FuNGI

A0A1Y1ZR47

Protein Details

Accession

A0A1Y1ZR47

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
37-60	YYTFLSKDCRRKLTKMKRHVLLDI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015712 DNA-dir_RNA_pol_su2 IPR007645 RNA_pol_Rpb2_3
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0032549 F:ribonucleoside binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04565 RNA_pol_Rpb2_3

Amino Acid Sequences

MFTDYKYIEYVRKVLNKGKDEKSIKNFSNEHTKFDFYYTFLSKDCRRKLTKMKRHVLLDIRFYYSLFFQLLRVKGIKSHEKQSISLVYVLRYLKPEFSLSEIKQIIIENVIGKNIPENIEIMISDSSPETTLESILSHRKESKEEIISIINGMIDSYLTPDSLHCDRSSYDDINTKFYTYLCMARVFLDFNSSKSYFSNRIDCFPCSIHRKIKYFGMDRKNKKLDTSSFVSNLNLTLYNMVKSGTIRSYFCEYSSIAVQTLSKRSYYDKLSHIRRVQIPINTESENLELRLSYQYGYFCPFETPESKDVGLVKYFGLSVLIAPDFTMDLSYLSSVLYDSPHYNDFKENKQSDKREYPVLLNSRFISFTTCNLAEFTYRDLKLRYPFISCIFDEVAYYLFTDEGRIVRPLRVRKGNIVFGIRFIDVAEYISNSDFEYEELDPNFIFGLISALSPFPGNNHVSRLTFQAGMTKQCMSNDSTIFNFNDNSRKLINAQKPFCMTKLEAILSR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.58
3	0.61
4	0.66
5	0.66
6	0.69
7	0.67
8	0.72
9	0.73
10	0.73
11	0.68
12	0.68
13	0.65
14	0.59
15	0.64
16	0.56
17	0.53
18	0.48
19	0.48
20	0.4
21	0.41
22	0.37
23	0.28
24	0.33
25	0.3
26	0.28
27	0.26
28	0.32
29	0.36
30	0.45
31	0.51
32	0.54
33	0.57
34	0.64
35	0.74
36	0.79
37	0.82
38	0.83
39	0.84
40	0.83
41	0.81
42	0.79
43	0.77
44	0.72
45	0.69
46	0.61
47	0.56
48	0.48
49	0.44
50	0.38
51	0.29
52	0.25
53	0.18
54	0.15
55	0.14
56	0.2
57	0.22
58	0.24
59	0.25
60	0.23
61	0.27
62	0.34
63	0.41
64	0.39
65	0.45
66	0.49
67	0.5
68	0.5
69	0.51
70	0.48
71	0.4
72	0.4
73	0.33
74	0.26
75	0.29
76	0.29
77	0.25
78	0.24
79	0.23
80	0.21
81	0.22
82	0.23
83	0.19
84	0.23
85	0.29
86	0.27
87	0.34
88	0.32
89	0.3
90	0.3
91	0.29
92	0.25
93	0.18
94	0.18
95	0.12
96	0.12
97	0.13
98	0.11
99	0.11
100	0.12
101	0.13
102	0.14
103	0.12
104	0.12
105	0.12
106	0.12
107	0.12
108	0.12
109	0.1
110	0.08
111	0.09
112	0.08
113	0.08
114	0.08
115	0.09
116	0.07
117	0.07
118	0.08
119	0.08
120	0.08
121	0.11
122	0.17
123	0.18
124	0.2
125	0.24
126	0.25
127	0.28
128	0.32
129	0.37
130	0.34
131	0.34
132	0.34
133	0.31
134	0.29
135	0.26
136	0.22
137	0.14
138	0.09
139	0.08
140	0.06
141	0.04
142	0.04
143	0.06
144	0.06
145	0.06
146	0.06
147	0.07
148	0.11
149	0.13
150	0.15
151	0.13
152	0.14
153	0.15
154	0.21
155	0.25
156	0.22
157	0.23
158	0.27
159	0.28
160	0.32
161	0.32
162	0.27
163	0.23
164	0.21
165	0.22
166	0.17
167	0.2
168	0.16
169	0.17
170	0.17
171	0.17
172	0.18
173	0.16
174	0.14
175	0.16
176	0.15
177	0.15
178	0.2
179	0.2
180	0.19
181	0.19
182	0.23
183	0.23
184	0.26
185	0.33
186	0.28
187	0.33
188	0.35
189	0.35
190	0.33
191	0.29
192	0.32
193	0.3
194	0.34
195	0.37
196	0.41
197	0.43
198	0.43
199	0.47
200	0.48
201	0.49
202	0.52
203	0.55
204	0.58
205	0.6
206	0.68
207	0.68
208	0.61
209	0.56
210	0.54
211	0.48
212	0.44
213	0.42
214	0.36
215	0.31
216	0.31
217	0.29
218	0.23
219	0.19
220	0.15
221	0.11
222	0.08
223	0.08
224	0.08
225	0.08
226	0.08
227	0.08
228	0.08
229	0.08
230	0.1
231	0.1
232	0.12
233	0.12
234	0.14
235	0.18
236	0.18
237	0.18
238	0.17
239	0.15
240	0.15
241	0.16
242	0.14
243	0.09
244	0.09
245	0.1
246	0.1
247	0.14
248	0.13
249	0.12
250	0.12
251	0.15
252	0.19
253	0.21
254	0.24
255	0.27
256	0.34
257	0.4
258	0.46
259	0.46
260	0.47
261	0.46
262	0.47
263	0.44
264	0.39
265	0.37
266	0.32
267	0.33
268	0.28
269	0.26
270	0.22
271	0.19
272	0.16
273	0.13
274	0.11
275	0.08
276	0.08
277	0.09
278	0.09
279	0.08
280	0.09
281	0.09
282	0.1
283	0.13
284	0.12
285	0.12
286	0.12
287	0.13
288	0.14
289	0.16
290	0.18
291	0.17
292	0.19
293	0.19
294	0.19
295	0.2
296	0.2
297	0.17
298	0.14
299	0.12
300	0.1
301	0.1
302	0.09
303	0.07
304	0.06
305	0.05
306	0.06
307	0.06
308	0.06
309	0.05
310	0.06
311	0.05
312	0.05
313	0.05
314	0.04
315	0.04
316	0.05
317	0.05
318	0.05
319	0.04
320	0.05
321	0.04
322	0.05
323	0.05
324	0.07
325	0.08
326	0.1
327	0.14
328	0.15
329	0.16
330	0.22
331	0.25
332	0.29
333	0.38
334	0.38
335	0.43
336	0.51
337	0.55
338	0.56
339	0.6
340	0.57
341	0.53
342	0.52
343	0.47
344	0.47
345	0.49
346	0.42
347	0.37
348	0.35
349	0.31
350	0.3
351	0.27
352	0.24
353	0.18
354	0.18
355	0.22
356	0.21
357	0.2
358	0.2
359	0.21
360	0.17
361	0.17
362	0.19
363	0.2
364	0.21
365	0.22
366	0.23
367	0.27
368	0.3
369	0.35
370	0.32
371	0.29
372	0.31
373	0.33
374	0.36
375	0.31
376	0.3
377	0.26
378	0.24
379	0.21
380	0.19
381	0.15
382	0.11
383	0.11
384	0.08
385	0.07
386	0.07
387	0.07
388	0.08
389	0.08
390	0.1
391	0.13
392	0.14
393	0.19
394	0.26
395	0.33
396	0.4
397	0.48
398	0.49
399	0.55
400	0.61
401	0.62
402	0.6
403	0.58
404	0.49
405	0.42
406	0.42
407	0.33
408	0.26
409	0.2
410	0.17
411	0.11
412	0.12
413	0.11
414	0.08
415	0.1
416	0.1
417	0.1
418	0.09
419	0.1
420	0.09
421	0.08
422	0.11
423	0.12
424	0.15
425	0.15
426	0.16
427	0.15
428	0.15
429	0.15
430	0.11
431	0.09
432	0.06
433	0.07
434	0.06
435	0.07
436	0.07
437	0.07
438	0.08
439	0.08
440	0.08
441	0.08
442	0.14
443	0.17
444	0.18
445	0.22
446	0.25
447	0.27
448	0.28
449	0.31
450	0.28
451	0.27
452	0.25
453	0.29
454	0.28
455	0.31
456	0.31
457	0.3
458	0.29
459	0.29
460	0.31
461	0.26
462	0.3
463	0.28
464	0.28
465	0.27
466	0.3
467	0.29
468	0.29
469	0.28
470	0.25
471	0.32
472	0.3
473	0.33
474	0.3
475	0.31
476	0.33
477	0.41
478	0.47
479	0.48
480	0.51
481	0.53
482	0.57
483	0.58
484	0.55
485	0.51
486	0.44
487	0.4
488	0.43

A0A1Y1ZR47

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer