Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H0ECI4

Protein Details
Accession H0ECI4    Localization Confidence Low Confidence Score 7.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
175-194GAVRKEKKTEYRQYMNRVGGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cysk 15, nucl 8, cyto 4, mito_nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MIAEMTEEDIEVGRPDEMIDAVEVVSVEGAEMIGNGEMRAEAVVEMTTGIAMDLEIERERNMEERRDAERELKREDREKSRSLIPDELPTKSRTATPPVSFKVGAPQAQAQDHDRMEVDLSRKSKEKPVEIPVADEEDDDEIVIEDDGMADMQAMMGFGGFSTTQNKKILGNNIGAVRKEKKTEYRQYMNRVGGFNRPLSPTRDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.08
3 0.08
4 0.08
5 0.08
6 0.07
7 0.07
8 0.07
9 0.07
10 0.07
11 0.06
12 0.05
13 0.04
14 0.04
15 0.03
16 0.03
17 0.03
18 0.03
19 0.04
20 0.04
21 0.05
22 0.04
23 0.05
24 0.05
25 0.05
26 0.05
27 0.05
28 0.04
29 0.04
30 0.05
31 0.04
32 0.05
33 0.04
34 0.04
35 0.04
36 0.04
37 0.03
38 0.03
39 0.04
40 0.04
41 0.06
42 0.06
43 0.07
44 0.07
45 0.08
46 0.09
47 0.14
48 0.16
49 0.18
50 0.21
51 0.24
52 0.28
53 0.31
54 0.32
55 0.34
56 0.37
57 0.37
58 0.41
59 0.43
60 0.43
61 0.46
62 0.51
63 0.51
64 0.52
65 0.5
66 0.47
67 0.47
68 0.48
69 0.45
70 0.43
71 0.35
72 0.36
73 0.35
74 0.34
75 0.3
76 0.27
77 0.24
78 0.2
79 0.22
80 0.17
81 0.21
82 0.25
83 0.26
84 0.29
85 0.3
86 0.32
87 0.29
88 0.27
89 0.27
90 0.24
91 0.22
92 0.18
93 0.19
94 0.18
95 0.18
96 0.2
97 0.16
98 0.17
99 0.16
100 0.15
101 0.14
102 0.12
103 0.12
104 0.14
105 0.13
106 0.14
107 0.15
108 0.17
109 0.19
110 0.21
111 0.27
112 0.29
113 0.33
114 0.34
115 0.39
116 0.44
117 0.42
118 0.42
119 0.37
120 0.34
121 0.29
122 0.23
123 0.18
124 0.11
125 0.1
126 0.08
127 0.07
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.04
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.02
146 0.04
147 0.04
148 0.05
149 0.11
150 0.14
151 0.18
152 0.21
153 0.22
154 0.24
155 0.3
156 0.37
157 0.34
158 0.35
159 0.34
160 0.38
161 0.4
162 0.38
163 0.38
164 0.35
165 0.35
166 0.37
167 0.4
168 0.44
169 0.51
170 0.6
171 0.65
172 0.7
173 0.74
174 0.78
175 0.8
176 0.77
177 0.71
178 0.63
179 0.55
180 0.52
181 0.49
182 0.43
183 0.39
184 0.37
185 0.36