Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2D838

Protein Details
Accession A0A1Y2D838    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
106-137TEEKTEGKKKSKKDTKAKRRSSQSRRSRSGSKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
112-137GKKKSKKDTKAKRRSSQSRRSRSGSK
151-177SNKKPLSPPASPTPAQEKQAKEKVKRR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 15.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040366  Nab2/ZC3H14  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0008143  F:poly(A) binding  
GO:1900364  P:negative regulation of mRNA polyadenylation  
GO:0043488  P:regulation of mRNA stability  
Pfam View protein in Pfam  
PF14608  zf-CCCH_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MTDVATNPILTEEAAPTSSRNKVRQRVADAVKNKLTQLNVDDAENLSVRITEMLAEGYSKEKLNEELVKLVGADKFKSSFIEWLYGYANVFFPQTPALSEKEDAETEEKTEGKKKSKKDTKAKRRSSQSRRSRSGSKSSVSSIDTDKSSKSNKKPLSPPASPTPAQEKQAKEKVKRRLSRSASSLDLANKVQTEVMAQAIAIAAAAESNNNVKHSRERSSSISSNRSNRSVERRNSFNRERKNSISSNSSNTERVRCQYWPECSRGDQCKYWHPKELCKKYPNCPAGDKCLYIHPASPSNPPSRSGSISSKHNRTKSDASSVISAASDRSSVECKFGANCNRPDCKYSHPSPAAIAAQIAKKATAAATETLEQTKQELQKQLKEQAQLKANAAAKSTVKSTVPCHFFPNCKNPDCPYQHPSPSQAIKDLKSKQSNSEYNVPCRYDGNCSRADCKFLHTKKH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.14
4 0.19
5 0.26
6 0.32
7 0.39
8 0.47
9 0.55
10 0.64
11 0.71
12 0.74
13 0.76
14 0.77
15 0.77
16 0.72
17 0.71
18 0.68
19 0.6
20 0.55
21 0.48
22 0.42
23 0.37
24 0.35
25 0.34
26 0.29
27 0.28
28 0.27
29 0.24
30 0.25
31 0.22
32 0.19
33 0.11
34 0.1
35 0.1
36 0.09
37 0.09
38 0.07
39 0.07
40 0.08
41 0.08
42 0.08
43 0.09
44 0.1
45 0.13
46 0.13
47 0.13
48 0.14
49 0.16
50 0.22
51 0.26
52 0.26
53 0.27
54 0.26
55 0.26
56 0.24
57 0.24
58 0.21
59 0.17
60 0.16
61 0.16
62 0.17
63 0.17
64 0.2
65 0.19
66 0.2
67 0.2
68 0.23
69 0.21
70 0.22
71 0.22
72 0.21
73 0.2
74 0.16
75 0.15
76 0.11
77 0.12
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.11
83 0.13
84 0.15
85 0.16
86 0.17
87 0.18
88 0.19
89 0.19
90 0.19
91 0.19
92 0.17
93 0.16
94 0.18
95 0.17
96 0.17
97 0.24
98 0.28
99 0.36
100 0.42
101 0.48
102 0.57
103 0.66
104 0.74
105 0.78
106 0.84
107 0.85
108 0.9
109 0.92
110 0.9
111 0.91
112 0.92
113 0.91
114 0.91
115 0.9
116 0.89
117 0.85
118 0.82
119 0.8
120 0.75
121 0.74
122 0.68
123 0.6
124 0.53
125 0.48
126 0.45
127 0.38
128 0.34
129 0.26
130 0.23
131 0.22
132 0.2
133 0.19
134 0.2
135 0.27
136 0.33
137 0.38
138 0.45
139 0.49
140 0.56
141 0.62
142 0.68
143 0.69
144 0.64
145 0.61
146 0.59
147 0.59
148 0.51
149 0.47
150 0.45
151 0.4
152 0.41
153 0.42
154 0.39
155 0.41
156 0.49
157 0.53
158 0.53
159 0.57
160 0.64
161 0.68
162 0.72
163 0.7
164 0.73
165 0.72
166 0.7
167 0.66
168 0.59
169 0.51
170 0.44
171 0.4
172 0.31
173 0.27
174 0.21
175 0.18
176 0.14
177 0.12
178 0.12
179 0.09
180 0.08
181 0.06
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.04
188 0.03
189 0.03
190 0.02
191 0.02
192 0.02
193 0.02
194 0.03
195 0.05
196 0.05
197 0.07
198 0.08
199 0.09
200 0.16
201 0.2
202 0.25
203 0.26
204 0.29
205 0.32
206 0.38
207 0.42
208 0.4
209 0.43
210 0.43
211 0.46
212 0.45
213 0.43
214 0.39
215 0.37
216 0.42
217 0.43
218 0.45
219 0.43
220 0.47
221 0.5
222 0.56
223 0.62
224 0.6
225 0.6
226 0.61
227 0.62
228 0.59
229 0.6
230 0.54
231 0.48
232 0.47
233 0.4
234 0.37
235 0.35
236 0.33
237 0.31
238 0.3
239 0.3
240 0.25
241 0.25
242 0.24
243 0.22
244 0.26
245 0.28
246 0.35
247 0.35
248 0.37
249 0.37
250 0.36
251 0.42
252 0.43
253 0.42
254 0.37
255 0.36
256 0.43
257 0.5
258 0.5
259 0.51
260 0.47
261 0.52
262 0.59
263 0.66
264 0.66
265 0.66
266 0.68
267 0.66
268 0.74
269 0.7
270 0.62
271 0.59
272 0.53
273 0.53
274 0.51
275 0.44
276 0.35
277 0.35
278 0.33
279 0.27
280 0.27
281 0.21
282 0.23
283 0.24
284 0.29
285 0.29
286 0.32
287 0.33
288 0.32
289 0.34
290 0.32
291 0.33
292 0.33
293 0.34
294 0.33
295 0.41
296 0.46
297 0.51
298 0.55
299 0.56
300 0.54
301 0.55
302 0.58
303 0.52
304 0.53
305 0.46
306 0.41
307 0.39
308 0.36
309 0.3
310 0.23
311 0.19
312 0.12
313 0.09
314 0.08
315 0.06
316 0.08
317 0.11
318 0.11
319 0.14
320 0.14
321 0.14
322 0.16
323 0.23
324 0.3
325 0.34
326 0.4
327 0.45
328 0.5
329 0.51
330 0.52
331 0.48
332 0.47
333 0.48
334 0.46
335 0.49
336 0.46
337 0.45
338 0.43
339 0.45
340 0.37
341 0.29
342 0.26
343 0.19
344 0.18
345 0.19
346 0.18
347 0.13
348 0.12
349 0.13
350 0.12
351 0.11
352 0.11
353 0.11
354 0.13
355 0.15
356 0.16
357 0.17
358 0.18
359 0.16
360 0.16
361 0.2
362 0.23
363 0.27
364 0.34
365 0.37
366 0.45
367 0.51
368 0.56
369 0.55
370 0.57
371 0.57
372 0.56
373 0.58
374 0.53
375 0.49
376 0.48
377 0.48
378 0.42
379 0.38
380 0.35
381 0.29
382 0.28
383 0.28
384 0.25
385 0.22
386 0.23
387 0.26
388 0.32
389 0.35
390 0.35
391 0.39
392 0.4
393 0.46
394 0.51
395 0.57
396 0.56
397 0.55
398 0.57
399 0.56
400 0.61
401 0.62
402 0.61
403 0.57
404 0.58
405 0.61
406 0.61
407 0.61
408 0.59
409 0.58
410 0.53
411 0.55
412 0.52
413 0.49
414 0.54
415 0.57
416 0.58
417 0.6
418 0.6
419 0.61
420 0.65
421 0.68
422 0.65
423 0.68
424 0.65
425 0.64
426 0.68
427 0.61
428 0.53
429 0.49
430 0.45
431 0.44
432 0.45
433 0.43
434 0.43
435 0.44
436 0.48
437 0.48
438 0.5
439 0.42
440 0.41
441 0.46