Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2C8J5

Protein Details
Accession A0A1Y2C8J5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
355-387IKPHLQSLKKYTYGKKKKKKKKKKLIFFKYNKIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
368-379GKKKKKKKKKKL
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR033133  PUM-HD  
IPR033712  Pumilio_RNA-bd  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00806  PUF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50302  PUM  
PS50303  PUM_HD  
CDD cd07920  Pumilio  
Amino Acid Sequences MLQRELANSNYNKNNQVSSPIVNSSVVHNQSNNNDANHISRSALLEEFRNNKLKKYELKDIIGNIVEFSGDQHGSRFIQQKLETANNEDKQMVFDEIKPKALHLMTDVFGNYVIQKFFEYGSASQKAVLAKIMEGHVLSLSLQMYGCRVVQKALEHIQEEQQAKLIKELDGNVLKCVKDQNGNHVIQKAIERVAPEHIQFIIDAFHGQVYSLATHPYGCRVIQRIFENCTNEHDSLLEELHRYTFNLIQDQYGNYVIQHVLEHGDPEDKSLVISKVMGQILILSKHKFASNVIEKCVTNGTREERQKMIDEVIKVKSDGSSDLINMMKDQFANYVVQKMLDVVDKDQHDLLITKIKPHLQSLKKYTYGKKKKKKKKKKLIFFKYNKI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.4
3 0.44
4 0.4
5 0.36
6 0.36
7 0.32
8 0.31
9 0.29
10 0.28
11 0.26
12 0.31
13 0.3
14 0.28
15 0.28
16 0.31
17 0.34
18 0.4
19 0.38
20 0.31
21 0.29
22 0.28
23 0.3
24 0.28
25 0.26
26 0.2
27 0.19
28 0.2
29 0.21
30 0.21
31 0.19
32 0.19
33 0.25
34 0.29
35 0.32
36 0.39
37 0.37
38 0.41
39 0.44
40 0.49
41 0.52
42 0.55
43 0.6
44 0.58
45 0.62
46 0.6
47 0.56
48 0.53
49 0.45
50 0.38
51 0.27
52 0.2
53 0.16
54 0.12
55 0.12
56 0.11
57 0.1
58 0.1
59 0.11
60 0.13
61 0.15
62 0.2
63 0.25
64 0.23
65 0.3
66 0.31
67 0.34
68 0.36
69 0.41
70 0.37
71 0.37
72 0.44
73 0.38
74 0.39
75 0.36
76 0.3
77 0.26
78 0.26
79 0.23
80 0.16
81 0.18
82 0.23
83 0.24
84 0.28
85 0.27
86 0.25
87 0.27
88 0.26
89 0.22
90 0.18
91 0.2
92 0.16
93 0.18
94 0.17
95 0.13
96 0.12
97 0.12
98 0.1
99 0.09
100 0.09
101 0.08
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.11
106 0.13
107 0.12
108 0.18
109 0.2
110 0.2
111 0.2
112 0.21
113 0.2
114 0.18
115 0.18
116 0.12
117 0.1
118 0.12
119 0.12
120 0.1
121 0.09
122 0.09
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.08
133 0.08
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.11
138 0.12
139 0.16
140 0.2
141 0.21
142 0.2
143 0.21
144 0.23
145 0.27
146 0.26
147 0.22
148 0.21
149 0.21
150 0.2
151 0.21
152 0.2
153 0.14
154 0.15
155 0.16
156 0.17
157 0.19
158 0.19
159 0.19
160 0.2
161 0.19
162 0.18
163 0.2
164 0.16
165 0.19
166 0.2
167 0.26
168 0.32
169 0.33
170 0.34
171 0.33
172 0.31
173 0.25
174 0.26
175 0.19
176 0.12
177 0.12
178 0.11
179 0.11
180 0.14
181 0.14
182 0.13
183 0.13
184 0.12
185 0.11
186 0.1
187 0.1
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.04
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.09
204 0.1
205 0.09
206 0.11
207 0.15
208 0.17
209 0.21
210 0.25
211 0.25
212 0.28
213 0.31
214 0.31
215 0.28
216 0.31
217 0.3
218 0.27
219 0.24
220 0.2
221 0.17
222 0.15
223 0.15
224 0.11
225 0.08
226 0.08
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.1
231 0.12
232 0.13
233 0.16
234 0.16
235 0.16
236 0.17
237 0.18
238 0.17
239 0.15
240 0.14
241 0.1
242 0.11
243 0.1
244 0.09
245 0.09
246 0.07
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.11
252 0.1
253 0.12
254 0.12
255 0.1
256 0.11
257 0.13
258 0.13
259 0.1
260 0.11
261 0.11
262 0.15
263 0.15
264 0.15
265 0.12
266 0.14
267 0.15
268 0.19
269 0.2
270 0.16
271 0.17
272 0.18
273 0.2
274 0.18
275 0.17
276 0.24
277 0.31
278 0.32
279 0.34
280 0.37
281 0.35
282 0.36
283 0.41
284 0.32
285 0.24
286 0.27
287 0.29
288 0.35
289 0.4
290 0.43
291 0.39
292 0.41
293 0.42
294 0.39
295 0.38
296 0.33
297 0.31
298 0.31
299 0.32
300 0.31
301 0.28
302 0.26
303 0.22
304 0.19
305 0.18
306 0.16
307 0.14
308 0.13
309 0.17
310 0.17
311 0.16
312 0.16
313 0.15
314 0.14
315 0.13
316 0.14
317 0.12
318 0.12
319 0.15
320 0.15
321 0.18
322 0.17
323 0.17
324 0.16
325 0.16
326 0.16
327 0.17
328 0.17
329 0.16
330 0.22
331 0.22
332 0.25
333 0.24
334 0.23
335 0.2
336 0.19
337 0.19
338 0.22
339 0.22
340 0.24
341 0.28
342 0.33
343 0.34
344 0.4
345 0.48
346 0.47
347 0.57
348 0.61
349 0.65
350 0.67
351 0.72
352 0.75
353 0.76
354 0.79
355 0.81
356 0.83
357 0.86
358 0.9
359 0.94
360 0.96
361 0.96
362 0.96
363 0.97
364 0.97
365 0.97
366 0.97
367 0.97