Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2F4L1

Protein Details
Accession A0A1Y2F4L1    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-36IRNINEKLVIRKSKSKRRKVTARINLKKGTLHydrophilic
52-99LDKYCNYCYQNKKTKLYRCAGCRSSYYCSKECQKKAYKYHKSECKFIKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-28RKSKSKRRKVTAR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 11.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001214  SET_dom  
IPR046341  SET_dom_sf  
IPR002893  Znf_MYND  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00856  SET  
PF01753  zf-MYND  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50280  SET  
PS01360  ZF_MYND_1  
PS50865  ZF_MYND_2  
CDD cd20071  SET_SMYD  
Amino Acid Sequences MDYTTIRNINEKLVIRKSKSKRRKVTARINLKKGTLLMTENALASNIEKEYLDKYCNYCYQNKKTKLYRCAGCRSSYYCSKECQKKAYKYHKSECKFIKEHPQSAINHCRLMNQILLKINEDSKIEQTFNELIDHKQEYLDNNKGEISDDMKEYASAEKFFSGYQGSLDSFIDKIIKVNCNVLGIFDGYLNYYASGLFLQFSNINHDCNPNCTIYFRGNTVYLKALRDIKQDEEITINYCSVYDTCRMRQTYLKNIYYFTCECPRCIEYKDQLYLDPSEGIKCQTEGCDGYISHVEFNACPKCGKKLSPEIEENVKSIINKIDHLPESMSIEEQEFLLKDMLREQRTYFHPKNYYIYQNLENQRHLQSLQKPPYSNSNVKDDSVSEFYGRRATVDYELYQYCTMMDTAKDETSFISTSTSISHPSSYKTILMAELLNNALTEILEYQEVHQMEMNDFMAYAQQKLEAIHYREVRQQLESELLLTFDDRSEVYTYTQDLFERFRLYLLM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.55
3 0.64
4 0.7
5 0.74
6 0.8
7 0.84
8 0.85
9 0.87
10 0.92
11 0.92
12 0.93
13 0.93
14 0.94
15 0.92
16 0.9
17 0.84
18 0.75
19 0.67
20 0.57
21 0.5
22 0.42
23 0.34
24 0.28
25 0.25
26 0.25
27 0.22
28 0.21
29 0.17
30 0.14
31 0.12
32 0.13
33 0.11
34 0.1
35 0.1
36 0.11
37 0.15
38 0.18
39 0.2
40 0.21
41 0.24
42 0.29
43 0.35
44 0.38
45 0.44
46 0.5
47 0.58
48 0.65
49 0.71
50 0.74
51 0.77
52 0.82
53 0.83
54 0.83
55 0.8
56 0.77
57 0.78
58 0.73
59 0.67
60 0.62
61 0.57
62 0.55
63 0.56
64 0.55
65 0.47
66 0.5
67 0.56
68 0.61
69 0.62
70 0.65
71 0.67
72 0.7
73 0.78
74 0.83
75 0.84
76 0.84
77 0.88
78 0.88
79 0.82
80 0.82
81 0.79
82 0.77
83 0.69
84 0.64
85 0.66
86 0.63
87 0.64
88 0.59
89 0.58
90 0.51
91 0.56
92 0.61
93 0.52
94 0.48
95 0.44
96 0.41
97 0.37
98 0.36
99 0.32
100 0.25
101 0.27
102 0.28
103 0.28
104 0.28
105 0.27
106 0.26
107 0.24
108 0.24
109 0.21
110 0.2
111 0.22
112 0.21
113 0.19
114 0.22
115 0.21
116 0.2
117 0.21
118 0.19
119 0.16
120 0.2
121 0.22
122 0.18
123 0.17
124 0.18
125 0.19
126 0.24
127 0.3
128 0.26
129 0.25
130 0.25
131 0.24
132 0.24
133 0.22
134 0.18
135 0.14
136 0.14
137 0.14
138 0.14
139 0.13
140 0.13
141 0.16
142 0.15
143 0.14
144 0.13
145 0.13
146 0.13
147 0.13
148 0.14
149 0.11
150 0.09
151 0.09
152 0.1
153 0.1
154 0.11
155 0.11
156 0.1
157 0.09
158 0.09
159 0.1
160 0.08
161 0.11
162 0.14
163 0.16
164 0.16
165 0.19
166 0.19
167 0.19
168 0.19
169 0.17
170 0.13
171 0.11
172 0.1
173 0.08
174 0.08
175 0.06
176 0.07
177 0.07
178 0.06
179 0.06
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.06
187 0.07
188 0.08
189 0.15
190 0.15
191 0.16
192 0.17
193 0.21
194 0.2
195 0.22
196 0.23
197 0.17
198 0.17
199 0.17
200 0.18
201 0.18
202 0.19
203 0.17
204 0.16
205 0.18
206 0.18
207 0.18
208 0.19
209 0.18
210 0.17
211 0.18
212 0.22
213 0.22
214 0.26
215 0.26
216 0.24
217 0.27
218 0.27
219 0.25
220 0.21
221 0.19
222 0.17
223 0.16
224 0.14
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.07
229 0.08
230 0.1
231 0.13
232 0.15
233 0.21
234 0.22
235 0.23
236 0.28
237 0.31
238 0.36
239 0.42
240 0.43
241 0.38
242 0.38
243 0.37
244 0.37
245 0.34
246 0.27
247 0.27
248 0.24
249 0.24
250 0.26
251 0.27
252 0.25
253 0.26
254 0.28
255 0.25
256 0.3
257 0.32
258 0.29
259 0.28
260 0.27
261 0.26
262 0.21
263 0.18
264 0.13
265 0.11
266 0.11
267 0.12
268 0.1
269 0.1
270 0.09
271 0.08
272 0.1
273 0.1
274 0.11
275 0.12
276 0.11
277 0.13
278 0.15
279 0.14
280 0.12
281 0.12
282 0.12
283 0.1
284 0.15
285 0.16
286 0.14
287 0.14
288 0.15
289 0.2
290 0.23
291 0.26
292 0.27
293 0.35
294 0.4
295 0.45
296 0.47
297 0.44
298 0.47
299 0.45
300 0.39
301 0.3
302 0.25
303 0.19
304 0.18
305 0.19
306 0.14
307 0.14
308 0.15
309 0.2
310 0.19
311 0.21
312 0.2
313 0.16
314 0.18
315 0.17
316 0.15
317 0.11
318 0.1
319 0.1
320 0.09
321 0.09
322 0.06
323 0.07
324 0.09
325 0.08
326 0.08
327 0.14
328 0.21
329 0.22
330 0.23
331 0.23
332 0.28
333 0.33
334 0.43
335 0.4
336 0.41
337 0.44
338 0.46
339 0.5
340 0.49
341 0.49
342 0.43
343 0.43
344 0.38
345 0.42
346 0.47
347 0.45
348 0.42
349 0.39
350 0.38
351 0.36
352 0.33
353 0.31
354 0.33
355 0.39
356 0.46
357 0.47
358 0.47
359 0.47
360 0.55
361 0.56
362 0.54
363 0.47
364 0.47
365 0.44
366 0.44
367 0.43
368 0.35
369 0.32
370 0.28
371 0.26
372 0.19
373 0.18
374 0.19
375 0.22
376 0.2
377 0.17
378 0.16
379 0.17
380 0.19
381 0.21
382 0.22
383 0.22
384 0.22
385 0.24
386 0.22
387 0.19
388 0.16
389 0.14
390 0.13
391 0.1
392 0.1
393 0.1
394 0.13
395 0.15
396 0.15
397 0.14
398 0.15
399 0.16
400 0.16
401 0.14
402 0.13
403 0.12
404 0.12
405 0.15
406 0.15
407 0.15
408 0.16
409 0.19
410 0.18
411 0.21
412 0.24
413 0.24
414 0.23
415 0.21
416 0.21
417 0.19
418 0.19
419 0.17
420 0.14
421 0.14
422 0.14
423 0.13
424 0.11
425 0.1
426 0.09
427 0.07
428 0.07
429 0.06
430 0.06
431 0.07
432 0.08
433 0.09
434 0.15
435 0.16
436 0.16
437 0.17
438 0.18
439 0.17
440 0.2
441 0.19
442 0.13
443 0.13
444 0.12
445 0.14
446 0.14
447 0.14
448 0.12
449 0.12
450 0.13
451 0.14
452 0.2
453 0.24
454 0.27
455 0.34
456 0.38
457 0.4
458 0.45
459 0.5
460 0.46
461 0.41
462 0.38
463 0.33
464 0.32
465 0.29
466 0.24
467 0.19
468 0.17
469 0.15
470 0.14
471 0.12
472 0.08
473 0.09
474 0.08
475 0.11
476 0.13
477 0.14
478 0.15
479 0.17
480 0.19
481 0.2
482 0.22
483 0.21
484 0.21
485 0.24
486 0.25
487 0.26
488 0.24