FuNGI

A0A1Y1YH36

Protein Details

Accession

A0A1Y1YH36

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
91-115	EKIMLKQSTRSKEKREKVKLDYHNL	Hydrophilic
497-519	NSNSPNEKRKTLKTGKKYPVLLN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto 5, golg 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007645 RNA_pol_Rpb2_3
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04565 RNA_pol_Rpb2_3

Amino Acid Sequences

MSENNYLAKFINQYNVYANIDKLFIKKLYDIKVFLEKKLPKLNPLTISIPEVEYDHLMVEKKTYYISLIHDDYEIKIPAPIDGVFVVDGIEKIMLKQSTRSKEKREKVKLDYHNLGNENYVDLNNEYTNIDIHYRFSNKSREKKLSNMKRYTLLDIRVYYSLFFQELRIKGIKSHERQSISLVYILHHLNPSLSLDEIKNIIVSVVIGENLPKDINIIIPDSFPEETLQSIIARRSESHNKILSMVDRMIDSYFTPDYLHCNESSSNDSSYDDKSTKFYTYLAMARSLFHNEGNVQYYNSRIDTFPYSLYRSIKYFTLENKKLPLDKFIRNLNIKLYGNVKSGKVRSYFREYEAISVQTLSKRSYYDKLSHLRRVQIPINTESDNSQLRMSYDYGYFCPFETPESKDVGFVKYFGLSVLMGPDFTIDEKILEPFLFKYNEIYDATTQDKKDDDNSNSNSDENINDNSQSNTENKSNDNSQSNSEYGDDDYCDSDTSNSNSPNEKRKTLKTGKKYPVLLNTRLSDSLPRI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.33
3	0.35
4	0.32
5	0.31
6	0.24
7	0.25
8	0.25
9	0.23
10	0.24
11	0.22
12	0.23
13	0.27
14	0.33
15	0.39
16	0.42
17	0.42
18	0.41
19	0.5
20	0.49
21	0.46
22	0.49
23	0.45
24	0.48
25	0.56
26	0.54
27	0.51
28	0.56
29	0.61
30	0.56
31	0.56
32	0.52
33	0.44
34	0.45
35	0.39
36	0.32
37	0.25
38	0.22
39	0.18
40	0.15
41	0.14
42	0.12
43	0.12
44	0.13
45	0.13
46	0.14
47	0.14
48	0.13
49	0.14
50	0.14
51	0.13
52	0.15
53	0.19
54	0.23
55	0.23
56	0.23
57	0.24
58	0.24
59	0.24
60	0.26
61	0.22
62	0.16
63	0.16
64	0.16
65	0.15
66	0.16
67	0.14
68	0.11
69	0.11
70	0.11
71	0.1
72	0.09
73	0.09
74	0.07
75	0.07
76	0.06
77	0.07
78	0.06
79	0.06
80	0.12
81	0.13
82	0.13
83	0.2
84	0.29
85	0.38
86	0.47
87	0.54
88	0.59
89	0.68
90	0.76
91	0.8
92	0.82
93	0.81
94	0.79
95	0.83
96	0.81
97	0.79
98	0.77
99	0.69
100	0.65
101	0.58
102	0.51
103	0.42
104	0.34
105	0.26
106	0.21
107	0.17
108	0.12
109	0.11
110	0.12
111	0.11
112	0.12
113	0.11
114	0.1
115	0.1
116	0.1
117	0.12
118	0.11
119	0.13
120	0.16
121	0.19
122	0.21
123	0.26
124	0.35
125	0.41
126	0.5
127	0.57
128	0.61
129	0.62
130	0.69
131	0.75
132	0.76
133	0.78
134	0.75
135	0.69
136	0.67
137	0.65
138	0.62
139	0.56
140	0.48
141	0.42
142	0.36
143	0.36
144	0.3
145	0.28
146	0.22
147	0.18
148	0.15
149	0.12
150	0.11
151	0.1
152	0.16
153	0.17
154	0.2
155	0.21
156	0.21
157	0.23
158	0.31
159	0.38
160	0.36
161	0.42
162	0.44
163	0.45
164	0.45
165	0.46
166	0.41
167	0.33
168	0.31
169	0.24
170	0.19
171	0.19
172	0.19
173	0.16
174	0.13
175	0.12
176	0.1
177	0.1
178	0.11
179	0.08
180	0.08
181	0.08
182	0.08
183	0.09
184	0.1
185	0.09
186	0.08
187	0.07
188	0.07
189	0.05
190	0.05
191	0.05
192	0.04
193	0.04
194	0.04
195	0.04
196	0.05
197	0.05
198	0.05
199	0.05
200	0.05
201	0.05
202	0.06
203	0.07
204	0.08
205	0.08
206	0.08
207	0.09
208	0.1
209	0.1
210	0.09
211	0.09
212	0.08
213	0.08
214	0.08
215	0.09
216	0.07
217	0.08
218	0.09
219	0.1
220	0.1
221	0.11
222	0.17
223	0.25
224	0.28
225	0.33
226	0.34
227	0.33
228	0.34
229	0.34
230	0.3
231	0.23
232	0.2
233	0.14
234	0.11
235	0.12
236	0.1
237	0.09
238	0.08
239	0.08
240	0.08
241	0.07
242	0.08
243	0.08
244	0.11
245	0.13
246	0.14
247	0.12
248	0.13
249	0.14
250	0.15
251	0.18
252	0.17
253	0.15
254	0.14
255	0.15
256	0.15
257	0.16
258	0.17
259	0.15
260	0.14
261	0.15
262	0.16
263	0.16
264	0.15
265	0.14
266	0.12
267	0.14
268	0.16
269	0.15
270	0.16
271	0.15
272	0.15
273	0.16
274	0.17
275	0.15
276	0.12
277	0.12
278	0.1
279	0.12
280	0.14
281	0.14
282	0.12
283	0.11
284	0.12
285	0.13
286	0.13
287	0.13
288	0.1
289	0.12
290	0.14
291	0.15
292	0.16
293	0.17
294	0.18
295	0.21
296	0.23
297	0.22
298	0.2
299	0.2
300	0.19
301	0.19
302	0.19
303	0.24
304	0.32
305	0.34
306	0.34
307	0.37
308	0.38
309	0.4
310	0.38
311	0.38
312	0.33
313	0.36
314	0.38
315	0.39
316	0.45
317	0.43
318	0.43
319	0.38
320	0.39
321	0.34
322	0.32
323	0.3
324	0.26
325	0.26
326	0.27
327	0.26
328	0.25
329	0.26
330	0.29
331	0.3
332	0.29
333	0.32
334	0.38
335	0.39
336	0.36
337	0.4
338	0.36
339	0.35
340	0.34
341	0.3
342	0.21
343	0.2
344	0.19
345	0.16
346	0.17
347	0.15
348	0.14
349	0.15
350	0.19
351	0.23
352	0.26
353	0.29
354	0.35
355	0.42
356	0.48
357	0.54
358	0.54
359	0.56
360	0.55
361	0.56
362	0.53
363	0.49
364	0.46
365	0.41
366	0.41
367	0.35
368	0.31
369	0.27
370	0.26
371	0.23
372	0.2
373	0.18
374	0.15
375	0.15
376	0.17
377	0.17
378	0.15
379	0.15
380	0.16
381	0.17
382	0.18
383	0.18
384	0.16
385	0.16
386	0.14
387	0.16
388	0.17
389	0.21
390	0.21
391	0.24
392	0.24
393	0.25
394	0.26
395	0.26
396	0.23
397	0.19
398	0.18
399	0.15
400	0.15
401	0.12
402	0.12
403	0.08
404	0.08
405	0.1
406	0.09
407	0.08
408	0.08
409	0.08
410	0.08
411	0.08
412	0.1
413	0.07
414	0.08
415	0.09
416	0.1
417	0.11
418	0.1
419	0.11
420	0.11
421	0.16
422	0.17
423	0.16
424	0.19
425	0.19
426	0.23
427	0.23
428	0.24
429	0.21
430	0.22
431	0.27
432	0.28
433	0.27
434	0.25
435	0.25
436	0.24
437	0.29
438	0.34
439	0.36
440	0.4
441	0.44
442	0.46
443	0.46
444	0.45
445	0.39
446	0.33
447	0.28
448	0.22
449	0.22
450	0.19
451	0.19
452	0.2
453	0.21
454	0.21
455	0.21
456	0.2
457	0.22
458	0.25
459	0.26
460	0.27
461	0.31
462	0.35
463	0.39
464	0.43
465	0.4
466	0.4
467	0.42
468	0.4
469	0.35
470	0.31
471	0.26
472	0.22
473	0.21
474	0.18
475	0.15
476	0.16
477	0.15
478	0.15
479	0.14
480	0.14
481	0.17
482	0.19
483	0.25
484	0.26
485	0.29
486	0.37
487	0.42
488	0.5
489	0.53
490	0.56
491	0.57
492	0.62
493	0.7
494	0.73
495	0.77
496	0.78
497	0.82
498	0.84
499	0.85
500	0.84
501	0.8
502	0.79
503	0.76
504	0.71
505	0.67
506	0.61
507	0.56
508	0.51
509	0.46

A0A1Y1YH36

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer