Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2DAQ9

Protein Details
Accession A0A1Y2DAQ9    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-41LYNETNKPNIRKVPKKSSDRLKVPKHSKKTKEQIEKVSILHydrophilic
233-252EGYHYKPHTNNKKHINKPSTHydrophilic
442-469YQENSNKPINKKKKNNRKEGKNSRDVFYHydrophilic
537-559TEMTKEEARKKQKKKLIPTLSLFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-32IRKVPKKSSDRLKVPKHSKKTK
449-462PINKKKKNNRKEGK
545-551RKKQKKK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 11.333, cyto 6.5, cyto_mito 5.666, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039693  Rtr1/RPAP2  
IPR007308  Rtr1/RPAP2_dom  
IPR038534  Rtr1/RPAP2_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0017018  F:myosin phosphatase activity  
GO:0043175  F:RNA polymerase core enzyme binding  
GO:0008420  F:RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat phosphatase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF04181  RPAP2_Rtr1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51479  ZF_RTR1  
Amino Acid Sequences MLYNETNKPNIRKVPKKSSDRLKVPKHSKKTKEQIEKVSILEKAKWEFKIMELQEKMFETPVTIKYLKYIAKYFQPAHYEEVVIERKSQNLCGYPLCNKKTQELKGKYRLSSSKKKIFDITELKSYCGSDCMISSRYYASQLLDEPVYLRNLETIKEVDVIPLGVNIENWILKENEKLNSYTERSLDSYVKSMMKSLPNLENKLIIHEHFGDNNSNNIQPIIEKSSFQYDSIEGYHYKPHTNNKKHINKPSTIILDKGLLNSYSKLDSNDKRSLKKNGSKEKVVSSVVMNREDANKFNELYEQYAREQHKKEEEKLKKEKSLNNSEKKETSNNTNNDNTKEEITSELSKLKLLNEITENNNLNLTENKSEVIIEEFNKLNIKDTPISKEENMNNEKKTISSKKSIGILKKSNSVSKENLKVRFNDDTSVKFIENKEEMNKAYQENSNKPINKKKKNNRKEGKNSRDVFYSYDVIEKSGVQKDILKSNAENVDNKEGNEEKNKEINEENIDENENDSEKKVKSLFEMNKDLEKILKITEMTKEEARKKQKKKLIPTLSLFGKTWTTISRMITNETRLFLNSKISEDELNEMLLVDDDIMNTRKDILITNIMKSFSSIKLEHGIITSIENELILLIKSFVVNESMVVLSSVEYWTLTVVFLKALTKRNKLLEEEISEEKWKKMIETVEVPYYQLVEFVNLFN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.82
3 0.86
4 0.87
5 0.88
6 0.88
7 0.89
8 0.89
9 0.88
10 0.89
11 0.9
12 0.91
13 0.91
14 0.91
15 0.89
16 0.9
17 0.9
18 0.9
19 0.91
20 0.89
21 0.88
22 0.85
23 0.79
24 0.7
25 0.64
26 0.57
27 0.49
28 0.43
29 0.38
30 0.35
31 0.38
32 0.37
33 0.36
34 0.33
35 0.33
36 0.39
37 0.37
38 0.41
39 0.37
40 0.37
41 0.37
42 0.38
43 0.36
44 0.28
45 0.25
46 0.18
47 0.21
48 0.22
49 0.25
50 0.25
51 0.24
52 0.25
53 0.32
54 0.32
55 0.32
56 0.34
57 0.31
58 0.38
59 0.45
60 0.45
61 0.46
62 0.46
63 0.44
64 0.45
65 0.43
66 0.35
67 0.29
68 0.33
69 0.32
70 0.28
71 0.3
72 0.26
73 0.29
74 0.3
75 0.33
76 0.3
77 0.29
78 0.31
79 0.31
80 0.35
81 0.38
82 0.46
83 0.46
84 0.48
85 0.46
86 0.51
87 0.56
88 0.6
89 0.63
90 0.63
91 0.69
92 0.73
93 0.77
94 0.71
95 0.7
96 0.71
97 0.69
98 0.7
99 0.7
100 0.69
101 0.67
102 0.68
103 0.67
104 0.61
105 0.62
106 0.59
107 0.54
108 0.54
109 0.51
110 0.48
111 0.43
112 0.41
113 0.31
114 0.25
115 0.21
116 0.12
117 0.13
118 0.16
119 0.16
120 0.16
121 0.17
122 0.17
123 0.18
124 0.19
125 0.19
126 0.16
127 0.17
128 0.17
129 0.19
130 0.16
131 0.15
132 0.14
133 0.14
134 0.15
135 0.13
136 0.11
137 0.12
138 0.13
139 0.14
140 0.15
141 0.14
142 0.14
143 0.16
144 0.16
145 0.13
146 0.12
147 0.12
148 0.1
149 0.09
150 0.09
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.1
158 0.1
159 0.1
160 0.15
161 0.18
162 0.21
163 0.22
164 0.23
165 0.24
166 0.29
167 0.32
168 0.3
169 0.28
170 0.26
171 0.26
172 0.28
173 0.28
174 0.23
175 0.22
176 0.23
177 0.24
178 0.21
179 0.21
180 0.23
181 0.24
182 0.25
183 0.27
184 0.32
185 0.35
186 0.38
187 0.36
188 0.36
189 0.32
190 0.34
191 0.31
192 0.23
193 0.21
194 0.2
195 0.21
196 0.19
197 0.2
198 0.2
199 0.19
200 0.21
201 0.2
202 0.18
203 0.17
204 0.15
205 0.14
206 0.11
207 0.13
208 0.16
209 0.15
210 0.15
211 0.17
212 0.23
213 0.24
214 0.23
215 0.22
216 0.16
217 0.18
218 0.18
219 0.19
220 0.13
221 0.14
222 0.19
223 0.18
224 0.21
225 0.23
226 0.32
227 0.41
228 0.48
229 0.55
230 0.6
231 0.7
232 0.74
233 0.81
234 0.77
235 0.68
236 0.64
237 0.62
238 0.57
239 0.47
240 0.4
241 0.31
242 0.28
243 0.25
244 0.23
245 0.18
246 0.12
247 0.12
248 0.12
249 0.13
250 0.12
251 0.12
252 0.14
253 0.2
254 0.24
255 0.3
256 0.37
257 0.4
258 0.43
259 0.48
260 0.54
261 0.56
262 0.59
263 0.62
264 0.64
265 0.66
266 0.65
267 0.62
268 0.58
269 0.53
270 0.46
271 0.37
272 0.28
273 0.28
274 0.26
275 0.25
276 0.21
277 0.18
278 0.21
279 0.21
280 0.21
281 0.18
282 0.17
283 0.16
284 0.16
285 0.18
286 0.15
287 0.17
288 0.17
289 0.17
290 0.16
291 0.23
292 0.25
293 0.29
294 0.3
295 0.3
296 0.38
297 0.4
298 0.46
299 0.5
300 0.55
301 0.58
302 0.66
303 0.67
304 0.64
305 0.66
306 0.65
307 0.63
308 0.66
309 0.66
310 0.66
311 0.64
312 0.6
313 0.57
314 0.54
315 0.5
316 0.41
317 0.4
318 0.4
319 0.38
320 0.4
321 0.43
322 0.42
323 0.4
324 0.4
325 0.33
326 0.25
327 0.23
328 0.18
329 0.15
330 0.16
331 0.15
332 0.13
333 0.14
334 0.13
335 0.13
336 0.13
337 0.12
338 0.14
339 0.13
340 0.13
341 0.14
342 0.16
343 0.18
344 0.22
345 0.22
346 0.18
347 0.19
348 0.17
349 0.15
350 0.15
351 0.15
352 0.11
353 0.11
354 0.11
355 0.1
356 0.1
357 0.1
358 0.1
359 0.09
360 0.09
361 0.11
362 0.11
363 0.12
364 0.14
365 0.13
366 0.13
367 0.13
368 0.15
369 0.16
370 0.18
371 0.21
372 0.22
373 0.25
374 0.23
375 0.29
376 0.28
377 0.33
378 0.36
379 0.36
380 0.34
381 0.33
382 0.32
383 0.27
384 0.31
385 0.31
386 0.3
387 0.32
388 0.33
389 0.35
390 0.41
391 0.45
392 0.43
393 0.44
394 0.46
395 0.42
396 0.47
397 0.45
398 0.43
399 0.41
400 0.4
401 0.37
402 0.37
403 0.44
404 0.43
405 0.47
406 0.45
407 0.44
408 0.44
409 0.45
410 0.39
411 0.34
412 0.3
413 0.26
414 0.27
415 0.28
416 0.23
417 0.21
418 0.2
419 0.22
420 0.22
421 0.21
422 0.21
423 0.22
424 0.22
425 0.22
426 0.24
427 0.19
428 0.21
429 0.23
430 0.26
431 0.27
432 0.31
433 0.36
434 0.39
435 0.43
436 0.51
437 0.58
438 0.63
439 0.69
440 0.76
441 0.8
442 0.85
443 0.91
444 0.91
445 0.91
446 0.92
447 0.93
448 0.91
449 0.9
450 0.82
451 0.73
452 0.66
453 0.56
454 0.47
455 0.39
456 0.32
457 0.22
458 0.22
459 0.2
460 0.18
461 0.17
462 0.15
463 0.15
464 0.18
465 0.18
466 0.15
467 0.2
468 0.21
469 0.27
470 0.28
471 0.26
472 0.22
473 0.27
474 0.32
475 0.29
476 0.3
477 0.28
478 0.34
479 0.33
480 0.32
481 0.31
482 0.27
483 0.29
484 0.34
485 0.33
486 0.29
487 0.33
488 0.33
489 0.32
490 0.31
491 0.32
492 0.28
493 0.28
494 0.25
495 0.22
496 0.23
497 0.2
498 0.2
499 0.17
500 0.14
501 0.12
502 0.12
503 0.15
504 0.14
505 0.18
506 0.19
507 0.19
508 0.21
509 0.3
510 0.36
511 0.38
512 0.45
513 0.43
514 0.45
515 0.45
516 0.42
517 0.34
518 0.29
519 0.23
520 0.17
521 0.18
522 0.14
523 0.15
524 0.21
525 0.21
526 0.23
527 0.27
528 0.34
529 0.39
530 0.47
531 0.56
532 0.61
533 0.67
534 0.73
535 0.78
536 0.8
537 0.83
538 0.85
539 0.84
540 0.82
541 0.78
542 0.75
543 0.7
544 0.63
545 0.53
546 0.43
547 0.35
548 0.27
549 0.24
550 0.19
551 0.18
552 0.19
553 0.22
554 0.25
555 0.26
556 0.3
557 0.32
558 0.35
559 0.34
560 0.32
561 0.31
562 0.26
563 0.27
564 0.23
565 0.27
566 0.23
567 0.23
568 0.24
569 0.24
570 0.24
571 0.23
572 0.25
573 0.18
574 0.17
575 0.15
576 0.12
577 0.11
578 0.1
579 0.08
580 0.06
581 0.05
582 0.05
583 0.08
584 0.1
585 0.1
586 0.1
587 0.11
588 0.11
589 0.12
590 0.14
591 0.16
592 0.24
593 0.26
594 0.29
595 0.31
596 0.31
597 0.3
598 0.3
599 0.28
600 0.22
601 0.25
602 0.23
603 0.23
604 0.27
605 0.28
606 0.27
607 0.24
608 0.23
609 0.17
610 0.18
611 0.16
612 0.12
613 0.11
614 0.1
615 0.08
616 0.07
617 0.08
618 0.06
619 0.06
620 0.06
621 0.07
622 0.07
623 0.07
624 0.08
625 0.09
626 0.09
627 0.09
628 0.1
629 0.1
630 0.1
631 0.1
632 0.09
633 0.08
634 0.09
635 0.09
636 0.07
637 0.07
638 0.07
639 0.07
640 0.08
641 0.08
642 0.08
643 0.08
644 0.08
645 0.09
646 0.13
647 0.18
648 0.26
649 0.34
650 0.39
651 0.45
652 0.51
653 0.55
654 0.57
655 0.58
656 0.56
657 0.53
658 0.52
659 0.5
660 0.45
661 0.46
662 0.43
663 0.38
664 0.34
665 0.3
666 0.26
667 0.28
668 0.3
669 0.31
670 0.36
671 0.4
672 0.42
673 0.42
674 0.41
675 0.35
676 0.32
677 0.25
678 0.2
679 0.16
680 0.12