FuNGI

A0A1Y2CTK6

Protein Details

Accession

A0A1Y2CTK6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1211-1232	EEKNTRKTEKKSSYSINKNTFS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039745 Vps54 IPR012501 Vps54_C IPR019515 VPS54_N
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0000938 C:GARP complex GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
Pfam	View protein in Pfam PF07928 Vps54 PF10475 Vps54_N

Amino Acid Sequences

MDLFLSIAQEEKEWTINDIGRNSISEIHNNPNDPNKLLNSQKQINYDTPVIPSTTIRKVKKIEFQKYTKSIADEYETSTDNIHKRNEIEHENSLAKGKSKETTTEGIEDDVTDQLKSIIPDIFFEKDFNLENPIIFDQVCENINITSDIVTDMSANNILQEKFFFTALSSLKTLYNEIDDCVEQIQNLKGQLKDVSKCETQKGLEVVCMKRKRVNLENLYNGIRLLSEVRQTQPTIQILLGQNDYIGALGLIEETNNAMKGYNYQPPKPNINDNSNNERTNTNIINSPTNLRSPISILSSNTLANSNYSTPLDLRGVKGLKNINGQLMEMSKAIEMMMQNEFVQVLMEDISNVDQYKPDSSLNMFEPKKETSIESLTSNTDDKSLTIFKTLIKNKIDVIPDTKDLIVNEEILYTKLSPLIFGLIRTNKFLNAFALFKNEIHNKLIDIIKQKFSSLYEIPLPIASKLKSENLTEENMALNKIKNLSFQEYYDLLENYYLFILSLLRRTTIIKCLINDIIEQAEKKNITIGMINEENSTIMSNNQNNSMYMSTDRNTRESDYKSDNRLMYDYNRIKKEFMTLINQVYDIYYHDSSKLLTTRAEKNSQLSSINFHRLYNINTEFFIACENLTKRSFLTLKSNLLSQAKNYISAFHGKKIRQIVNDIETDQWIPAEITENNQDIVNKITHKEWGSIVELKTNESISSLSSSQNSSSEKVNKTNNKRPVNRALYIDKKKYIIAACTLSFINALSEYITCAEVIPILTIDVINSIYSLLQIFNSKVCQIIIGGGAVTSGGLKYIAAKHLALASRSLGAVKALIPYIRNFLQSKLMPKQLILLNDLDRYAKDYDNHQTEIYDKLISIMNGKLESHCKSFQAMDWEQPEIPTKPNVYMLLMVKDLTSLYRLLSKIIPIEILQKIMKEVLTSYTSRLEKELETVEIYSSNAKNRLLIDFQYYIQKLSLLDGVDGPGNKLEVVVNNMTIKEKKPTLEQKTIINEYIRQSFDSGSRRSSIYDENSSSGHSFTNSPLITGKNEDNIIGSEKLSSSPLINERGMDNTIGSEKLSNSPLIIERNMDNTIGSEKFSLDNLSQDELSLDSNNEIISVHNENNGQINNGNEYNNSSLNQSISLNTDEEEHSIHSANPYITENLDIHRSNSNSHEMATSALNYSGLGVNDYLNKRHNSAPDSNYGFAPEYKGGDTMGSSIYDRKNSYTEEKNTRKTEKKSSYSINKNTFSKFSQNVKKFGSEIKKHYSSSNNSMESLFGLDKMVSKSNSSKSLLSNSEILDNHNNSNE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.22
3	0.25
4	0.29
5	0.29
6	0.3
7	0.27
8	0.28
9	0.27
10	0.29
11	0.27
12	0.3
13	0.32
14	0.38
15	0.42
16	0.42
17	0.44
18	0.46
19	0.47
20	0.43
21	0.43
22	0.39
23	0.42
24	0.47
25	0.52
26	0.51
27	0.56
28	0.59
29	0.6
30	0.6
31	0.56
32	0.54
33	0.5
34	0.43
35	0.38
36	0.34
37	0.3
38	0.26
39	0.26
40	0.26
41	0.32
42	0.4
43	0.4
44	0.46
45	0.52
46	0.58
47	0.65
48	0.7
49	0.7
50	0.71
51	0.75
52	0.78
53	0.76
54	0.74
55	0.68
56	0.6
57	0.52
58	0.46
59	0.44
60	0.35
61	0.34
62	0.32
63	0.3
64	0.27
65	0.26
66	0.29
67	0.28
68	0.32
69	0.31
70	0.32
71	0.32
72	0.37
73	0.43
74	0.44
75	0.45
76	0.44
77	0.45
78	0.43
79	0.42
80	0.41
81	0.36
82	0.33
83	0.3
84	0.29
85	0.3
86	0.31
87	0.35
88	0.35
89	0.38
90	0.37
91	0.38
92	0.36
93	0.31
94	0.29
95	0.24
96	0.21
97	0.18
98	0.15
99	0.11
100	0.11
101	0.11
102	0.13
103	0.13
104	0.14
105	0.15
106	0.14
107	0.16
108	0.2
109	0.22
110	0.2
111	0.21
112	0.19
113	0.19
114	0.2
115	0.19
116	0.21
117	0.19
118	0.18
119	0.21
120	0.21
121	0.2
122	0.17
123	0.17
124	0.13
125	0.16
126	0.16
127	0.13
128	0.13
129	0.12
130	0.13
131	0.14
132	0.12
133	0.1
134	0.09
135	0.1
136	0.09
137	0.09
138	0.08
139	0.07
140	0.09
141	0.1
142	0.09
143	0.1
144	0.14
145	0.14
146	0.14
147	0.15
148	0.16
149	0.16
150	0.17
151	0.15
152	0.12
153	0.18
154	0.19
155	0.21
156	0.19
157	0.19
158	0.21
159	0.21
160	0.22
161	0.17
162	0.2
163	0.17
164	0.17
165	0.19
166	0.17
167	0.17
168	0.17
169	0.16
170	0.12
171	0.14
172	0.15
173	0.15
174	0.18
175	0.21
176	0.2
177	0.22
178	0.28
179	0.31
180	0.33
181	0.34
182	0.36
183	0.38
184	0.4
185	0.42
186	0.41
187	0.37
188	0.38
189	0.38
190	0.33
191	0.32
192	0.35
193	0.36
194	0.41
195	0.45
196	0.42
197	0.44
198	0.48
199	0.52
200	0.55
201	0.6
202	0.6
203	0.63
204	0.67
205	0.65
206	0.63
207	0.55
208	0.45
209	0.35
210	0.25
211	0.18
212	0.15
213	0.13
214	0.16
215	0.18
216	0.21
217	0.24
218	0.25
219	0.27
220	0.3
221	0.29
222	0.26
223	0.23
224	0.27
225	0.26
226	0.28
227	0.26
228	0.19
229	0.18
230	0.16
231	0.16
232	0.1
233	0.07
234	0.04
235	0.03
236	0.03
237	0.04
238	0.04
239	0.04
240	0.04
241	0.05
242	0.06
243	0.07
244	0.07
245	0.07
246	0.07
247	0.12
248	0.16
249	0.22
250	0.26
251	0.31
252	0.38
253	0.43
254	0.51
255	0.51
256	0.56
257	0.55
258	0.6
259	0.63
260	0.63
261	0.67
262	0.65
263	0.62
264	0.54
265	0.48
266	0.41
267	0.38
268	0.33
269	0.25
270	0.25
271	0.26
272	0.28
273	0.29
274	0.31
275	0.27
276	0.27
277	0.27
278	0.22
279	0.21
280	0.19
281	0.2
282	0.2
283	0.21
284	0.2
285	0.2
286	0.21
287	0.2
288	0.19
289	0.18
290	0.14
291	0.13
292	0.14
293	0.13
294	0.14
295	0.14
296	0.15
297	0.13
298	0.16
299	0.19
300	0.18
301	0.18
302	0.22
303	0.23
304	0.23
305	0.28
306	0.29
307	0.3
308	0.34
309	0.34
310	0.31
311	0.29
312	0.28
313	0.25
314	0.21
315	0.19
316	0.14
317	0.13
318	0.09
319	0.09
320	0.08
321	0.09
322	0.08
323	0.09
324	0.1
325	0.1
326	0.1
327	0.1
328	0.1
329	0.08
330	0.08
331	0.06
332	0.05
333	0.05
334	0.05
335	0.05
336	0.05
337	0.06
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.08
342	0.09
343	0.11
344	0.13
345	0.13
346	0.13
347	0.14
348	0.18
349	0.19
350	0.27
351	0.25
352	0.25
353	0.28
354	0.27
355	0.28
356	0.26
357	0.24
358	0.19
359	0.23
360	0.23
361	0.21
362	0.21
363	0.2
364	0.21
365	0.2
366	0.16
367	0.14
368	0.12
369	0.11
370	0.13
371	0.15
372	0.13
373	0.14
374	0.15
375	0.17
376	0.26
377	0.31
378	0.34
379	0.33
380	0.34
381	0.34
382	0.39
383	0.38
384	0.31
385	0.31
386	0.27
387	0.26
388	0.27
389	0.25
390	0.21
391	0.19
392	0.2
393	0.16
394	0.14
395	0.12
396	0.12
397	0.12
398	0.11
399	0.12
400	0.08
401	0.08
402	0.09
403	0.09
404	0.09
405	0.09
406	0.11
407	0.11
408	0.11
409	0.17
410	0.19
411	0.21
412	0.23
413	0.23
414	0.22
415	0.22
416	0.22
417	0.19
418	0.16
419	0.17
420	0.15
421	0.19
422	0.18
423	0.17
424	0.22
425	0.23
426	0.23
427	0.23
428	0.23
429	0.19
430	0.22
431	0.24
432	0.22
433	0.25
434	0.26
435	0.29
436	0.29
437	0.29
438	0.26
439	0.25
440	0.27
441	0.21
442	0.21
443	0.18
444	0.18
445	0.19
446	0.18
447	0.18
448	0.14
449	0.16
450	0.13
451	0.13
452	0.14
453	0.18
454	0.19
455	0.19
456	0.22
457	0.21
458	0.23
459	0.22
460	0.2
461	0.18
462	0.15
463	0.15
464	0.13
465	0.11
466	0.1
467	0.12
468	0.12
469	0.14
470	0.17
471	0.21
472	0.22
473	0.22
474	0.24
475	0.22
476	0.23
477	0.21
478	0.18
479	0.13
480	0.12
481	0.12
482	0.08
483	0.08
484	0.07
485	0.05
486	0.05
487	0.06
488	0.06
489	0.1
490	0.09
491	0.1
492	0.11
493	0.13
494	0.15
495	0.19
496	0.24
497	0.22
498	0.23
499	0.25
500	0.26
501	0.24
502	0.22
503	0.18
504	0.13
505	0.12
506	0.12
507	0.1
508	0.12
509	0.12
510	0.11
511	0.13
512	0.11
513	0.11
514	0.13
515	0.13
516	0.14
517	0.15
518	0.15
519	0.13
520	0.13
521	0.12
522	0.1
523	0.1
524	0.06
525	0.07
526	0.1
527	0.13
528	0.13
529	0.16
530	0.16
531	0.16
532	0.18
533	0.17
534	0.13
535	0.13
536	0.14
537	0.13
538	0.18
539	0.19
540	0.19
541	0.2
542	0.22
543	0.25
544	0.26
545	0.29
546	0.31
547	0.34
548	0.36
549	0.39
550	0.38
551	0.33
552	0.32
553	0.29
554	0.24
555	0.3
556	0.32
557	0.34
558	0.36
559	0.36
560	0.36
561	0.34
562	0.36
563	0.29
564	0.26
565	0.24
566	0.24
567	0.24
568	0.24
569	0.23
570	0.19
571	0.15
572	0.13
573	0.09
574	0.11
575	0.1
576	0.1
577	0.1
578	0.11
579	0.11
580	0.13
581	0.13
582	0.1
583	0.12
584	0.16
585	0.23
586	0.27
587	0.3
588	0.28
589	0.3
590	0.3
591	0.29
592	0.27
593	0.2
594	0.2
595	0.2
596	0.25
597	0.23
598	0.21
599	0.22
600	0.22
601	0.23
602	0.25
603	0.24
604	0.19
605	0.18
606	0.19
607	0.17
608	0.15
609	0.15
610	0.09
611	0.06
612	0.1
613	0.1
614	0.13
615	0.13
616	0.14
617	0.13
618	0.17
619	0.18
620	0.16
621	0.23
622	0.23
623	0.26
624	0.26
625	0.26
626	0.25
627	0.26
628	0.24
629	0.17
630	0.2
631	0.17
632	0.19
633	0.18
634	0.17
635	0.15
636	0.22
637	0.23
638	0.21
639	0.27
640	0.25
641	0.29
642	0.35
643	0.38
644	0.32
645	0.34
646	0.32
647	0.3
648	0.3
649	0.27
650	0.2
651	0.17
652	0.16
653	0.13
654	0.09
655	0.06
656	0.05
657	0.05
658	0.07
659	0.07
660	0.08
661	0.11
662	0.11
663	0.12
664	0.12
665	0.12
666	0.1
667	0.12
668	0.12
669	0.1
670	0.11
671	0.11
672	0.14
673	0.15
674	0.16
675	0.15
676	0.15
677	0.18
678	0.2
679	0.2
680	0.2
681	0.19
682	0.19
683	0.19
684	0.16
685	0.13
686	0.1
687	0.1
688	0.07
689	0.09
690	0.09
691	0.09
692	0.1
693	0.11
694	0.11
695	0.14
696	0.14
697	0.13
698	0.17
699	0.23
700	0.24
701	0.29
702	0.36
703	0.42
704	0.49
705	0.57
706	0.62
707	0.65
708	0.67
709	0.69
710	0.71
711	0.69
712	0.62
713	0.58
714	0.54
715	0.55
716	0.57
717	0.54
718	0.46
719	0.4
720	0.38
721	0.37
722	0.32
723	0.24
724	0.2
725	0.2
726	0.18
727	0.19
728	0.18
729	0.15
730	0.13
731	0.12
732	0.09
733	0.06
734	0.06
735	0.05
736	0.05
737	0.05
738	0.06
739	0.06
740	0.06
741	0.06
742	0.05
743	0.05
744	0.05
745	0.05
746	0.04
747	0.04
748	0.04
749	0.04
750	0.04
751	0.04
752	0.04
753	0.04
754	0.04
755	0.04
756	0.04
757	0.04
758	0.05
759	0.04
760	0.05
761	0.06
762	0.07
763	0.08
764	0.09
765	0.09
766	0.09
767	0.09
768	0.08
769	0.07
770	0.08
771	0.07
772	0.06
773	0.06
774	0.05
775	0.05
776	0.04
777	0.04
778	0.03
779	0.02
780	0.02
781	0.03
782	0.03
783	0.05
784	0.07
785	0.09
786	0.1
787	0.1
788	0.1
789	0.14
790	0.16
791	0.14
792	0.13
793	0.12
794	0.12
795	0.12
796	0.12
797	0.08
798	0.07
799	0.07
800	0.07
801	0.07
802	0.07
803	0.08
804	0.08
805	0.09
806	0.13
807	0.13
808	0.16
809	0.16
810	0.17
811	0.23
812	0.24
813	0.3
814	0.31
815	0.34
816	0.31
817	0.3
818	0.34
819	0.3
820	0.29
821	0.25
822	0.22
823	0.19
824	0.2
825	0.2
826	0.16
827	0.13
828	0.14
829	0.15
830	0.14
831	0.14
832	0.17
833	0.25
834	0.28
835	0.3
836	0.27
837	0.25
838	0.24
839	0.26
840	0.23
841	0.15
842	0.11
843	0.11
844	0.12
845	0.12
846	0.13
847	0.11
848	0.11
849	0.12
850	0.12
851	0.13
852	0.16
853	0.19
854	0.21
855	0.21
856	0.2
857	0.21
858	0.22
859	0.23
860	0.27
861	0.25
862	0.25
863	0.26
864	0.27
865	0.25
866	0.25
867	0.26
868	0.19
869	0.2
870	0.18
871	0.18
872	0.17
873	0.2
874	0.2
875	0.17
876	0.2
877	0.19
878	0.19
879	0.18
880	0.17
881	0.14
882	0.13
883	0.12
884	0.09
885	0.08
886	0.06
887	0.07
888	0.11
889	0.11
890	0.13
891	0.14
892	0.15
893	0.15
894	0.15
895	0.15
896	0.11
897	0.17
898	0.15
899	0.17
900	0.17
901	0.15
902	0.15
903	0.16
904	0.15
905	0.11
906	0.11
907	0.11
908	0.14
909	0.14
910	0.15
911	0.21
912	0.22
913	0.22
914	0.23
915	0.21
916	0.19
917	0.21
918	0.21
919	0.15
920	0.16
921	0.15
922	0.15
923	0.13
924	0.13
925	0.15
926	0.14
927	0.17
928	0.19
929	0.19
930	0.2
931	0.21
932	0.24
933	0.22
934	0.22
935	0.23
936	0.21
937	0.22
938	0.27
939	0.26
940	0.23
941	0.21
942	0.21
943	0.16
944	0.16
945	0.18
946	0.11
947	0.11
948	0.11
949	0.12
950	0.12
951	0.12
952	0.11
953	0.09
954	0.09
955	0.08
956	0.08
957	0.08
958	0.08
959	0.12
960	0.13
961	0.14
962	0.15
963	0.15
964	0.18
965	0.19
966	0.19
967	0.21
968	0.23
969	0.23
970	0.31
971	0.41
972	0.46
973	0.53
974	0.54
975	0.54
976	0.59
977	0.6
978	0.54
979	0.45
980	0.4
981	0.35
982	0.38
983	0.32
984	0.26
985	0.24
986	0.23
987	0.27
988	0.31
989	0.29
990	0.26
991	0.27
992	0.27
993	0.28
994	0.29
995	0.29
996	0.28
997	0.32
998	0.32
999	0.31
1000	0.31
1001	0.31
1002	0.29
1003	0.23
1004	0.18
1005	0.13
1006	0.13
1007	0.12
1008	0.2
1009	0.18
1010	0.18
1011	0.19
1012	0.21
1013	0.21
1014	0.24
1015	0.24
1016	0.2
1017	0.21
1018	0.2
1019	0.19
1020	0.19
1021	0.21
1022	0.17
1023	0.16
1024	0.13
1025	0.13
1026	0.14
1027	0.14
1028	0.13
1029	0.1
1030	0.14
1031	0.18
1032	0.22
1033	0.22
1034	0.22
1035	0.22
1036	0.24
1037	0.24
1038	0.2
1039	0.15
1040	0.13
1041	0.14
1042	0.13
1043	0.12
1044	0.11
1045	0.12
1046	0.15
1047	0.16
1048	0.15
1049	0.14
1050	0.16
1051	0.19
1052	0.21
1053	0.2
1054	0.19
1055	0.19
1056	0.22
1057	0.23
1058	0.2
1059	0.17
1060	0.15
1061	0.18
1062	0.16
1063	0.16
1064	0.13
1065	0.13
1066	0.14
1067	0.14
1068	0.16
1069	0.13
1070	0.16
1071	0.17
1072	0.19
1073	0.18
1074	0.17
1075	0.16
1076	0.14
1077	0.15
1078	0.13
1079	0.11
1080	0.09
1081	0.09
1082	0.09
1083	0.09
1084	0.08
1085	0.07
1086	0.11
1087	0.14
1088	0.14
1089	0.17
1090	0.18
1091	0.19
1092	0.23
1093	0.23
1094	0.2
1095	0.18
1096	0.19
1097	0.2
1098	0.21
1099	0.21
1100	0.17
1101	0.2
1102	0.22
1103	0.22
1104	0.21
1105	0.18
1106	0.18
1107	0.18
1108	0.19
1109	0.16
1110	0.14
1111	0.15
1112	0.17
1113	0.16
1114	0.15
1115	0.16
1116	0.15
1117	0.15
1118	0.15
1119	0.14
1120	0.14
1121	0.14
1122	0.14
1123	0.13
1124	0.16
1125	0.15
1126	0.16
1127	0.18
1128	0.17
1129	0.17
1130	0.19
1131	0.18
1132	0.17
1133	0.23
1134	0.21
1135	0.21
1136	0.26
1137	0.26
1138	0.26
1139	0.29
1140	0.34
1141	0.28
1142	0.28
1143	0.27
1144	0.21
1145	0.22
1146	0.21
1147	0.18
1148	0.13
1149	0.13
1150	0.12
1151	0.11
1152	0.12
1153	0.13
1154	0.11
1155	0.11
1156	0.11
1157	0.12
1158	0.19
1159	0.22
1160	0.24
1161	0.27
1162	0.29
1163	0.31
1164	0.36
1165	0.41
1166	0.4
1167	0.46
1168	0.47
1169	0.5
1170	0.53
1171	0.51
1172	0.46
1173	0.42
1174	0.37
1175	0.3
1176	0.3
1177	0.23
1178	0.2
1179	0.2
1180	0.2
1181	0.18
1182	0.17
1183	0.16
1184	0.14
1185	0.13
1186	0.12
1187	0.12
1188	0.17
1189	0.21
1190	0.25
1191	0.26
1192	0.28
1193	0.3
1194	0.34
1195	0.4
1196	0.44
1197	0.49
1198	0.55
1199	0.62
1200	0.68
1201	0.73
1202	0.77
1203	0.79
1204	0.77
1205	0.79
1206	0.79
1207	0.77
1208	0.76
1209	0.78
1210	0.8
1211	0.81
1212	0.83
1213	0.81
1214	0.78
1215	0.76
1216	0.72
1217	0.66
1218	0.6
1219	0.58
1220	0.56
1221	0.57
1222	0.61
1223	0.62
1224	0.65
1225	0.64
1226	0.62
1227	0.56
1228	0.58
1229	0.58
1230	0.56
1231	0.57
1232	0.6
1233	0.62
1234	0.6
1235	0.64
1236	0.64
1237	0.61
1238	0.61
1239	0.63
1240	0.56
1241	0.51
1242	0.5
1243	0.44
1244	0.36
1245	0.32
1246	0.23
1247	0.15
1248	0.14
1249	0.13
1250	0.16
1251	0.19
1252	0.24
1253	0.22
1254	0.25
1255	0.32
1256	0.37
1257	0.44
1258	0.44
1259	0.44
1260	0.42
1261	0.49
1262	0.48
1263	0.44
1264	0.42
1265	0.36
1266	0.39
1267	0.36
1268	0.36
1269	0.36
1270	0.36

A0A1Y2CTK6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer