Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2D4H4

Protein Details
Accession A0A1Y2D4H4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-37EFRNKTKQYPRLFRITRRIHPKTKKIIESFNIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
322-325KKKG
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 13.5, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR019039  T4-Rnl1-like_N  
IPR015966  tRNA_lig_kin_fungi  
IPR003124  WH2_dom  
Gene Ontology GO:0030479  C:actin cortical patch  
GO:0003779  F:actin binding  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003972  F:RNA ligase (ATP) activity  
GO:0006388  P:tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation  
Pfam View protein in Pfam  
PF09511  RNA_lig_T4_1  
PF08303  tRNA_lig_kinase  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51082  WH2  
Amino Acid Sequences MEKIIEFRNKTKQYPRLFRITRRIHPKTKKIIESFNIQESAFKKRNIIPFLARGIFINPEDNSVIVRGYDKFFNIGETEDTLWKNIEENTVGPFELTLKENGCIIFVSVYEDDLFVTSKHSFTSINNDGNLVPNNYSDLGEKWLDKYIKDKREQLKKFIKENNVTLVFELIDNDFEEHVLEYSKQEDGLYLHGINENTVEFKTWPSEKVNEVAKEFNLMPVKYQIYSDIHELKKFADSCNGYYNNKAIEGWVIRCKKQDGDTFFFKYKYEEPYLLYREWREVTKAYIDHKPVKCKYLKTYGYMEWIKQKYQTNKELFDGIKKKKGIIKLRKMYLDETNGGEYTGKTFEPVTKDNAKYKLILPIGIIGFGKTTVGRMLKILFDIGHIQSDNIQKKKPAPEFIANVCKEFDYKTIVMADKNNHLKRHRGELCEKLKEIYPNTLWIVALHWNIETVKERDILEFARERIEKRGENHQNLTPEKTANYPHIIKMFLNNYENLDIENNIEDSLIDEVIDVDFKEDSISIVKKIIKALNLEPKTDKELEDAFKQANELKSEIDAKAKKIDPLYYGIGMKYINCKELAMKYLKDYSDQHNEYIKDFEHLKFIIEEGNFLQREHVTIAHRKSDPIDMIKHYEALIGKTKQVMNFNNPDLEVYIHISSIVWTSNHAFIPVDKIESDKLYVKEEKSDNNNNNNESEKEEKKNDDELLYHITLASYGDVKPIECRNILQKINNYYKEHDNIKPEIINEEKLPLIDESYVIDDTNKDKENEIIHPKIVYQLLPSSIKNTTFMKPIKIVEGPDWKQLFFEPFKFKGYYTKFYY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.76
3 0.77
4 0.78
5 0.79
6 0.8
7 0.81
8 0.8
9 0.8
10 0.83
11 0.83
12 0.86
13 0.87
14 0.87
15 0.88
16 0.87
17 0.82
18 0.83
19 0.76
20 0.74
21 0.68
22 0.63
23 0.55
24 0.46
25 0.44
26 0.37
27 0.42
28 0.39
29 0.36
30 0.36
31 0.4
32 0.49
33 0.49
34 0.54
35 0.5
36 0.5
37 0.56
38 0.52
39 0.45
40 0.38
41 0.35
42 0.32
43 0.27
44 0.26
45 0.2
46 0.21
47 0.21
48 0.2
49 0.19
50 0.16
51 0.16
52 0.11
53 0.13
54 0.13
55 0.15
56 0.18
57 0.17
58 0.19
59 0.19
60 0.2
61 0.19
62 0.18
63 0.17
64 0.17
65 0.19
66 0.21
67 0.21
68 0.2
69 0.2
70 0.19
71 0.19
72 0.18
73 0.19
74 0.16
75 0.16
76 0.18
77 0.19
78 0.19
79 0.16
80 0.15
81 0.13
82 0.14
83 0.15
84 0.15
85 0.15
86 0.16
87 0.17
88 0.17
89 0.16
90 0.14
91 0.13
92 0.1
93 0.09
94 0.13
95 0.11
96 0.12
97 0.12
98 0.12
99 0.11
100 0.11
101 0.12
102 0.07
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.12
107 0.13
108 0.14
109 0.15
110 0.24
111 0.28
112 0.3
113 0.3
114 0.31
115 0.3
116 0.32
117 0.33
118 0.26
119 0.19
120 0.16
121 0.18
122 0.18
123 0.18
124 0.16
125 0.14
126 0.16
127 0.17
128 0.18
129 0.18
130 0.24
131 0.24
132 0.23
133 0.31
134 0.37
135 0.44
136 0.49
137 0.56
138 0.58
139 0.68
140 0.73
141 0.74
142 0.75
143 0.73
144 0.76
145 0.75
146 0.76
147 0.71
148 0.69
149 0.67
150 0.6
151 0.52
152 0.44
153 0.36
154 0.27
155 0.21
156 0.19
157 0.11
158 0.09
159 0.09
160 0.1
161 0.09
162 0.08
163 0.09
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.09
173 0.1
174 0.1
175 0.12
176 0.14
177 0.13
178 0.13
179 0.16
180 0.16
181 0.14
182 0.14
183 0.12
184 0.11
185 0.1
186 0.11
187 0.09
188 0.1
189 0.15
190 0.16
191 0.19
192 0.21
193 0.24
194 0.24
195 0.29
196 0.35
197 0.33
198 0.33
199 0.32
200 0.29
201 0.29
202 0.27
203 0.27
204 0.25
205 0.22
206 0.21
207 0.23
208 0.25
209 0.22
210 0.22
211 0.21
212 0.19
213 0.21
214 0.24
215 0.28
216 0.28
217 0.28
218 0.28
219 0.25
220 0.29
221 0.28
222 0.24
223 0.25
224 0.25
225 0.27
226 0.34
227 0.37
228 0.32
229 0.32
230 0.34
231 0.27
232 0.25
233 0.22
234 0.15
235 0.15
236 0.17
237 0.19
238 0.25
239 0.27
240 0.28
241 0.31
242 0.32
243 0.31
244 0.35
245 0.39
246 0.39
247 0.42
248 0.46
249 0.48
250 0.48
251 0.45
252 0.39
253 0.35
254 0.31
255 0.31
256 0.28
257 0.25
258 0.26
259 0.32
260 0.35
261 0.33
262 0.32
263 0.27
264 0.26
265 0.27
266 0.25
267 0.21
268 0.18
269 0.19
270 0.22
271 0.23
272 0.23
273 0.27
274 0.31
275 0.38
276 0.41
277 0.48
278 0.45
279 0.5
280 0.51
281 0.49
282 0.51
283 0.52
284 0.51
285 0.46
286 0.49
287 0.43
288 0.46
289 0.43
290 0.39
291 0.37
292 0.36
293 0.33
294 0.33
295 0.38
296 0.39
297 0.46
298 0.53
299 0.48
300 0.49
301 0.49
302 0.48
303 0.42
304 0.42
305 0.43
306 0.38
307 0.4
308 0.38
309 0.4
310 0.4
311 0.48
312 0.5
313 0.52
314 0.59
315 0.6
316 0.65
317 0.65
318 0.63
319 0.57
320 0.51
321 0.44
322 0.35
323 0.28
324 0.25
325 0.21
326 0.2
327 0.17
328 0.12
329 0.1
330 0.1
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.11
335 0.15
336 0.17
337 0.2
338 0.26
339 0.29
340 0.33
341 0.37
342 0.35
343 0.32
344 0.31
345 0.33
346 0.27
347 0.24
348 0.19
349 0.19
350 0.18
351 0.17
352 0.16
353 0.09
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.04
358 0.05
359 0.07
360 0.08
361 0.08
362 0.09
363 0.1
364 0.1
365 0.1
366 0.1
367 0.07
368 0.07
369 0.09
370 0.09
371 0.09
372 0.09
373 0.08
374 0.12
375 0.19
376 0.24
377 0.23
378 0.24
379 0.25
380 0.29
381 0.38
382 0.38
383 0.36
384 0.35
385 0.39
386 0.41
387 0.44
388 0.48
389 0.4
390 0.36
391 0.32
392 0.27
393 0.22
394 0.19
395 0.16
396 0.12
397 0.12
398 0.12
399 0.14
400 0.15
401 0.15
402 0.17
403 0.18
404 0.2
405 0.28
406 0.31
407 0.33
408 0.34
409 0.39
410 0.39
411 0.48
412 0.46
413 0.43
414 0.45
415 0.5
416 0.55
417 0.52
418 0.5
419 0.41
420 0.38
421 0.36
422 0.32
423 0.27
424 0.21
425 0.2
426 0.2
427 0.2
428 0.17
429 0.14
430 0.14
431 0.12
432 0.12
433 0.1
434 0.09
435 0.09
436 0.09
437 0.1
438 0.12
439 0.11
440 0.12
441 0.14
442 0.14
443 0.14
444 0.15
445 0.15
446 0.15
447 0.15
448 0.14
449 0.18
450 0.18
451 0.19
452 0.23
453 0.27
454 0.27
455 0.28
456 0.38
457 0.41
458 0.44
459 0.47
460 0.45
461 0.46
462 0.44
463 0.45
464 0.35
465 0.28
466 0.24
467 0.23
468 0.22
469 0.18
470 0.22
471 0.2
472 0.21
473 0.22
474 0.22
475 0.2
476 0.23
477 0.23
478 0.21
479 0.21
480 0.2
481 0.19
482 0.19
483 0.19
484 0.15
485 0.13
486 0.1
487 0.09
488 0.09
489 0.08
490 0.07
491 0.07
492 0.06
493 0.06
494 0.06
495 0.06
496 0.05
497 0.04
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.04
502 0.04
503 0.04
504 0.04
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.08
509 0.09
510 0.09
511 0.14
512 0.15
513 0.16
514 0.2
515 0.22
516 0.21
517 0.24
518 0.29
519 0.35
520 0.35
521 0.36
522 0.34
523 0.33
524 0.36
525 0.33
526 0.28
527 0.21
528 0.23
529 0.24
530 0.24
531 0.24
532 0.2
533 0.19
534 0.19
535 0.2
536 0.19
537 0.18
538 0.16
539 0.15
540 0.17
541 0.19
542 0.19
543 0.23
544 0.22
545 0.22
546 0.28
547 0.29
548 0.3
549 0.29
550 0.31
551 0.25
552 0.28
553 0.29
554 0.24
555 0.24
556 0.2
557 0.2
558 0.17
559 0.16
560 0.19
561 0.18
562 0.17
563 0.16
564 0.17
565 0.18
566 0.21
567 0.25
568 0.23
569 0.22
570 0.24
571 0.29
572 0.29
573 0.29
574 0.3
575 0.31
576 0.37
577 0.37
578 0.37
579 0.37
580 0.38
581 0.36
582 0.35
583 0.29
584 0.22
585 0.23
586 0.21
587 0.19
588 0.19
589 0.18
590 0.16
591 0.16
592 0.18
593 0.15
594 0.16
595 0.13
596 0.2
597 0.19
598 0.19
599 0.2
600 0.16
601 0.17
602 0.17
603 0.19
604 0.17
605 0.24
606 0.28
607 0.33
608 0.33
609 0.33
610 0.34
611 0.35
612 0.35
613 0.32
614 0.33
615 0.29
616 0.34
617 0.34
618 0.32
619 0.27
620 0.26
621 0.23
622 0.22
623 0.26
624 0.22
625 0.23
626 0.27
627 0.29
628 0.29
629 0.35
630 0.37
631 0.36
632 0.41
633 0.42
634 0.39
635 0.37
636 0.34
637 0.28
638 0.24
639 0.18
640 0.16
641 0.14
642 0.12
643 0.12
644 0.11
645 0.11
646 0.11
647 0.11
648 0.08
649 0.09
650 0.12
651 0.16
652 0.16
653 0.16
654 0.15
655 0.14
656 0.2
657 0.19
658 0.19
659 0.15
660 0.17
661 0.18
662 0.19
663 0.22
664 0.21
665 0.22
666 0.26
667 0.31
668 0.3
669 0.36
670 0.38
671 0.42
672 0.44
673 0.53
674 0.54
675 0.59
676 0.63
677 0.57
678 0.57
679 0.53
680 0.46
681 0.42
682 0.41
683 0.38
684 0.39
685 0.42
686 0.44
687 0.44
688 0.48
689 0.46
690 0.41
691 0.36
692 0.33
693 0.34
694 0.3
695 0.26
696 0.21
697 0.18
698 0.16
699 0.15
700 0.13
701 0.08
702 0.08
703 0.11
704 0.12
705 0.12
706 0.17
707 0.21
708 0.24
709 0.23
710 0.26
711 0.3
712 0.39
713 0.43
714 0.44
715 0.47
716 0.52
717 0.61
718 0.66
719 0.62
720 0.58
721 0.61
722 0.61
723 0.59
724 0.55
725 0.52
726 0.47
727 0.48
728 0.46
729 0.39
730 0.39
731 0.36
732 0.34
733 0.28
734 0.28
735 0.24
736 0.22
737 0.23
738 0.17
739 0.16
740 0.13
741 0.13
742 0.12
743 0.14
744 0.15
745 0.13
746 0.13
747 0.14
748 0.16
749 0.22
750 0.24
751 0.22
752 0.23
753 0.27
754 0.3
755 0.37
756 0.42
757 0.39
758 0.37
759 0.37
760 0.36
761 0.37
762 0.35
763 0.27
764 0.22
765 0.22
766 0.26
767 0.29
768 0.29
769 0.28
770 0.3
771 0.3
772 0.31
773 0.31
774 0.29
775 0.34
776 0.37
777 0.39
778 0.4
779 0.41
780 0.43
781 0.42
782 0.41
783 0.4
784 0.48
785 0.45
786 0.49
787 0.49
788 0.43
789 0.41
790 0.41
791 0.4
792 0.35
793 0.4
794 0.38
795 0.39
796 0.44
797 0.44
798 0.43
799 0.46
800 0.48