Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2C143

Protein Details
Accession A0A1Y2C143    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-59QKLHKVPRPKSIRQHAVRKDTQHydrophilic
176-204LSDKSDKSSKSKKKVKTNQTPVTQKKIKLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
185-189KSKKK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039355  Transcription_factor_GATA  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MATQPVKPVCANCGVNHTPLWRRSANDEILCNACGLYQKLHKVPRPKSIRQHAVRKDTQVMTEHETIECSNCHTTNTPLWRRDENGSTLCNACGLYQKMHHSARPISMKTDLPRKRQRFDSIPNIPGMGSPSLLTSPGLSSFLPYGNYYPLGFGGLPGNSQFMYNPLNQAALSPALSDKSDKSSKSKKKVKTNQTPVTQKKIKLSNPSPTVVEKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.35
3 0.36
4 0.38
5 0.37
6 0.37
7 0.42
8 0.36
9 0.36
10 0.4
11 0.45
12 0.47
13 0.44
14 0.43
15 0.4
16 0.4
17 0.37
18 0.31
19 0.23
20 0.17
21 0.16
22 0.16
23 0.17
24 0.2
25 0.26
26 0.33
27 0.4
28 0.45
29 0.52
30 0.57
31 0.62
32 0.66
33 0.68
34 0.72
35 0.75
36 0.8
37 0.78
38 0.82
39 0.81
40 0.81
41 0.76
42 0.7
43 0.66
44 0.56
45 0.51
46 0.44
47 0.38
48 0.35
49 0.33
50 0.3
51 0.24
52 0.23
53 0.2
54 0.18
55 0.15
56 0.13
57 0.13
58 0.12
59 0.14
60 0.15
61 0.18
62 0.22
63 0.31
64 0.35
65 0.37
66 0.4
67 0.4
68 0.42
69 0.43
70 0.4
71 0.35
72 0.3
73 0.27
74 0.25
75 0.24
76 0.2
77 0.17
78 0.14
79 0.1
80 0.12
81 0.13
82 0.13
83 0.15
84 0.18
85 0.24
86 0.25
87 0.26
88 0.24
89 0.24
90 0.29
91 0.31
92 0.29
93 0.24
94 0.26
95 0.27
96 0.26
97 0.35
98 0.35
99 0.39
100 0.48
101 0.51
102 0.53
103 0.56
104 0.6
105 0.57
106 0.58
107 0.59
108 0.55
109 0.52
110 0.48
111 0.42
112 0.36
113 0.29
114 0.24
115 0.14
116 0.09
117 0.07
118 0.08
119 0.07
120 0.08
121 0.08
122 0.06
123 0.06
124 0.07
125 0.08
126 0.07
127 0.08
128 0.08
129 0.09
130 0.1
131 0.1
132 0.11
133 0.11
134 0.12
135 0.12
136 0.11
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.09
141 0.1
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.1
146 0.09
147 0.09
148 0.08
149 0.09
150 0.12
151 0.12
152 0.14
153 0.13
154 0.14
155 0.14
156 0.14
157 0.13
158 0.11
159 0.11
160 0.09
161 0.09
162 0.1
163 0.11
164 0.12
165 0.12
166 0.18
167 0.23
168 0.25
169 0.32
170 0.42
171 0.51
172 0.61
173 0.68
174 0.71
175 0.77
176 0.86
177 0.89
178 0.89
179 0.9
180 0.89
181 0.89
182 0.91
183 0.86
184 0.85
185 0.81
186 0.73
187 0.71
188 0.71
189 0.68
190 0.68
191 0.68
192 0.69
193 0.67
194 0.66
195 0.6
196 0.57