Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2F9T1

Protein Details
Accession A0A1Y2F9T1    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-70VQKQTKIVKKILKDKKGRQTNLPKNSFKNHydrophilic
285-307ETLSIPKKTKKKLNINVNIKPKSHydrophilic
422-453NNQNKKIKIIKKVKRRKGKHQQHQQHQQHQQHHydrophilic
773-793QQISKEKLYYKSNKNKNDYYDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
426-440KKIKIIKKVKRRKGK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MKSNEQNNTITHLKKEELKRLIDQEWITLEEEIKNKYIKDSVQKQTKIVKKILKDKKGRQTNLPKNSFKNVNNNQNGNVDKRSENDNNSEMIKQELKDYTEINLLTEMYNSAKQLPIPHFSVIKHPPNPFSIFTKDNINMIIKKNPTMTRAQALRIVAKKWKNVDSEEKTRYIEKSKEYKEDYENLVKYAYLQRALINNPNIARLCLENQLKEKVNDKFDKKEENINFKELNTDDEIVKAFKYIVRKFPQGYPLASPVLRFPERSITQKFKKSKNKSIEDLNEHETLSIPKKTKKKLNINVNIKPKSQAFDFFVKDRYKLLLKATPTLSLSDLFDELEKEWKNLSYGDKLPYILLEIKDIKRYYIDQCEISKEKRGRKHNIITEMLKENEETINDEEEEEEAEEEEEEVNTMVIDNILLGNNNQNKKIKIIKKVKRRKGKHQQHQQHQQHQQHQQHFNSNEYSTLLEDSENEQDSNYNLLCIKKNRILGRNENYEIMEKHNLKQNDKINWSPSNDMNKNYISSDTSEEYLTFNNFDGKYIFENSNGNEIENLAKENINDHFDIQTQINNSNININDRNNSNISRDCTFIPVTDSININDSTNYSLSQDTVVYNIPEDKLNNNSNTTFSGNQYNDSKDDESNEQRSNTQMSILSQDSKDEISLNKVLQKSFGHSLSESPNNKENNKIIENKNSEKNNSNLFRENKQTIFETPSSNIENSVKSITSSLGINPSLLKENNLETTKVSQKSESLLKPLRSIRKSGIWKFGNVIGLDQQISKEKLYYKSNKNKNDYYDGDDDDDYFYDSDDDDTYISLDEISSFSSSNDDNDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.48
3 0.52
4 0.52
5 0.55
6 0.58
7 0.6
8 0.58
9 0.56
10 0.49
11 0.42
12 0.38
13 0.35
14 0.3
15 0.25
16 0.24
17 0.22
18 0.25
19 0.24
20 0.25
21 0.25
22 0.25
23 0.27
24 0.3
25 0.31
26 0.39
27 0.46
28 0.53
29 0.61
30 0.63
31 0.65
32 0.7
33 0.71
34 0.68
35 0.66
36 0.64
37 0.62
38 0.71
39 0.76
40 0.76
41 0.79
42 0.82
43 0.85
44 0.88
45 0.84
46 0.84
47 0.85
48 0.85
49 0.86
50 0.85
51 0.81
52 0.75
53 0.78
54 0.77
55 0.71
56 0.71
57 0.7
58 0.71
59 0.73
60 0.71
61 0.66
62 0.63
63 0.61
64 0.54
65 0.48
66 0.41
67 0.34
68 0.34
69 0.39
70 0.39
71 0.4
72 0.41
73 0.4
74 0.38
75 0.39
76 0.38
77 0.3
78 0.28
79 0.27
80 0.22
81 0.25
82 0.26
83 0.26
84 0.27
85 0.27
86 0.25
87 0.27
88 0.26
89 0.22
90 0.19
91 0.18
92 0.16
93 0.15
94 0.14
95 0.12
96 0.14
97 0.13
98 0.14
99 0.15
100 0.16
101 0.22
102 0.25
103 0.27
104 0.28
105 0.31
106 0.32
107 0.31
108 0.39
109 0.41
110 0.46
111 0.47
112 0.48
113 0.48
114 0.5
115 0.53
116 0.47
117 0.44
118 0.41
119 0.36
120 0.34
121 0.39
122 0.35
123 0.32
124 0.32
125 0.31
126 0.29
127 0.3
128 0.36
129 0.3
130 0.32
131 0.37
132 0.38
133 0.37
134 0.39
135 0.39
136 0.4
137 0.42
138 0.41
139 0.39
140 0.38
141 0.41
142 0.39
143 0.38
144 0.38
145 0.41
146 0.44
147 0.46
148 0.5
149 0.47
150 0.49
151 0.56
152 0.56
153 0.6
154 0.59
155 0.56
156 0.52
157 0.51
158 0.48
159 0.45
160 0.42
161 0.41
162 0.46
163 0.49
164 0.55
165 0.56
166 0.58
167 0.56
168 0.56
169 0.54
170 0.52
171 0.48
172 0.4
173 0.36
174 0.31
175 0.29
176 0.3
177 0.26
178 0.19
179 0.19
180 0.21
181 0.25
182 0.28
183 0.32
184 0.29
185 0.29
186 0.28
187 0.32
188 0.3
189 0.26
190 0.24
191 0.19
192 0.19
193 0.24
194 0.26
195 0.25
196 0.28
197 0.34
198 0.36
199 0.35
200 0.4
201 0.38
202 0.43
203 0.47
204 0.48
205 0.5
206 0.51
207 0.58
208 0.54
209 0.58
210 0.56
211 0.58
212 0.57
213 0.54
214 0.5
215 0.41
216 0.44
217 0.34
218 0.31
219 0.24
220 0.22
221 0.18
222 0.18
223 0.19
224 0.15
225 0.14
226 0.11
227 0.09
228 0.1
229 0.18
230 0.21
231 0.29
232 0.34
233 0.38
234 0.4
235 0.45
236 0.5
237 0.45
238 0.43
239 0.37
240 0.34
241 0.33
242 0.3
243 0.26
244 0.21
245 0.25
246 0.24
247 0.21
248 0.2
249 0.26
250 0.29
251 0.34
252 0.38
253 0.41
254 0.47
255 0.55
256 0.61
257 0.62
258 0.7
259 0.74
260 0.77
261 0.78
262 0.78
263 0.73
264 0.75
265 0.72
266 0.67
267 0.62
268 0.56
269 0.47
270 0.4
271 0.36
272 0.28
273 0.23
274 0.2
275 0.21
276 0.2
277 0.26
278 0.34
279 0.41
280 0.49
281 0.57
282 0.64
283 0.69
284 0.77
285 0.81
286 0.82
287 0.82
288 0.84
289 0.77
290 0.66
291 0.6
292 0.5
293 0.42
294 0.34
295 0.3
296 0.24
297 0.26
298 0.28
299 0.27
300 0.32
301 0.31
302 0.3
303 0.27
304 0.26
305 0.23
306 0.23
307 0.25
308 0.23
309 0.23
310 0.28
311 0.27
312 0.26
313 0.25
314 0.24
315 0.2
316 0.17
317 0.16
318 0.12
319 0.11
320 0.09
321 0.09
322 0.08
323 0.08
324 0.13
325 0.13
326 0.13
327 0.13
328 0.13
329 0.14
330 0.15
331 0.18
332 0.17
333 0.19
334 0.21
335 0.21
336 0.21
337 0.2
338 0.18
339 0.18
340 0.15
341 0.12
342 0.13
343 0.16
344 0.17
345 0.22
346 0.22
347 0.2
348 0.19
349 0.21
350 0.22
351 0.25
352 0.26
353 0.24
354 0.25
355 0.3
356 0.32
357 0.31
358 0.34
359 0.33
360 0.38
361 0.43
362 0.51
363 0.54
364 0.6
365 0.67
366 0.65
367 0.66
368 0.63
369 0.57
370 0.52
371 0.47
372 0.38
373 0.3
374 0.24
375 0.18
376 0.15
377 0.13
378 0.12
379 0.1
380 0.1
381 0.1
382 0.1
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.06
387 0.05
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.02
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.03
407 0.09
408 0.14
409 0.15
410 0.18
411 0.2
412 0.21
413 0.24
414 0.33
415 0.35
416 0.4
417 0.5
418 0.55
419 0.64
420 0.74
421 0.8
422 0.82
423 0.82
424 0.83
425 0.84
426 0.87
427 0.86
428 0.87
429 0.87
430 0.87
431 0.91
432 0.88
433 0.86
434 0.84
435 0.8
436 0.77
437 0.76
438 0.73
439 0.7
440 0.68
441 0.61
442 0.59
443 0.54
444 0.48
445 0.41
446 0.34
447 0.27
448 0.21
449 0.19
450 0.12
451 0.11
452 0.09
453 0.07
454 0.08
455 0.09
456 0.11
457 0.11
458 0.11
459 0.1
460 0.1
461 0.11
462 0.12
463 0.1
464 0.08
465 0.09
466 0.11
467 0.15
468 0.17
469 0.22
470 0.24
471 0.3
472 0.35
473 0.41
474 0.45
475 0.5
476 0.54
477 0.55
478 0.52
479 0.47
480 0.43
481 0.38
482 0.33
483 0.27
484 0.28
485 0.22
486 0.23
487 0.29
488 0.31
489 0.31
490 0.37
491 0.4
492 0.4
493 0.43
494 0.44
495 0.42
496 0.43
497 0.44
498 0.4
499 0.38
500 0.41
501 0.39
502 0.38
503 0.36
504 0.33
505 0.31
506 0.29
507 0.25
508 0.17
509 0.16
510 0.18
511 0.16
512 0.16
513 0.15
514 0.14
515 0.14
516 0.14
517 0.12
518 0.1
519 0.09
520 0.13
521 0.13
522 0.13
523 0.13
524 0.13
525 0.15
526 0.17
527 0.18
528 0.14
529 0.16
530 0.16
531 0.22
532 0.21
533 0.18
534 0.15
535 0.15
536 0.15
537 0.14
538 0.14
539 0.09
540 0.1
541 0.09
542 0.11
543 0.13
544 0.14
545 0.14
546 0.14
547 0.14
548 0.14
549 0.16
550 0.14
551 0.14
552 0.14
553 0.14
554 0.15
555 0.15
556 0.14
557 0.17
558 0.17
559 0.2
560 0.21
561 0.22
562 0.23
563 0.24
564 0.27
565 0.25
566 0.26
567 0.24
568 0.25
569 0.27
570 0.26
571 0.26
572 0.24
573 0.24
574 0.23
575 0.2
576 0.19
577 0.17
578 0.17
579 0.18
580 0.19
581 0.16
582 0.18
583 0.18
584 0.15
585 0.14
586 0.13
587 0.13
588 0.12
589 0.12
590 0.11
591 0.11
592 0.11
593 0.11
594 0.11
595 0.09
596 0.1
597 0.11
598 0.1
599 0.1
600 0.11
601 0.11
602 0.12
603 0.13
604 0.14
605 0.2
606 0.24
607 0.25
608 0.27
609 0.27
610 0.26
611 0.28
612 0.29
613 0.24
614 0.21
615 0.28
616 0.25
617 0.28
618 0.3
619 0.3
620 0.27
621 0.3
622 0.3
623 0.22
624 0.26
625 0.28
626 0.31
627 0.34
628 0.36
629 0.33
630 0.32
631 0.34
632 0.33
633 0.27
634 0.23
635 0.19
636 0.17
637 0.2
638 0.22
639 0.23
640 0.19
641 0.2
642 0.19
643 0.18
644 0.17
645 0.14
646 0.13
647 0.15
648 0.18
649 0.18
650 0.22
651 0.24
652 0.24
653 0.26
654 0.27
655 0.27
656 0.3
657 0.3
658 0.28
659 0.26
660 0.29
661 0.31
662 0.39
663 0.36
664 0.35
665 0.4
666 0.42
667 0.43
668 0.45
669 0.44
670 0.43
671 0.45
672 0.49
673 0.48
674 0.53
675 0.59
676 0.59
677 0.62
678 0.6
679 0.58
680 0.55
681 0.55
682 0.55
683 0.53
684 0.52
685 0.52
686 0.52
687 0.52
688 0.55
689 0.55
690 0.47
691 0.45
692 0.43
693 0.37
694 0.39
695 0.36
696 0.32
697 0.3
698 0.32
699 0.33
700 0.3
701 0.3
702 0.26
703 0.25
704 0.24
705 0.24
706 0.2
707 0.17
708 0.18
709 0.16
710 0.15
711 0.15
712 0.14
713 0.16
714 0.16
715 0.16
716 0.16
717 0.18
718 0.22
719 0.21
720 0.21
721 0.19
722 0.22
723 0.29
724 0.3
725 0.29
726 0.25
727 0.31
728 0.38
729 0.39
730 0.38
731 0.32
732 0.32
733 0.36
734 0.43
735 0.39
736 0.4
737 0.44
738 0.44
739 0.49
740 0.56
741 0.61
742 0.55
743 0.57
744 0.53
745 0.56
746 0.63
747 0.63
748 0.65
749 0.58
750 0.57
751 0.55
752 0.53
753 0.48
754 0.39
755 0.34
756 0.27
757 0.26
758 0.25
759 0.23
760 0.2
761 0.21
762 0.23
763 0.22
764 0.23
765 0.26
766 0.32
767 0.42
768 0.5
769 0.55
770 0.64
771 0.73
772 0.79
773 0.81
774 0.82
775 0.79
776 0.78
777 0.71
778 0.67
779 0.63
780 0.56
781 0.51
782 0.44
783 0.38
784 0.31
785 0.27
786 0.22
787 0.16
788 0.14
789 0.11
790 0.11
791 0.12
792 0.11
793 0.11
794 0.09
795 0.1
796 0.1
797 0.1
798 0.1
799 0.08
800 0.07
801 0.07
802 0.08
803 0.09
804 0.1
805 0.09
806 0.1
807 0.13
808 0.13