21
311 0.21
312 0.19
313 0.15
314 0.18
315 0.16
316 0.16
317 0.16
318 0.16
319 0.17
320 0.16
321 0.14
322 0.08
323 0.07
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.05
328 0.06
329 0.06
330 0.07
331 0.07
332 0.08
333 0.08
334 0.08
335 0.09
336 0.11
337 0.12
338 0.13
339 0.13
340 0.15
341 0.14
342 0.15
343 0.14
344 0.13
345 0.11
346 0.12
347 0.11
348 0.12
349 0.13
350 0.11
351 0.14
352 0.14
353 0.15
354 0.17
355 0.17
356 0.14
357 0.18
358 0.19
359 0.16
360 0.17
361 0.18
362 0.19
363 0.25
364 0.26
365 0.22
366 0.22
367 0.22
368 0.23
369 0.24
370 0.2
371 0.14
372 0.13
373 0.13
374 0.13
375 0.12
376 0.09
377 0.08
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.1
382 0.11
383 0.12
384 0.16
385 0.16
386 0.15
387 0.21
388 0.21
389 0.22
390 0.25
391 0.26
392 0.24
393 0.26
394 0.28
395 0.25
396 0.27
397 0.3
398 0.31
399 0.37
400 0.37
401 0.37
402 0.4
403 0.4
404 0.45
405 0.5
406 0.52
407 0.49
408 0.55
409 0.55
410 0.53
411 0.52
412 0.51
413 0.47
414 0.48
415 0.5
416 0.52
417 0.55
418 0.6
419 0.68
420 0.7
421 0.74
422 0.68
423 0.63
424 0.55
425 0.5
426 0.45
427 0.36
428 0.29
429 0.2
430 0.17
431 0.15
432 0.16
433 0.16
434 0.16
435 0.21
436 0.22
437 0.25
438 0.27
439 0.29
440 0.31
441 0.36
442 0.4
443 0.42
444 0.48
445 0.52
446 0.56
447 0.55
448 0.54
449 0.57
450 0.56
451 0.57
452 0.55
453 0.54
454 0.56
455 0.61
456 0.6
457 0.56
458 0.53
459 0.51
460 0.46
461 0.4
462 0.33
463 0.29
464 0.28
465 0.25
466 0.22
467 0.17
468 0.16
469 0.16
470 0.14
471 0.13
472 0.12
473 0.11
474 0.13
475 0.14
476 0.13
477 0.15
478 0.14
479 0.19
480 0.28
481 0.36
482 0.42
483 0.49
484 0.58
485 0.65
486 0.72
487 0.76
488 0.78
489 0.8
490 0.83
491 0.84
492 0.85
493 0.87
494 0.88
495 0.87
496 0.86
497 0.83
498 0.82
499 0.83
500 0.82
501 0.81
502 0.84
503 0.85
504 0.8
505 0.82
506 0.82
507 0.82
508 0.82
509 0.82
510 0.83
511 0.84
512 0.89
513 0.9
514 0.9
515 0.88
516 0.88
517 0.89
518 0.88
519 0.88
520 0.88
521 0.89
522 0.89
523 0.88
524 0.85
525 0.85
526 0.85
527 0.83
528 0.78
529 0.76
530 0.72
531 0.75
532 0.76
533 0.74
534 0.71
535 0.73