FuNGI

A0A1Y2CY03

Protein Details

Accession

A0A1Y2CY03

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
170-192	STEVPQPEVKKVKKRRWDMTSAD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

plas 13, nucl 4, vacu 3, cyto 2, E.R. 2, golg 2, mito_nucl 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR021133 HEAT_type_2 IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like IPR034085 TOG
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50077 HEAT_REPEAT

Amino Acid Sequences

MDQDIDDEIKKLQKERQNAKASLVGSVSYDTDLYETEDKYAGYDTELKDEDEDEDEAQNEIARPKLRSFTAPTEILKEIQNQDDDVDPMAEMRPSRKIADREDEYHARRFNRIISPERVDAFSENNNTENARSYSDVMKEAELEREQQRIMKSIAEKKKKAENSGSATISTEVPQPEVKKVKKRRWDMTSADASEPVKTEKKSEWDEEVRPATKTKSRWDETPKPEETPRKRSRWDDTGSTPVSTSSAWDATPKVSSGSVAETPKRRSRWDETPVNVSASQFAATPVGNMGLVTPTPNQLAQPMTPMTPEAMNAMRWEKEIDYRNRPLSDEELDSMLPTTGYKILEPPANYAPIRTPARKLTATPTPMGAGGFMMMEENSQMYDIPPEIPGVGNLSFFKPEDMQHFGKLLENKDENSLSVDELKERKIMRLLLKIKNGTPPMRKAALRQITDKARDFGAGPLFNLILPLLMSPTLEDQERHLLVKVIDRILYKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDEDYYARVEGREIISNLSKAAGLATMISTMRPDIDHVDEYVRNTTARAFSVVASALGIPVLLPFLKAVCRSKKSWQACHTGIKIVQQIAILMGCAILPHLKSLVEAIAHGLEDEQQKVRTITALALAALAEAAAPYGIESFDIVLKPLWKGIEKHRGKGLAAFLKACGYIIPLMNAEAANYFTNQLMDTLIREFQSPDEEMKKIVLKVVKQCAATDGVTPEYIKTKILPSFFKHFWVRRMALDRRNYKQLVETTVELANKVGVSEILLRIVEDLKDESEPYRKMVMETIEKIVSMLGSSDIDDRLEEVLIDGILYAFQEQTIEDIVMLNGFGTVVNSLGIRVQAYLPQICSTILWRLNNKSAKVRQQAADLISRIAIVMKTCGEEKLMGHLGVVLYEYLGEEYPEVLGSILGALKAIVNVVGMSSMTPPIKDLLPRLTPILKNRHEKVQENCIDLVGRIADRGAEYVSPREWMRICFELIDLLKTHKKGIRRAAVNTFGYIAKAIGPQDVLATLLNNLKVQERQNRVCTTVAIAIVAETCSPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMGKDYIYAITPLLEDALMDRDLVHRQTACTTVKHAALGVYGLGCEDALVHLLNYIWPNIFEQSPHVINAVMEAIEGLRVGLGPATILQYVLQGLFHPARKVREIYWKIYNNLYIGSQDNLIPFYPRIEDDERNHYHRYELDLVL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.56
3	0.64
4	0.68
5	0.67
6	0.67
7	0.64
8	0.57
9	0.49
10	0.41
11	0.31
12	0.22
13	0.22
14	0.19
15	0.14
16	0.14
17	0.1
18	0.1
19	0.1
20	0.14
21	0.16
22	0.16
23	0.17
24	0.18
25	0.18
26	0.18
27	0.19
28	0.15
29	0.15
30	0.21
31	0.2
32	0.25
33	0.27
34	0.26
35	0.25
36	0.26
37	0.24
38	0.21
39	0.21
40	0.16
41	0.16
42	0.16
43	0.16
44	0.15
45	0.15
46	0.14
47	0.14
48	0.18
49	0.21
50	0.23
51	0.26
52	0.32
53	0.33
54	0.37
55	0.42
56	0.45
57	0.48
58	0.49
59	0.47
60	0.46
61	0.45
62	0.41
63	0.36
64	0.35
65	0.32
66	0.32
67	0.32
68	0.27
69	0.27
70	0.27
71	0.25
72	0.21
73	0.17
74	0.12
75	0.12
76	0.12
77	0.13
78	0.12
79	0.15
80	0.2
81	0.22
82	0.26
83	0.33
84	0.38
85	0.43
86	0.52
87	0.55
88	0.53
89	0.59
90	0.63
91	0.59
92	0.61
93	0.59
94	0.51
95	0.48
96	0.47
97	0.45
98	0.46
99	0.49
100	0.48
101	0.5
102	0.54
103	0.55
104	0.54
105	0.49
106	0.42
107	0.36
108	0.33
109	0.31
110	0.3
111	0.27
112	0.26
113	0.26
114	0.25
115	0.25
116	0.27
117	0.23
118	0.21
119	0.21
120	0.23
121	0.27
122	0.28
123	0.31
124	0.26
125	0.25
126	0.24
127	0.24
128	0.26
129	0.23
130	0.25
131	0.24
132	0.26
133	0.26
134	0.27
135	0.28
136	0.27
137	0.27
138	0.28
139	0.33
140	0.4
141	0.5
142	0.56
143	0.58
144	0.59
145	0.67
146	0.68
147	0.68
148	0.67
149	0.65
150	0.63
151	0.66
152	0.62
153	0.53
154	0.48
155	0.42
156	0.34
157	0.26
158	0.22
159	0.16
160	0.17
161	0.2
162	0.21
163	0.28
164	0.36
165	0.43
166	0.49
167	0.59
168	0.67
169	0.73
170	0.8
171	0.82
172	0.81
173	0.82
174	0.77
175	0.76
176	0.74
177	0.68
178	0.59
179	0.52
180	0.45
181	0.37
182	0.33
183	0.28
184	0.25
185	0.22
186	0.25
187	0.27
188	0.34
189	0.39
190	0.42
191	0.46
192	0.47
193	0.49
194	0.52
195	0.54
196	0.48
197	0.43
198	0.41
199	0.38
200	0.38
201	0.39
202	0.42
203	0.46
204	0.48
205	0.54
206	0.62
207	0.67
208	0.69
209	0.74
210	0.67
211	0.62
212	0.66
213	0.68
214	0.67
215	0.67
216	0.68
217	0.68
218	0.72
219	0.74
220	0.75
221	0.74
222	0.71
223	0.66
224	0.62
225	0.62
226	0.57
227	0.5
228	0.42
229	0.33
230	0.28
231	0.21
232	0.18
233	0.13
234	0.12
235	0.12
236	0.13
237	0.14
238	0.15
239	0.16
240	0.15
241	0.13
242	0.12
243	0.13
244	0.12
245	0.15
246	0.19
247	0.21
248	0.26
249	0.31
250	0.38
251	0.45
252	0.47
253	0.47
254	0.5
255	0.54
256	0.58
257	0.62
258	0.64
259	0.6
260	0.62
261	0.59
262	0.54
263	0.47
264	0.37
265	0.29
266	0.21
267	0.18
268	0.12
269	0.11
270	0.1
271	0.09
272	0.09
273	0.08
274	0.08
275	0.07
276	0.07
277	0.07
278	0.06
279	0.06
280	0.08
281	0.08
282	0.09
283	0.11
284	0.11
285	0.11
286	0.12
287	0.14
288	0.13
289	0.16
290	0.16
291	0.15
292	0.15
293	0.15
294	0.14
295	0.12
296	0.12
297	0.11
298	0.11
299	0.11
300	0.13
301	0.15
302	0.15
303	0.15
304	0.16
305	0.15
306	0.2
307	0.29
308	0.34
309	0.39
310	0.45
311	0.49
312	0.49
313	0.49
314	0.45
315	0.4
316	0.36
317	0.3
318	0.25
319	0.22
320	0.2
321	0.19
322	0.17
323	0.13
324	0.09
325	0.07
326	0.08
327	0.09
328	0.09
329	0.1
330	0.11
331	0.14
332	0.17
333	0.18
334	0.21
335	0.21
336	0.24
337	0.24
338	0.23
339	0.22
340	0.27
341	0.31
342	0.29
343	0.31
344	0.31
345	0.37
346	0.38
347	0.37
348	0.35
349	0.38
350	0.38
351	0.35
352	0.32
353	0.26
354	0.25
355	0.24
356	0.18
357	0.1
358	0.07
359	0.06
360	0.05
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.06
371	0.06
372	0.07
373	0.07
374	0.07
375	0.08
376	0.08
377	0.08
378	0.09
379	0.09
380	0.09
381	0.1
382	0.11
383	0.12
384	0.12
385	0.13
386	0.11
387	0.12
388	0.15
389	0.21
390	0.21
391	0.22
392	0.23
393	0.22
394	0.24
395	0.27
396	0.24
397	0.25
398	0.24
399	0.24
400	0.26
401	0.26
402	0.22
403	0.21
404	0.2
405	0.14
406	0.15
407	0.14
408	0.15
409	0.16
410	0.17
411	0.19
412	0.19
413	0.2
414	0.21
415	0.26
416	0.27
417	0.35
418	0.41
419	0.43
420	0.48
421	0.49
422	0.47
423	0.48
424	0.48
425	0.45
426	0.42
427	0.41
428	0.4
429	0.42
430	0.41
431	0.38
432	0.44
433	0.45
434	0.43
435	0.41
436	0.43
437	0.44
438	0.48
439	0.46
440	0.38
441	0.3
442	0.28
443	0.26
444	0.22
445	0.22
446	0.18
447	0.16
448	0.15
449	0.15
450	0.14
451	0.13
452	0.1
453	0.05
454	0.04
455	0.04
456	0.04
457	0.04
458	0.04
459	0.04
460	0.05
461	0.06
462	0.07
463	0.07
464	0.09
465	0.14
466	0.15
467	0.15
468	0.14
469	0.15
470	0.15
471	0.2
472	0.2
473	0.16
474	0.18
475	0.17
476	0.18
477	0.17
478	0.17
479	0.13
480	0.13
481	0.14
482	0.14
483	0.15
484	0.17
485	0.16
486	0.16
487	0.18
488	0.18
489	0.16
490	0.14
491	0.13
492	0.13
493	0.14
494	0.13
495	0.12
496	0.09
497	0.09
498	0.09
499	0.09
500	0.06
501	0.04
502	0.04
503	0.04
504	0.05
505	0.05
506	0.05
507	0.05
508	0.05
509	0.06
510	0.08
511	0.09
512	0.11
513	0.11
514	0.13
515	0.14
516	0.14
517	0.14
518	0.12
519	0.1
520	0.07
521	0.07
522	0.05
523	0.04
524	0.04
525	0.04
526	0.05
527	0.05
528	0.05
529	0.05
530	0.05
531	0.05
532	0.05
533	0.06
534	0.07
535	0.09
536	0.1
537	0.11
538	0.13
539	0.14
540	0.15
541	0.15
542	0.14
543	0.11
544	0.11
545	0.12
546	0.11
547	0.11
548	0.11
549	0.1
550	0.1
551	0.11
552	0.11
553	0.09
554	0.08
555	0.07
556	0.05
557	0.04
558	0.04
559	0.03
560	0.03
561	0.03
562	0.03
563	0.03
564	0.03
565	0.04
566	0.05
567	0.08
568	0.13
569	0.19
570	0.23
571	0.26
572	0.33
573	0.42
574	0.47
575	0.53
576	0.53
577	0.54
578	0.54
579	0.56
580	0.51
581	0.44
582	0.39
583	0.33
584	0.3
585	0.23
586	0.2
587	0.15
588	0.13
589	0.11
590	0.1
591	0.07
592	0.04
593	0.04
594	0.03
595	0.03
596	0.03
597	0.03
598	0.04
599	0.04
600	0.05
601	0.05
602	0.05
603	0.05
604	0.06
605	0.05
606	0.05
607	0.05
608	0.05
609	0.05
610	0.05
611	0.05
612	0.06
613	0.07
614	0.08
615	0.09
616	0.09
617	0.1
618	0.1
619	0.11
620	0.09
621	0.08
622	0.08
623	0.08
624	0.08
625	0.07
626	0.07
627	0.06
628	0.06
629	0.05
630	0.04
631	0.02
632	0.02
633	0.02
634	0.02
635	0.02
636	0.02
637	0.02
638	0.02
639	0.02
640	0.03
641	0.03
642	0.04
643	0.05
644	0.05
645	0.06
646	0.07
647	0.07
648	0.08
649	0.09
650	0.1
651	0.12
652	0.2
653	0.3
654	0.31
655	0.34
656	0.36
657	0.37
658	0.35
659	0.35
660	0.33
661	0.27
662	0.27
663	0.24
664	0.21
665	0.2
666	0.2
667	0.16
668	0.1
669	0.06
670	0.07
671	0.07
672	0.08
673	0.07
674	0.07
675	0.08
676	0.08
677	0.07
678	0.06
679	0.07
680	0.06
681	0.07
682	0.07
683	0.07
684	0.07
685	0.07
686	0.07
687	0.06
688	0.06
689	0.07
690	0.07
691	0.08
692	0.08
693	0.09
694	0.09
695	0.09
696	0.11
697	0.11
698	0.13
699	0.14
700	0.14
701	0.14
702	0.16
703	0.17
704	0.15
705	0.17
706	0.17
707	0.18
708	0.24
709	0.3
710	0.32
711	0.3
712	0.3
713	0.29
714	0.28
715	0.25
716	0.2
717	0.15
718	0.12
719	0.12
720	0.12
721	0.11
722	0.11
723	0.11
724	0.1
725	0.1
726	0.13
727	0.16
728	0.19
729	0.22
730	0.24
731	0.3
732	0.31
733	0.35
734	0.38
735	0.37
736	0.38
737	0.41
738	0.39
739	0.37
740	0.44
741	0.45
742	0.46
743	0.52
744	0.54
745	0.51
746	0.56
747	0.53
748	0.45
749	0.44
750	0.39
751	0.35
752	0.31
753	0.27
754	0.23
755	0.25
756	0.24
757	0.19
758	0.16
759	0.12
760	0.1
761	0.09
762	0.07
763	0.04
764	0.05
765	0.07
766	0.07
767	0.07
768	0.07
769	0.07
770	0.08
771	0.09
772	0.08
773	0.07
774	0.08
775	0.08
776	0.08
777	0.09
778	0.1
779	0.15
780	0.15
781	0.17
782	0.19
783	0.18
784	0.18
785	0.21
786	0.23
787	0.23
788	0.24
789	0.25
790	0.22
791	0.21
792	0.2
793	0.17
794	0.13
795	0.08
796	0.06
797	0.05
798	0.05
799	0.06
800	0.07
801	0.07
802	0.07
803	0.07
804	0.07
805	0.07
806	0.07
807	0.06
808	0.05
809	0.05
810	0.05
811	0.05
812	0.04
813	0.03
814	0.03
815	0.03
816	0.04
817	0.03
818	0.03
819	0.04
820	0.04
821	0.05
822	0.05
823	0.05
824	0.05
825	0.06
826	0.06
827	0.05
828	0.05
829	0.04
830	0.03
831	0.03
832	0.03
833	0.03
834	0.03
835	0.04
836	0.04
837	0.04
838	0.04
839	0.05
840	0.05
841	0.05
842	0.06
843	0.06
844	0.09
845	0.11
846	0.13
847	0.13
848	0.13
849	0.14
850	0.13
851	0.13
852	0.12
853	0.16
854	0.19
855	0.22
856	0.26
857	0.29
858	0.37
859	0.42
860	0.43
861	0.45
862	0.48
863	0.53
864	0.56
865	0.57
866	0.5
867	0.49
868	0.5
869	0.44
870	0.42
871	0.33
872	0.27
873	0.21
874	0.19
875	0.16
876	0.13
877	0.11
878	0.07
879	0.08
880	0.08
881	0.09
882	0.1
883	0.1
884	0.1
885	0.11
886	0.11
887	0.16
888	0.18
889	0.16
890	0.15
891	0.16
892	0.15
893	0.14
894	0.14
895	0.07
896	0.05
897	0.05
898	0.05
899	0.04
900	0.05
901	0.05
902	0.04
903	0.05
904	0.05
905	0.05
906	0.05
907	0.04
908	0.04
909	0.04
910	0.05
911	0.05
912	0.04
913	0.04
914	0.04
915	0.04
916	0.04
917	0.04
918	0.04
919	0.04
920	0.04
921	0.04
922	0.04
923	0.04
924	0.04
925	0.05
926	0.08
927	0.09
928	0.09
929	0.09
930	0.11
931	0.13
932	0.14
933	0.17
934	0.2
935	0.23
936	0.24
937	0.27
938	0.31
939	0.33
940	0.38
941	0.45
942	0.46
943	0.52
944	0.53
945	0.6
946	0.6
947	0.62
948	0.61
949	0.61
950	0.59
951	0.54
952	0.51
953	0.43
954	0.37
955	0.31
956	0.26
957	0.17
958	0.12
959	0.09
960	0.08
961	0.08
962	0.08
963	0.09
964	0.08
965	0.08
966	0.1
967	0.13
968	0.13
969	0.15
970	0.15
971	0.19
972	0.2
973	0.2
974	0.24
975	0.24
976	0.24
977	0.22
978	0.22
979	0.23
980	0.22
981	0.22
982	0.17
983	0.2
984	0.24
985	0.24
986	0.29
987	0.27
988	0.33
989	0.38
990	0.48
991	0.52
992	0.53
993	0.58
994	0.6
995	0.65
996	0.6
997	0.52
998	0.44
999	0.35
1000	0.3
1001	0.24
1002	0.17
1003	0.11
1004	0.12
1005	0.12
1006	0.11
1007	0.11
1008	0.1
1009	0.11
1010	0.1
1011	0.1
1012	0.08
1013	0.08
1014	0.09
1015	0.11
1016	0.12
1017	0.12
1018	0.13
1019	0.15
1020	0.19
1021	0.25
1022	0.32
1023	0.38
1024	0.44
1025	0.51
1026	0.53
1027	0.53
1028	0.5
1029	0.44
1030	0.38
1031	0.33
1032	0.27
1033	0.19
1034	0.17
1035	0.14
1036	0.13
1037	0.13
1038	0.09
1039	0.06
1040	0.06
1041	0.06
1042	0.07
1043	0.07
1044	0.07
1045	0.09
1046	0.1
1047	0.11
1048	0.12
1049	0.16
1050	0.16
1051	0.18
1052	0.18
1053	0.18
1054	0.19
1055	0.19
1056	0.19
1057	0.2
1058	0.23
1059	0.25
1060	0.26
1061	0.25
1062	0.28
1063	0.27
1064	0.26
1065	0.2
1066	0.17
1067	0.14
1068	0.14
1069	0.15
1070	0.11
1071	0.11
1072	0.11
1073	0.11
1074	0.13
1075	0.12
1076	0.12
1077	0.11
1078	0.11
1079	0.11
1080	0.1
1081	0.1
1082	0.09
1083	0.08
1084	0.07
1085	0.08
1086	0.08
1087	0.08
1088	0.08
1089	0.08
1090	0.08
1091	0.07
1092	0.06
1093	0.07
1094	0.1
1095	0.09
1096	0.09
1097	0.09
1098	0.11
1099	0.15
1100	0.17
1101	0.19
1102	0.17
1103	0.18
1104	0.21
1105	0.27
1106	0.28
1107	0.26
1108	0.29
1109	0.3
1110	0.3
1111	0.29
1112	0.27
1113	0.22
1114	0.19
1115	0.18
1116	0.14
1117	0.1
1118	0.08
1119	0.08
1120	0.07
1121	0.06
1122	0.05
1123	0.05
1124	0.04
1125	0.06
1126	0.06
1127	0.06
1128	0.06
1129	0.07
1130	0.1
1131	0.11
1132	0.12
1133	0.11
1134	0.11
1135	0.14
1136	0.16
1137	0.16
1138	0.15
1139	0.17
1140	0.22
1141	0.23
1142	0.23
1143	0.22
1144	0.2
1145	0.19
1146	0.2
1147	0.17
1148	0.1
1149	0.09
1150	0.08
1151	0.07
1152	0.07
1153	0.07
1154	0.05
1155	0.04
1156	0.04
1157	0.05
1158	0.05
1159	0.05
1160	0.05
1161	0.06
1162	0.08
1163	0.08
1164	0.09
1165	0.08
1166	0.09
1167	0.1
1168	0.1
1169	0.09
1170	0.08
1171	0.13
1172	0.18
1173	0.21
1174	0.26
1175	0.3
1176	0.34
1177	0.39
1178	0.42
1179	0.42
1180	0.48
1181	0.51
1182	0.52
1183	0.57
1184	0.59
1185	0.56
1186	0.58
1187	0.55
1188	0.45
1189	0.41
1190	0.36
1191	0.28
1192	0.24
1193	0.23
1194	0.19
1195	0.18
1196	0.18
1197	0.18
1198	0.17
1199	0.18
1200	0.16
1201	0.17
1202	0.19
1203	0.18
1204	0.24
1205	0.28
1206	0.35
1207	0.37
1208	0.46
1209	0.5
1210	0.52
1211	0.54
1212	0.48
1213	0.45
1214	0.41
1215	0.43

A0A1Y2CY03

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer