Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2CMY9

Protein Details
Accession A0A1Y2CMY9    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
284-311ETCDPPSFKNSRKKGKRKRSIEPEYEKDBasic
397-422LENGVVRKPRTKKRNTNKDQTPTAQTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
293-302NSRKKGKRKR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011665  BRF1_TBP-bd_dom  
IPR013763  Cyclin-like_dom  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR000812  TFIIB  
IPR013150  TFIIB_cyclin  
Gene Ontology GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0070897  P:transcription preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF07741  BRF1  
PF00382  TFIIB  
CDD cd20553  CYCLIN_TFIIIB90_rpt1  
cd20554  CYCLIN_TFIIIB90_rpt2  
Amino Acid Sequences MSTNNCIHNLVEDEAMGHRVCTKCGQIMEENIIVSEVSFSEKSNGAAVADGFFISSGKARASIPNRFGGRNSMNTLESREQVIANGRRRIQQIANALNMTERHMEAAQRYYNLAVLNDFNKGRKTVNVASACLYIVCRMEKTSHLLIDFSDVLQTNVYLLGATFLKLVQKLHLELPLVDPALYIARFASKLDFGDKSQVVIRDALRLVSRMNRDWIQTGRRPAGICAACLLIAARMHDFHRTQREIISVVKICNSTLRKRLDEFRNTPSSELTIEDFQNIWLEETCDPPSFKNSRKKGKRKRSIEPEYEKDYEDEELKKEINDILKGDEIKELTKKIDMDELLADDNNLEVLDNDEEIKDVILNEEEVEFKTRVWTNENKDWIEAQEAKRRQAIMDLENGVVRKPRTKKRNTNKDQTPTAQTPAEAAKKLLTQTKISKKINYAAIDHLFEDSLNLKTEN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.2
3 0.16
4 0.12
5 0.16
6 0.17
7 0.19
8 0.22
9 0.24
10 0.27
11 0.29
12 0.34
13 0.32
14 0.36
15 0.39
16 0.36
17 0.33
18 0.27
19 0.25
20 0.2
21 0.16
22 0.12
23 0.07
24 0.1
25 0.1
26 0.11
27 0.14
28 0.15
29 0.16
30 0.17
31 0.17
32 0.13
33 0.14
34 0.14
35 0.12
36 0.11
37 0.1
38 0.08
39 0.07
40 0.07
41 0.07
42 0.08
43 0.09
44 0.09
45 0.11
46 0.12
47 0.21
48 0.27
49 0.35
50 0.37
51 0.44
52 0.46
53 0.46
54 0.46
55 0.46
56 0.44
57 0.41
58 0.41
59 0.36
60 0.35
61 0.35
62 0.39
63 0.34
64 0.3
65 0.27
66 0.24
67 0.21
68 0.21
69 0.29
70 0.31
71 0.36
72 0.41
73 0.41
74 0.45
75 0.47
76 0.5
77 0.44
78 0.43
79 0.44
80 0.43
81 0.44
82 0.39
83 0.36
84 0.33
85 0.3
86 0.26
87 0.19
88 0.15
89 0.14
90 0.15
91 0.16
92 0.17
93 0.22
94 0.21
95 0.2
96 0.21
97 0.19
98 0.2
99 0.19
100 0.17
101 0.13
102 0.13
103 0.13
104 0.17
105 0.17
106 0.17
107 0.18
108 0.2
109 0.2
110 0.2
111 0.26
112 0.27
113 0.35
114 0.36
115 0.35
116 0.35
117 0.34
118 0.32
119 0.25
120 0.2
121 0.13
122 0.12
123 0.12
124 0.1
125 0.11
126 0.13
127 0.14
128 0.2
129 0.22
130 0.21
131 0.21
132 0.2
133 0.19
134 0.21
135 0.19
136 0.13
137 0.12
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.1
142 0.07
143 0.06
144 0.06
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.05
149 0.06
150 0.05
151 0.06
152 0.07
153 0.09
154 0.09
155 0.1
156 0.12
157 0.13
158 0.15
159 0.17
160 0.16
161 0.15
162 0.17
163 0.16
164 0.15
165 0.13
166 0.11
167 0.09
168 0.1
169 0.09
170 0.07
171 0.06
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.09
176 0.08
177 0.09
178 0.12
179 0.13
180 0.12
181 0.18
182 0.17
183 0.17
184 0.18
185 0.19
186 0.17
187 0.19
188 0.18
189 0.16
190 0.16
191 0.16
192 0.14
193 0.13
194 0.13
195 0.16
196 0.18
197 0.16
198 0.19
199 0.2
200 0.2
201 0.23
202 0.25
203 0.26
204 0.27
205 0.3
206 0.29
207 0.3
208 0.29
209 0.27
210 0.31
211 0.25
212 0.21
213 0.18
214 0.16
215 0.13
216 0.13
217 0.13
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.08
224 0.11
225 0.12
226 0.15
227 0.23
228 0.24
229 0.24
230 0.24
231 0.25
232 0.23
233 0.23
234 0.24
235 0.18
236 0.16
237 0.18
238 0.17
239 0.15
240 0.2
241 0.23
242 0.22
243 0.28
244 0.32
245 0.32
246 0.35
247 0.44
248 0.46
249 0.51
250 0.51
251 0.51
252 0.52
253 0.51
254 0.48
255 0.4
256 0.33
257 0.24
258 0.21
259 0.17
260 0.13
261 0.12
262 0.13
263 0.12
264 0.11
265 0.12
266 0.11
267 0.09
268 0.07
269 0.09
270 0.09
271 0.11
272 0.14
273 0.14
274 0.14
275 0.14
276 0.21
277 0.24
278 0.32
279 0.4
280 0.46
281 0.56
282 0.66
283 0.77
284 0.81
285 0.88
286 0.9
287 0.88
288 0.9
289 0.9
290 0.89
291 0.88
292 0.85
293 0.79
294 0.75
295 0.69
296 0.59
297 0.48
298 0.4
299 0.31
300 0.26
301 0.21
302 0.16
303 0.17
304 0.16
305 0.16
306 0.16
307 0.17
308 0.17
309 0.17
310 0.16
311 0.17
312 0.19
313 0.2
314 0.19
315 0.19
316 0.16
317 0.17
318 0.19
319 0.18
320 0.16
321 0.19
322 0.19
323 0.18
324 0.22
325 0.2
326 0.19
327 0.19
328 0.18
329 0.16
330 0.16
331 0.14
332 0.09
333 0.09
334 0.07
335 0.06
336 0.04
337 0.03
338 0.06
339 0.06
340 0.07
341 0.08
342 0.07
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.06
347 0.06
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.08
353 0.09
354 0.09
355 0.13
356 0.12
357 0.12
358 0.17
359 0.2
360 0.22
361 0.26
362 0.34
363 0.38
364 0.45
365 0.52
366 0.47
367 0.45
368 0.45
369 0.4
370 0.39
371 0.37
372 0.35
373 0.38
374 0.41
375 0.42
376 0.44
377 0.44
378 0.37
379 0.37
380 0.37
381 0.31
382 0.34
383 0.33
384 0.3
385 0.31
386 0.31
387 0.25
388 0.25
389 0.23
390 0.26
391 0.33
392 0.43
393 0.52
394 0.63
395 0.73
396 0.79
397 0.89
398 0.9
399 0.92
400 0.92
401 0.9
402 0.87
403 0.82
404 0.79
405 0.71
406 0.66
407 0.56
408 0.46
409 0.4
410 0.39
411 0.39
412 0.31
413 0.29
414 0.27
415 0.29
416 0.32
417 0.36
418 0.33
419 0.34
420 0.43
421 0.53
422 0.6
423 0.62
424 0.65
425 0.63
426 0.67
427 0.68
428 0.61
429 0.54
430 0.51
431 0.51
432 0.46
433 0.41
434 0.35
435 0.27
436 0.23
437 0.22
438 0.17
439 0.14