FuNGI

A0A1Y1YDW5

Protein Details

Accession

A0A1Y1YDW5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
142-172	MLKQSTRSKEKSEKSRKKIKKYEKIYLIRYS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
148-162	RSKEKSEKSRKKIKK

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015712 DNA-dir_RNA_pol_su2 IPR007120 DNA-dir_RNAP_su2_dom IPR037033 DNA-dir_RNAP_su2_hyb_sf IPR007645 RNA_pol_Rpb2_3 IPR007641 RNA_pol_Rpb2_7 IPR014724 RNA_pol_RPB2_OB-fold
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0032549 F:ribonucleoside binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04565 RNA_pol_Rpb2_3 PF00562 RNA_pol_Rpb2_6 PF04560 RNA_pol_Rpb2_7

Amino Acid Sequences

MSENNYLAKFINQYNVYANIDKLFIKKLYDIKVFLEKKLPNLNPLTISIPEVEYDHLMVEKKTYYISLIHDDYEIKIPAPIDGVFVVDGIEKVIISQEIFCTPFFVYKEDHVEYKECNEKGKFQSLEMFTDYSYIVYLKKIMLKQSTRSKEKSEKSRKKIKKYEKIYLIRYSSLLFIIFPRLRIKGIKSHERQSISLVYILHHLNPSLSLDEIKKIIVSVVIGENLPKDINIIIPDSFPEETLQSIIARRSESHNKILSMVDRMIDSYFTPDYLHCNESSSNDSSYDDKSTKFYTYLAMARSLFHNEGNVQYYNSRIDTFPYSLYRSIKYFTLENKKLPLDKFIRNLNIKLYGNVKSGKVRSYFREYEAISVQTLSKRSYYDKLSHLRRVQIPINTESDNSQLRMSYDYGYFCPFETPESKDVGFVKYFGLSVLMGPDFTIDEKILEPFLFNNSNSDENINDNSQSNTENKSNDNSKSNSEYGDDDYCDSDTSNSNSPNEKRKTLKTGKKYPVLLNTRFIGFTTTDLVDYTYKVLKLKYPYISCVFDNISYYLFTDEGRMFRPIRIKKNGKEIGIRLVEISENKININYQYEELDPNFIFGLISALSPFPGNNHVPRLTFQAGMTKQCMSNDSTIFKYNDNSRRLINAQRPFCMTKLEYILSRRLCHYKSLDFLLNKDNINMSELFSNLEFLDNSIEENSKENSENIKFDKNLTLNNNEFRNRLADLSNITIESDDTLLVTTGNTYHRFGGQNAIVAIMAYGNNQEDSLIFNDKSIKDGLFNNIKYRYQYLSYNIKREILVNINLNYKDGLPKPNTKIAYNPHNVNEPLFRIYDVISNKVTDVENIFRKPVIVDHCTRYIEDDVCYCCVKVRHLYQPQQGDKFASRYAQKGVIGSILLEEMMPRTKYGVIPDIIVNPHAFPSRMTVGHLIEMYVGKCMIMDPQRFGTYFDASIESEDLRSFESKFFESDIPILEEMVDPISGKSIGNAFVGVCYYTALQHQVQEKMFYRTTGNVNSISKQPTEGKSRNGGLRIGEMEKDALVAHGTNAIIQDMFKNNTDAIDIRYCEICHSVNTLSTCCNTPTTILNVSNSFNIMNSYLDSIGVRASIYE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.34
3	0.35
4	0.33
5	0.31
6	0.24
7	0.25
8	0.25
9	0.24
10	0.25
11	0.22
12	0.23
13	0.28
14	0.33
15	0.39
16	0.43
17	0.43
18	0.42
19	0.51
20	0.5
21	0.47
22	0.49
23	0.43
24	0.45
25	0.53
26	0.5
27	0.47
28	0.49
29	0.5
30	0.44
31	0.45
32	0.41
33	0.32
34	0.31
35	0.26
36	0.22
37	0.19
38	0.18
39	0.17
40	0.14
41	0.13
42	0.13
43	0.13
44	0.14
45	0.14
46	0.15
47	0.15
48	0.15
49	0.15
50	0.15
51	0.15
52	0.17
53	0.2
54	0.25
55	0.25
56	0.25
57	0.26
58	0.26
59	0.26
60	0.28
61	0.24
62	0.18
63	0.18
64	0.17
65	0.17
66	0.18
67	0.16
68	0.13
69	0.12
70	0.13
71	0.11
72	0.1
73	0.1
74	0.08
75	0.08
76	0.07
77	0.07
78	0.06
79	0.06
80	0.07
81	0.08
82	0.08
83	0.09
84	0.1
85	0.13
86	0.14
87	0.14
88	0.15
89	0.15
90	0.19
91	0.19
92	0.2
93	0.2
94	0.23
95	0.3
96	0.31
97	0.32
98	0.3
99	0.31
100	0.31
101	0.35
102	0.39
103	0.32
104	0.37
105	0.37
106	0.42
107	0.46
108	0.53
109	0.47
110	0.41
111	0.48
112	0.44
113	0.45
114	0.4
115	0.35
116	0.25
117	0.26
118	0.24
119	0.15
120	0.14
121	0.11
122	0.09
123	0.09
124	0.11
125	0.12
126	0.19
127	0.21
128	0.27
129	0.36
130	0.4
131	0.47
132	0.56
133	0.64
134	0.65
135	0.66
136	0.68
137	0.69
138	0.74
139	0.77
140	0.77
141	0.79
142	0.8
143	0.87
144	0.89
145	0.9
146	0.91
147	0.91
148	0.91
149	0.89
150	0.9
151	0.89
152	0.87
153	0.83
154	0.8
155	0.72
156	0.63
157	0.55
158	0.45
159	0.36
160	0.28
161	0.22
162	0.14
163	0.12
164	0.19
165	0.19
166	0.2
167	0.23
168	0.23
169	0.25
170	0.29
171	0.32
172	0.32
173	0.39
174	0.47
175	0.5
176	0.56
177	0.61
178	0.6
179	0.57
180	0.53
181	0.49
182	0.39
183	0.36
184	0.29
185	0.23
186	0.23
187	0.23
188	0.2
189	0.17
190	0.15
191	0.13
192	0.13
193	0.14
194	0.12
195	0.11
196	0.12
197	0.13
198	0.15
199	0.15
200	0.15
201	0.13
202	0.12
203	0.11
204	0.1
205	0.09
206	0.08
207	0.09
208	0.1
209	0.1
210	0.1
211	0.11
212	0.11
213	0.11
214	0.08
215	0.08
216	0.07
217	0.09
218	0.1
219	0.11
220	0.11
221	0.11
222	0.12
223	0.14
224	0.14
225	0.13
226	0.12
227	0.11
228	0.11
229	0.11
230	0.12
231	0.1
232	0.12
233	0.13
234	0.14
235	0.15
236	0.16
237	0.23
238	0.32
239	0.35
240	0.41
241	0.43
242	0.41
243	0.42
244	0.43
245	0.37
246	0.31
247	0.28
248	0.21
249	0.17
250	0.17
251	0.15
252	0.14
253	0.12
254	0.11
255	0.11
256	0.11
257	0.11
258	0.11
259	0.15
260	0.18
261	0.2
262	0.16
263	0.18
264	0.19
265	0.21
266	0.25
267	0.23
268	0.2
269	0.19
270	0.21
271	0.2
272	0.22
273	0.24
274	0.2
275	0.19
276	0.21
277	0.22
278	0.22
279	0.21
280	0.19
281	0.17
282	0.19
283	0.22
284	0.2
285	0.21
286	0.2
287	0.2
288	0.21
289	0.23
290	0.2
291	0.17
292	0.17
293	0.15
294	0.17
295	0.19
296	0.18
297	0.16
298	0.15
299	0.16
300	0.17
301	0.17
302	0.16
303	0.13
304	0.15
305	0.18
306	0.19
307	0.2
308	0.21
309	0.23
310	0.25
311	0.27
312	0.27
313	0.24
314	0.24
315	0.23
316	0.22
317	0.23
318	0.27
319	0.36
320	0.37
321	0.38
322	0.41
323	0.42
324	0.45
325	0.42
326	0.42
327	0.37
328	0.39
329	0.42
330	0.43
331	0.48
332	0.46
333	0.47
334	0.41
335	0.42
336	0.37
337	0.35
338	0.32
339	0.28
340	0.28
341	0.29
342	0.28
343	0.26
344	0.28
345	0.3
346	0.31
347	0.31
348	0.33
349	0.39
350	0.4
351	0.37
352	0.41
353	0.37
354	0.36
355	0.34
356	0.3
357	0.21
358	0.2
359	0.18
360	0.15
361	0.17
362	0.15
363	0.14
364	0.15
365	0.18
366	0.22
367	0.25
368	0.28
369	0.33
370	0.41
371	0.46
372	0.52
373	0.52
374	0.53
375	0.53
376	0.53
377	0.5
378	0.45
379	0.43
380	0.38
381	0.37
382	0.32
383	0.29
384	0.24
385	0.23
386	0.21
387	0.18
388	0.16
389	0.13
390	0.13
391	0.15
392	0.15
393	0.13
394	0.13
395	0.14
396	0.14
397	0.16
398	0.15
399	0.13
400	0.14
401	0.12
402	0.13
403	0.14
404	0.17
405	0.17
406	0.2
407	0.19
408	0.2
409	0.22
410	0.22
411	0.19
412	0.16
413	0.14
414	0.12
415	0.12
416	0.1
417	0.09
418	0.06
419	0.06
420	0.07
421	0.07
422	0.06
423	0.06
424	0.06
425	0.05
426	0.06
427	0.07
428	0.05
429	0.06
430	0.06
431	0.07
432	0.07
433	0.07
434	0.07
435	0.06
436	0.1
437	0.11
438	0.11
439	0.12
440	0.14
441	0.15
442	0.15
443	0.16
444	0.13
445	0.13
446	0.15
447	0.14
448	0.12
449	0.12
450	0.12
451	0.12
452	0.13
453	0.13
454	0.14
455	0.16
456	0.17
457	0.17
458	0.21
459	0.25
460	0.27
461	0.3
462	0.28
463	0.29
464	0.31
465	0.31
466	0.27
467	0.24
468	0.22
469	0.2
470	0.2
471	0.17
472	0.13
473	0.13
474	0.13
475	0.12
476	0.1
477	0.09
478	0.09
479	0.11
480	0.14
481	0.15
482	0.16
483	0.21
484	0.24
485	0.33
486	0.34
487	0.37
488	0.38
489	0.41
490	0.49
491	0.54
492	0.6
493	0.6
494	0.67
495	0.69
496	0.71
497	0.7
498	0.63
499	0.62
500	0.61
501	0.53
502	0.45
503	0.39
504	0.34
505	0.3
506	0.27
507	0.19
508	0.12
509	0.11
510	0.11
511	0.1
512	0.09
513	0.1
514	0.11
515	0.09
516	0.09
517	0.1
518	0.09
519	0.1
520	0.1
521	0.11
522	0.13
523	0.17
524	0.22
525	0.26
526	0.25
527	0.28
528	0.3
529	0.32
530	0.28
531	0.27
532	0.23
533	0.17
534	0.18
535	0.15
536	0.12
537	0.1
538	0.1
539	0.08
540	0.08
541	0.07
542	0.08
543	0.09
544	0.09
545	0.1
546	0.13
547	0.13
548	0.15
549	0.23
550	0.27
551	0.34
552	0.43
553	0.49
554	0.5
555	0.6
556	0.62
557	0.56
558	0.54
559	0.47
560	0.45
561	0.38
562	0.35
563	0.24
564	0.2
565	0.18
566	0.14
567	0.16
568	0.1
569	0.1
570	0.1
571	0.1
572	0.1
573	0.1
574	0.13
575	0.11
576	0.1
577	0.11
578	0.12
579	0.13
580	0.13
581	0.14
582	0.11
583	0.11
584	0.1
585	0.09
586	0.08
587	0.06
588	0.07
589	0.04
590	0.05
591	0.05
592	0.04
593	0.05
594	0.05
595	0.05
596	0.05
597	0.09
598	0.11
599	0.12
600	0.16
601	0.17
602	0.18
603	0.19
604	0.24
605	0.22
606	0.21
607	0.19
608	0.23
609	0.23
610	0.24
611	0.25
612	0.2
613	0.19
614	0.19
615	0.2
616	0.14
617	0.16
618	0.17
619	0.17
620	0.18
621	0.21
622	0.22
623	0.21
624	0.22
625	0.26
626	0.32
627	0.33
628	0.33
629	0.3
630	0.32
631	0.34
632	0.38
633	0.38
634	0.38
635	0.38
636	0.38
637	0.41
638	0.39
639	0.36
640	0.34
641	0.26
642	0.21
643	0.22
644	0.22
645	0.21
646	0.21
647	0.27
648	0.25
649	0.26
650	0.26
651	0.28
652	0.28
653	0.3
654	0.32
655	0.28
656	0.29
657	0.31
658	0.34
659	0.29
660	0.3
661	0.3
662	0.29
663	0.26
664	0.24
665	0.21
666	0.16
667	0.17
668	0.16
669	0.12
670	0.1
671	0.1
672	0.1
673	0.09
674	0.1
675	0.08
676	0.08
677	0.07
678	0.07
679	0.08
680	0.07
681	0.08
682	0.08
683	0.08
684	0.08
685	0.1
686	0.11
687	0.11
688	0.12
689	0.13
690	0.17
691	0.19
692	0.22
693	0.22
694	0.26
695	0.24
696	0.25
697	0.3
698	0.26
699	0.3
700	0.3
701	0.33
702	0.32
703	0.36
704	0.39
705	0.34
706	0.33
707	0.29
708	0.28
709	0.23
710	0.21
711	0.17
712	0.15
713	0.15
714	0.17
715	0.16
716	0.14
717	0.13
718	0.11
719	0.1
720	0.09
721	0.08
722	0.05
723	0.05
724	0.05
725	0.05
726	0.05
727	0.05
728	0.04
729	0.06
730	0.09
731	0.11
732	0.12
733	0.13
734	0.16
735	0.18
736	0.18
737	0.22
738	0.2
739	0.2
740	0.19
741	0.18
742	0.15
743	0.13
744	0.12
745	0.07
746	0.06
747	0.04
748	0.05
749	0.05
750	0.05
751	0.05
752	0.06
753	0.05
754	0.07
755	0.09
756	0.12
757	0.12
758	0.13
759	0.18
760	0.18
761	0.19
762	0.19
763	0.16
764	0.15
765	0.17
766	0.23
767	0.26
768	0.28
769	0.31
770	0.33
771	0.34
772	0.34
773	0.35
774	0.32
775	0.26
776	0.28
777	0.3
778	0.37
779	0.4
780	0.43
781	0.42
782	0.4
783	0.38
784	0.36
785	0.34
786	0.28
787	0.28
788	0.27
789	0.27
790	0.3
791	0.3
792	0.29
793	0.26
794	0.21
795	0.22
796	0.21
797	0.25
798	0.25
799	0.33
800	0.37
801	0.44
802	0.45
803	0.41
804	0.44
805	0.45
806	0.5
807	0.48
808	0.47
809	0.42
810	0.45
811	0.44
812	0.4
813	0.36
814	0.29
815	0.25
816	0.22
817	0.2
818	0.15
819	0.16
820	0.19
821	0.18
822	0.19
823	0.18
824	0.18
825	0.18
826	0.19
827	0.19
828	0.14
829	0.16
830	0.19
831	0.24
832	0.25
833	0.25
834	0.23
835	0.23
836	0.23
837	0.24
838	0.24
839	0.24
840	0.27
841	0.3
842	0.35
843	0.35
844	0.35
845	0.34
846	0.31
847	0.27
848	0.24
849	0.23
850	0.21
851	0.22
852	0.22
853	0.19
854	0.19
855	0.19
856	0.22
857	0.26
858	0.31
859	0.39
860	0.47
861	0.56
862	0.59
863	0.67
864	0.7
865	0.66
866	0.6
867	0.54
868	0.48
869	0.42
870	0.37
871	0.32
872	0.28
873	0.27
874	0.3
875	0.3
876	0.28
877	0.26
878	0.25
879	0.21
880	0.19
881	0.16
882	0.13
883	0.09
884	0.07
885	0.06
886	0.06
887	0.06
888	0.1
889	0.11
890	0.1
891	0.12
892	0.14
893	0.16
894	0.2
895	0.24
896	0.2
897	0.22
898	0.23
899	0.25
900	0.24
901	0.24
902	0.2
903	0.15
904	0.17
905	0.16
906	0.15
907	0.12
908	0.17
909	0.2
910	0.2
911	0.22
912	0.23
913	0.23
914	0.25
915	0.24
916	0.19
917	0.16
918	0.17
919	0.15
920	0.12
921	0.11
922	0.08
923	0.08
924	0.08
925	0.13
926	0.19
927	0.21
928	0.24
929	0.28
930	0.31
931	0.31
932	0.34
933	0.31
934	0.26
935	0.24
936	0.22
937	0.21
938	0.18
939	0.19
940	0.18
941	0.15
942	0.13
943	0.12
944	0.12
945	0.11
946	0.13
947	0.13
948	0.14
949	0.17
950	0.18
951	0.19
952	0.21
953	0.2
954	0.21
955	0.21
956	0.21
957	0.21
958	0.19
959	0.18
960	0.15
961	0.14
962	0.13
963	0.12
964	0.1
965	0.07
966	0.07
967	0.09
968	0.09
969	0.09
970	0.1
971	0.11
972	0.13
973	0.13
974	0.13
975	0.11
976	0.11
977	0.12
978	0.11
979	0.09
980	0.08
981	0.08
982	0.09
983	0.1
984	0.14
985	0.14
986	0.19
987	0.23
988	0.28
989	0.29
990	0.34
991	0.35
992	0.38
993	0.38
994	0.35
995	0.33
996	0.32
997	0.36
998	0.35
999	0.35
1000	0.34
1001	0.36
1002	0.37
1003	0.39
1004	0.38
1005	0.33
1006	0.32
1007	0.36
1008	0.36
1009	0.44
1010	0.46
1011	0.47
1012	0.51
1013	0.56
1014	0.57
1015	0.54
1016	0.5
1017	0.42
1018	0.41
1019	0.39
1020	0.34
1021	0.29
1022	0.24
1023	0.22
1024	0.19
1025	0.18
1026	0.14
1027	0.1
1028	0.09
1029	0.09
1030	0.08
1031	0.1
1032	0.1
1033	0.11
1034	0.11
1035	0.11
1036	0.1
1037	0.1
1038	0.14
1039	0.16
1040	0.19
1041	0.2
1042	0.21
1043	0.21
1044	0.21
1045	0.23
1046	0.2
1047	0.2
1048	0.24
1049	0.24
1050	0.24
1051	0.26
1052	0.26
1053	0.25
1054	0.27
1055	0.24
1056	0.19
1057	0.22
1058	0.22
1059	0.24
1060	0.26
1061	0.26
1062	0.25
1063	0.26
1064	0.27
1065	0.25
1066	0.25
1067	0.21
1068	0.21
1069	0.23
1070	0.26
1071	0.3
1072	0.3
1073	0.32
1074	0.32
1075	0.33
1076	0.32
1077	0.3
1078	0.24
1079	0.18
1080	0.18
1081	0.15
1082	0.14
1083	0.13
1084	0.15
1085	0.14
1086	0.15
1087	0.14
1088	0.13
1089	0.12
1090	0.11

A0A1Y1YDW5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer