Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H0ETB9

Protein Details
Accession H0ETB9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
197-216TPSGRGKRTKTHHHHHHQEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
169-183SSRGGATSRRRKLKE
194-206GRRTPSGRGKRTK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 12, cyto 10.5, mito 1, extr 1, pero 1, cysk 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036609  LCCL_sf  
IPR013951  Rxt3  
Gene Ontology GO:0016575  P:histone deacetylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF08642  Rxt3  
Amino Acid Sequences MPAQHAAPSNQYEASMIERQRIANVAQHLHQQHQPGPAYAGPPMNGPYQPQESPTRRNMEESQQMQQQRSFLGVEFNRKGRLSPLPQAVQGAQAQHGGPGGEPGIKSEFGRMFSGIGSGVSGLGVPSPVSANAQSMPFSNSGQLRREDLEGFANQDSPMDNGSIKPRSSSRGGATSRRRKLKEEDGRDDESSTGRRTPSGRGKRTKTHHHHHHQEEITRRRAVYGTDIYTDDSDVVAACIHEGWFRGAWAPDVDISLLDLEIGDPPARPIDAEAVLTAPPPHGPLIVPKNHDVDIKILILPALVEYKGCVRFGIRSREWGVKHSGYQAQHDGLSFKIMSVQFVAGDGGVESKRGKVAYSQNLTARELEEERRTARVFEMGDQVMQDRAEEISFERGEAGLRGVGMRSWNLDPPPPKRVEEVQREVPAPIRVRTPRVMEPPVVEPITPAAGQEKMVGLGVDAVVETAGVLAALRGGEVEGVGMGRREGSGLGEGGDVGRVAEGAKEVTEADIQRVMGIQGGTGESERGRVVEMVTERMVWNANSVGRH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.27
3 0.24
4 0.27
5 0.29
6 0.29
7 0.3
8 0.32
9 0.27
10 0.26
11 0.31
12 0.3
13 0.29
14 0.36
15 0.37
16 0.38
17 0.4
18 0.39
19 0.38
20 0.42
21 0.42
22 0.35
23 0.36
24 0.34
25 0.32
26 0.31
27 0.29
28 0.22
29 0.22
30 0.23
31 0.23
32 0.21
33 0.22
34 0.25
35 0.28
36 0.28
37 0.3
38 0.38
39 0.41
40 0.47
41 0.52
42 0.54
43 0.49
44 0.55
45 0.55
46 0.54
47 0.57
48 0.54
49 0.52
50 0.51
51 0.54
52 0.5
53 0.48
54 0.41
55 0.31
56 0.3
57 0.25
58 0.19
59 0.24
60 0.25
61 0.31
62 0.34
63 0.37
64 0.39
65 0.38
66 0.39
67 0.34
68 0.4
69 0.38
70 0.42
71 0.47
72 0.45
73 0.46
74 0.48
75 0.43
76 0.38
77 0.33
78 0.26
79 0.19
80 0.18
81 0.17
82 0.15
83 0.16
84 0.12
85 0.1
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.12
91 0.14
92 0.14
93 0.15
94 0.19
95 0.21
96 0.21
97 0.23
98 0.21
99 0.19
100 0.18
101 0.18
102 0.13
103 0.1
104 0.08
105 0.06
106 0.06
107 0.05
108 0.05
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.05
115 0.06
116 0.07
117 0.08
118 0.09
119 0.11
120 0.12
121 0.12
122 0.12
123 0.14
124 0.14
125 0.14
126 0.16
127 0.19
128 0.23
129 0.26
130 0.26
131 0.27
132 0.27
133 0.29
134 0.26
135 0.23
136 0.23
137 0.2
138 0.21
139 0.18
140 0.17
141 0.15
142 0.14
143 0.13
144 0.1
145 0.11
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.16
150 0.19
151 0.19
152 0.2
153 0.21
154 0.25
155 0.28
156 0.31
157 0.28
158 0.33
159 0.36
160 0.43
161 0.52
162 0.58
163 0.63
164 0.67
165 0.66
166 0.62
167 0.66
168 0.68
169 0.68
170 0.67
171 0.67
172 0.64
173 0.66
174 0.62
175 0.55
176 0.45
177 0.36
178 0.29
179 0.23
180 0.2
181 0.16
182 0.18
183 0.19
184 0.26
185 0.35
186 0.43
187 0.5
188 0.56
189 0.62
190 0.68
191 0.74
192 0.77
193 0.75
194 0.75
195 0.77
196 0.78
197 0.82
198 0.77
199 0.78
200 0.71
201 0.67
202 0.66
203 0.62
204 0.57
205 0.49
206 0.44
207 0.37
208 0.34
209 0.3
210 0.26
211 0.23
212 0.2
213 0.2
214 0.21
215 0.2
216 0.19
217 0.18
218 0.13
219 0.08
220 0.07
221 0.05
222 0.05
223 0.04
224 0.04
225 0.03
226 0.03
227 0.04
228 0.04
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.08
240 0.07
241 0.06
242 0.06
243 0.05
244 0.04
245 0.04
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.05
270 0.05
271 0.11
272 0.17
273 0.21
274 0.23
275 0.24
276 0.26
277 0.27
278 0.27
279 0.22
280 0.18
281 0.16
282 0.15
283 0.13
284 0.11
285 0.09
286 0.08
287 0.08
288 0.06
289 0.05
290 0.04
291 0.04
292 0.05
293 0.09
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.16
299 0.21
300 0.3
301 0.27
302 0.3
303 0.33
304 0.39
305 0.4
306 0.37
307 0.37
308 0.29
309 0.3
310 0.29
311 0.31
312 0.26
313 0.28
314 0.27
315 0.23
316 0.22
317 0.21
318 0.17
319 0.13
320 0.13
321 0.1
322 0.08
323 0.12
324 0.11
325 0.12
326 0.12
327 0.12
328 0.1
329 0.1
330 0.11
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.07
339 0.09
340 0.09
341 0.1
342 0.14
343 0.22
344 0.3
345 0.34
346 0.37
347 0.39
348 0.41
349 0.42
350 0.37
351 0.29
352 0.23
353 0.21
354 0.21
355 0.2
356 0.21
357 0.21
358 0.23
359 0.23
360 0.21
361 0.2
362 0.21
363 0.18
364 0.18
365 0.22
366 0.19
367 0.19
368 0.18
369 0.18
370 0.15
371 0.14
372 0.11
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.08
378 0.12
379 0.12
380 0.12
381 0.12
382 0.11
383 0.12
384 0.12
385 0.12
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.08
391 0.09
392 0.09
393 0.11
394 0.12
395 0.15
396 0.16
397 0.22
398 0.27
399 0.31
400 0.38
401 0.38
402 0.38
403 0.39
404 0.46
405 0.5
406 0.54
407 0.56
408 0.56
409 0.56
410 0.55
411 0.52
412 0.47
413 0.44
414 0.37
415 0.31
416 0.32
417 0.32
418 0.36
419 0.4
420 0.42
421 0.43
422 0.47
423 0.49
424 0.43
425 0.42
426 0.41
427 0.41
428 0.36
429 0.29
430 0.22
431 0.2
432 0.2
433 0.17
434 0.14
435 0.11
436 0.11
437 0.12
438 0.13
439 0.12
440 0.1
441 0.11
442 0.1
443 0.08
444 0.08
445 0.07
446 0.06
447 0.05
448 0.05
449 0.04
450 0.04
451 0.04
452 0.03
453 0.03
454 0.02
455 0.02
456 0.02
457 0.03
458 0.03
459 0.03
460 0.03
461 0.04
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.06
471 0.06
472 0.06
473 0.07
474 0.08
475 0.1
476 0.1
477 0.1
478 0.1
479 0.1
480 0.1
481 0.1
482 0.08
483 0.06
484 0.05
485 0.05
486 0.05
487 0.05
488 0.06
489 0.07
490 0.07
491 0.08
492 0.08
493 0.09
494 0.13
495 0.13
496 0.15
497 0.17
498 0.17
499 0.16
500 0.17
501 0.15
502 0.14
503 0.13
504 0.11
505 0.1
506 0.1
507 0.11
508 0.11
509 0.12
510 0.09
511 0.11
512 0.12
513 0.11
514 0.12
515 0.12
516 0.12
517 0.17
518 0.19
519 0.21
520 0.22
521 0.23
522 0.21
523 0.22
524 0.24
525 0.17
526 0.18
527 0.18